“生物计算”：比超级计算机更聪明、高效、紧凑
上图 真菌可能与标准电子设备相连。图片来源：安德鲁·阿达马茨基下图 实验室培养的脑细胞可用于计算。图片来源：托马斯·哈滕/约翰斯·霍普金斯大学细菌和超级计算机有什么区别？区别是细菌更“高级”，因为它有更多的回路和更强的处理能力。所有生命都在“计算”。从响应化学信号的单个细胞，到在特定环境中航行的复杂生物体，信息处理是生命系统的核心。经过数十年的尝试，科学家终于开始收集细胞、分子甚至整个生物体，来为人类自己的目的执行计算任务。从本质上讲，计算机也只是信息处理器，而且人们越来越认识到大自然拥有丰富的这种能力。最明显的例子是复杂生物体的神经系统，它能处理来自环境的大量数据并对各种复杂的行为“下指令”。但即使是最小的细胞，也充满了复杂的生物分子通路，这些通路响应输入信号，打开和关闭基因、产生化学物质或进行自我组织。最终，生命中所有令人难以置信的壮举，都依赖于DNA存储、复制和传递遗传指令的能力。如何构建一台生物计算机？生物系统有自身的独......阅读全文
计算生物学研究所“蛋白建模”学习班举办
Juergen Schlitter教授讲课中 6月7日至11日，中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所、中科院计算生物学重点实验室举办了为期一周的“Protein Modeling” 学习班。学习班面向生科院各所研究生开放，来自全院的多名研究生参加了学习培训。 学习班由
摆脱传统硅基硬件，生物计算机不再是梦
尽管人工智能（AI）领域已经取得了显著突破，展现出了前所未有的智能水平，但它们仍然依赖于20世纪50年代奠定计算基础的硅基硬件。假如人们能够摆脱传统束缚，创造出由生物材料构成的计算机，那将会是怎样的一番景象？ 面对AI领域数据存储与耗能激增的双重挑战，一些来自学术界和商业界的研究人员未雨绸缪，
水溶液提取法测定氟生物（植物）测定质量结果计算
结果计算 W=c×r/(1-f)质量控制和质量保证(1)采用风干土提取时需测定土壤含水量。具体做法是:称1.00g风干土在烘箱中(105±2)℃下烘干8h后,将样品取出置于恒温干燥器中1h后称重,然后,将样品重新放回烘箱中(105±2)℃下再烘干1h,干燥,称重,重复上述过程,直至恒重(恒重的标准为
PPM计算
TDS就是水中溶解物质的总含量，包括钙镁离子、胶体、悬浮颗粒物、蛋白质、病毒、细菌、微生物及尸体。1、水中TDS值为2900PPM，表示水中杂质总含量为0.29%，要知道其中各杂质的含量必须用其他方法测定。2、若饮用水TDS为100PPM，表示水中杂质总含量为0.01%。TDS数值越小，也就说明水中
新工具可计算生物医学论文可重复性得分
科学界正在寻找新工具衡量已发表研究成果的可再现性，因为人们担心许多研究无法独立再现。图片来源：National Eye Institute, National Institutes of Health 1月19日公布的一个新的在线工具可通过分析已发表论文的引文数量，衡量该论文可再现性。 这个
新药如何“算出来”：上海计算生物学创新大赛结果揭晓
化合物多如牛毛，靶点信息有限，作用机制难以明确，这些使得药物发现的过程投入巨大，时间漫长。而计算生物学可以通过模拟和计算大大加快这一进程。9月9日，“2024浦江创新论坛——上海国际计算生物学创新专题论坛”举行。该论坛以“计算生物学赋能生物医药”为主题，在论坛上，2023上海国际计算生物学创新大赛公
临床生物化学实验室中计算机的应用
微处理机在临床生物化学实验室全面管理中的作用及其进展已有专著介绍。这里仅就有关实验数据的处理与报告方面的应用作一概括性的提示。 应用计算机系统处理实验数据并打印报告等具有多方面的应用，如通过编定的程序，可从大量实验数据中筛选出最有价值的数据，以提供参比；也可将原始数据进行分析、加工，做出更高层次的
计算生物学家为分析解释遗传测序数据开发平台
我们可以在现场获得可操作信息，从而让我们很快地就如何向前推进做出决策。 对于设法治疗无明显致病原因患者的医生来说，基因测序技术可能会为他们指点迷津。但大量的信息也会使其很难快速找到答案。 两三年前，位于秘鲁利马的美国海军医学研究六所（NAMRU-6）的医生必须将其测序数据送往美国分析，这一过
技术方法：如何计算进化生物学的突变率
突变率有多种计算用途，比如，进化生物学家可以基于物种的突变率，预测一个物种首次分化为两个物种时的“分子钟”。科学家们还利用这些速率来追踪流感等病毒的演变速度。癌症生物学家也可以利用突变率估计肿瘤细胞基因组随时间变化的速度。 “这是每一个进化模型中必须输入的参数，”新加坡基因组研究所的博士后Yu
临床生物化学实验室中计算机的应用
微处理机在临床生物化学实验室全面管理中的作用及其进展已有专著介绍。这里仅就有关实验数据的处理与报告方面的应用作一概括性的提示。 应用计算机系统处理实验数据并打印报告等具有多方面的应用，如通过编定的程序，可从大量实验数据中筛选出最有价值的数据，以提供参比；也可将原始数据进行分析、加工，做出更高层次的
2023上海国际计算生物学创新大赛圆满收官
9月9日，2023上海国际计算生物学创新大赛决赛在上海圆满收官。5支团队入围决赛，结合湿实验得分（占70%）、决赛现场答辩汇报质量、建模探索过程、建模方案创新性等维度的综合打分，最终评选出一等奖1名、二等奖2名、三等奖2名。其中，一等奖获得者为GeminiMol团队，来自上海科技大学。据专家介绍：该
临床生物化学实验室中计算机的应用
微处理机在临床生物化学实验室全面管理中的作用及其进展已有专著介绍。这里仅就有关实验数据的处理与报告方面的应用作一概括性的提示。 应用计算机系统处理实验数据并打印报告等具有多方面的应用，如通过编定的程序，可从大量实验数据中筛选出最有价值的数据，以提供参比；也可将原始数据进行分析、加工，做出更高层次
首届世界华人计算生物和分子模拟大会在大连举行
8月11日至13日，由中科院大连化学物理研究所分子反应动力学国家重点实验室以及理论计算中心主办，分子模拟与设计研究组(1106组)承办的第一届世界华人计算生物和分子模拟大会在大连化物所举行。来自海内外的理论与计算化学、计算生物学等相关领域的专家、学者100余人参加了会议。会议安排大
路甬祥与马普学会主席续签计算生物学伙伴所协议
路甬祥与马普学会主席续签计算生物学伙伴所协议并访问德科研机构 9月9日至14日，应德国马普学会Peter Gruss主席的邀请，路甬祥院长率团访问了马普学会及相关研究所。 路甬祥在会见Peter Gruss主席时，双方共同回顾了合作近40年来取得的成果与经验，并深入探讨了中
“计算生物学与生物信息学术研讨会”在基因组所召开
随着生命科学研究及基因测序等相关技术的飞速发展，计算生物学的重要性和复杂性在当前生物学数据量的不断增长中日益显现，并逐渐成为现代生物学研究的核心方法之一。为了推动国内相关研究单位间计算生物学和生物数据库等领域的交流与合作，10月27日至28日，中科院北京基因组研究所召集国内外众多
计算物质的溶出速率怎么计算
定时测定被溶出物质在溶液中的浓度，将两次溶出的浓度差比上时间差，就是溶出速率。例如时间（分）0510152025时间差55555浓度c1c2c3c4c5c6浓度差c2-c1c3-c2c4-c3c5-c4c6-c5速率(c2-c1)/5.................................
孔径计算经典计算方法的比较
所谓经典的宏观热力学概念是基于一定的孔填充机理的假设，是与孔内毛细管凝聚现象相关、以Kelvin 方程为基础的方法（如BJH 法）。它们可应用于介孔分布分析，但不适用于微孔填充的描述。经典的微孔处理方法，如DR法和半经验处理方法（如HK 和SF 法）都是基于不同的材料建立模型进而描述微孔填充，不能应
计算物质的溶出速率怎么计算
定时测定被溶出物质在溶液中的浓度，将两次溶出的浓度差比上时间差，就是溶出速率。例如时间（分）0510152025时间差55555浓度c1c2c3c4c5c6浓度差c2-c1c3-c2c4-c3c5-c4c6-c5速率(c2-c1)/5.................................
粉尘浓度的计算及计算公式
随着环保要求的越来越严格化，在各个行业里面大家都越来越多的会提到一个词“排放浓度”。那么今天我们就来了解下粉尘的排放浓度。1、粉尘排放浓度的概念：排放的废气中所含污染物的浓度，以mg／m3计。换句话说就是：含尘气体在经过除尘器过滤之后排放的污染物是多少毫克每立方。2、如何计算：其实根据概念很容易理解
孔径计算经典计算方法的比较
所谓经典的宏观热力学概念是基于一定的孔填充机理的假设，是与孔内毛细管凝聚现象相关、以Kelvin 方程为基础的方法（如BJH 法）。它们可应用于介孔分布分析，但不适用于微孔填充的描述。经典的微孔处理方法，如DR法和半经验处理方法（如HK 和SF 法）都是基于不同的材料建立模型进而描述微孔填充，不能应
回收率计算公式怎么计算？
加入已知浓度A的待测物质，用该方法测定其浓度值B，回收率=（A/B）×100%.注：已知浓度A应在该检测方法的可以检测浓度范围内。加标回收率，一般是测定样品中待测物质的浓度为C；再取另一份样品，加入定量待测物质（定量加入待测物质的理论浓度为E）（加入待测物质的量最好与样品中待测物质的量一样）测定其浓
科学家开发出能加密和破译图像的生物计算机
据美国物理学家组织网2月8日(北京时间)报道，美国加州斯克里普斯研究院和以色列理工学院科学家开发出一种生物计算机，目前可用于破译存储在DNA芯片中的加密图像。这是首次通过实验演示基于DNA计算的分子图像密码系统。相关论文发表在最新一期《应用化学》上。 电子计算机由硬件、软件、输入和输出4个
生物科技会是继计算机之后的未来新浪潮吗
著名创业公司孵化器Y Combinator正在走向生物科技领域。生物科技会是继计算机之后的未来新浪潮吗？马库斯•沃森(Marcus Wohlsen)的书《生物朋克》，该书详细讲述了爱好者们如何在“自家车库”里努力献身生物科技 Y Combinator是一家有名的创业公司孵化器。Y Combin
计算生物学所探索女性衰老和认知衰退更快的深层原因
女性的平均寿命通常比男性长，有意思的是，研究表明，女性呈现出更快的和年龄相关的认知衰退和较高的阿尔兹海默病的发病率。国际知名杂志Aging Cell于8月2日在线发表了中科院上海生命科学研究院计算生物学所研究人员对这种矛盾趋势的分子生物机制研究。 计算生物学所袁媛和Mehme
计算生物学所等建立识别汉族遗传结构的遗传标记
5月29日，《欧洲人类遗传学杂志》在线发表了中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所徐书华研究组的研究成果A panel of ancestry informative markers to estimate and correct potential effects of populati
新量子计算机解锁更多计算能力
奥地利因斯布鲁克大学实验物理系托马斯·蒙兹团队成功开发了一种量子计算机，可使用所谓的“量子数字”执行任意计算，从而以更少的量子粒子释放更多的计算能力。该项研究成果发表在最新一期《自然·物理学》杂志上。 计算机使用0和1，也就是二进制信息进行运算。在此基础上，今天的量子计算机在设计时也考虑到了二
怎样计算色谱中的校正因子计算
色谱定量分析的依据是被测组分量与检测器的响应信号(峰面积或峰高)成正比。但是同一种物质在不同类型检测器上往往有不同的响应灵敏度；同样，不同物质在同一检测器上的响应灵敏度也往往不同，即相同量的不同物质产生不同值的峰面积或峰高。这样，各组分峰面积或峰高的相对百分数并不等于样品中各组分的百分含量。因此引入
怎样计算色谱中的校正因子计算
在求转化率选择性时均要用到色谱分析产物。那么关于定量分析时涉及到校正因子。 我配置了从甲烷、乙烷，乙烯，丙烷，丙烯，异丁烷，正丁烷，1-丁烯，顺-2-丁烯，反-2-丁烯，异丁烯，1,3-丁二烯的标准气。他们的体积分数（也就是mol分数）分别为： 甲烷（0.144%） 乙烷（0.147%） 乙烯（0.
怎样计算色谱中的校正因子计算
色谱定量分析的依据是被测组分量与检测器的响应信号(峰面积或峰高)成正比。但是同一种物质在不同类型检测器上往往有不同的响应灵敏度；同样，不同物质在同一检测器上的响应灵敏度也往往不同，即相同量的不同物质产生不同值的峰面积或峰高。这样，各组分峰面积或峰高的相对百分数并不等于样品中各组分的百分含量。因此引入
怎样计算色谱中的校正因子计算
色谱定量分析的依据是被测组分量与检测器的响应信号(峰面积或峰高)成正比。但是同一种物质在不同类型检测器上往往有不同的响应灵敏度；同样，不同物质在同一检测器上的响应灵敏度也往往不同，即相同量的不同物质产生不同值的峰面积或峰高。这样，各组分峰面积或峰高的相对百分数并不等于样品中各组分的百分含量。因此引入