解析古老的单细胞基因组
单细胞的古细菌用肉眼根本看不到,甚至在使用显微镜时,也必须特别用心才能观察到它们。近日由丹麦奥尔胡斯大学地质微生物学中心领导的一个国际研究人员小组,却成功地从海底淤泥中获得了四个古细菌细胞,并绘制出了每个细胞的基因组图谱。这一突破性研究成果发表在著名的《自然》(Nature)杂志上。 “直到现在,也没有人知道这些广泛居住在泥浆中的古细菌事实上是如何生存的。绘制出四个古细菌细胞的基因组,显示它们都具有一些基因,使得它们能够依靠蛋白质降解存活,”论文的主要作者、田纳西大学Karen Lloyd教授说。 科学家们从前认为,在海洋中只有细菌才分解蛋白质,现在证实古细菌是海底蛋白质降解的重要的新生物。蛋白质实际上构成了海底大部分的有机物质,由于海底具有世界上最大的有机碳沉积区,古细菌因而似乎在全球碳循环中发挥了从前未知的重要作用。 就像海滩上的一粒沙子 古细菌是世界上最丰富的一些生物,但很少有人听说过它们。......阅读全文
北京基因组所开发新型高通量单细胞多组学新技术
单细胞测序已成为生物医学领域的关键共性技术。然而,由于缺乏高效的手段降低“假单细胞率”,主流微流控平台的单通道细胞通量通常在1万细胞以下,空载率达到90%以上,且成本高昂,限制了对数百万个细胞或上千例样本的人群队列进行大规模研究。 近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)蒋岚研究组
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法,使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》(Nature Methods)上的实验方案,可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速,被广泛用于研究细胞间的基因表达谱(转录组)
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
PerkinElmer以0.28美元/股现金收购单细胞基因组学公司RHS
分析测试百科网讯 近日,据外媒报道,PerkinElmer同意支付约1980万美元现金(每股0.28美元)收购澳大利亚细胞基因组学公司RHS Ltd,这项决议得到了RHS公司全体董事会的支持。 RHS董事长David Brookes说:“PKI提案受到了董事会的欢迎,作为奖励股东忠诚度并在重要
北京大学Cell发布突破性单细胞基因组检测技术
全球有多达15%的夫妇受到不孕不育的影响,体外受精(IVF)是治疗这种常见疾病的一种方法。在发表于12月19日的《Cell》杂志上的一项新研究中,北京大学的研究人员报道了一项安全、准确且廉价的方法,可为IVF程序选择出基因正常的胚胎,因此提高了一对夫妇生育健康孩子的机会。 通过对单个的卵细
Nature-Genetics:单细胞全基因组DNA甲基化组新发现
北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心,北大生命科学学院与第三医院等处的研究人员发表了题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章,利用单细胞DNA甲基化组高通量测序方法,首次在单细胞分辨
新型基因组学工具ECCITEseq扩展多模态单细胞分析
单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域之一。其能够帮助研究人员深入探索单细胞的特性,有效区分不同的细胞类型,并在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。随着对复杂人体组织甚至整个生物体的研究进展,研究人员越来越认识到需要大规模并行技术及数据集才能更加深入地揭示微妙的细胞状态。 近日,一种新型单
单细胞分离用于单细胞基因扩增
单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。 单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测;获得单克隆细胞;用于单细胞基因扩增,
构建单细胞癌症基因组时间序列模型,可预测乳腺癌细...
构建单细胞癌症基因组时间序列模型,可预测乳腺癌细胞克隆适应性不同生物会随着时间的推移不断进化,环境压力可促使具有某些特征的个体在群体中变得更加普遍。癌症也不例外,在不断增殖的肿瘤中,具有最佳竞争资源和抵御环境压力的癌细胞会逐渐占据主导地位。癌细胞的适应性(fitness)并不是一成不变的。在化疗药物
Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序
2018年11月,Namocell与CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞,并且将其进行单细胞测序,为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序(scRNA-s
单细胞拉曼结合靶向宏基因组揭示土壤活性抗生素耐药组
抗生素耐药性(AMR)在人类、环境和动植物间的传播,加剧全球“One Health”的负担。土壤是“One Health”的关键环节之一,所携带的抗生素耐药性可通过食物链等方式转移至人类而带来健康威胁。土壤中栖息着地球上最丰富多样的微生物,其中活性耐药菌在驱动土壤耐药性传播中具有关键作用。然而,
CloneSelect 单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法
CloneSelect™ Single-Cell Printer™ f.sight™ ( f.sight )被开发用于满足这些需求, 它可以柔和地接种单个细胞至微孔,同时记录整个细胞接种过程,提供单克隆性的图像证据以及优异的接种后细胞生长用于细胞株开发在这个研究中,我们开展了六组实验,用无血清培养基
北京基因组所单细胞中识别染色质类染色质拓扑的算法
基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中,这一高级结构即三维基因组学,对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获(3C),尤其是高通量技术(Hi-C,ChIA-PET)的发展推动了三维基因组的研究,发现了包括染色质拓扑相关结构域(TAD),染色质环等一系列层次化的结构特征。近
中国参与的人类基因组测序都完了来了解下单细胞测序
细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。 中文名 单细胞测序 外文名 Single-cell sequencing 细 胞 生物学的基本单位 实 例 多重退火 主
北大汤富酬团队首次在单细胞水平上从头组装人类基因组
基因组组装受益于具有更高准确性和更高连续性的长读长测序技术。然而,大多数人类基因组组装需要来自同质细胞系的大量 DNA,而不会保持细胞异质性,因为细胞异质性会严重影响单倍型组装结果。 2022年7月12日,北京大学汤富酬团队在Nucleic Acids Research (IF=19)在线发表
Cell惊人发现:一种单细胞生物基因组以约25万碎片形式存在
近日,《Cell》杂志上的一项研究发现,一种生活在池塘中的单细胞原生动物Oxytricha trifallax能够将自己的DNA分解成近25万份碎片,而当它们进行交配时又能够快速重装这些碎片。 参与该研究的普林斯顿大学的Laura Landweber教授说:“Oxytricha trifall
单细胞凝胶电泳法检测单细胞DNA损伤
单细胞凝胶电泳(single-cell gel eiectrophoresis,SCGE)又称慧星试验(comet assay)是一项较新的电泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于检验DNA单链断裂以来,经过不断的改进,已成为一种快速、灵敏、简便的检测DNA损伤的方法,广泛地应用
Namocell单细胞分离仪应用介绍——藻类单细胞分离
Namocell单细胞分离仪最新应用:随着人们对环境研究的不断深入,研究人员逐渐将目光转向藻类的单细胞层面:有些需要对藻类进行单细胞级别的分析(如藻类单细胞测序等),也有需要对单细胞藻类进行培养。这样就面临一个棘手的问题,那就是如何获取藻类的单个细胞。通常实验室里的方式,是在显微镜下用毛细管吸取。这
一起来了解一下单细胞全基因组的测序技术吧
单细胞全基因组测序技术是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增,获得高覆盖率的完整的基因组后进行高通量测序用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。 从方法学角度来看,获得高覆盖率高保真性的全基因组扩增产物是准确全面的测序结果的保障。多重置
单细胞是什么
单细胞既可以指单细胞生物,比如细菌等,也可以指从多细胞生命体分离的单个细胞,比如实验室培养的人体细胞等。此外,受精卵也是单细胞,属于可以发育成完整生命体的全能干细胞。
什么是单细胞
单细胞生物 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物(Protozoa)和多细胞生物(Metazoa)。单细胞生物只由单个细胞组成,个体微小,用肉眼很难看的见,大多数单细胞生物生活在水域环境中,有些寄生在我们身上。单细胞生物靠分裂繁殖(酵母菌在适宜的环境下出芽繁殖)单细胞生物包括所有古细菌和真细菌和
单细胞分离技术
单细胞测序日趋火爆的原因很大程度上得益于单细胞分离技术的不断完善。这一讲,我们将跟大家一起回顾传统的单细胞分离技术,并重点介绍单细胞分离技术的新宠微孔芯片技术及微流控技术。图1为目前常见单细胞分离设备。图1:目前常见单细胞分离设备传统单细胞分离技术相信许多实验人员,都见过下面我们要介绍的传统的单细胞
单细胞分离对单细胞测序领域有着很大的帮助
单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来,然后移到合适的培养基进行培养,分离法对操作技术有比较高的要求,多限于高度专业化的科学研究中采用。 它不仅仅可以用于分离单细胞,还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选,对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞
Namocell单细胞分离仪在单细胞测序领域的应用
9月26至27日2019年细胞产业大会暨2019第四届(上海)细胞与肿瘤医疗高峰论坛在上海新南雅酒店举行。本届会议,邀请了全国30位专家学者、人物演讲、40家企业参展,400余人报名参会,逾500人参加了会议,就细胞储存、细胞治疗、细胞培养、细胞工程、细胞银行、细胞能量与代谢、细胞免疫学、细胞生理学
单细胞分离仪在单细胞测序领域有着很大的帮助
单细胞分离仪可以实现从微孔芯片转移单细胞到细胞收集管中。单细胞转移分离系统集单细胞成像,单细胞隔离,单细胞选择功能于一体,自动聚焦成像。 转移单细胞到微管,PCR微孔板或其它反应微管中,在隔离单细胞后,它可以对选定收集的细胞进行扫描并成像,采用倒置荧光显微镜,配备自动扫描显微镜载物台,自
单细胞分离技术应用于众多领域的单细胞分析
单细胞分离目前主要有三种选择:手动分离、荧光激活细胞分选和微流体技术。当然,除了成熟的方法,巧妙的新方法也在不断涌现,能以更高的准确性和特异性来分离单细胞。 将细胞分散到悬液中,会失去它们在组织里的位置信息。如果想了解单细胞所处的环境,就需要用到激光捕获显微切割技术,这种技术通过扫描组织切片来
如何-解读-单细胞-测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
单细胞动物的简介
没有神经系统,没有反射,只有“应激性” 草履虫等单细胞动物也是自然界中降解水体中有机物的主要动力。 草履虫是研究单细胞动物最好的标本,因为它具有这类动物的全部属性。单细胞动物就是只有由一个细胞构成的生物个体,这种动物往往比较低级,如很多细菌就是单细胞生物.其他生物就比单细胞生物要高级的多,而且身
如何-解读-单细胞-测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。