在动物中发现介导水平基因转移的载体:病毒样转座子
几十年来,科学家们已经知道基因可以从一种物种转移到另一种物种,无论是动物还是植物。然而,这类看似不可能发生的事件是如何发生的,其机制仍然是未知的。如今,来自奥地利科学院分子生物技术研究所Alejandro Burga实验室的研究人员在线虫中发现了一种水平基因转移(horizontal gene transfer, HGT)的载体。这些发现可能会导致在真核生物中发现更多的HGT载体,并可能在病原体控制中找到应用。相关研究结果发表在2023年6月30日的Science期刊上,论文标题为“Virus-like transposons cross the species barrier and drive the evolution of genetic incompatibilities”。 生活在北极和南极海洋的鱼类已经进化出巧妙的策略,以防止它们的血液和组织在不适宜居住的极地水域中冻结。其中的一种适应性策略是进化出产生抗冻蛋......阅读全文
我国科研人员在DNA转座子研究领域取得新突破
DNA转座子是存在于染色体DNA上可自主复制和位移的基本单位,是基因组中一段可移动的DNA序列,可以通过切割、重新整合等一系列过程从基因组的一个位置“跳跃”到另一个位置,对于生命科学研究具有非常重要的意义。中国科学院动物研究所科研团队基于自然界丰富的动物遗传资源开展了迄今为止最大规模的DNA转座子活
转座子-Tol2-的转座机制与转座优势详述
转基因,岂能不知Tol2 ? Tol2转座子 提及转基因,大家首先映入脑海的是什么呢?转基因大豆?玉米?食用油?(对于那些一个都想不到的孩纸们,小编我只想哭晕在厕所)名词很熟悉,各大超市随处可见,可何为转基因,如何得到转基因产品?今天小编简单来跟大家聊一聊。 所谓转
我国科学家构建目前最大活跃DNA转座子数据集
DNA转座子也称跳跃基因,可被用作基因工程工具。近日,中国科学院动物研究所张勇和王皓毅研究组开展了迄今为止最大规模的DNA转座子活性筛选,构建了目前最大的活跃DNA转座子数据集,极大扩展了基于DNA转座子的基因工程工具箱。相关研究成果5日在线发表于《细胞》杂志。130个新型DNA转座子和20个已知活
转座子-Tol2-的转座机制与转座优势详述
转基因,岂能不知Tol2 ? Tol2转座子 提及转基因,大家首先映入脑海的是什么呢?转基因大豆?玉米?食用油?(对于那些一个都想不到的孩纸们,小编我只想哭晕在厕所)名词很熟悉,各大超市随处可见,可何为转基因,如何得到转基因产品?今天小编简单来跟大家聊一聊。 所谓转
我国创建世界上最大转座子插入资源库
不知你有没有注意到,从菜市场买回来的玉米,有的是黄灿灿的,有的却像个大花脸,中间夹杂着紫色、白色的玉米粒? 其实,这是玉米的天性使然。玉米基因中有很多非常活跃的转座子,它们就像一支“小画笔”,跳到哪个基因上,就会抹去那里本来的“颜色”。因此导致籽粒颜色变化有一部分是转座子运动产生的。 转座
动物中DNA转座子通过两种机制介导基因重复
转座子被认为是宿主基因组演化的重要推动力。其类型众多,包含non-LTR(Long Terminal Repeat)型逆转座子、LTR型逆转座子、Helitron型DNA转座子、TIR(Terminal Inverted Repeat)型DNA转座子等,可引起包含基因重复(gene duplic
天津大学Cell子刊揭示反转座子调控新机制
来自天津大学及约翰霍普金斯大学的研究人员在新研究中证实,与自身免疫病Aicardi-Goutières综合征相关的一种蛋白质SAMHD1调节了反转座子LINE-1及其LINE-1介导的Alu/SVA反转录转座。相关研究论文发表在9月12日的《Cell Reports》杂志上。 文章的通
研究揭示苹果转座子调控等位基因特异性表达机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/8/484573.shtm 苹果花瓣颜色与MYB10和MYB110a的表达量相关。中国农科院果树所供图 近日,中国农业科学院果树研究所苹果资源与育种创新团队联合国内外科研机构,从全基因组层面上阐
在动物中发现介导水平基因转移的载体:病毒样转座子
几十年来,科学家们已经知道基因可以从一种物种转移到另一种物种,无论是动物还是植物。然而,这类看似不可能发生的事件是如何发生的,其机制仍然是未知的。如今,来自奥地利科学院分子生物技术研究所Alejandro Burga实验室的研究人员在线虫中发现了一种水平基因转移(horizontal gene
天津大学Cell子刊揭示反转座子调控新机制
来自天津大学及约翰霍普金斯大学的研究人员在新研究中证实,与自身免疫病Aicardi-Goutières综合征相关的一种蛋白质SAMHD1调节了反转座子LINE-1及其LINE-1介导的Alu/SVA反转录转座。相关研究论文发表在9月12日的《Cell Reports》杂志上。 文章的通
转座子-Tol2-的转座机制与转座优势详述(一)
Tol2转座子提及转基因,大家首先映入脑海的是什么呢?转基因大豆?玉米?食用油?(对于那些一个都想不到的孩纸们,小编我只想哭晕在厕所)名词很熟悉,各大超市随处可见,可何为转基因,如何得到转基因产品?今天小编简单来跟大家聊一聊。所谓转基因,顾名思义,就是外源基因整合进入宿主基因组,目前哺乳动物系统最常
转座子-Tol2-的转座机制与转座优势详述(二)
当然,实践是检验真理的唯一标准,2009年,Zoltán Ivics等[3]就为大家详细阐述了Tol2转座机制在鼠中的应用,具体流程如图3,通过不断地表型筛选,Tol2系统可以用于构建转基因鼠和稳定的基因表达细胞系。 图3 利用Tol2构建转基因鼠和基因表达细胞系[3]3、Tol2转座优势与传统的转
酵母菌基因组转座子的诱变实验——基本方案
实验材料诱变转座子基因组文库质粒DNA试剂、试剂盒10×TE缓冲液 pH 8.0无菌 E. coli tetskans (如 DH5c×)14 cm的LB培养基平板培养基中加入3 mg mL的四环素和40μg mL的卡那霉素LB培养基丙三醇无菌NotⅠ非限制性内切核酸酶及缓冲液Ura3_酵母菌培养一
Nature子刊:华中农大发现转座子可抑制mRNA翻译
来自华中农业大学生命科学学院,作物遗传改良国家重点实验室的研究人员发现水稻中的一类DNA转座子具有翻译抑制功能,这揭示了微小反向重复转座元件的新功能,对研究其他重复序列的功能提供了借鉴意义,同时也拓宽了对于转座子的认识。 这一研究成果公布在3月3日的Nature Communications杂
研究揭示人逆转座子LINE1靶向整合基因组机制
中国科学院生物物理研究所许瑞明、朱冰和薛愿超课题组合作,系统揭示了人逆转座子LINE-1靶向整合基因组的重要机制。该研究刷新了对LINE-1逆转座机制的认知,也为基于逆转座调控的药物研发提供了新的理论依据。相关研究成果10月9日发表于《科学》杂志。类基因组中存在大量具有“跳跃”能力的逆转座子序列。这
遗传发育所等在表观遗传调控水稻转座子活性方面获进展
转座元件是指在基因组中能够移动或复制并重新整合到基因组新位点的DNA片段,它们对动植物基因组的组成、进化和基因表达具有重要影响。而在宿主基因组中,如果失去对转座元件的有效抑制,这些元件将对基因表达和基因组的稳定性构成影响。水稻是主要的粮食作物同时也是重要的单子叶模式植物,其中
上海生科院揭示非编码RNA和转座子在长寿中的作用机制
3月21日,中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究员韩敬东在《细胞-报告》(Cell Reports)上在线发表了题为Impact of Dietary Interventions on Noncoding RNA Networks and mRNAs Encoding Chromatin
Cell Reports报道揭示非编码RNA和转座子在长寿中的作用机制
3月21日,中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究员韩敬东在《细胞-报告》(Cell Reports)上在线发表了题为Impact of Dietary Interventions on Noncoding RNA Networks and mRNAs Encoding Chromatin
我国学者揭示转座子的遗传变异可使植物快速适应新生境
在物种形成或物种入侵到新生境时,往往只涉及祖先物种里的少数群体或个体,从而导致形成的新物种或入侵群体的遗传多样性下降,即所谓“瓶颈效应”。尽管瓶颈效应使得新物种或入侵群体遗传多样性很低,但这些群体仍能够适应新生境。这种很低的遗传多样性和很强的适应能力之间的巨大反差被称为“生物入侵的遗传悖论”。对
Nat-Genet:通过表观遗传疗法激发转座子新抗原,推进癌症免疫治疗
近年来,免疫疗法已在多种癌症的治疗中取得了突破性的进展。这种疗法通过利用肿瘤中特异性表达的新抗原(neoantigen),使免疫细胞能够精准地锁定并消灭癌细胞【1】。传统上,人们认为这些新抗原主要源于编码基因的突变。然而,近年研究表明,基因组中非编码区域在肿瘤中的异常表达也可能导致新抗原的产生,
研究发现水稻转座子受驯化选择和抗病抗逆中的调节功能
6月19日,Molecular Plant 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所何祖华研究组题为Elimination of a retrotransposon for quenching genome instability in modern rice 的研究
PNAS:利用荧光显微镜实时观测活细胞内的转座子
美国伊利诺伊大学香槟分校的科学家们实时观察到了活细胞内的跳跃基因活动。这项研究的长期研究目标是在分子水平上深入了解进化是如何运作的。直接观察细胞内的基因组如何重组自我,可让我们精确测定适应率,并可能揭示了一系列重要的进化问题,包括从生命的出现到癌症的传播。 生物通报道:美国伊利诺伊大学香槟分校
酵母菌基因组转座子诱变实验—mTn诱变基因产物表位标记
实验材料mTn诱变酵母菌株试剂、试剂盒pGAL-cre含有2% (W V)棉籽糖的-Leu-Ura Raff CM缺失成分培养基平板和培养基含有2% {m V)半乳糖的-Leu Gal CM缺失成分培养基含有2% (m V)葡萄糖的-Leu Glc CM缺失成分培养基5-FOA培养基平板(5-FOA
酵母菌基因组转座子的诱变实验—-小载体聚合酶链反应
实验材料诱变转座子基因组文库质粒DNA试剂、试剂盒锚定囊泡引物1和2 、1 mol L MgCl2、普通小载体(UV)和mTn引物、转座子诱变酵母菌株、合适的限制性内切核酸酶(如AZmI或DraI)和缓冲液、10×T4 DNA连接酶缓冲液、5 mmol L ATP、400 U μL T4 DNA连接
Science:新研究揭示转座子编码的内含子与向导RNA之间的拮抗冲突
TnpB核酸酶是CRISPR-Cas12的进化前身,广泛存在于生命的各个领域,这可能是由于它们在转座子扩增中的关键作用。近期的研究已证实IS605 家族的 TnpB 同源物通过利用转座子编码的向导RNA——ωRNA,来切割基因组 DNA,因而通过 DNA 双链断裂刺激的同源重组来驱动转座子的维持
概述转座因子在分子生物学研究中的应用
随着人们对转座因子的转位机制和作用研究的逐步深入,转座因子的应用也越来越广泛,其中主要有以下三个方面的应用。 (1)遗传育种上的应用。一方面,转座子的转位会在靶位点引起其邻近基因序列和功能的变化而引起突变。因此,可根据转座子转座的遗传学效应来筛选突变体,培育新品种。另一方面,某些转座子可能是调
不需要RNA中间物的复制型转座介绍
在不需要RNA中间物的复制型转座过程中,转座子一般由Y2一转座酶催化进行滚环复制。使用此途径进行复制的转座子有IS91和Helitron,转座过程一般有两种机制。一种机制的复制和插入分开进行,具体步骤如下: ①转座酶切开转座子起点处的一条链,酶的Tyr—OH与切口的5‘—磷酸基以酯键连接,切口
不需要RNA中间物的复制型转座
在不需要RNA中间物的复制型转座过程中,转座子一般由Y2一转座酶催化进行滚环复制。使用此途径进行复制的转座子有IS91和Helitron,转座过程一般有两种机制。一种机制的复制和插入分开进行,具体步骤如下:①转座酶切开转座子起点处的一条链,酶的Tyr—OH与切口的5‘—磷酸基以酯键连接,切口的另一侧
中科院PNAS表观遗传研究新进展
近日来自中国科学院遗传与发育生物学研究所的研究人员在组蛋白H3K4去甲基化酶研究中取得重要进展,证实水稻中的H3K4特异性去甲基酶JMJ703参与控制了转座子活性,相关研究论文于1月14日在线发表在《美国科学院院刊》(PNAS)杂志上。 领导这一研究的是中国科学院遗传发育所基因组生物学研究
Cell:永不停息的基因战争
我们的细胞中进行着激烈的基因战争,入侵的外源DNA频频试图破坏人类的基因蓝图。现在,加州大学旧金山分校UCSF的研究人员发现了,细胞保护自身基因抵抗入侵者的新分子机制。 这一机制负责识别和靶标外源DNA,被研究人员称为SCANR。UCSF的研究人员是在酵母中发现SCANR机制的,由于酵母与