北京生科院最新研究进展
4月12日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》（Nature Protocols）上，发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文，建立了环形RNA全长转录本解析和高效挖掘的技术体系。 近年的研究表明，环形RNA在真核生物体内具有广泛的生物学功能。环形RNA序列与线性RNA相似度高，因此如何高效鉴定环形RNA特有的外显子结构，是环形RNA研究中的重要问题。针对这一问题，赵方庆团队前期提出了CIRI-AS算法（基于BSJ读段对比结果对环形RNA内部可变剪接结构进行识别）。后续研究开发了CIRI-full算法（通过识别双端250bp测序数据中反向重叠区特征，对500bp以内的环形RNA进行全长重构）。由于上述方法主要基于短读长测序技术，难以对长度500bp以上的环形RNA的全长......阅读全文
逆转录PCR(RTPCR)扩增基因特异片段
逆转录PCR(RT-PCR)扩增基因特异片段 一、实验原理RT-PCR是将RNA的反转录（RT）和cDNA的聚合酶链式扩增（PCR）相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA，再以cDNA为模板，扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛，可用于检测细胞中基因表达水平，细胞中R
PCR步骤
1、 DNA变性（90℃-96℃）：双链DNA模板在热作用下， 氢键断裂，形成单链DNA。2、退火（25℃-65℃）：系统温度降低，引物与DNA模板结合，形成局部双链。3、延伸（70℃-75℃）：在Taq酶（在72℃左右，活性最佳）的作用下，以dNTP为原料，从引物的5′端→3′端延伸，合成与模板互
Colony－PCR
Colony PCRDavid AmbergThis procedure will work for both yeast and E. coli:Take a small colony and suspend it in 5ul of H2O in a PCR tube. Heat for 5 m
实时－PCR
试剂、试剂盒 cDNA 样品rRNA 引物和探针目的基因的引物和探针Tag Man Universal PCR Master Mix 超纯水仪器、耗材 序列监测仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂来自方案 5 的 cDNA 样品20X18SrRNA 引物和探针（AppliedBiosyste
PCR－原理
PCR技术的诞生得益于DNA双螺旋结构、DNA的半保留复制模式与碱基互补配对原则的解析，其基本原理是在体外模拟DNA的天然复制过程，主要由‘变性-退火-延伸’这三个基本步骤构成.
PCR技术
PCR常见问题总汇 PCR产物的电泳检测时间 一般为48h以内，有些最好于当日电泳检测，大于48h后带型不规则甚致消失。 假阴性，不出现扩增条带 PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备，②引物的质量与特异性，③酶的质量及， ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。 模板：①模
PCR引物
PCR Primer Design and Reaction Optimization (Molecular Biology Techniques Manual) PCR Primer Design (Newman Lab) PCR Primer Design (Eppendorf)Detail
原位PCR
实验概要原位PCR技术自上世纪90年代初建立至今，科学家就一直对原位PCR的技术和应用进行研究，目前该项技术已日臻完善。原位PCR既能分辨带有靶序列的细胞又能标出靶序列在细胞内的位置，在分子和细胞水平上研究疾病的发病机理、临床过程以及病理的转归，其特异性和敏感性均高于一般PCR技术。在病毒学、病理学
PCR技术
PCR技术www.runwelltac.comPCR技术的基本原理与操作流程聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction，PCR）是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法，为zui常用的分子生物学技术之一。典型的PCR由（1）高温变性模板；（2）引物与模板退火；（3）引物沿
菌落PCR
菌落PCR可用于：（1）重组体的筛选；（2）重组体DNA测序分析。实验方法原理直接挑取菌落进行PCR，PCR的95℃加热可以破胞，释放基因组DNA或质粒，成为PCR体系的模板，然后进行链式扩增。实验材料菌落样品试剂、试剂盒dNTPPCR混合液仪器、耗材PCR仪实验步骤1. PCR混合液的制备（1）
PCR仪
简单的说，PCR就是利用DNA聚合酶对特定基因做体外或试管内In Vitro的大量合成，基本上它是利用DNA聚合酶进行专一性的连锁复制。目前常用的技术，可以将一段基因复制为原来的一百亿至一千亿倍。根据DNA扩增的目的和检测的标准，可以将PCR仪分为普通PCR仪，梯度PCR仪，原位PCR仪，实时荧光定
菌落PCR
实验方法原理 直接挑取菌落进行PCR，PCR的95℃加热可以破胞，释放基因组DNA或质粒，成为PCR体系的模板，然后进行链式扩增。实验材料 基因样品试剂、试剂盒 dNTPPCR混合液仪器、耗材 PCR仪实验步骤 1. PCR混合液的制备（1）Taq buffer（10×） 180 ul（2）dNT
免疫PCR
免疫PCR 实验方法原理 主要由两个部分组成，第一部分的免疫反应类似于普通的酶联免疫吸附试验（ELISA）的测定过程；第二部分即通常的PCR检测，抗原分子的量
实时－PCR
试剂、试剂盒 cDNA 样品 rRNA 引物和探针 目的基因的引物和探针 Tag Man Universal PCR Master Mix 超纯水
PCR引物
PCR Primer Design and Reaction Optimization (Molecular Biology Techniques Manual) PCR Primer Design (Newman Lab) PCR Primer Design (Eppendorf)Detail
Long－PCR
Two long PCR steps:First round of the nested PCR step of the end point dilution procedure to quantitate the cDNA.First round of the nested PCR step of
实时－PCR
一旦 RNA 收集纯化完成，可以采用对不同的细胞质或核糖体 RNA 专一的商业化的实时 PCR 试剂盒，以组成型的 rRNA 为标准对所有资料进行标定。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。试剂、试剂盒cDNA 样品rRNA 引物和探针目的基因的引物和探针Tag Man Un
PCR技术
1 导论 多聚酶链式反应（Polymerase Chain Reaction, PCR）是美国Perkin-Elmer/Cetus公司人类遗传研究室Mullis K. B.等人于1985年发明的一种快速体外DNA片段扩增技术，是八十年代分子生物学资源领域的一项革命性突破，被誉为分子生物学资源发展史上
定量PCR
定量PCR可以用于：（1）以外参或内参为标准，通过对PCR终产物的分析或PCR过程的监测，进行PCR起始模板量的定量；（2）用外标法（荧光杂交探针保证特异性）通过监测PCR过程（监测扩增效率）达到精确定量起始模板数的目的，同时以内对照有效排除假阴性结果（扩增效率为零）。实验方法原理定量PCR（即时聚
标准PCR
· What's PCR? (Michael Blaber's Lab)Illustrated introduction to usr/localious aspects of PCR technique. It's very valuable not onl
定量PCR
实验方法原理 定量PCR（即时聚合酶链锁反应，Real-time Polymerase Chain Reaction，简称 Real-time PCR、即时PCR），又称定量即时聚合酶链锁反应（Quantitative real time
简并PCR
简并PCR就是引物合成的时候在某个位置用两种以上的碱基代替原来的单碱基渗入oligo链合成的是一堆混和物实际上能够起做用的在其中占一定比例这个比例一般用简并度表示比如agctN合成的时候最后一位用4种碱基反应真正用的agctc，占总数的1/4agctNN其中agctCC就占1/16一般公司推荐3‘端
Inverse－PCR
Genomic DNA Prepfrom 5 ml culture, resuspend in 50 µl TEDigestionsUse either AciI, AluI, HaeIII, HpaII, RsaI or TaqI for Leu transposon libraries37 de
反向PCR
实验方法原理 标准 PCR 技术应用于定位在两个引物之间（指向内部）的一段 DNA 片段的扩增。与此相反，反向 PCR (inverse PCR) 应用于扩增和克隆与已知 DNA 序列某一个末端相邻的侧翼的未知 DNA 序列，这种未知序列没有引物可以利用。该项技术由几个研究小组开发（Ochm
原位PCR
About in situ PCR (Applied Biosystems)Basic information about in situ PCR and its applications.The In Situ PCR: Amplification and Detection in a Cellu
PCR技术
实验方法原理 PCR是在模板DNA、引物和dNTPs的存在下依赖于DNA聚合酶的酶促反应。PCR技术的特异性取决于引物和模板结合的特异性。反应分为变性、退火、延伸三步，经过一定的循环，介于两个引物之间的特异DNA片段得到大量扩增。
降落PCR
基本方案 实验方法原理 基于PCR原理三步骤而设置变性-退火-延伸三个温度点。在标准反应中采用三温度点法，双链DNA在90～95℃变性，再迅速冷却至40
反向PCR
标准 PCR 技术应用于定位在两个引物之间（指向内部）的一段 DNA 片段的扩增。与此相反，反向 PCR (inverse PCR) 应用于扩增和克隆与已知 DNA 序列某一个末端相邻的侧翼的未知 DNA 序列，这种未知序列没有引物可以利用。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原
反向PCR
实验方法原理 标准 PCR 技术应用于定位在两个引物之间（指向内部）的一段 DNA 片段的扩增。与此相反，反向 PCR (inverse PCR) 应用于扩增和克隆与已知 DNA 序列某一个末端相邻的侧翼的未知 DNA 序列，这种未知
Degenerate－PCR
Degenerate PCR is in most respects identical to ordinary PCR, but with one major difference. Instead of using specific PCR primers with a given sequen