这些新测试能知道你到底有多健康
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511906.shtm ?图片来源：英国《新科学家》网站 ?肠道微生物组测试能反映人的整体健康状况。图片来源：英国《新科学家》网站英国《新科学家》网站在11月3日的报道中指出，一个人是否健康？有多健康？血压和体重指数等常规指标能阐释的信息很有限。测试微生物组和代谢产物，甚至“免疫等级”，或许能让人更深入地了解自己的健康状况。血压和BMI当人们去医院体检或看病时，医生一般会从测量血压、检查“身体质量指数”（BMI）开始，但这些指标在评估人体健康方面并不完美。在大多数高收入国家，BMI值介于18.5—24.9之间被认为是健康的。BMI值超过25被视为超重，超过30则被归类为肥胖，而肥胖则与罹患心血管疾病、中风和Ⅱ型糖尿病等疾病有关。但用BMI来评估人的健康状态受到的争议越来越......阅读全文
微生物的形态特征和生理生化特征
形态特征（1）个体形态 镜检细胞形状、大小、排列，革兰氏染色反应，运动性，鞭毛位置、数目，芽孢有无、形状和部位，荚膜，细胞内含物；放线菌和真菌的菌丝结构，孢子丝、孢子囊或孢子穗的形状和结构，孢子的形状、大小、颜色及表面特征等。（2）培养特征1）在固体培养基平板上的菌落（colony）和斜面上的菌苔（
我国学者根际微生物组响应作物生长和氮素输入
根际是指靠近植物根系、受植物根系活动影响的微区域，是植物与土壤生态系统之间的交互界面。大量微生物定殖于此并与植物根系以及周边土壤存在密切的相互作用，对植物养分获取、生长发育等方面起到重要作用。根际微生物基因组被视作植物第二基因组。我国是世界上氮肥施用量最大的国家，过量的氮肥投入已造成严重的环境污
青藏高原水生微生物基因组和基因目录初步建立
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517774.shtm 中国科研人员搜集来自青藏高原湿地、淡水湖、盐水湖、河流、温泉和冰川等六种水生生态系统的498个水体环境DNA样本，并进行宏基因组测序，初步建立了青藏高原水生微生物基因组和基因目录
实质等同性（代谢组学）实验
实验材料SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒[ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤本章描述的方法最适合于分析小麦精白面，但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织，如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前，如其他任何田间试验或温室
实质等同性（代谢组学）实验
实验材料 SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒 [ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材 Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤 本章描述的方法最适合于分析小麦精白面，但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织，如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前，如其他任何田间试
合作成果丨靶向代谢组学
本文内容非商业广告，仅供专业人士参考。关于岛津 岛津企业管理（中国）有限公司是（株）岛津制作所于1999年100%出资，在中国设立的现地法人公司，在中国全境拥有13个分公司，事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心，并拥有覆盖全国30个省的销售代理
实质等同性（代谢组学）实验
实验材料：SIMCA - P 多变量统计软件 试剂、试剂盒：[ 1H ] - NMR 抽提剂 仪器、耗材：Eppendorf 聚丙稀管 NMR 管
代谢组学全流程解决方案
赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱（Orbitrap）质谱平台结合其功能强大的软件平台，提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求，而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标
临床代谢组学研究常见问题
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。Q：如何设置验证集和测试集？A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这几个数据集概念，通常
Science：新方法鉴定肠道微生物组产生的代谢物分子
肠道菌群产生数百种以高水平存在于血液循环中的分子，它们的水平在不同人之间差异很大。这些分子是研究肠道微生物组与宿主相互作用的一个有前景的起点；少数经过详细描述的分子具有强效的免疫或代谢调节活性，并且是G蛋白偶联受体或核激素受体的配体。但是，在大多数情况下，这些分子的产生尚未与特定的细菌菌株或代谢
自然基金资助：微生物生物膜功能代谢组学领域取得进展
自然基金资助成果：我国科学家在微生物生物膜功能代谢组学领域取得新进展 在国家自然科学基金项目（批准号：81274175，31670031 ）等资助下，上海交通大学吕海涛课题组，整合运用精准靶向代谢组学和遗传学整合策略（Precision-Targeted Metabolomics combin
我国科学家提出合成微生物组代谢调控的新方案
微生物感应群体密度，调控自身基因表达情况和群体行为的现象称为群体感应(QS, quorum sensing)现象。群体感应系统(Quorum Sensing System)是指参与该现象的基因簇，其天然广泛存在于微生物群体中，通过以高丝氨酸内脂(AHLs)为代表的一系列小分子传递信号，在微生物种
蛋白质组和转录组的表达谱分析方法相同吗
不相同。对生物体特定状态下的基因和蛋白质表达水平进行全方位分析，或得一个表达谱的“全景图”；挖掘受转录后调控的关键蛋白或关键基因，寻找某些关键的代谢通路或者调控因子；对于一些蛋白数据库不完整的物种，通过转录组数据构建蛋白质库，可以大幅度提高蛋白质的鉴定数。
单细胞测序新技术：同时分析转录组和甲基化组
单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而，在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。这是因为细胞之间存在较大的差异，又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组。加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授领导团队解决了这个问题。他们在Genome Biology杂志上发
高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析完成
9月22日，中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位，成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱，构建了栽培和野生豌豆泛基因组，解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构，为揭示豌豆起源驯化，以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。
Nature子刊发布重磅测序技术：基因组和转录组平行测序
四月二十七日的Nature Methods杂志上发布了一项引人注目的测序技术，G&T-seq（Genome and Transcriptome Sequencing）。该技术能够实现大规模的DNA和RNA平行测序，同时展现单个细胞的基因组序列和基因活性。 研究人员用G&T-seq对220个小鼠
六倍体小麦调控组和亚基因组的分化调控研究
普通小麦(Triticum aestivum L.）是经两次远缘杂交而形成的一种异源六倍体作物，含有A、B和D三个亚基因组。亚基因组分化对多倍体小麦基因组可塑性具有重要贡献，且成为其成功驯化的关键因素之一。然而，决定小麦亚基因组分化的时空特异性调控机制尚不清楚。中国科学院遗传与发育生物学研究所研
－Cell特辑：从基因组到代谢组学——癌症标记物的进展
“Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推荐文章集合手册，主要介绍某个生命科学研究领域最新的进展及突出成果。相关特辑内容包括研究论文，评论性文章以及snapshots，涉及了同一领域的方方面面，更为重要的是这些文章由赞助商赞助，可以免费获取。 癌症生物标记物是
代谢组学前沿与热点——定性代谢流解决方案
作为代谢组学领域先进解决方案的一贯领导者，安捷伦近期隆重推出了全新的定性代谢流解决方案—— MassHunter VistaFlux 工作流程，旨在关注代谢组学的前沿和热点，提供更快、更准、更完整的高效工作流程，助力科研工作者拓展组学研究的精度与深度。 下面将从五个方面助您了解定性代谢流及安捷
后微生物组时代－首次发现人体特有的病毒组
我们人体中的病毒会影响微生物群体的结构和行为，但是关于身体许多区域的噬菌体，也就是感染细菌的病毒，科学家们所知甚少。近期一组研究人员发现，在膀胱中整合进细菌基因组的是噬菌体要比细菌本身多得多，这项出乎人意料的研究发现公布在1月29日的the Journal of Bacteriology杂志上。
一组新分子可以预防与年龄有关的疾病
耶路撒冷希伯来大学医学院的Einav Gross教授和Shmuel Ben-Sasson教授领导的一项新研究发现了一组分子，可以使细胞修复受损的成分，使这些组织保持正常功能成为可能。这种分子的功效在一个模型生物身上得到了证实。研究小组研究了各种疗法对寿命和生活质量的影响，并成功证明了它们可以保护有机
Nature子刊重要发现：基因和出生地共同塑造肠道微生物组
人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用，许多人类疾病都与微生物组失衡有关。美国能源部西北太平洋国家实验室和劳伦斯伯克利国家实验室的科学家们最近解析了塑造肠道微生物组的背后推手。他们十一月二十八日在Nature
Nature子刊：顺产or剖腹产－或影响婴儿微生物组和疫苗反应
儿童疫苗旨在为童年期相关的一系列感染性疾病提供保护。这些疫苗与免疫反应的相互作用、诱导效果如何，对于在婴儿体内产生的保护力至关重要。人们已知微生物组在疫苗接种的免疫反应中发挥重要作用。但是对早期生活及其对肠道微生物组组成的影响，与后续儿童疫苗反应之间的关系，我们仍所知不多。 2022年11月1
新发现！特殊分子能将肠道微生物组和大脑功能联系起来
日前，一篇发表在国际杂志Science Advances上的研究报告中，来自格拉斯哥大学等机构的科学家们通过研究描述了一种新型分子，其能建立肠道微生物组和大脑之间的直接关联，该分子或能导致临床前小鼠模型机体中大脑细胞功能的抑制。图片来源：CC0 Public Domain 这项研究中，研究人员
BOA：揭秘饮食、肠道微生物组和结直肠癌发生之间的关联
最近对动物模型的研究证据表明，特殊类型的肠道细菌在结直肠癌的发病过程中扮演着重要角色，如果肠道中微生物菌群失衡会诱发机体患结直肠癌的话，那么基于饮食的治疗性干预措施或许就能够通过改善机体肠道微生物组的组成来降低个体的患癌风险。 近日，来自德国慕尼黑理工大学的研究人员在国际杂志BioResear
BMI阈值可预测青少代谢疾病风险研究概要
研究从国家健康与营养调查研究（NHANES）数据库中入选12.0～18.9岁的3385例青少年，根据是否合并代谢综合征以及美国疾病预防控制中心（CDC）指南及FITNESSGram指南所推荐的诊断肥胖的BMI阈值对其进行分类，以确定识别代谢综合征的最佳BMI百分位数。CDC指南及FITNES
青岛能源所等开发微生物组内部代谢互作示踪新技术
微生物组（Microbiome）是微生物在自然界中的存在形式，它们无处不在、无所不能，与我们每个人乃至海洋、土壤、大气的健康都息息相关。在微生物组的内部，不同种类的微生物之间存在着复杂、精妙的相互作用与影响，这一跨物种的细胞间代谢互作网络是群落功能和进化的基础。然而由于自然界中绝大部分微生物尚难
100多个血压相关基因组新区域发现
美国国立卫生研究院领导的研究团队在人体中发现了100多个可能影响血压的基因组新区域，并确定了几个与铁代谢和肾上腺素能受体有关的风险基因座。这些见解有助于发现潜在的血压药物靶点。NIH领导的研究发现，遗传标记可以解释两个人血压差异高达12%。图片来源：国家人类基因组研究所这项发表在30日《自然·遗传学
Proton和HiSeq外显子组平台比较
Proton和HiSeq外显子组平台比较：单核苷酸变异检测均表现良好美国国家癌症研究所的研究人员在近日发表的有关Proton和HiSeq 平台的对比研究显示，在进行外显子组测序时，Life Technologies的Ion Proton和Illumina的HiSeq 2000在单核苷酸变异检
基因组重排的定义和发生节点
基因是一个包含必要的信息,在可控制的方式生产功能的RNA产物的核酸段。它们包含这个产品是在什么条件下发号施令的监管区域,转录区域发号施令RNA的产品序列,和/或其他功能序列。身体发育和生物体的表型可以想到作为一个相互交融的基因与环境的产品,可以继承的单位和基因。主要发生在减数第一次分裂前期的交叉互换