北京生科院最新研究进展
4月12日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》（Nature Protocols）上，发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文，建立了环形RNA全长转录本解析和高效挖掘的技术体系。 近年的研究表明，环形RNA在真核生物体内具有广泛的生物学功能。环形RNA序列与线性RNA相似度高，因此如何高效鉴定环形RNA特有的外显子结构，是环形RNA研究中的重要问题。针对这一问题，赵方庆团队前期提出了CIRI-AS算法（基于BSJ读段对比结果对环形RNA内部可变剪接结构进行识别）。后续研究开发了CIRI-full算法（通过识别双端250bp测序数据中反向重叠区特征，对500bp以内的环形RNA进行全长重构）。由于上述方法主要基于短读长测序技术，难以对长度500bp以上的环形RNA的全长......阅读全文
RNA点线杂交
RNA点线杂交（Dot and Slot blotting）· RNA dot blot and slot blot (Beverly Faulkner-Jones)This methods allows the rapid analysis of numerous small sa
RNA微注射
· RNA Injection (Hoshi Lab)The oocyte is a useful model for the investigation of the function of usr/localious genes and is a widely used syst
RNA的制备
来源于任何细胞的RNA都可以通过反转录酶的作用拷贝成双链DNA并克隆化，获得相应的于特定细胞来源的cDNA文库。因此，RNA制备的意义有两个方面 * 获得特定细胞来源的cDNA文库，克隆目的基因 * 分析基因的表达，阐明基因调控的特性，了解从基因转录产生RNA的结构，数量，水平及合成的速率抑制RNA
RNA－反转录
实验材料 poly(A)+RNA 反转录酶 鼠源反转酶 或禽源反转录酶 试剂、试剂盒 oligo
RNA－Isolation－Protocol
RNA Isolation Protocol(Revised 5-15-2003)Stabilize RNAStart with 15 ml E. coli Culture containing 7.5* 109 cells (OD600= 0.2 Dilute cells or scale up)
RNA－gel－electrophoresis
MaterialsDEPC H2ODEPC 0.1% (v/v)q.s. de-ioinized H2O37ºC x1 hr, or r.t. overnightAutoclave.(NaOAc, EDTA and ethidium bromide solutions should also be
RNA点杂交
RNA点杂交1） 纯化的RNA的点杂交和狭线杂交安装印迹装置1．切一张合适大小的带正电荷尼龙膜。用铅笔标上表示方向的记号。用水把膜简单弄湿，在20×SSC中室温泡1 h。2．在膜浸泡期间，先用0.1 mol/L NaOH小心清洗印迹装置，再用无菌水洗干净。3．把两片厚滤纸用20×SSC浸湿，再放到
RNA－Immunoprecipita...
实验概要Interest in RNA-protein interactions is booming as we begin to appreciate the role of RNA, not just in well-established processes such as tran
Reverse－Transcription－of－RNA
实验概要The purpose of Reverse transcription of RNA is acquiring cDNA for follow research.实验原理Reverse Transcription (RT reaction) is a process in which s
DNA－and－RNA－EXTRACTIONS
A protocol / method / schedule /procedure for extraction / isolation of both DNA and RNA from the same material typically plant leaf / leaves(See also
RNA干涉实验
化学合成siRNA分子实验 体外转录合成siRNA分子实验 采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子 采用RNaseⅢ制备siRNA分子实验 实验方法
前信使RNA
中文名称前信使RNA英文名称pre-messenger RNA;pre-mRNA;precursor mRNA定 义未经剪接加工的基因转录产物。即初级转录物。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
RNA的提取
【实验原理】Trizol 试剂是直接从细胞或组织中提取总RNA 的试剂。它在破碎和溶解细胞时能保持RNA 的完整性。加入氯仿后离心，样品分成水样层和有机层。RNA存在于水样层中。收集上面的的水样层后，RNA 可以通过异丙醇沉淀获得。【实验仪器】1. 匀浆机2. 低温离心机3. 涡旋器【试剂及配制】1
RNA病毒介绍
RNA是核糖核酸，single-stranded是单链。一般看脱氧核糖核酸（DNA）的图片都是有两条链扭在一起，而核糖核酸一般都是单链的。讲到ssRNA，一般都是在说RNA病毒。一般来说生物学家是根据RNA能否直接起mRNA作用而分成正链ssRNA病毒与负链ssRNA病毒两种。(1)正链RNA病毒（
实质等同性（转录组学）实验（五）
3.13 实时 RT- PCR 验证转录组数据有两种常用的基因（扩增子）定量检测方法：基因特异荧光探针（如 TaqMan chemistry) 或者特异双链 DNA 结合试剂（SYBR green chemistry ) [22]。我们通过实时 RT-PCR，选择 SYBR green che
真核细胞总RNA的制备（Total－RNA－Isolation）1
从细胞中分离RNA的纯度于完整性对于许多分子生物学实验至关重要。如Northern印迹与杂交分析、寡聚（dT）纤维素选择分离 mRNA，cDNA合成及体外翻译等实验的成败，在很大程度上决定于RNA的质量。RNA分离的最关键因素是尽量减少RNA酶的污染。快速一步法提取总RNA组织及有核细胞在匀浆过程中
从果蝇胚胎中提取总－RNA－或－poIy(A)－+RNA
试剂、试剂盒 0.lmol LNaOH 乙醇 3mol L 乙酸钠 苯酚 无 SDS 的结合缓冲液 含 SDS 的结合缓冲液 TE 缓冲液 SEVAG 漂白剂（Bleach) 含 MgCl2 的 PBS(pH7.2) 果蝇勻浆缓冲液实验步骤 一 材料与设备1)0.lmol/LNaOH2)70%(V/
从果蝇胚胎中提取总－RNA－或－poIy(A)－+RNA
试剂、试剂盒 0.lmol LNaOH 乙醇 3mol L 乙酸钠 苯酚 无 SDS 的结合缓冲液 含 SDS 的结合缓冲
真核细胞总RNA的制备（Total－RNA－Isolation）2
Total RNA Isolation Guanidine-based isolation Objective: To obtain total RNA from zebrafish embryos. Required Materials Denaturing Solution
普通PCR－梯度PCR－荧光定量PCR仪的区别及运用
PCR：即合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)，利用DNA在体外95℃时解旋（变性），55℃时引物与单链按碱基互补配对的原则结合（退火），再调温度至72℃左右，DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链（延伸）。PCR仪实际就是一个温控设
PCR,RTPCR,实时荧光定量PCR的区别与联系
1、所说的PCR应该就是最常规的PCR，以DNA为模板，通过上下游引物，实现DNA的扩增。2、RT-PCR一般情况下是指反转录PCR（reverse transcription），尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也（realtime fluores-cence quantitative PCR）也
普通PCR－梯度PCR－荧光定量PCR仪的区别及运用
PCR：即合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)，利用DNA在体外95℃时解旋（变性），55℃时引物与单链按碱基互补配对的原则结合（退火），再调温度至72℃左右，DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链（延伸）。PCR仪实际就是一个温控
普通－PCR、实时荧光定量－PCR－和数字－PCR－对比分析
提起 PCR，在生物及其相关行业内可谓如雷贯耳，无人不知无人不晓，其影响之深，应用之广可见一斑。 1985 年，美国 PE-Cetus 公司的 Mullis 等人发明了聚合酶链反应（PCR），实现了在试管中模拟细胞内的 DNA 复制。然而，采用 E-coli DNA 聚合酶进行 PCR，由
PCR,RTPCR,实时荧光定量PCR的区别与联系
1、所说的PCR应该就是最常规的PCR，以DNA为模板，通过上下游引物，实现DNA的扩增。2、RT-PCR一般情况下是指反转录PCR（reverse transcription），尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也（realtime fluores-cence quantitative PCR）也
普通PCR、实时荧光定量PCR、数字PCR技术的功能区别
一、普通PCR技术 KARY MULLIS （1944.12.28-2019.8.7） Kary Mullis于1983年发明了聚合酶链式反应法（polymerase chain reaction ，PCR），据说是载着女友开车的时候，忽然灵光一闪，想到了PCR原理（论开车的好处）
普通－PCR、实时荧光定量－PCR－和数字－PCR－对比分析
提起 PCR，在生物及其相关行业内可谓如雷贯耳，无人不知无人不晓，其影响之深，应用之广可见一斑。 1985 年，美国 PE-Cetus 公司的 Mullis 等人发明了聚合酶链反应（PCR），实现了在试管中模拟细胞内的 DNA 复制。然而，采用 E-coli DNA 聚合酶进行 PCR，由于
美开发出基于热映像的图像分割算法
美国普渡大学的研究人员开发出一种基于热映像的计算机图像分割算法，可使计算机迅速识别出物体的外形，即便其发生扭曲或轻度变形也不会受到影响。该技术将使机器视觉与人类视觉更加接近，可广泛应用于图像搜索、医疗影像以及无人机制造等多个领域。详细研究结果将分为两篇论文，在6月21日至23日举行的IEEE(美
数字地形分析并行算法设计方面取得进展
数字地形分析算法常具有数据-计算密集型特点，一方面算法步骤常涉及迭代、递归等高复杂度的计算，另一方面其应用经常需面对大区域、高分辨率的大规模栅格数字高程模型(DEM)数据。在这种情况下，传统以串行方式实现的数字地形分析算法以分钟、小时、乃至以天计的运行时间，显然难以满足用户的时间响应需求，因此迫
新计算机算法可辨别声音环境方向
假如把你蒙住眼睛放在一个陌生房间里，你打个响指听听动静，能否听出房间是什么形状格局?蝙蝠和海豚能用这种回声定位法在环境中辨别方向，有些盲人也能做到这一点。而据物理学家组织网6月18日报道，瑞士联邦理工学院视听通讯实验室(LCAV)科学家设计出一种计算机算法，通过分析来自4个麦克的声音，同样能完成
AI新算法测寿命－或能助人类更长寿
据英国每日邮报报道，一项新的研究表明，利用AI技术可以检测人的细胞年龄，并依此制定出个性化医疗方案，从而帮助人们实现长寿的愿望。 据悉，科学家开发的这种AI算法被称为“Aging.AI”，根据人们的血液样本可以计算出生理年龄，并验证某些生活方式的改变和药物是否能提高人们长寿和健康的几率。目