新研究解析栽培草莓“祖先”基因组图谱
草莓具有重要的经济价值和营养价值，现代八倍体栽培草莓起源于两个八倍体野生种——弗州草莓和智利草莓的种间杂交。近日，中国科学院昆明植物研究所研究员朱安丹课题组深入解析了八倍体草莓的起源和遗传分化特征。相关成果在线发表于《自然-植物》。 朱安丹表示，由于草莓属系统发育解析涉及未知的祖先、同源染色体交换和不完全谱系分选等问题，八倍体草莓的二倍体祖先问题至今仍存在较大争议。此外，八倍体草莓在驯化过程中的亚基因组的同源偏向性表达及转变模式并不明确。 该研究提出了一套适用于多倍体的ALLHiC迭代挂载流程，构建了两个八倍体野生草莓——弗州草莓和智利草莓染色体水平的高质量分型基因组。研究人员完成了八倍体草莓亚基因组的分离，并在此基础上采用不同的分析方法重新追溯了八倍体草莓的二倍体祖先。 研究结果纠正了国外学者在亚基因组分配上的错误，并进一步确定森林草莓和饭沼草莓是八倍体草莓现存的二倍体祖先种。研究还探讨了八倍体草莓在驯化过程中的同源......阅读全文
首个山羊基因组图谱在《自然•生物技术》杂志发表
2012年12月24日，由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成的首个山羊全基因组图谱在《自然•生物技术》(Nature Biotechnology)杂志在线发表。本研究采用新一代测序技术(NGS)与全基因组酶切图谱(Whole-genome mapping)技术相结
Cell绘制广泛的人类基因组互作图谱
来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)、斯坦福大学的科学家们阐明了，我们的基因表达在DNA中受控的机制。发表在《细胞》(Cell)杂志上的这项新研究，将促成更好地了解某些遗传变异可以开启或关闭控制基因表达的调控元件，最终表现为个体特征和疾病易感性的机制。 这些变异存在于非直接负责编码基因，而是发
顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱
基因组中表观遗传变化是能遗传的，近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析，从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。 文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
我国科学家发布大黄鱼全基因组图谱
由浙江海洋学院、上海交通大学、复旦大学等高校研究机构联合破译的大黄鱼全基因组图谱，日前在世界权威期刊——《自然》周刊发表。这是继半滑舌鳎之后，我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱，也是世界上第一个石首科鱼类基因组图谱，标志着我国海洋生物学的研究真正进入基因组时代。 自1985年大黄鱼人工养殖
我国科学家完成甜橙基因组图谱找到甜橙起源
甜美又不上火的甜橙来源于柚作为母本和橘杂交，其后代再与橘杂交而形成的杂种。华中农业大学徐强博士等人26日发表在国际著名学术刊物《自然-遗传学》题为“甜橙基因组图谱”的研究论文，提出了甜橙起源这一新理论。 专家表示，甜橙基因组将在理论上为柑橘基因功能研究提供框架，也将在应用上为果实品质包括色
蔬菜中心：绘成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国是世界第一西瓜生产与消费大国，但是人们却始终未能从外到内了解它，直到2013年1月，国际学术顶级刊物《自然·遗传学》发表了世界首张西瓜基因组序列图谱（影响因子35.532），标志着人类成功破译了西瓜遗传“密码”。这项由蔬菜中心主任许勇的研究团队牵头进行的科研创新，为高效培育兼具优质、高产、抗
多国科学家破解硬粒小麦全基因组图谱
近日，来自意大利、加拿大、德国等多国科研机构的科学家共同在Nature Genetics上发表了题为“Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets”的文章，绘制
《自然—生物技术》：美教授“自绘”个人基因组图谱
斯蒂芬·夸克(Stephen Quake) 一台机器、3个人、5万美元，美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克(Stephen Quake)最近用“自绘”个人基因组图谱的经历说明，这项“游戏”已不再是谁也玩不起的了。 斯坦福大学8月10日发表声明说，夸克在两名同事的帮助下，利用一台冰箱大
中国首份个人基因组图谱将在1年内出炉
每个人的基因都能刻成盘？ 采访人：记者 余建斌 点评人：浙江大学遗传与基因组医学中心主任 祁 鸣 来源：人民网－《人民日报》 事件 人民网综合消息诺贝尔奖获得者、被人称为“ＤＮＡ之父”的吉姆·沃森得到了一份特殊奖品：一张含有组成他基因的３０亿个ＤＮＡ单位详细信息的光盘，颁奖仪式３１
北京农业局:本地草莓很少用农药－不合格草莓禁上市
近日，央视财经一档节目报道称，记者随机购买8种草莓，结果都检测出农药乙草胺，该农药在美国被列为致癌物。这一消息让部分市民感到担心，鲜嫩香甜的草莓都不能吃吗? 昨日，北京市农业局相关负责人表示将成立专项调查组，全市范围内启动草莓生产过程中的农药使用检查，并赴北京市草莓主产区——昌平区开展调查。
罗氏454测序用于野生双峰驼基因组图谱绘制
中国及中亚细亚温带荒漠地区的骆驼均为双峰骆驼(Bactrian camel)，中国的双峰驼集中分布于内蒙古西部、宁夏、新疆、甘肃的温带荒漠和荒漠草原区，占全国总驼数的95%。且中国尚有数量比大熊猫还少的世界珍稀濒危动物―野生双峰驼存在。内蒙古阿拉善盟是中国骆驼最多的地区，拥有双峰驼10万峰以
Nature子刊：非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日，匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归（Elastic Net regression）的机器学习模型，从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱（long noncoding RNAs, lncRNAs）与265种抗癌药物敏感性数据中，挖掘出了27
我国科研机构联合破译白公式豚全基因组图谱
南京师范大学、华大基因等单位的科研人员成功破译了白鱀豚全基因组图谱，为解析白鱀豚独特的生活习性及进化历程奠定了重要的遗传学基础，同时也为哺乳动物尤其是鲸类的研究与保护提供了宝贵资源。最新研究成果今天在《自然·通讯》杂志发表。 科研人员对一只雄性白鱀豚进行了全基因组测序，并构建了高质量基因组
武汉植物园等完成中国莲基因组框架图谱绘制
中科院武汉植物园与美国、澳大利亚科学家合作完成了对中国古代莲的基因组测序和分析，相关研究成果已于5月10日刊登在《基因组生物学》杂志上。 研究人员利用全基因组鸟枪测序法完成了对中国莲(Nelumbo nucifera)基因组的测序。结果显示，莲基因组大约有2.7万个基因，全长9.3亿个
科研人员首绘小黄鱼全基因组精细图谱
17日，记者从浙江省农科院获悉，该院水生生物研究所小黄鱼科研团队与美国奥本大学、厦门大学合作，首次完成小黄鱼全基因组组装注释与精细图谱绘制，为建立小黄鱼基因组选择育种、培育高产抗病优质良种提供了基因资源和技术手段，相关研究论文近日在线发表于学术期刊《分子生态学资源》上。 小黄鱼是中国重要的海产经
我国专家首绘蝎子基因组图谱－揭开多样性面纱
由武汉大学领衔，与上海生物信息技术研究中心合作，近日完成了对马氏正钳蝎(Mesobuthus martensii)的基因组测序，预测了32016个蛋白质编码基因，在国际上第一个揭示了蝎子(scorpion)这一种独特的节肢动物适应模式。 专家表示，马氏正钳蝎基因组的解析揭开了蝎毒素多样
任兵教授Nature重要成果：首张小鼠功能基因组图谱
通常被称之为“生命之书”的人类基因组非常地难于阅读。在没有充分了解其语法和句法的情况下，基因组中29亿的腺嘌呤与胸腺嘧啶、鸟嘌呤和胞嘧啶碱基对为了解人类的基础遗传学提供了有限的认识。 在发表于7月1日《自然》(Nature)杂志上的一篇论文中，来自德维格癌症研究所和加州大学圣地亚哥医学院的
多样性增加281％，人类肠道菌群基因组图谱公布！
近两年来，以免疫检查点为药物靶点的免疫检查点抑制剂治疗癌症受到越来越多科研工作者的青睐。但是临床研究结果表明，许多癌症患者因接受免疫药物治疗而出现不同程度的免疫相关不良反应，最终出现不得不提前终止治疗的情况。 而寄居在人体内的肠道菌群可以影响免疫检查点抑制剂治疗癌症，能够极大地改善患者对该疗法
中国科学家绘就谷子基因组单倍型图谱
由中国农科院作物科学研究所、中科院上海生科院国家基因研究中心、中科院遗传与发育生物学研究所等8家单位组成的科研团队，在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和47个主要农艺性状的全基因组关联分析。相关成果6月23日在线发表于《自然—遗传学》杂志。 据介绍，谷子为二倍体，基因组小、自花
Lal－Teer畜牧公司联合华大基因成功绘制水牛基因组图谱
2014年1月24日，孟加拉Lal Teer畜牧科技公司(孟加拉Lal Teer种业科技公司的联营公司，以下简称"Lal Teer")与华大基因联合宣布水牛基因组图谱绘制完成。该项科研成果将为深入了解水牛这一物种的起源、驯化过程及其品种选育等奠定重要的遗传学基础。 水牛，也叫印度水牛，
全球首个青稞基因组图谱绘制完成－揭示其驯化栽培过程
青稞经过藏族人民长达3500—4000年的驯化栽培，已经完全适应了极端的高原气候，成为了藏族人民的主食。全球首个青稞基因组图谱由我国科学家正式绘制成功，1月13日，其研究成果在线发表在PNAS杂志上。研究成果揭示了青稞的高原适应性机制，解读其起源、驯化及栽培选育过程。 科学家对西藏的地方品种青
人类基因组“primiRNA”剪切位点图谱绘制
人体的基因表达是一个复杂的过程，那么多的基因不可能都总是持续表达。指挥基因表达的功臣之中就包括几种RNA分子。MicroRNA（miRNA）是一类真核生物内源性的小分子单链RNA，它是一种古老的、生死攸关的基因调节因素，30-60%的哺乳动物蛋白质编码基因都受miRNA的调控（主要是基因沉默调控
我国绘制完成世界首个鹅全基因组序列图谱
6月3日，深圳华大基因研究院和浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所联合召开新闻发布会，宣布“鹅全基因组序列图谱绘制完成”。这是我国独立研究完成的全世界首个鹅全基因组序列图谱，这一研究成果对于揭示家鹅繁殖、抗逆、生长、肉质、羽色等性状的遗传基础，鹅的驯化、不同鹅种的生物学分类、中国家鹅
人类首张黄种人基因组图谱有望在深面世
人类第一张“黄种人基因组图谱”有望在深面世，并计划在今年高交会期间向全世界发布。目前，深圳华大基因研究院近百位科学家已进驻盐田。市区两级政府正着手将沙头角海山街道辖区的恩上村整体搬迁改造成“生物研发加速器”，作为该项目基地。 人们对基因工程技术应用于制药和医学治疗的信心在不断增强。2006年底，
日本研究人员首次成功绘制日本人基因组图谱
据日本共同社报道，日本理化学研究所基因组医科学研究中心日前通过新一代DNA测序仪成功绘制出首份日本人基因组图谱。该成果10月24日发表在美国《自然—遗传学》杂志网络版上。 DNA一共有4种碱基排列组合，人类大约有30亿对碱基对。新一代测序仪可将DNA进行极其精细的切片，对大量切片同时
鸭嘴兽基因组图谱揭秘独特的性染色体
鸭嘴兽可能是世界上长得最奇怪的动物。据说，当欧洲学者第一次见到这种鸭子嘴、海狸尾、水獭足的动物时，他们认为这是一场精心设计的骗局。它看上去既像爬行动物又像哺乳动物，还像鸟类。实际上，它属于稀有的单孔类动物。 鸭嘴兽不仅有一些奇特的身体特征，其新的基因组版本也强调了它一些不寻常的遗传特性。在上周
我国科学家完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制
近日，由中国水产科学研究院首席科学家孙效文牵头，中国水产科学研究院联合黑龙江水产研究所、中科院基因组研究所、哈佛大学、奥本大学等单位组建的国际合作研究团队，完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制，在国际上首个完成全面解析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该研究成果于9月21日在国际生物学权威期刊《自然—
我国科学家绘制完成鲤鱼全基因组序列图谱
鲤科鱼类是我国最重要的水产养殖种类，年产量占我国淡水养殖总产量的70%以上，其中鲤鱼不仅是我国也是世界性的重要养殖鱼类。5月6日，中国“鲤鱼基因组计划”学术报告会暨新闻发布会在京举行。由中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心、黑龙江水产研究所和中科院北京基因组研究所共同实施
江苏专家：“毒草莓”检测存疑
这两天，央视报道的草莓中农药乙草胺超标的消息备受关注。草莓真的有毒？我们还能放心吃吗？从最初的担心，到眼下对检测结果的质疑，成为各界热议的焦点。昨天，现代快报记者采访了江苏省农业科学院草莓研究专家赵密珍，她明确提出了对这份检测结果的质疑。南京的草莓种植大户们也表示，草莓种植中不太可能使用乙草胺。
吃草莓容易感染病毒？福建微生物专家：跟草莓关系不大
近日，众多微信公号都在传播一篇帖文《一女子拉肚子15次，小孩因它感染病毒！都因吃这种水果，最近正大量上市》。帖文列举了三个食用草莓感染病毒的例子，并提醒“小朋友吃草莓可能感染上诺如病毒”。 帖文的传播一方面让草莓成为“众矢之的”，另一方面不少网友也疑惑不解，吃个草莓真的会感染上诺如病毒吗？草