新算法让监控复杂系统变简单
在一个复杂系统中，如包含了2万个互相联系的基因的人类基因组，要想一次监控整个系统几乎是不可能的。据物理学家组织网近日报道，来自美国东北大学、麻省理工大学等单位的研究人员开发出一种新算法，能识别出复杂系统的子单位或必要结点，使监控大型复杂系统成为可能。相关论文发表在最近出版的美国《国家科学院学报》上。 复杂系统如生物基因组、生化反应系统、社会网络等，由许多互相关联的子部分组成，其中任何一个部分有了变化，都会对其余部分造成影响。因此要分析监控一个复杂系统是极为困难的。“复杂系统的本质是连接，各组成部分之间要凭借这些连接，才能将信息分布到整个网络。因此我们不必监控每个部分，也能从整体上把握整个系统。”论文作者之一、东北大学生物学院和计算机与信息科学院物理学教授艾伯特-拉斯洛·巴拉巴斯说，他们设计的方法利用了复杂系统子单位间相互依赖的特性，可超越数量限制观察系统的整体情况。 利用这种新算法，研究小......阅读全文
急性肾损伤早期的生物学标记
1、尿酶：谷胱甘肽-S-转移酶（GST）、γ-谷氨酰基转移酶（γ-GT）、碱性磷酸酶（AKP）、N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶（NAG）等[4]。 2、尿低分子蛋白：胱抑素C（CysC）、α1-微球蛋白、β2-微球蛋白、视黄醇结合蛋白（RBP） 3、中性粒细胞明胶酶相关性脂质运载蛋白（NG
乳腺癌预后有了新生物标记
预测治疗后效果对医疗管理来说是至关重要的。发表在最新一期《分子与细胞生物学》上的研究报告指出，p66ShcA蛋白有望作为生物标志，用以识别预后较差的乳腺癌。 预后良好的患者可幸免进行带有严重副作用的侵入性治疗，但不对侵入性肿瘤进行侵入治疗或可导致死亡。癌症之所以致命，在很大程度上是由于其发生了
肿瘤细胞的－“身份证”——生物标记物
抗肿瘤药物是当前创新药物研发最活跃的领域之一，也是生物标志物能够“大展拳脚“的领域。不同肿瘤患者的个体异质性和同一患者的组织异质性是有效治疗肿瘤的巨大障碍，依靠生物标记物区分癌种和确定药物响应是精准医疗、抗肿瘤药物开发的试金石。 图1. 肿瘤细胞生物标记物的应用1 生物标记物的发
研究发现肿瘤血管新生的新分子标记Apj
中国科学院生物化学与细胞生物学研究所研究员周斌课题组发现肿瘤血管新生的新分子标记Apj，为肿瘤疾病治疗等提供了一个新的研究靶点。相关成果10月30日发表在《细胞通讯》上。 近年来，由于环境污染加剧，人口老龄化，社会生活压力大及个人的不良生活习惯等，现代社会恶性肿瘤的发病率居高不下，如何有效
新标记物检测癌症准确率达90％
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512309.shtm
研究发现肿瘤血管新生的新分子标记Apj
10月30日，国际学术期刊Cell Reports 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的科研成果“Apj+ vessels drive tumor growth and represent a tractable therapeutic target”。该研究利用在Apj-
阿尔茨海默病新标记物“现身”
阿尔茨海默病的神经退行性病变通常是渐进的，在任何症状（如记忆丧失）出现多年前，患者可能就已经发病。因此，早期诊断有助医生施用药物减缓患者病情。瑞典和英国科学家在最新一期《大脑》杂志上发表论文称，他们的最新研究发现，胶质纤维酸性蛋白（GFAP）可能是阿尔茨海默病早期阶段的生物标志物，有助提前10年揭示
欧盟发布纺织品新标签及标记规例
2011年10月18日，欧盟《官方公报》刊登第1007/2011号规例，内容涉及纺织纤维名称及纺织品的标签及标记。规例为欧盟市场内所有纺织品订立标签及标记条款，并引入崭新的条款，规定若纺织品含有源自动物的非纺织部分，必须在标签内以特别字句说明。 新规例适用于所有纺织品，包括只含纺织纤维的原材料
大数据成为反腐利器－新算法体系精准发现疑似问题线索
如何从碎片化、结构化的电子政务大数据中发现疑似问题线索？ 中科院计算所的研究团队经过长期研究找到了答案。 “在不同电子政务系统产生的偶然数据中蕴含着具体人、具体事的必然章法和趋势。”在中科院计算所研究员方金云看来，大数据具有使小恶小善振荡放大的力量，有助于从电子政务数据中精准发现疑似问题线索
一种新的酵母菌细胞明场图像分割算法
酵母菌细胞由于其易培养和易操作性已成为一种在生物学界被广泛应用的模式生物。在遗传学研究中，对已发生基因突变的与人类遗传疾病有关的酵母进行表型研究，极大地提高了人类疾病的诊断和治疗水平。然而，在研究中，研究人员通常需要采集大量的酵母细胞图像，观察基因突变或不同药物处理下的细胞结构和行为。比较常用的
科学家研发新算法－可快速揭示细胞内部结构
借由高功率显微镜和机器学习，美国科学家研发出一种新算法，可在整个细胞的超高分辨率图像中自动识别大约30种不同类型的细胞器和其他结构。相关论文发表在最新一期的《自然》杂志上。 领导该COSEM（电子显微镜下细胞分割）项目团队的奥布蕾·魏格尔说，这些图像中的细节几乎不可能在整个细胞中手动解析。仅一
清华大学提出冷冻电镜粒子筛选新算法获得国际认可
为进一步提高冷冻电镜分辨率和效率，清华大学研究团队提出的一款新算法CryoSieve，受到了国际冷冻电镜研发领域的高度关注。4月24日，由哈佛大学医学院管理，为全球结构生物学提供计算支持的SBGrid联盟收录了CryoSieve算法。冷冻电子显微镜是一种确定生物大分子的近原子分辨率结构的重要方法。在
新算法高效预测病毒天然宿主－可助人类预防传染病
据美国《科学》杂志4日消息，英国格拉斯哥大学研究团队发布了一项最新人工智能研究报告：科学家借助全新的机器学习算法，可以更高效地从基因层面预测埃博拉和寨卡等病毒的天然宿主，从而采取措施预防这些病毒传播到人类身上。图片来源于网络 科学家一直试图在第一时间发现病毒的天然宿主，这对人类的传染病防控事
原噬菌体de－novo预测新算法在南海研究所建立
中国科学院南海海洋研究所研究员王晓雪团队建立了一种不依赖于噬菌体基因序列相似性的原噬菌体de novo预测新算法，集成分析流程的工具名为Prophage Tracer。9月22日，相关研究成果在线发表在《核酸研究》上。 烈性噬菌体侵染细菌宿主后，大量繁殖，裂解宿主细胞释放子代噬菌体粒子。温和噬
加速新药研发！新算法助力质谱数据准确高效预测小分子
小分子的鉴定是生命科学一项关键任务。质谱（mass spectrometry，MS）可用于分析化合物成分，高通量质谱技术能够从数十万个环境中收集小分子的串联质谱。然而，现有的方法是基于化学领域的知识，无法解释小分子质谱中的许多峰。 卡内基梅隆大学和俄罗斯圣彼得堡国立大学的研究人员提出一种算法—
缺陷检测算法
基本两个步骤：1、缺陷检出，算法较多，本人认为是不变矩阵法和主成分分析法；2、缺陷识别和分类,多数使用BP神经网络进行训练，提高识别率。
基质效应的算法
化学分析中，基质指的是样品中被分析物以外的组分。基质常常对分析物的分析过程有显著的干扰，并影响分析结果的准确性。例如，溶液的离子强度会对分析物活度系数有影响，这些影响和干扰被称为基质效应（matrix effect）。去除方法 目前最常用的去除基质效应的方法是，通过已知分析物浓度的标准样品，同时尽
藉由生物标记可诊断阿兹海默症
印度研究人员发现藉由1种新生物标记来诊断阿兹海默症的临床证据，借以排除侵入性的诊断程序。研究成果将发表在“生物精神医学”期刊。 新生物标记“谷胱甘(月太)”（Glutathione）是1种可保护脑部免于受损的天然抗氧化物质。印度国立脑科研究中心（National Brain Research
蛋白质的生物合成标记实验（二）
实验材料细胞试剂、试剂盒PBS甲硫氨酸仪器、耗材培养箱离心机实验步骤1. 在100 mm 直径的培养皿上培养贴壁细胞（0.5~2×107）至70%~90%汇片，吸去培养液，用10 ml 于37℃短时间标记培养基轻轻搖晃冼两次细胞。2. 加入5 ml 于37℃短时间标记培养基，在5%CO2的加湿培
血流感染相关生物标记物的临床应用
血流感染是临床医生高度关注的严重疾病。由于其治疗涉及大量抗生素的应用，而细菌耐药性的问题又日趋严峻，因此，血流感染的快速诊断和预后评估需要更有效而可靠的方法。血培养、细菌鉴定和药敏试验是败血症诊治中不可替代的检测方法。血流感染时机体会对细菌内毒素产生免疫反应。自身免疫反应刺激巨噬细胞分泌肿瘤坏死因子
Nature综述：动态生物标记预测免疫疗法应答人群？
【新闻事件】：日前《自然药物发现》杂志发表一篇文章讨论如何寻找预测免疫疗法应答人群的文章。这篇文章认为现在使用的所谓静态生物标记如PD-L1、变异负担、新抗原表达等难以预测免疫疗法应答，因为对于免疫系统这样复杂的体系来说微小的起始差异可能造成巨大的免疫应答差异。比如试验动物虽然基因背景一样、年龄
科学家用生物标记预测老年痴呆
图片来源：National Geographic Creative 本报讯 近日，研究人员报告了能够预测大脑中β-淀粉样蛋白沉积物（阿尔兹海默氏症的最早期病理特征）的血浆生物标志物。这些发现展示了血浆生物标志物在预测个体大脑中的β-淀粉样蛋白状态的潜在临床应用。然而，在被广泛应用于临床之前，还需要
－生物标记物市场到2018年将增长18.5％
生物标记物现在已经成为诊断领域和疾病研究领域不可或缺的工具，这也促进了这一市场的蓬勃发展。调查显示，到2018年生物标记物市场总额将增长到408 亿美元的规模，比2013年增长18.5%。随着检测技术的进步以及对生物标记物研究的重视，新型生物标记物的研发项目越来越多，同时FDA对新型生物标记
生物分子相互作用无标记溶液内研究
采用标准 测量类型:亲和力（KD）测量类型:焓∆H测量类型:熵 ∆S测量类型:化学计量（n）样品量:280µL样品池容积:200µLInjection syringe volume:40µLInjection volume precision:
Nature综述：动态生物标记预测免疫疗法应答人群？
【新闻事件】：日前《自然药物发现》杂志发表一篇文章讨论如何寻找预测免疫疗法应答人群的文章。这篇文章认为现在使用的所谓静态生物标记如PD-L1、变异负担、新抗原表达等难以预测免疫疗法应答，因为对于免疫系统这样复杂的体系来说微小的起始差异可能造成巨大的免疫应答差异。比如试验动物虽然基因背景一样、年龄
蛋白质的生物合成标记实验（一）
甲硫氨酸短时间标记悬液中的细胞生物按照从脱氧核糖核酸 (DNA)转录得到的信使核糖核酸（mRNA）上的遗传信息合成蛋白质的过程。由于mRNA上的遗传信息是以密码（见遗传密码）形式存在的，只有合成为蛋白质才能表达出生物性状，因此将蛋白质生物合成比拟为转译或翻译。实验材料蛋白质试剂、试剂盒甲硫氨酸PBS
生物化学标记的基本内容介绍
生化遗传标记(Biochemical Genetic Markers )是以动物体内的某些生化性状为遗传标记，主要指血型、血清蛋白及同工酶。 20世纪60年代以来，蛋白电泳技术作为检测遗传特性的一种主要方法得到了广泛的应用。蛋白电泳所检测的主要是血浆和血细胞中可溶性蛋白和同工酶中氨基酸的变化，通
心血管生物学标记物与POCT
在第25届长城国际心脏病学会议上，卫计委北京医院急诊科张新超教授讲解了常见心血管生物学标记物以及生物学标记物即时检测的临床意义和临床价值。 一、何为理想的生物学标记物？ 理想的反应急性组织损伤或功能变化的生物学标记物应该具有以下特点： （1）高度的特异性； （2）高度的敏
抗体的生物素化标记的方法介绍
本法可使抗体或其它蛋白质的ε-氨基通过手臂与酰化的生物素共价结合。其后，生物素化的分子可应用酶标-亲和素或荧光染料-链霉亲和素复合物来检测。小分子的水溶性生物素对细菌蛋白链霉亲和素具有高度亲和力是本法的设计基础。NHSB：N-羟基琥珀酰亚胺生物素（有商品供应）0.1 mol/L 碳酸氢钠缓冲液，pH
生物化学标记的概念和方法特点
生化遗传标记(Biochemical Genetic Markers )是以动物体内的某些生化性状为遗传标记，主要指血型、血清蛋白及同工酶。 20世纪60年代以来，蛋白电泳技术作为检测遗传特性的一种主要方法得到了广泛的应用。蛋白电泳所检测的主要是血浆和血细胞中可溶性蛋白和同工酶中氨基酸的变化，通过对