cDNA浓度的测定

理论上讲,等质量是必要的。但是就反转录结果而言,里面的成分太多,测量浓度的误差比较大。我们实验室一般都是测量RNA的浓度,然后取等量RNA、过量oligodT做充分反转录,再取等量反转录体系做PCR。另外,我看你用条带定量?这样很不准确,因为你也不知道PCR多少循环后达到饱和。比方说,组间差8倍,差异很明显了,但也不过就差3个循环而已。你说减少了PCR循环数,但是也不能保证减少到合适的程度。一组在10个循环饱和,一个在13个循环饱和,你从20个循环减少到15个循环,条带还是一样亮。强烈建议做Real-timePCR,用实时定量曲线去看组间有没有变化,这样就没有循环数的问题了。另外,由于内参的存在,也就没有cDNA浓度问题了。......阅读全文

cDNA的筛选3

免疫学染色1.为了洗去顶层琼脂上的残余物和细胞碎片,将硝酸纤维素滤膜一次最多5张转移放在摇床上的盘子(10×10cm)内,用25ml TBS室温洗涤10 min 2次。2.然后滤膜用25ml封闭缓冲液(每张90mm直径的滤膜至少15ml)于室温温育 30min,以封闭滤膜上的非特异性结合位点。不断晃

cDNA克隆的定义

中文名称cDNA克隆英文名称cDNA cloning定  义从基因的转录产物(如mRNA)开始,逆转录合成互补DNA(cDNA),然后重组入载体,经过复制,筛选得到单一种cDNA分子的技术。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

cDNA合成技术1

Promega公司的RibocloneR M-MLV(H- ) cDNA合成系统采用M-MLV反转录酶的RNase H缺失突变株取代AMV反转录酶,使合成的cDNA更长。该系统的第一链合成使用M-MLV反转录酶,cDNA第二链合成采用置换合成法,采用 RNaseH和DNA聚合酶Ⅰ进行置换合成

cDNA克隆的概念

cDNA克隆( cDNA cloing)与RNA互补的双链DNA片段,而且它能携在克隆载体中。通常用于克隆真核生物mRNA的DNA拷贝。由于cDNA持贝是一个成熟的信息分子拷贝,因此,无内含子顺序。如果在其克隆的藏体中连上一个适当的活动子序,它可在任何宿主体内得以迅速表达

cDNA能存放多久

不要反复冻融就没有太大影响,可以放在-70度长期保存。

cDNA合成技术2

3. 第一链产量测定第一链掺入率(%)= 掺入cpm/总cpm ×100%掺入dNTP(nmol)=2nmol dNTP/μl ×反应体积(μl)×(第一链掺入率)设330为每mol dNTP的平均分子量合成cDNA量(ng)=掺入dNTP (nmol)×330ng/nmolmRNA向cDNA转变率

cDNA浓度的测定

理论上讲,等质量是必要的。但是就反转录结果而言,里面的成分太多,测量浓度的误差比较大。我们实验室一般都是测量RNA的浓度,然后取等量RNA、过量oligodT做充分反转录,再取等量反转录体系做PCR。另外,我看你用条带定量?这样很不准确,因为你也不知道PCR多少循环后达到饱和。比方说,组间差8倍,差

cDNA能存放多久

不要反复冻融就没有太大影响,可以放在-70度长期保存。

cDNA-文库的构建

            实验材料 λ噬菌体臂 大肠杆菌菌株 用于λ噬菌体的包装抽提物 试剂、试剂盒 放线菌素 D

cDNA浓度的测定

理论上讲,等质量是必要的。但是就反转录结果而言,里面的成分太多,测量浓度的误差比较大。我们实验室一般都是测量RNA的浓度,然后取等量RNA、过量oligodT做充分反转录,再取等量反转录体系做PCR。另外,我看你用条带定量?这样很不准确,因为你也不知道PCR多少循环后达到饱和。比方说,组间差8倍,差

Differential-cDNA-Screening-Procedures

Differential cDNA Screening ProceduresThe protocols listed refer to cDNA library construction and preliminary differential screening procedures. They

cDNA合成技术3

2. 电泳分析(1) 用50mM NaCl, 1mM EDTA制备1.4%的碱性琼脂糖电泳, 并置碱性电泳缓冲液中30分钟。(2) 取样品液, 用TE调整体积, 使第一链和第二链产率测定液的体积相同,加入等体积的2×样品缓冲液(20mmol/L NaOH, 20%甘油,0.025%溴粉兰)。(3)

cDNA-文库的构建

此经典方案建立在 Gubler-Hoffman 法(Gulber-Hoffman 1983) 之上,分为六个阶段。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。实验材料λ噬菌体臂大肠杆菌菌株用于λ噬菌体的包装抽提物试剂、试剂盒放线菌素 D二硫苏糖醇EDTATris-ClMgCl2反转录酶

cDNA文库组标准流程五:cDNA双链和载体的连接

1.连接:根据载体和cDNA的电泳定量结果,每个样品设置3个比例的连接,即:insert/vector=1/3  incert/vector=1/1   insert/vector=3/1按以下体系依次加入:      ddH2O                      xulT4 ligase

cDNA-文库的构建2

阶段 3:cDNA 的甲基化 材料 缓冲液和溶液 将贮存液稀释到合适浓度。 氯仿 10XEcoRⅠ 缓冲液 1XEcoRⅠ 甲基化酶缓冲液(选用) 如希望,可替代步骤 1 中的 Tris-HCl,NaCl 和 EDTA。 EDTA(0.5mol/L,pH8.0) 乙醇 MgCl2(

cDNA文库的构建3

接头-衔接子与cDNA的连接8.将下列试剂加入到已削成平末端的DNA中:10×T4噬菌体DNA聚合酶修复缓冲液 2μl800~1000 ng 的磷酸化接头或衔接子 2μlT4噬菌体DNA连接酶(105 Weiss单位/ml) 1μl10 mmol/L ATP 2μl混匀后,在16℃温育8~12h。9

cDNA文库的构建2

10. Sephadex G-50用含有10 mmol/L NaCl的TE(pH7.6)溶液进行平衡,然后通过离子柱层析将未掺入的dNTP和 cDNA分开。11. 加入0.1倍体积的3mol/L乙酸钠(pH5.2)和2倍体积的乙醇,沉淀柱层析洗脱下来的cDNA,将样品置于冰上至少15分钟,然后在微量

cDNA-扩增和影印实验

实验方法原理 实验材料 保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列试剂、试剂盒 LB 培养基超级肉汤培养基乙醇裂解液RNA 酶溶液缓冲液乙醇 乙酸溶液丁二酸酐1-甲基-2-吡咯烷酮硼酸钠仪器、耗材 离心机96 孔热循环仪水浴锅微量滴定板清洗仪实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具

Experimental-Protocol-for-cDNA-Library-Construction

Experimental Protocol for cDNA Library ConstructionIdentify appropriate celltype over-expressing corresponding gene.Find out if transcription can be s

锚定酶消化cDNA实验

            试剂、试剂盒 溶液与缓冲液 引物 仪器、耗材 试剂盒 MPC-E PCR仪

制备cDNA的基本介绍

  制备互补DNA,往往需要先分离从目的基因转录来的mRNA.如果该基因编码的蛋白质是细胞中的主要蛋白质,则此基因的产物是总mRNA的主要组成部分 [2] 。就胰岛B细胞而论,此细胞含有高水平胰岛素前体mRNA,后者有时可以沉淀正在翻译的mRNA的核糖核蛋白体,如果用特异抗体结合所表达的蛋白质(抗原

cDNA文库的物化方法

  基因工程初始阶段所用的方法,已不用。利用核酸双螺旋之间存在着碱基G C,A T配对特性,分离目的基因。  例如:海胆rDNA分子内其G C含量可以达63%(其稳定性高,溶解温度高),通过热变性和S1酶解处理可得到提纯50倍的rDNA,最后经氯化铯平衡梯度离心,得到相对分子量为1.9X107Dal

cDNA-文库的构建(二)

7. 尽可能快地进行 cDNA 合成的下一步骤阶段 2:cDNA 第二链的合成材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿EDTA(0.5mol/LpH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)(NH4)2SO4(1mol/L)将 1.3 g 固体硫酸铵溶解于终体积为 10 ml 的水中,溶液经滤膜过滤

关于cDNA文库的简介

  cDNA文库(cDNA library):是指某生物某一发育时期所转录的mRNA全部经反转录形成的cDNA片段与某种载体连接而形成的克隆的集合。  cDNA文库是以特定的组织或细胞mRNA为模板,逆转录形成的互补DNA(cDNA)与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌形成重组DNA

cDNA的制备与检测

[实验原理]总RNA,经寡聚(d丁)纤维素亲和层析柱分离出mRNA,以寡聚(d丁)为引物,经反转录合成双链cDNA。先用反转录酶合成第一条cDNA链;经碱降解作用除去RNA模板后用大肠杆菌DNA聚合酶,以第一条链cDNA的3’末端结构为引物合成第二链,最后形成双链cDNA。[仪器、材料与试剂](一)

cDNA-探针的制备方法

首先需分离纯化相应mRNA,这从含有大量mRNA的组织、细胞中比较容易做到,如从造血细胞中制备α或β珠蛋白mRNA。有了mRNA作模板后,在逆转录酶的作用下,就可以合成与之互补的DNA(即cDNA),cDNA与待测基因的编码区有完全相同的碱基顺序,但内含子已在加工过程中切除。

cDNA-扩增和影印实验

实验材料保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列试剂、试剂盒LB 培养基超级肉汤培养基乙醇裂解液RNA 酶溶液缓冲液乙醇 乙酸溶液丁二酸酐1-甲基-2-吡咯烷酮硼酸钠仪器、耗材离心机96 孔热循环仪水浴锅微量滴定板清洗仪实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 将密

锚定酶消化cDNA实验

试剂、试剂盒 溶液与缓冲液引物仪器、耗材 试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤 实验方案 A1.通过加入下列物质来消化双链 cDNA2.在 37°C 下消化 lh。3.65°C 孵育 20 min 热失活限制性酶。4.等体积 PCI 抽提后乙醇沉淀(实验方案 A, 第

锚定酶消化cDNA实验

试剂、试剂盒溶液与缓冲液引物仪器、耗材试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤实验方案 A1.通过加入下列物质来消化双链 cDNA2.在 37°C 下消化 lh。3.65°C 孵育 20 min 热失活限制性酶。4.等体积 PCI 抽提后乙醇沉淀(实验方案 A, 第 2 步

cDNA-文库的构建(三)

阶段 3:cDNA 的甲基化材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿10XEcoRⅠ 缓冲液1XEcoRⅠ 甲基化酶缓冲液(选用)如希望,可替代步骤 1 中的 Tris-HCl,NaCl 和 EDTA。EDTA(0.5mol/L,pH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)NaCl(5mol/L)