英国建成首个粮食作物微生物组低温库
英国宣布建成全球首个公开资源的主要粮食作物微生物组低温库(UK-CMCB),将致力于保存栽培在英国土壤中的6种主要粮食作物的重要微生物组样本,包括活性微生物、作物根部环境的基因组和DNA序列。 UK-CMCB由国际应用生物科学中心(CABI)、英国洛桑研究所(Rothamsted Research)等研究机构科学家创建,将采用液氮低温技术保存涉及不同作物的所有生物资源。UK-CMCB的建设将涵盖生物信息学、微生物学、植物健康学和存储设施等学科,还包括分离植物生长有益细菌和构建合成微生物群。通过DNA测序技术表征,还可以帮助科学家保存作物根部微生物组成分和功能,以及开发提高作物生长潜力的技术。......阅读全文
全球未培养微生物培养组计划启动
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511761.shtm
抗生素干扰婴儿肠道微生物组
在我们的肠道里,生活着许多微生物群落,它们在调控机体代谢和免疫防御功能上起着关键作用。这些微生物群落的集合被称为肠道微生物组。美国《科学转化医学》杂志6月15日发表的研究结果显示,使用抗生素会降低婴儿肠道微生物组的多样性和稳定性。 在世界大部分地区,对患病婴幼儿用抗生素治疗已成常规做法,美国孩
The-Scientist:肺部微生物组决定你的健康
近年来,肺部微生物组对呼吸道健康的重要性逐渐受到了科学家们的重视。The Scientist杂志特别撰文介绍了这一领域的最新进展。 如果将人类的消化系统看作是从口腔延伸至胃和肠道的一条河流,那么肺就是河流旁的湖泊,常常被湍急的水流波及,密歇根大学的Gary Huffnagle说。Huffnag
肠道微生物组与儿童行为问题有关
一项新的研究表明,有行为问题的孩子的肠道微生物组可能有不同的成分,父母在差异的明显程度方面起着重要作用,值得重视。 肠道微生物很重要 肠道微生物组中至少有400种细菌,数万亿种微生物生活在消化道中,这意味着肠道中细菌的数量比体内所有细胞都要多。肠道中的微生物执行重要功能,包括合成维生素、抵御
北京生科院提出微生物组解析新技术
1月23日,国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室赵方庆团队题为MetaSort untangles metagenome assembly by reducing microbial community
Gastroenterology:微生物组与肠癌发生的关系
最近,根据来自George Washington大学研究者们在《Gastroenterology》杂志上发表的一项新研究,患有结肠癌的患者体内的一种蛋白突变体阻断了调节细胞增殖和扩张的信号通路,从而增加了促进结肠癌发展的肠道微生物种群,这最终导致肠癌恶化的后果。这些发现表明了微生物组中细菌与结肠
免疫球蛋白-影响肠道微生物组
IgA(免疫球蛋白A)是最丰富的黏膜抗体,动物模型实验表明它可以强化肠道屏障,防止危险细菌破坏宿主。然而,缺乏特异性IgA的人通常只有轻微的症状。法国巴黎免疫与疾病研究中心珍妮·法德拉等科学家,比较了健康个体与缺乏IgA个体的粪便微生物组,发现在缺乏IgA的不同患者中,不同属的细菌占不同的主导地
Nature惊人发现:谁可媲美微生物组
Nature惊人发现:谁可媲美微生物组 来自纽约大学Langone医学中心的微生物学家说,他们获得了第一个强有力的证据证实,天然存在于肠道中的病毒(他们将其称作为“病毒组”(virome))像居住在肠道中、构成“微生物组”(microbiome)的细菌一样发挥了维持健康以及对抗
迄今最久微生物基因组草图出炉
英国《自然》杂志日前在线发表的一项演化学研究报告,近乎完整地构建出了一种口腔细菌的基因组,这个有48000年历史的微生物的基因组,是迄今为止历史最悠久的微生物基因组草图,研究同时揭示了尼安德特人的饮食结构。 尼安德特人的DNA序列和现代人类的DNA序列非常相似。他们是现代欧洲人祖先的近亲,从1
生殖健康方向微生物组研究进展
近年来,微生物组学的研究提升了关于身体各部位共生微生物的认识。中国科学院北京生命科学研究院研究员赵方庆团队发现微生物组学或进一步拓展对女性生理和生殖健康方面的认识,并有助于提升治疗水平。 作为人体最主要的菌库之一,阴道菌群及其对女性生理和生殖健康的作用显而易见。作为“生命摇篮”的宫腔像一个黑箱
质疑:肥胖真的与微生物组有关么?
我们体内生活着不计其数的微生物,它们组成的生态系统就是微生物组。近几年人们发现微生物组对人体健康有着重要的影响,微生物组研究因此受到了极大的重视,甚至被称为是人体的“第二基因组”。 研究者们普遍认为微生物组参与了许多重要的生理活动,比如消化食物、合成营养物质和抵御疾病。包括肥胖在内的许多人类疾
中国科学家建立全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。 现在,中国科学家构建的全球首个青藏高原冰川微生物
中国科学家建立全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。 现在,中国科学家构建的
微生物所举办噬菌体资源库建设研讨会
4月26日,噬菌体资源库建设研讨会在京召开。会议由中国科学院微生物研究所主办,中国普通微生物菌种保藏管理中心和mLife期刊联合承办。 会上,微生物所所长钱韦阐述了噬菌体库建设对应对耐药问题的重要性,希望噬菌体资源库保持公益性,建立噬菌体功能研究平台,“资源化、数据化、工程化”齐头并进。中国普
低温对锂离子电池组机能的影响分析
低温对锂离子电池组机能影响▲低温对充放电机能影响跟着温度的低落,锂离子电池的放电平均电压和放电容量均有所低落,尤其当温度为-20℃时,电池的放电容量和放电平均电压下降较快。▲低温对轮回机能影响电池在-10℃的情况下容量衰减较快,100次轮回后容量仅剩59mAh/g,容量衰减47.8%;将在低温下放过
2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验
仪器、耗材DBMS实验步骤3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动输入操作
2DE-蛋白质组学的-PROTICdb-数据库实验
实验步骤:3.1 PROTICdb 概述在输入或浏览数据时,每个最终用户需要一个 PROTICdb 账户(由您的管理员创建 ) 。作为一个新用户,首先要创建一个新的项目。一旦建立,该项目就属于这个用户,这个用户有权授予其他用户访问权限。为确保数据一致性的精确度,尽量不要用手动输入操作。因此,
成都生物所研究构建易变山羊草首个转录组数据库
易变山羊草(2n=4x=28, UUSvSv, Ae. variabilis syn. Triticum peregrinum (Hack In J. Fraser) Marie & Hackel)是小麦的近缘物种,与小麦进行远源杂交时可产生可育后代,是小麦育种改良的重要资源。人们除了从
中国科学院:生物组学数据库获国际认可
记者12月20日从中国科学院北京基因组研究所获悉,该所生命与健康大数据中心(BIGD)建成的生物组学数据库首次获得国际认可。 BIGD团队近日在国际学术期刊《核酸研究》上发表研究论文《北京基因组研究所生命与健康大数据中心:从存储到整合、再到转化》,这是中国首次以数据中心的模式,整体发布中国生物
新研究在番茄基因组库中添加近5000个基因
现在,来自农业研究局(ARS)和Boyce Thompson研究所(BTI)的科学家们在刚刚发表的《Nature Genetics》一文中,重点讨论了这个问题。 位于纽约伊萨卡的ARS植物、土壤和营养研究实验室的分子生物学家James Giovannoni和BTI生物信息学科学家Zhangju
微缩化技术在宏基因组测序建库中的应用
2020年伊始,突如其来的新冠疫情牵动着每个人的心。自武汉卫健委首发肺炎疫情情况通报后的短短一个星期,新型冠状病毒就在实验室中被检出,并获得了该病毒的全基因组序列。如此快速地确定病原体抢占研究先机,宏基因组测序技术功不可没。 宏基因组学(Metagenomics),以环境样品中的微生物群体为研究对象
我国科学家开发出转录组快速建库新方法
北京大学与清华大学联合课题组近期在国际权威学术期刊《美国科学院院刊》发表论文,称开发出了名为“SHERRY”的转录组测序快速建库新方法。研究团队表示,这种方法大大简化了建库过程,不仅可用于高质量的单细胞转录组测序,对包括新型冠状病毒等样本的测序质量和速度也有望显着提升。 核糖核酸(RNA)是存
北京基因组所的脑疾病知识库BrainBase正式上线
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的脑疾病知识库BrainBase正式上线。相关研究成果以BrainBase: a curated knowledgebase for brain diseases为题,在线发表在Nucleic Acids Resear
蛋白质组学之窗:英国生物库项目将改写疾病认知
导读:一项有史以来规模最大的开放获取蛋白质组学数据集为未来发现新型药物靶点和生物标志物奠定了基础。来自英国生物库制药蛋白质组学项目的科学家们在本月发表于《自然》杂志的两项重要研究中揭示了遗传学、蛋白质表达和人类疾病之间的新联系。该研究分析了来自超过54,000名英国生物库参与者的蛋白质组数据,展示了
我国发布首个柑桔全基因组变异数据库
近日,《园艺研究》(Horticulture Research)在线发表了中国农业科学院柑桔研究所构建完成的柑桔全基因组变异数据库CitGVD(http://citgvd.cric.cn/home),这是第一个园艺类作物全基因组变异数据库。 柑桔是全世界最重要的商业水果作物之一。当前,柑桔类物
迄今最大哺乳动物基因组库为进化提供新见解
当21世纪初,小鼠、人类、大鼠和黑猩猩的完整基因组首次发表后,遗传学家通过比较基因序列为了解哺乳动物进化打开了大门。为什么一些哺乳动物嗅觉特别灵敏?为什么有些哺乳动物要冬眠?为什么一些哺乳动物的大脑发更大?20年后的今天,由美国麻省理工学院、哈佛大学等单位的科学家牵头的大型国际研究项目——“Zoon
如何降低温度对微生物絮凝剂的影响?
降低温度对微生物絮凝剂影响的方法:优化使用条件:在使用微生物絮凝剂之前,通过实验确定在不同温度下的最佳投加量、搅拌速度和反应时间等参数,以补偿温度变化带来的影响。选择耐温菌株:筛选和培育具有良好耐温性能的微生物菌株来生产絮凝剂,从源头上提高微生物絮凝剂对温度的耐受性。预处理污水:如果可能,对污水进行
赵立平专访:人类微生物组研究,解密人体第二基因组
2007年12月美国《科学》杂志预测:人体共生微生物的研究将可能是国际科学研究在2008年取得突破的7个重要领域之一。就如何研究共生微生物与人体健康的关系等问题,4月刚刚出席了巴黎国际人类微生物组研究联盟筹委会会议的上海交通大学生命科学技术学院教授赵立平接受了《科学时报》的采访。 深圳华大基因
2013值得关注的技术:微生物组功能研究
《Nature Methods》杂志将2012年度技术授予了定向蛋白质组学(targeted proteomics)。同时,杂志还介绍了2013年值得关注的技术,包括纳米孔测序仪(Disruptive nanopores)、微生物组功能研究(Probing microbiome func
Nature:营养不良破坏你的微生物组
人类的肠道菌群建立于幼儿时期,这些微生物对于儿童的健康有着重要的影响。日前科学家们在孟加拉一个贫民区,对健康和严重营养不良的儿童进行了研究。研究人员在这些儿童出生后两年中,跟踪分析了他们的肠道菌群,发现营养不良会破坏微生物组的健康发展。就算通过膳食治疗改善营养不良的症状,也不能恢复这样的破坏。这