化学学院邹鹏课题组利用光催化邻近标记技术揭示应激颗粒转录组动态变化

应激颗粒是在胁迫条件下形成的动态结构,通常认为其中包含翻译被抑制的RNA以及翻译元件,并可在刺激消失后解聚,是细胞内典型的无膜细胞器。在应激颗粒组装的不同阶段,大量RNA分子会被招募至应激颗粒中,对维持应激颗粒结构的稳定和刺激下通过调节基因表达来影响细胞生存等方面发挥重要作用。近年来,关于应激颗粒中的RNA成分问题已经开展了大量的研究。例如,基于成像的技术能够直接观测不同转录本在应激颗粒中的定位,以及可以实现在活细胞中监测转录本在不同颗粒之间的交换与翻译状态。然而,成像技术受限于较低的通量,并且需要已知的序列信息设计引物或构建报告分子,难以对应激颗粒中的RNA组成进行全局研究。另外,基于抗体的亲和沉淀分离应激颗粒并结合高通量测序技术能够提供应激颗粒的转录组信息。在实际操作中,复杂的分离纯化步骤很容易造成组分丢失或引入污染,从而导致转录组数据含有较高的假阴性与假阳性。同时,这种分离方法无法应用于研究应激颗粒的组装与解聚动态过程......阅读全文

慢性不可预知温和应激-(CUMS)-模型实验

基本方案             实验方法原理 通过建立慢性不可预知温和应激模型,模拟抑郁症患者的疾病状态,可用于抗抑郁药物的筛选和抑郁症病理生理机制的实验研究。药物干预依据个人实验

tRFtiRNA:为什么以及如何研究它们?(一)

概述    转运RNA (tRNA)是一种参与解码mRNA、翻译蛋白质的接头分子。近年来的研究表明tRNA还能作为小非编码RNA (sncRNA)的主要来源之一,具有独特且多样的功能1。这些tRNA来源的ncRNA并非随机降解的产物,而是通过精确的生物发生过程产生的 (图.1) 。源自tRN

RNA提取心得(组织RNA提取和培养细胞的RNA提取)

一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织,这样RNA提取的效果比较好,这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的(最好在半年之内,-80℃或者液氮中冻存的)组织,注意不要反复冻融,从冰冻状态拿到0-4℃,注意不要拿到常温,待组织解冻后,用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织,称重后,放到预冷的匀浆器中,然后

RNA干扰相关知识RNARITS)

RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质,通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。

RNA分离与分析实验_分离RNA

实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀,每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚,充分混匀,于 60

RNA干扰相关知识RNARISC

RNA-induced silencing complex(RISC):一种RNA-蛋白质复合物,通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC,miRNA组装miRISC。RISCs(无论siRISC还是miRISC)包括两种类型:切割型和不切割型。

反义技术——RNA干扰(RNA-interference,RNAi)

最近由于RNA干扰(RNA interference,RNAi)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA干扰是由长的双链 RNA

RNA电泳

RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and  TransferUsing glyoxal

RNA标记

RNA标记是将标记物(如放射性同位素、荧光素或酶)共价地连接到RNA,通过检测标记物,进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛,在疾病诊断方面也很有前景。 理想的RNA标记方法应符合以下要求: 1.  操作简单,灵敏度高 2.  不影响碱基配对的特异性 3.  不影响RN

RNA降解

新鲜细胞:如果试剂没有问题,且外源性污染也可以排除,那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如  果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织:某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏,胸腺等),即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮条件下将组织

RNA标记

RNA labeling (Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes  32P-pCp 3' End-labeling

RNA-电泳

①电泳RNA 所用器械如制胶的模具、梳子、电泳槽等用肥皂粉洗干净后用双蒸水冲洗二遍后在室温晾干备用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %琼脂糖凝胶,倒胶时溴化乙锭(E直接加入凝胶中。③制备好的琼脂糖凝胶板放入电泳槽后再加入经高压灭菌过的1XTBE ,液面只能刚好同胶面平齐,缓冲液不要淹过胶面。④点样

指导RNA

中文名称指导RNA英文名称guide RNA;gRNA定  义一种小分子RNA,约含60~80个核苷酸,在RNA编辑中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或删除的信息。由小环DNA及大环DNA编码的指导RNA均带有编辑区的序列信息,可介导编辑过程。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调

Quantitating-RNA

RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an

RNA-Electrophoresis

Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th

RNA-剪接

中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定  义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子,连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

RNA提取

RNA提取(主要内容如下)Tips for Handing RNA Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum  Basic Procedures for Handing

RNA电泳

·         RNA Gel (Crawford Lab)·         Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis. ·         Northern

Nature:发现调控应激细胞命运的关键分子

  应激反应在调节体内平衡过程中具有重要作用,主要通过调节细胞存活和死亡实现。在应激反应过程中,会出现应激颗粒,是一种细胞质区室,可以使细胞在各种应激条件下存活。应激颗粒的组装和拆卸缺陷与多种疾病有关,比如神经退行性疾病、异常抗病毒反应、癌症等。  炎性小体是应激反应中重要的蛋白质复合体,能够感知与

肠应激综合征的并发症

  症状出现或加重常与精神因素或一些应激状态有关。部分病人伴有上胃肠道及肠道外多种功能紊乱的症状。还可伴有心理精神异常表现,如抑郁、多疑、紧张、焦虑、敌意等。

关于应激性溃疡的基本信息介绍

  应激性溃疡泛指休克、创伤、手术后和严重全身性感染时发生的急性胃炎,多伴有出血症状,是一种急性胃黏膜病变。应激性溃疡的发病率近年来有增高的趋势,主要原因是由于重症监护的加强,生命器官的有效支持,以及抗感染药物的更新,增加了发生应激性溃疡的机会。

研究揭示应激血糖代谢的新机制

日前,中国科学技术大学研究员刘际课题组揭示了一条肾上腺非依赖性的下丘脑-交感-肝脏轴通路调控应激血糖代谢的新机制。10月5日,相关研究结果发表于《自然-通讯》。下丘脑-交感-肝脏轴调控应激血糖的示意图。中国科大供图应激反应是动物在处理威胁时作出的本能反应,其中包括血糖快速上升来应对潜在的危险。经典的

PM2.5-可致人体应激激素升高

  复旦大学公共卫生学院阚海东教授课题组带领硕士研究生李慧楚、副研究员蔡婧,在大气细颗粒物(PM2.5)健康危害机制研究中取得新进展。他们发现,PM2.5 暴露可引起人体应激激素水平显着上升,并促进机体的脂类氧化以及糖类和氨基酸的代谢,进而产生血压升高、炎症反应等现象,危害心血管健康。该发现为防治

解密植物对环境变化的应激反应

  近日,山东建筑大学市政与环境工程学院副教授侯书国团队联合美国得州农工大学、杜克大学,法国图卢兹大学、日本冈山大学等知名大学的研究团队,通过对植物如何感受环境变化作出应激反应的研究,揭示了植物对病虫害、干旱等环境胁迫因素的应激机理,国际期刊《自然》在线发表这一研究成果。这一重要发现改变了人们以往对

研究发现:应激激素促进乳腺癌转移

   长期以来,人们一直认为压力会导致癌症恶化。近日,瑞士巴塞尔大学和巴塞尔大学医院的科学家们破解了乳腺癌转移与应激激素增加之间的分子机制。此外,他们还发现,在癌症治疗中经常被用作消炎药的应激激素合成衍生物会降低化疗的疗效。研究结果来自于人源性乳腺癌小鼠模型,并可能对乳腺癌患者的治疗产生影响。该研究

血小板在在免疫应激中协助运送细菌

研究人员发现,血小板在驱动系统对作出反应的过程中发挥了重要作用,新成果发表在11月在线出版的《自然—免疫学》期刊上。 血小板的经典作用是它们参与了血凝反应。然而,Dirk Busch和同事指出,特定类型的细菌在中会被血小板迅速包裹,这一过程依赖于一种血小板所表达的分子GPIb。被包裹的细菌被

母亲创伤后应激障碍-胎儿早产风险高

  一项最新研究显示,与其他已知的危险因素类似,活动性创伤后应激障碍(PTSD)可能是早产的一个新的危险因素。斯坦福大学学者Jonathan G. Shaw博士在12月5日妇科学和产科学杂志的一篇文章中报道,在这项迄今为止最大的PTSD暴露分娩的队列研究中,在分娩前经历PTSD的母亲其胎儿早

动物应激试验中动物跑台的作用

  做动物应激试验,将鹌鹑放到动物跑台上,给予声音刺激,让它沿着跑道向前跑动。   动物跑台类似于一个小型跑步机,前面是一个传送带,传送带末尾有电栅,通电后给予电刺激。如果小动物跑速过慢就会从跑道掉到电栅上受到电击。   抓了只笼子里贼活泼的,放在跑道上。一切顺利。   开启传送带,小鹌鹑刚开

研究揭示内质网还原应激加速衰老

延缓衰老和健康衰老与生活质量密切相关,氧化还原失衡是衰老的重要因素。然而,根据“衰老的自由基学说”通过抗氧化来抗衰老的策略未能达到理想干预效果,促使科研人员对氧化还原调控抗衰老做进一步思考。针对这一问题,中国科学院生物物理研究所陈畅课题组提出精准氧化还原调控是抗氧化的关键(Antioxid Redo

肠应激综合征的并发症

  症状出现或加重常与精神因素或一些应激状态有关。部分病人伴有上胃肠道及肠道外多种功能紊乱的症状。还可伴有心理精神异常表现,如抑郁、多疑、紧张、焦虑、敌意等。