新算法突破实现药物靶标亲合力快速精准预测

海南大学药学院教授罗海彬团队联合中山大学药学院副教授李哲团队提出了一种基于组合结构的相对结合自由能 (CS-FEP) 的药物设计新方法,实现小分子药物与生物大分子靶标间的结合自由能(以下简称药物-靶标亲合力)的快速精准预测,取得药物设计关键技术的突破,实现自由能微扰(FEP)在药物设计新方法领域的国产化和自主可控。近日,相关研究成果发表在《药学学报》英文版上。 实现药物-靶标亲合力的快速精准预测,可缩短新药创制周期,降低研发成本并提升研发效率。FEP方法是基于统计力学理论,经过严格推导而来,理论精度较高,在相关方面具有良好应用前景。但现有的FEP方法难以模拟非物理中间态,得到收敛结果的计算成本高,且缺乏公认的最佳流程,因而尚未得到广泛应用。 美国药物设计软件企业薛定谔发展的FEP在相对自由能上的预测方法受到制药企业和科研工作者的极大关注,但该方法只能被应用于预测结构相似药物间的相对结合自由能,无法预测不同骨架的化合物与靶......阅读全文

新算法突破实现药物靶标亲合力快速精准预测

海南大学药学院教授罗海彬团队联合中山大学药学院副教授李哲团队提出了一种基于组合结构的相对结合自由能 (CS-FEP) 的药物设计新方法,实现小分子药物与生物大分子靶标间的结合自由能(以下简称药物-靶标亲合力)的快速精准预测,取得药物设计关键技术的突破,实现自由能微扰(FEP)在药物设计新方法领域的国

新算法突破实现药物靶标亲合力快速精准预测

  海南大学药学院教授罗海彬团队联合中山大学药学院副教授李哲团队提出了一种基于组合结构的相对结合自由能 (CS-FEP) 的药物设计新方法,实现小分子药物与生物大分子靶标间的结合自由能(以下简称药物-靶标亲合力)的快速精准预测,取得药物设计关键技术的突破,实现自由能微扰(FEP)在药物设计新方法领域

靶标预测

靶标预测A:有什么简单的方法可以通过化合物的结构式预测该化合物可能的药理毒理作用么,比如抗肿瘤,抗炎,抗神经等等。B:反向找靶。A:那就复杂咯,想简单点,然后去做细胞实验验证。想着是不是可以通过计算机来预测哈子。C:反向对接。D:直接做激酶谱不就行了。E:多糖类药物可以做这个激酶谱吗?F:激酶谱 一

抗原抗体亲和性和亲合力指的是什么?

  亲和性指抗体分子上一个抗原结合点与对应的抗原表位之间相适应而存在的引力,它是抗原抗体间固有的结合力。亲和性用平衡常数K来表示,K值越大,亲和性越强,与抗原结合也越牢固。  抗体的亲合力指抗体结合部位与抗原表位间结合的强度,与抗体结合价、抗体的亲和性、抗原有效表位数目等相关。

什么是分子靶标

分子靶标是以研究疾病发生、发展过程中细胞分子生物学上的差异(包括基因、酶、信号转导等不同特性)为基础,筛选和鉴定与疾病密切相关的蛋白质、核酸、酶、受体等生物分子作为药物作用的靶点,通过研究药物设计和构效关系得到靶向特异性生物分子的先导化合物,通过靶向给药控释系统实现有效靶向给药及个体化治疗。分子靶标

细胞瘤新靶标

科学研究人员发现可能用于治疗神经母细胞瘤的新靶点。神经母细胞瘤是zui致命的儿童癌症之一,占所有儿童癌症死亡人数的15%。多数患者无法得到完全治愈,往往在确诊时癌症已经扩散至全身。在过去的20年中,儿童接受的治疗通常伴有非常大的副作用,不仅杀死肿瘤细胞,也杀伤正常细胞。相较于其他大部分癌症,神经母细

单靶标or多靶标:新冠检测试剂该如何选择?

目前,国家药品监督管理局(NMPA)批准的新型冠状病毒检测试剂中,大部分采用的方法为实时荧光RT-PCR。它具有简便快速、特异性强、灵敏度高等特点。那么,其高灵敏度和高特异性的基础究竟是什么呢?让我们来一探究竟。01试剂的检测性能如何体现?检测性能评价中最主要的就是灵敏度与特异性。PCR扩增产物以指

测定抗体亲合力鉴别原发感染和再激活感染

  抗HCMV-IgG浓度过高时包被抗原相对不足,存在过剩的IgG,此时由于高亲合力的IgG在尿素的作用下仍然能与包被抗原结合,而非变性孔IgG与包被抗原的结合已经饱和,所测得的A值相对恒定,因此影响AI测定,得出较高的AI值。这与K li-mashevskaya等的报道一致。而Dangel等却认为

抗原抗体的亲和性和亲合力指的是什么?

亲和性指抗体分子上一个抗原结合点与对应的抗原表位之间相适应而存在的引力,它是抗原抗体间固有的结合力。亲和性用平衡常数K来表示,K值越大,亲和性越强,与抗原结合也越牢固。抗体的亲合力指抗体结合部位与抗原表位间结合的强度,与抗体结合价、抗体的亲和性、抗原有效表位数目等相关。

神经生长因子低亲合力受体在肝细胞的表达

  神经生长因子受体( NGFR)由两个亚基组成即神经生长因子低亲合力受体-P75( low-affinity nerve growth factor receptor,P75) 和神经生长因子高亲合力受体-酪氨酸激酶A( tyrosine kinase A,TrkA)。Trim等认为,人与大鼠(h

什么是靶标发现技术

靶标发现技术靶标的发现对发展创新药物、生物诊断和生物治疗技术具有重要意义。重点研究生理和病理过程中关键基因功能及其调控网络的规模化识别,突破疾病相关基因的功能识别、表达调控及靶标筛查和确证技术,“从基因到药物”的新药创制技术。简单来说就是一种准确定位致病基因并通过对该基因的修复达到治疗疾病的目的的技

Bioinformatics:新型肺癌肿瘤靶标

3月25日从中科院昆明动物研究所获悉,在国家自然科学基金委和科技部项目的支持下,该所李功华博士在黄京飞研究员的指导下,建立了新的系统生物学模型,并发现可能是新型的针对肺癌的肿瘤靶标。该研究成果已发表在《生物信息学》上        3月25日从中科院昆明动物研究所获悉,在国家自然科学基金委和科技部项

在化学上,什么叫做靶标

一般是做药学或者医学的会用到靶标这个概念我们现在做的课题是材料化学方向的,应用在医学上面,就牵涉到靶标靶标是指药物作用于体内并实现疗效的特定分子看到你的补充了底物这个概念是和酶配套存在的正所谓酶的反应有特异性就是说酶的活性位点能够结合的是一个特定的结构而能够和酶进行结合反应的,拥有这样特定结构的东西

研究发现抗衰老靶标基因

  2月27日,《自然》期刊在线发表了题为《两个保守的表观遗传调控因子妨碍健康衰老》的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室蔡时青研究组与中国科学院上海巴斯德研究所江陆斌研究组合作完成。  衰老是生物体随时间推移各

Cell-Reports:CRISPR挖出大量抗癌靶标

  白血病是一种造血系统的恶性肿瘤,俗称“血癌”。急性髓性白血病AML是比较常见的一种白血病,现有治疗药物在临床上的效果并不理想。Wellcome Trust Sanger研究所改良了CRISPR基因编辑技术,并用该技术找到了大量治疗AML的新靶标。这项研究发表在十月十八日的Cell Reports

肿瘤早期诊断新靶标之ctDNA

  肿瘤液态活检是目前最具发展潜力的肿瘤无创诊断和实时疗效监测手段,区别于传统的临床诊断手段,该方法具有简便、安全、无创、实时等特点。广义而言,肿瘤液态活检主要是指以外周血液为主的体液标本中细胞及核酸的检测。通常包括了循环肿瘤细胞(CTC)和游离的DNA(ctDNA)两大类,是目前精准医疗的最前沿领

EMT可作为肾病的治疗靶标

  成年人受惊吓或恐惧的时候会蜷缩成胎儿姿势。同样,受伤(包括引起癌症的遗传损伤)的成年细胞,会启动一个过程,该过程存在于胚胎发育过程中。  当面临糖尿病、癌症或感染之类的情况时,大多数器官会回复到导致它们出现的方式。然而,这种适应性可能是保护性的,也是有代价的,会导致进一步的长期器官损害。  德克

首次成功靶定“通用”肿瘤靶标

  端粒酶是一种几乎“通用”的肿瘤靶标,因为它在绝大多数的肿瘤中是被激活的。尽管端粒酶在癌症中的重要作用,但是目前在临床上,还没有靶定这种酶的治疗方法。特别是,由于缺乏可用的结构信息,端粒酶小分子抑制剂的研究和开发,已经远远落后于任何其他方法。基于结构的药物设计,是一个强大的工具,可开发高度有效的特

肿瘤早期诊断新靶标之ctDNA

  肿瘤液态活检是目前最具发展潜力的肿瘤无创诊断和实时疗效监测手段,区别于传统的临床诊断手段,该方法具有简便、安全、无创、实时等特点。广义而言,肿瘤液态活检主要是指以外周血液为主的体液标本中细胞及核酸的检测。通常包括了循环肿瘤细胞(CTC)和游离的DNA(ctDNA)两大类,是目前精准医疗的最前沿领

“973”分子靶标绿色农药项目验收

  “973”计划项目分子靶标导向的绿色化学农药创新研究课题结题总结会日前在华东理工大学召开。会议由项目首席科学家钱旭红院士主持。该项目发表论文总计801篇,申请ZL280项,授权119项,其中国外授权ZL11项。  会上,课题负责人汇报了5年来课题的完成情况和代表性成果,钱旭红院士作了项目总结。该

NEJM:癌症药物研发的新型靶标

  SALL4基因负责调节胚胎干细胞的自我更新,是许多癌症中的关键基因,例如肝癌。现在,哈佛干细胞研究所HSCI的研究人员,在肝癌模型中对SALL4基因进行研究,找到了阻断其活性的新型药物。这项研究发表在新英格兰医学杂志(New England Journal of Medicine)上。  

研究揭示调节炎症的新靶标

  炎症是人体自愈过程不可分割的组成部分,但是,当它变成慢性炎症时就会导致癌症、阿尔兹海默症和心血管疾病等。炎性体(inflammasomes)是遇到各种细胞应激信号时触发炎症反应的蛋白质分子机器。  都柏林圣三一学院的科学家们发现了一个调节炎症的潜在新靶点,炎症会引发一系列疾病,包括糖尿病、癌症和

Immunity:败血症研究靶标确定

  败血症是一种很少有病人听说过,但大多数医生都害怕的疾病。人体对细菌攻击的反应可能引发一连串的细胞自我毁灭,无意间导致血块、多器官衰竭和死亡。  免疫系统的功能类似于细胞吃豆人,利用白细胞来追捕"坏人",发起攻击和反击。然而,在极端的情况下,白细胞会进行某种切腹自杀,触发自己的死亡,试图消灭感染。

靶标效应是什么意思?

  药物靶标,选择药物作用靶标要考虑两个方面:  1. 靶标的有效性,即靶标与疾病确实相关,并且通过调节靶标的生理活性能有效地改善疾病症状。  2. 靶标的副作用,如果对靶标的生理活性的调节不可避免地产生严重的副作用,那么将其选作药物作用靶标是不合适的。  靶标发现与确证的一般流程:  1. 寻找疾

新冠病毒高亲合力高10倍以上,但SARS抗体可阻碍进入细胞

  SARS-CoV-2的出现导致全球80000多例感染和2700多例死亡。冠状病毒刺突(S)糖蛋白促进病毒进入细胞,是抗体的主要靶标。因此,解析SARS-CoV-2病毒的S蛋白的结构,对于了解病毒的致病机制和疫苗的设计和开发具有重要的指导意义。  2020年3月1日,华盛顿大学David Vees

昆明动物所揭示新的肿瘤靶标

  肿瘤目前是世界人口死亡的第一原因。中国每年因肿瘤死亡的人数超过200万。除了传统的放化疗等方法外,靶向治疗是肿瘤临床的研究热点及发展趋势。该治疗方法是通过药物选择性抑制肿瘤细胞特异的分子靶标的功能,来抑制肿瘤生长,而不杀伤或较少损伤正常细胞。相比传统放化疗方法,靶向治疗具有耐受性好、毒副作用轻微

我科研团队发现哮喘治疗新靶标

  记者近日从常州大学获悉,上海中医药大学杨永清教授研究团队与该校邓林红教授研究团队合作,发现了哮喘治疗新靶标——肌动蛋白结合蛋白2(Transgelin-2),这将为研发哮喘治疗新药与有效控制哮喘,找到了一条新的路径。研究成果日前已刊登在国际著名期刊《Science Translational M

研究发现新的抗衰老靶标基因

  我国科学家从神经系统和基因层面揭示了衰老的原理,并发现了BAZ2B这一全新的抗衰老靶标基因,为延缓大脑衰老提供了新的理论依据。2月27日凌晨,相关研究成果以《两个保守的表观遗传调控因子妨碍健康衰老》为题在国际著名学术论文期刊《自然》上在线发表。  该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(

我国科研团队发现哮喘治疗新靶标

  记者近日从常州大学获悉,上海中医药大学杨永清教授研究团队与该校邓林红教授研究团队合作,发现了哮喘治疗新靶标——肌动蛋白结合蛋白2(Transgelin-2),这将为研发哮喘治疗新药与有效控制哮喘,找到了一条新的路径。研究成果日前已刊登在国际著名期刊《Science Translational M

Cell子刊:CRISPR挖出大量抗癌靶标

  白血病是一种造血系统的恶性肿瘤,俗称“血癌”。急性髓性白血病AML是比较常见的一种白血病,现有治疗药物在临床上的效果并不理想。Wellcome Trust Sanger研究所改良了CRISPR基因编辑技术,并用该技术找到了大量治疗AML的新靶标。这项研究发表在十月十八日的Cell Reports