Nature：转座子编码的核酸酶利用向导RNA促进转座子自身的传播
基因组工程可能是医学的未来，但它依赖于数十亿年前在原始细菌中取得的进化进步，而原始细菌是最初的基因编辑大师。科学家们对这些古老的基因编辑系统进行改造，推动它们完成更加复杂的基因编辑任务。然而，要发现新工具，有时需要回顾过去，了解细菌最初如何创建原始的基因编辑系统，以及构建的原因。 在一项新的研究中，美国哥伦比亚大学的Sam Sternberg和他的博士后Chance Meers博士回顾了CRISPR-Cas9的前身---它们潜伏在所谓的“跳跃基因（jumping gene）”中---以揭示CRISPR的DNA剪刀是如何进化的。他们的发现揭示了数千种新发现的DNA剪刀是如何工作的，以及如何将它们设计成新的基因组工程技术。相关研究结果近期发表在Nature期刊上，论文标题为“Transposon-encoded nucleases use guide RNAs to promote their selfish spread”。......阅读全文
应用Jurkat细胞研究核糖核酸酶P的M1RNA介绍
探讨抗MHCⅡ类分子转录激活因子(CⅡTA)的M1-RNA抑制细胞表面MHCⅡ类分子的表达.M1-RNA是核糖核酸酶P的催化活性单位,设计并克隆针对CⅡTA第3408位点的M1-RNA(M1-3408-GS)及其相应的CⅡTA靶基因片段(3176-3560),分别插入pUC19、pGEM-7zf(+
表观遗传调控水稻重要农艺性状研究获进展
转座子(transposon)是一段自身能够插入到基因组上的DNA片段，上世纪40年代，芭芭拉·麦克林托克(Barbara McClintock)首先在玉米中发现了转座子。从简单的细菌到复杂的人类，转座子广泛存在。转座子随机插入到重要基因中，会引发疾病、癌症和其他生理缺陷。DNA甲基化、组蛋
反义RNA的调控细菌基因的表达功能
反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来，和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补，因此在体外mic
反义RNA调控细菌基因的表达功能介绍
反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来，和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补，因此在体外m
罗红霉素如何影响细菌的RNA合成？
罗红霉素通过抑制细菌蛋白质的合成来发挥作用。 罗红霉素属于大环内酯类抗生素，它的主要作用机制是与细菌的50S核糖体亚单位结合，阻止氨酰tRNA与核糖体结合，进而抑制了细菌蛋白质的合成。由于这一作用，罗红霉素对多种细菌都有良好的抗菌活性，特别是对某些革兰阳性菌和一些革兰阴性菌。
基因组的分类
病毒基因组病毒基因组可以由RNA或DNA组成。 RNA病毒的基因组包含单链或双链RNA，也包含一种或多种单独的RNA分子。 DNA病毒基因组可以是单链或双链DNA。大多数DNA病毒基因组由单个线性DNA分子组成，但有些由DNA病毒基因组由环状DNA分子组成 。原核基因组原核生物和真核生物基因组由D
RNA干扰的作用机制
病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内，并利用宿主细胞进行转录时，常产生一些dsRNA。宿主细胞对这些dsRNA迅即产生反应，其胞质中的核酸内切酶Dicer将dsRNA切割成多个具有特定长度和结构的小片段RNA（大约21～23 bp），即siRNA。siRNA在细胞内R
Cell：永不停息的基因战争
我们的细胞中进行着激烈的基因战争，入侵的外源DNA频频试图破坏人类的基因蓝图。现在，加州大学旧金山分校UCSF的研究人员发现了，细胞保护自身基因抵抗入侵者的新分子机制。 这一机制负责识别和靶标外源DNA，被研究人员称为SCANR。UCSF的研究人员是在酵母中发现SCANR机制的，由于酵母与
应用人胎肝细胞研究核糖核酸酶P的M1RNA
研究抗组织相容性复合物(MHC)Ⅱ类分子转录激活因子(CⅡTA)核糖核酸酶P(RNaseP)抑制肝细胞表面MHCⅡ分子的表达。方法 ：M1—RNA是RNaseP的催化活性单位，设计并克隆针对CⅡTA第629位点的M1—RNA(M1—629—GS)及其对应的CⅡTA靶序列，分别插入腺相关病毒载体psN
报道转座子的定义
中文名称报道转座子英文名称reporter transposon定 义在转座子处插入报道基因,如某种抗性基因和酶基因等,作为这段序列是否发生转座的标记。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
报道转座子的定义
中文名称报道转座子英文名称reporter transposon定 义在转座子处插入报道基因，如某种抗性基因和酶基因等，作为这段序列是否发生转座的标记。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
概述转录后基因沉默的基本内容
PTGS在多种生物中有共性，对PTGS的激活和与其相关的RNA降解调控过程有了初步的认识。也发现植物病毒在转基因植物和非转基因植物中都能和转基因一样诱发转录后基因沉默。令人吃惊的是，转基因植物的共抑制现象（转基因与同源的内源基因一起失活）、转基因植物的病毒抗性和非转基因植物对病毒正常自然侵染的抗
新发现！细菌RNA代谢调控新机制
近日，中国科学院水生生物研究所张承才团队关于细菌中RNA代谢调控机制的研究取得了进展。相关研究成果以《蓝藻中RNase E受一个保守蛋白调控》（A conserved protein inhibitor brings under check the activity of RNase E in
BIOG细菌RNA提取试剂盒使用说明
特点◎提取RNA纯度高，无抑制剂，A260/A280为1.8-2.0；◎产率高，同样的样本量提取的RNA更多。◎不含苯酚和氯仿等有毒溶剂，安全无毒。◎对于革兰氏阴性菌和一般的革兰氏阳性菌有较好的提取效果。试剂盒组成 组分 50次
水生所揭示细菌RNA代谢调控新机制
近日，中国科学院水生生物研究所张承才团队关于细菌中RNA代谢调控机制的研究取得了进展。相关研究成果以《蓝藻中RNase E受一个保守蛋白调控》（A conserved protein inhibitor brings under check the activity of RNase E in
Science揭示基因组的捍卫者
从细菌到人类，生物体都必须要保护自身对抗称作为转座子的寄生遗传元件，并且赌注下得很大。这些DNA片段可在基因组中四处跳跃破坏基因，其可以造成极大的破坏因此细胞有专门的监视机制来抑制它们。 为了保护后代对抗基因组破坏，这些天然防御系统发生缺陷通常会导致不育不孕。在动物中，对抗捣乱转座子的主要防御
BMC－Biology：含Cas酶的新型转座子
转座子是一种可移动的遗传元件，能够在基因组的不同位点之间跳跃，这种DNA片段广泛存在于自然界的各种生物中。近日，科学家们在细菌和古生菌中发现了一类新型的转座子，这种转座子不仅含有Cas内切酶的编码基因，还依赖这种酶整合到新的基因组区域。 细菌一直在与病毒或入侵核酸（质粒）进行斗争，为此它们演化
Dicer酶结构及作用原理
1、Dicer酶在RNA干扰研究中会用到Dicer酶，Dicer酶是RNaseIII型家族中的蛋白酶，可特异识别dsRNA，它可以切割以各种方式进入到细胞内的dsRNA，将其切割成19-21bp大小的短RNAs。Dicer是来自果蝇RNA干扰必须的RNaseIII型蛋白。Dicer酶是RNase I
应用人胎肝细胞研究核糖核酸酶P的M1RNA介绍
研究抗组织相容性复合物(MHC)Ⅱ类分子转录激活因子(CⅡTA)核糖核酸酶P(RNaseP)抑制肝细胞表面MHCⅡ分子的表达。方法 ：M1—RNA是RNaseP的催化活性单位，设计并克隆针对CⅡTA第629位点的M1—RNA(M1—629—GS)及其对应的CⅡTA靶序列，分别插入腺相关病毒载体psN
小干扰RNA转录后基因沉默的介绍
siRNA诱导的转录后基因沉默始于RNA诱导的沉默复合物（RISC）的组装。该复合物通过切割编码靶基因的mRNA分子来沉默某些基因表达。为了开始该过程，两条siRNA链中的一条（引导链）将被装载到RISC中，而另一条链即过客链被降解。某些Dicer酶可能负责将引导链加载到RISC中。然后，siR
Science：有比CRISPRCas更安全的技术吗？基于retroelement的基因组编辑工具
在一篇展望文章中，Stephen Tang和Samuel Sternberg讨论了基于retroelement的基因编辑作为CRISPR-Cas方法的一种更安全的替代方法。 精确的基因组编辑技术改变了现代生物学。可编程DNA靶向的能力已经迅速提高，这主要是由于细菌RNA引导的CRISPR-Ca
关于核糖核酸酶P的研究分析介绍
来自美国科罗拉多州大学分子，细胞和发育生物学系，以及亚利桑那州立大学生命科学学院化学与生物化学系的研究人员通 过比较真核与细菌核糖核酸酶P RNA（Ribonuclease P RNA，RNase P）的不同，获得了一RNase P三级结构，为研究RNase P带来了突破性进展，这一研究成果公布
分子生物学课程教学讲义（五）
1. DNA复制的起始 大肠杆菌中的复制起始位点是Ori C，全长245Bp，该序列在所有细菌复制起始位点中都是保守的。DNA复制起始中的主要步骤a. 大约20个左右的DnaA蛋白首先与OriC中的4个9碱基重复区相结合；b. 识别并使3个13碱基串联重复区DNA形成开环结构；c. DnaB蛋白在
Nature：小RNA生物学里程碑成果－解开piRNA生物合成谜题
PIWI相互作用的RNA，简称piRNAs，是一类小型的调控RNAs ——长度只有22–30个核苷酸的小块核酸。它们可能很小，但是与它们相关的Argonaute蛋白一起，piRNAs就能够“沉默”转座因子，所谓的自私基因，存在于植物、真菌和动物的基因组中。piRNA介导的沉默可以作用于染色质，以
Cell新发现：意料不到的保护“裸露”基因组的RNA
2015年，来自冷泉港实验室的Andrea Schorn和Rob Martienssen等人发现了Piwi系统的一个重要奥秘：它们能利用一种蛋白质将细胞的基因沉默机器引导到了基因组中的正确位点，使得它能够让转座子失活，且不会干扰生物体自身的基因。从中他们指出，胚胎基因组之所以不会受到攻击是因为小
科学家开发逆转座子基因工程新技术 实现全RNA介导的基因精准写入
基因组DNA是生命的蓝图，对基因组DNA实现任意尺度的精准操作代表对生命蓝图进行修改绘制的底层能力，是基因工程技术发展的核心。以CRISPR基因编辑技术为代表的技术进步实现了基因组单碱基和短序列尺度的精准编辑，基本解决了基因组精准编辑的挑战。然而，如何针对应用场景的需求，实现大片段DNA在基因组
抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验
实验方法原理 一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。实验材料 N-表达质粒E.coil N567 感受态细菌试剂、试剂盒 储存液缓冲液仪器、耗材 蛋白胨培养基蛋白胨平板N-表达质粒组合文库培养板实验步骤 ―、材料与设备1. 通过比较 β-半乳糖苷酶表达
抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验
一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。实验材料N-表达质粒E.coil N567 感受态细菌试剂、试剂盒储
抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验
实验方法原理 一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。 实验材料 N-表达质粒 E.coi
科学家发现首个细菌中的RNA修复系统
美国伊利诺伊大学香槟分校生物化学系教授Raven H. Huang及其同事首次在细菌中发现了RNA修复系统。这是迄今为止发现的第二个RNA修复系统，第一个为噬菌体(可攻击细菌的一种病毒)中的带有2个蛋白的RNA修复系统。相关文章发表在本月的美国《科学》杂志以及《美国国家科学院院刊》上。