新研究解析栽培草莓“祖先”基因组图谱
草莓具有重要的经济价值和营养价值,现代八倍体栽培草莓起源于两个八倍体野生种——弗州草莓和智利草莓的种间杂交。近日,中国科学院昆明植物研究所研究员朱安丹课题组深入解析了八倍体草莓的起源和遗传分化特征。相关成果在线发表于《自然-植物》。 朱安丹表示,由于草莓属系统发育解析涉及未知的祖先、同源染色体交换和不完全谱系分选等问题,八倍体草莓的二倍体祖先问题至今仍存在较大争议。此外,八倍体草莓在驯化过程中的亚基因组的同源偏向性表达及转变模式并不明确。 该研究提出了一套适用于多倍体的ALLHiC迭代挂载流程,构建了两个八倍体野生草莓——弗州草莓和智利草莓染色体水平的高质量分型基因组。研究人员完成了八倍体草莓亚基因组的分离,并在此基础上采用不同的分析方法重新追溯了八倍体草莓的二倍体祖先。 研究结果纠正了国外学者在亚基因组分配上的错误,并进一步确定森林草莓和饭沼草莓是八倍体草莓现存的二倍体祖先种。研究还探讨了八倍体草莓在驯化过程中的同源......阅读全文
我国科学家完成扇贝基因组精细图谱绘制
日前,中国海洋大学教授包振民团队完成了扇贝基因组精细图谱绘制,探究原始动物祖先染色体核型进化、躯体结构多样性产生、眼睛起源及其调控机制等,在动物宏观进化研究领域取得重要进展。相关成果日前发布于《自然.生态学与进化》。 动物界99%的物种隶属于双侧对称动物,进化学家推测这些双侧对称动物可能起
科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱
近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。 通过与半滑舌鳎全基因组
科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱
近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。 通过与半滑舌鳎全基因组
香港中大破解鼻咽癌全基因组图谱
香港中文大学7日宣布,该校医学院研究人员成功破解鼻咽癌的全基因组图谱,这一突破性发现有助评估鼻咽癌病人的预后情况,并向鼻咽癌的个人化治疗迈出一大步。 鼻咽癌是华南地区常见的癌症,也是一种极具侵略性的头颈癌。据介绍,鼻咽癌大多与感染EB病毒相关。由于缺乏早期病征,60%至70%患者于确诊时已届晚
科学家构建高质量金粟兰基因组图谱
11月26日,《自然—通讯》以背靠背的形式在线发表了两项由中国科研团队主导的研究,这两项研究填补了核心被子植物最后一个主要分枝——金粟兰目的基因组信息,为破解被子植物的早期演化历程提供了更翔实的证据。被子植物是地球上数量最多、种类最丰富的植物类群。还原植物清晰的间亲缘关系系统发育树,对了解被子植物的
Nature里程碑成果:扩展人类表观基因组图谱
10年前,科学家们宣布人类基因组计划(Human Genome Project)完工。通过这一国际项目人们旨在了解人类独特的四种核苷酸——腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤的组合。这一生物学字母表帮助研究人员确定了人类基因组中大约2.5万个编码基因,然而随着时间的推移,他们开始提出一些关于这些
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
日前,复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队,首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划,“DNA元件百科全书计划”(Encyclopedia of DNA Elements)从2003年启动至今整整20周年;本研
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
日前,复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队,首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划,“DNA元件百科全书计划”(Encyclopedia of DNA Elements)从2003年启动至今整整20周年;本研
Science:绘制一张复杂疾病基因组图谱
尽管研究人员已经利用全基因组关联研究(GWAS)确定了与人类疾病相关的遗传因素,但是要解释这些数据,还需要清楚的了解这些新的风险基因是如何被调控的。 近期Science杂志发布了最新研究成果,解析了人类天然免疫系统中的遗传调控网络,并且也指出了这些信息如何能直接用于理解自身免疫疾病的遗传学
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497746.shtm 日前,复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队,首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划,“DN
致榆树枯萎病真菌基因组图谱绘制完成
据《每日科学》网站近日报道,加拿大多伦多大学研究人员宣布,他们已成功绘制出可引起榆树枯萎病的真菌的基因图谱,该图谱包含有3000万个DNA(脱氧核糖核酸)字符。此项研究成果发表在本周《BMC基因组学》网络版上。 研究报告作者之一、多伦多大学细胞和系统生物学助理教授艾伦·摩西称,从本质上说,
科学家绘制高精度类人猿基因组图谱
一个国际科研团队宣布,他们新近绘制出红毛猩猩和黑猩猩这两种类人猿的高精度基因组图谱。与过去类似研究不同的是,这次没有参照人类基因组图谱,因此更准确地揭示了人类与类人猿的基因差异。 利用第三代基因测序技术和先进的拼接方法,美国华盛顿大学等机构研究人员绘制出的这个高精度基因组图谱,对人与类人猿基因组
科学家绘制出首幅小麦基因组物理图谱
《科学》:有助于培育出更高产和抗旱的小麦新品种 一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱,这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行
高精度亚洲猪参考基因组图谱绘制成功
近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物基因工程与种质创新科技创新团队联合北京相关生物企业等单位成功绘制了梅山猪高质量基因组图谱。该图谱是迄今为止精度最高的亚洲猪基因组图谱,为我国地方猪种质资源保护和开发利用奠定了基础。相关成果发表于《分子生态资源(Molecular Ecology Reso
最新测序的完整的人类基因组图谱
最新测序的完整的人类基因组图谱。 图片来源:英国《新科学家》网站 20年前,科学家宣布读取了一个人的全部脱氧核糖核酸(DNA),其实,他们漏掉了少许。现在,由于读取DNA方法的改进,科学家终于可以从头到尾读取人类的全部基因组了!据生物预印本网站(biorxiv)近日报道,美国科学家对全部
我国完成世界首张-西瓜基因组序列图谱
由北京市农林科学院蔬菜平台牵头,联合了中国农业科学院、深圳华大基因科技有限公司、美国康奈尔大学、荷兰瑞克斯旺等优势单位,共同完成了世界首张西瓜基因组序列图谱绘制与破译,获得了高质量的西瓜基因组序列图谱,成为由中国主导完成的世界第一张西瓜基因组序列
我国完成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国主导完成世界首张西瓜基因组序列图谱的绘制与破译,相关研究成果于北京时间11月26日凌晨在国际学术顶级刊物《自然·遗传学》上在线发表。 西瓜是全球重要的经济作物和夏季消暑水果,但就是这样一种常见的水果,人们却始终未能从内到外了解它。过去,各国科学家虽然知道栽培西瓜遗传多样性狭窄是制约西瓜
莆田:两农民种植草莓违法使用农药-毒草莓流入市场
据莆田晚报报道,餐桌安全关系百姓的健康,可有人为了自己利益,使用违禁农药种植草莓,这极易造成残留农药的水果上市,造成“毒水果”毒害市民的健康。 2月8日,仙游县公安局治安管理大队根据仙游县农业局移送犯罪嫌疑人刘某新、吴某妹涉嫌生产、销售有毒有害食品犯罪案件的线索,迅速出击,在仙游县榜头镇抓获犯
畸形草莓含膨大剂?
左侧草莓较右侧草莓略显形状不规则、果面凹凸不平 眼下正是品尝草莓的旺季,一则"如何辨别打激素草莓"的帖子出现在微信、微博上,称个大畸形、空心、果柄处发白的草莓,是过量使用了膨大剂这类激素催生而成的,提醒消费者"长点心"。 记者走访多家水果市场、采摘园时发现,网传的不规则草
昌平草莓安全可追溯
近期,随着北京农业嘉年华的举办,昌平的草莓迎来了销售旺季。许多市民在嘉年华园区或在昌平其他景点游玩后,往往会到园区东侧的“草莓休闲体验带”亲自采上几盒新鲜的草莓,这里有1万栋草莓温室大棚供市民进行采摘体验。 就在不久前,昌平区20家草莓生产基地代表共同宣读《2016昌平草莓安全生产自律公约》
街上草莓-农药残留高?
十五以后,草莓大量上市,街上出现不少卖草莓的商贩。有市民称草莓农药残留多,常吃有害健康,这种说法是真的吗? 2月14日,《法制晚报》记者带着从街上小摊购买的11份样品送检。检测结果显示,样品农药残留全部符合国家标准。较多样品均有少量农药残留,只有少数样品农药残留量基本为零。 专家表示,
“吃草莓致癌”不靠谱
4月,一则有关“草莓被检出含有乙草胺,可能会致癌”的报道,让消费者对草莓望而却步,也严重影响了不少地区的草莓产业。5月13日,北京市网信办、市科协以及昌平区农业服务中心等多部门联合辟谣:草莓种植不会用到乙草胺,“吃草莓致癌”说法不靠谱。那么,乙草胺是什么?为什么媒体检测就超标了,而政府权威机构
吃草莓染出血热?西安草莓滞销|疾病面前勿轻信谣言
今年入冬以来,西安各大医院相继接诊多名出血热患者,随之,一则“吃草莓会导致出血热”的谣言被顶上热搜,导致山西草莓滞销,草莓种植户收入锐减,苦不堪言。出血热全称是肾综合征出血热,由一种名为“汉坦”的病毒(Hantavirus)引起,是以鼠类为主要传染源的一种自然疫源性疾病,以发热、出血、休克和损害肾脏
我国完成首部高原濒危物种全基因组序列图谱
12月25日,由青海大学和深圳华大基因研究院共同发起并承担的藏羚羊基因组序列图谱在青海大学医学院宣告绘制完成,这是世界上第一部绘制完成的高原濒危物种全基因组序列图谱,也是中国科学家对全球基因组科学的又一重大贡献。 藏羚羊是我国青藏高原特有的物种,其生存环境高寒、缺氧,自然条件极为严酷。在喜
科学家成功绘制-首幅小麦基因组物理图谱
一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱,这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息,它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传
荷兰科研人员首次绘出女性个人基因组图谱
荷兰科研人员5月26日说,他们首次绘出女性的个人基因组图谱,这将有助于深入研究人的遗传多样性。 荷兰莱顿大学医学中心发表的一份声明说,科研人员已测定该中心一位女性临床遗传学家的基因组序列,她是基因组被完整测序的首位女性和首位欧洲人。 基因组是指包含在生物DNA(脱氧核糖核酸)中的全部遗传信息。此前科
我国学者首次绘制一串红基因组图谱
北京市园林科学研究院21日对外称,由该研究院和北京林业大学合作共同完成了一串红高质量的基因组图谱绘制项目工作,这使我国成为世界上首个绘制出一串红基因组图谱的国家。图片来源于网络 唇形科是开花植物中的第六大科,包括约236个属,6900—7200个种类。而一串红则隶属唇形科鼠尾草属,其花色艳丽
NIH-340万美元资助癌症基因组图谱研究计划
美国国立卫生研究院于当地时间7月2日宣布,决定对八个单位(或个人)进行为期两年、总值340万美元的资助,以支持癌症基因组图谱研究计划(Cancer Genome Atlas pilot program)。 癌症基因组图谱计划是美国国立癌症研究所和美国国家人类基因组研究的合作项目,于2005年晚期,
最广泛的人类基因组相互作用图谱
最近,英国剑桥Babraham研究所和伦敦Francis Crick研究所的研究人员,开发并使用了一种新的技术,将基因组拼图中的点连接起来。就像连接点拼图,需要完成才能看到整幅图片,研究者的这项分析把称为启动子和增强子的调控因子连接起来,并指出了它们在小鼠和人类基因组中长距离内的物理相互作用。确
首张拓扑异构酶II全基因组剪切图谱
DNA切割酶对基因结构调节起着关键作用。研究人员发现,它在导致癌症的(如白血病和实体瘤)易位(translocations)异常重排中表现活跃。 II型拓扑异构酶(type II topoisomerase, TOP2)通过断裂DNA双链磷酸二酯键,来更正DNA连环数,使细胞DNA正常转录、复