英国建成首个粮食作物微生物组低温库

英国宣布建成全球首个公开资源的主要粮食作物微生物组低温库(UK-CMCB),将致力于保存栽培在英国土壤中的6种主要粮食作物的重要微生物组样本,包括活性微生物、作物根部环境的基因组和DNA序列。 UK-CMCB由国际应用生物科学中心(CABI)、英国洛桑研究所(Rothamsted Research)等研究机构科学家创建,将采用液氮低温技术保存涉及不同作物的所有生物资源。UK-CMCB的建设将涵盖生物信息学、微生物学、植物健康学和存储设施等学科,还包括分离植物生长有益细菌和构建合成微生物群。通过DNA测序技术表征,还可以帮助科学家保存作物根部微生物组成分和功能,以及开发提高作物生长潜力的技术。......阅读全文

英国建成首个粮食作物微生物组低温库

  英国宣布建成全球首个公开资源的主要粮食作物微生物组低温库(UK-CMCB),将致力于保存栽培在英国土壤中的6种主要粮食作物的重要微生物组样本,包括活性微生物、作物根部环境的基因组和DNA序列。  UK-CMCB由国际应用生物科学中心(CABI)、英国洛桑研究所(Rothamsted Resear

英国建成首个粮食作物微生物组低温库

  英国宣布建成全球首个公开资源的主要粮食作物微生物组低温库(UK-CMCB),将致力于保存栽培在英国土壤中的6种主要粮食作物的重要微生物组样本,包括活性微生物、作物根部环境的基因组和DNA序列。  UK-CMCB由国际应用生物科学中心(CABI)、英国洛桑研究所(Rothamsted Resear

英国建成首个粮食作物微生物组低温库

  英国宣布建成全球首个公开资源的主要粮食作物微生物组低温库(UK-CMCB),将致力于保存栽培在英国土壤中的6种主要粮食作物的重要微生物组样本,包括活性微生物、作物根部环境的基因组和DNA序列。  UK-CMCB由国际应用生物科学中心(CABI)、英国洛桑研究所(Rothamsted Resear

全球最大的海洋微生物组数据库建立

9月4日,《自然》在线发表中外科学家的合作成果,该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者,助理研究员刘琨为文章共同第一作者。该成果在《自然》报道   山东大学供图微生物已在生物制造、

全球最大的海洋微生物组数据库建立

  9月4日,《自然》在线发表中外科学家的合作成果,该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者,助理研究员刘琨为文章共同第一作者。  微生物已在生物制造、生物医药、生物农业、环境治理等

研究人员构建人类阴道微生物基因组库

6月21日,深圳市宝安中医院(集团)副院长黄链莎、转化医学中心助理研究员孙文与大连医科大学副教授鄢秋龙等课题组的最新合作成果发表于《自然—微生物学》。人类女性阴道是一个包括细菌、真菌和病毒在内的复杂微生态系统,各微生物之间是相互制约、相互作用、相互依赖、对立统一的关系,其间的平衡关乎女性生殖健康及胎

“百万微生态”计划将构建全球最大人体微生物组数据库

  2019年10月26日,“百万微生态”国际合作计划(MMHP)在深圳第14届国际基因组学大会(ICG-14)上正式启动,来自中国、瑞典、丹麦、法国、拉托维亚等多国科学家将合作开展微生物宏基因组研究,致力于在未来三至五年内对100万份来自肠道、口腔、皮肤、生殖道等器官的微生物组样品进行测序分析,绘

融智生物发布全球首个商用化生物组学微生物质谱数据库

  近日,融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。  传统上,基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异,对核糖体蛋白组的质谱测试,可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TO

利用种子低温标准库科学储藏种子

    种子是农业的根本,因此与种子相关的工作内容非常多,而种子的储藏就是其中的一项重要内容,而为了更加科学的储藏种子,现在多是采用专业的种子低温标准库。由于种子是有生命的东西,没一粒种子都有一个胚,而胚能够生根、发芽,继而长成植株。而湿度和温度是促使种子生根、发芽的基本条件。因此利用种子低温标准库

种子低温储藏库可用于超干烟草种子低温保存

    种子低温储藏是近年来种子保存方面应用的比较多的一种技术,针对于很多种子也是非常有效的一种储藏方式,而且随着科技的发展,也有相应的设备可以使用,那就是种子低温储藏库,利用它来直接贮藏种子,可以实现种子的长期储藏,同时有效保持种子的生活力。    烟草种子是比较常见的作物种子,实现长时间的烟草种

研究构建绵羊和山羊肠道高质量微生物基因组数据库

近日,西北农林科技大学羊遗传改良与生物育种团队携手国内外多家科研机构,在绵羊和山羊肠道微生物基因组数据库构建及肠道粘蛋白和多糖代谢功能菌种挖掘方面取得进展,研究成果发表在Microbiome上。研究团队在全国范围内的32个羊场收集了来自21个绵羊和山羊品种共计320个肠道样本,分别构建了包含1.6亿

种子低温储藏库如何做到种子以丰补歉?

     种子生产的数量和种类,虽然在生产之前会进行市场调研,预测市场需求,但是俗话说计划赶不上变化,有时还是会由于一些原因导致种子积压,而为了做到种子的以丰补歉,这就需要利用种子低温储藏库来贮藏种子,创造良好的种子贮藏条件,保证种子有较高的活力,使其来年依然具有良好的播种品质。    一般来说,种

低温种子标准样品库的两个特点

    在现代很多的种子生产企业中,使用低温种子标准样品库来储藏种子已经不是什么新鲜事了,不仅有效延长了种子的储藏寿命,降低了种子储藏期间受环境影响所造成的损失,同时由于保证了储藏的效果,因此也更加有利于种子的生产工作,方面种子排产,解决种子剩余的后顾之忧。不仅在种子生产企业,在其他与种子相关的研

种子低温储藏库——高粱种子安全贮藏方法

    高粱是我国北方主要的杂粮,高粱种子收获时天气寒冷,种子不易干燥,同时又容易混入外颖等杂物,更不利于通风散湿,从而导致高粱种子发生霉变。尤其是用于育种试验的种子,要如何避免高粱种子变质呢?    种子低温储藏库是现代种子储存的有利设备。它采用了低温抑制种子生理生长的原理,能让种子种质在十几年甚

全球首个冰川微生物数据库

青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。 现在,中国科学家构建的

基因组所发布全转录组关联研究知识库

近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心(NGDC)开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在

超4000种-融智生物发布商用化生物组学微生物质谱数据库

  近日,融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。  传统上,基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异,对核糖体蛋白组的质谱测试,可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TO

中外科学家合作建立全球最大海洋微生物组数据库

9月4日,国际顶级期刊《自然》(Nature)在线发表中外科学家的合作成果“ Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting ”。该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗

中外科学家合作建立全球最大海洋微生物组数据库

  9月4日,国际顶级期刊《自然》(Nature)在线发表中外科学家的合作成果“ Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting ”。该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具

代谢组学常使用的数据库

  代谢组主要是对小分子代谢物(一般50-1500 Da)进行高通量定性和定量分析,代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据,方便后续的代谢组学数据分析,揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。  目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD

种子低温标准库的建设要考虑哪些内容?

    种子储藏是保障种子品质,防治种子损失和浪费的重要措施,因此只要是与种子相关的,大部分都会涉及到种子的安全储藏。虽然种子的储藏方式很多,有普通干藏、密封干藏、湿藏等,但是要长期储藏大量种子,达到良好的种子储藏效果,实现种子的高效利用,那么我们建议是建设专业性更强的种子低温标准库,而要发挥

种子低温标准库的使用和管理办法

   种子低温标准库是采用机械降温,智能控制的方式来创造适合种子长期储藏的环境,一般来说,种子低温标准库可以长期稳定的实现低温低湿环境,因此可以说是储藏杂交种子和一些名贵种子的理想储藏设备,通过试验证明,应用种子低温标准库储藏种子,可以延长种子的使用寿命,保持较高的发芽率,对于提高种子的经济应用价值

北京基因组所开发表观组关联分析数据库

  近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核

中国BIGD跻身国际生物组学数据库

  测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代,海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究,基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究,组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出,搭建组学数据库,实现海量信息的存储、整合及

研究开发表观组关联分析数据库

  近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核

《自然》获得首创性全基因组RNAi库

来自奥地利科学院维也纳分子生物学研究院(Institute of Molecular Biotechnology of the Austrian Academy of Sciences)的研究人员以果蝇为研究对象,利用一套完整的基因组序列数据,从达到了88%覆盖率的蛋白编码基因中获得了全基因组范围内

研究发布大豆多维组学数据库SoyOmics

  大豆(Glycine max (L.) Merr.)是重要的粮油作物之一,其产量提升、品质改进关乎全球人口的需求和利益。高通量测序技术的发展促使大豆组学研究不断深入。实现大豆多维组学数据的整合分析,将会为大豆遗传育种提供有力支持。  近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜团队联合北京基因组

cDNA文库组标准流程八:pBlueScript-cDNA库扩增

1.试剂及配方:2 x LB (1升):        20g    氯化钠        20g    蛋白提取物        10g    酵母提取物      加入蒸馏水至1升,用NaOH调pH值至7.0,高压灭菌2 x LB-甘油(12.5%)(200ml)175ml  2 x LB液体2

基因组所完成开发RiceWiki数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台,是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。   水稻是人类重

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese