基因组精确注释新方法:增强子鉴定新技术

近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所动物功能基因组学创新团队研发出增强子鉴定新技术。该技术与传统技术相比,平均分辨率提高了约10倍,为基因组的精确注释提供了新方法。相关研究成果发表在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上。 增强子是一种基因组非编码区的顺式调控元件,它与启动子相互作用调控基因的表达,对增强子的正确鉴定有助于理解基因表达机制。然而目前不同的技术对增强子鉴定的长度差别较大,导致基因组中这些增强子区域没有被正确解读。 为了解决这一问题,科研团队开发了增强子鉴定新技术。该技术的优势在于具有较高的准确性和一致性,可以有效地去除序列冗余,直接鉴定序列的增强子功能。它还可以大规模地进行增强子鉴定,适用于多种细胞类型。 文章摘要图片该研究得到国家重点研发计划项目、国家自然科学基金、中国农业科学院科技创新工程和广东省自然科学基金等项目的支持。......阅读全文

牛油果无间隙参考基因组组装助力脂肪酸生物合成和抗病性相关基因鉴定

  牛油果属樟科鳄梨属常绿乔木,原产于中美洲。为阐释牛油果的遗传信息,中国科学院西双版纳热带植物园植物基因组演化与次生代谢研究组利用NGS、PacBio HiFi、ONT、Pore-C等测序技术对西印度品种的牛油果进行了全基因组测序,并组装了841.6Mb无间隙的牛油果基因组序列。  研究显示西印度

裸子植物鉴定实验_其他常见裸子植物的观察鉴定

实验材料华山松等试剂、试剂盒乙酸洋红仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤观察华山松、青海云杉、刺柏、杜松,圆柏,叉子圆柏等植物。

蕨类植物鉴定实验——其他常见蕨类植物鉴定

实验材料石松标本卷柏(或中华卷柏)腊叶标本石松茎横切片石松卷柏孢子叶穗纵切片问荆(或节节草)新鲜叶片(或腊叶标本)蕨腊叶标本蕨地下茎横切片蕨孢子囊群水封 片(或永久封片)蕨原叶体装片常见蕨类植物的标本仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤(四)其他常见蕨类植物的观察另外观察槐

微生物鉴定药敏分析仪细菌鉴定原理

  细菌鉴定原理:采用传统的比色法和快速荧光法。根据不同类别细菌的理化性质不同,设计不同的测试卡, 每一张卡包括多项生化反应。仪器采用光电比色法测定细菌因分解底物导致PH值改变或由于细菌生长利用底物而引起的透光度变化;其荧光法是在测试卡的小孔中加入酶底物, 使其与细菌产生的酶结合生成荧光物质。仪器在

核酸鉴定方法之浓度/纯度及完整性鉴定

核酸纯化在分子生物学实验室已经广泛应用。怎样获得高质量、高纯度的DNA或RNA样品对下游实验的顺利进行至关重要,因此,对纯化后的核酸进行鉴定也是必不可少的步骤。本文简单的回顾学习一下核酸鉴定的方法。核酸鉴定包括:浓度/纯度鉴定+完整性鉴定 1.浓度/纯度鉴定 (1)紫外分光光度计:原理:由于核酸中的

泽泻叶的鉴定

  性状鉴别 叶皱缩卷曲,展平后完整者呈椭圆形、长椭圆形或宽卵形,长6-12cm,宽4-8cm。两面均为绿色或黄绿色,先端锐尖或钝尖,基部圆形或心形,全缘;叶柄长20-30cm。呈细长圆柱状,基部稍膨大成鞘状。质脆,易破碎。气微,味微酸、涩。

红三七的鉴定

  干燥根茎近圆柱形,根头处稍粗壮,外表棕黑色,粗糙凹凸不平、具节,节上有明显疙瘩突起,须根黑色,卷曲而长。质坚硬,断面粉红色至棕红色。气微,味淡微涩。

续断的鉴定介绍

  (1)本品横切面:木栓细胞数列。皮层较窄。韧皮部筛管群稀疏散在。形成层环明显或不甚明显。木质部射线宽广,导管近形成层处分布较密,向内渐稀少,常单个散在或2~4个相聚。髓部小,细根多无髓。薄壁细胞含草酸钙簇晶。粉末黄棕色。草酸钙簇晶甚多,直径15~50μm,散在或存在于皱缩的薄壁细胞中,有时数个排

种子植物鉴定实验

实验方法原理植物分类主要是根据桢物各部分形态特征来进行的,在鉴定一种植物时,首先要对该种植物进行全面细致的分析观察,并作好描述记录,以利鉴定工作进行。实验材料植物材料仪器、耗材放大镜实验步骤(一)一般被子植物分析观察的内容1 生活型:是乔木、灌木、草本(一年生、二钉生或多年生),还是藤本(木质或草质

Southern-blot杂交鉴定

1)取10ul待测DNA,于一定浓度的琼脂糖凝胶上进行电泳。(20mL,1.0%凝胶,)2) 凝胶用溴化乙锭染色,切掉凝胶四周多余部分,并在凝胶的一角作一记号, 拍照记录电泳结果(拍照时, 凝胶旁放一尺子)。3) 杂交用胶的制备 (做以下步骤两组合一)A.将凝胶浸没入30mL 0.25mol/L H

亲子鉴定步骤:采样

●可以进行DNA检测的样本可以是 血痕、口腔粘膜、带毛囊的毛发。●血痕采集用针轻刺皮肤表面(手指尖、耳垂、脚后跟以及身体表面任何部位),待血流出时,用准备好的纱布或则餐巾纸轻轻擦拭,在其表面留下3-4个如同黄豆大小的血印即可。  ●口腔粘膜采集从药店购买单头消毒棉签,每人三根。拿起一根棉签伸进口腔在

娑罗子的显微鉴定

  1.七叶树:种皮解离组织:1.1.种皮表皮细胞黄棕色,表面观多角形,直径15-38μm,壁略不均匀增厚,角部有锥状工瘤状突起;断面观类长方形或类方形。  1.2.种皮下皮细胞卵圆形、类圆形或类长方形,长径25-93μm,短径21-43μm,壁稍厚,纹孔及孔沟较稀疏。  1.3.种皮分枝细胞较大,

高效鉴定致病弧菌

肠出血性大肠杆菌(EHEC)迅速蔓延的历史教训已经向人们证明:快速鉴定并及时遏制致病菌十分重要。对于致病性弧菌,也是如此。该致病菌不仅分布于水域中,也存在于鱼类和海产品这类在德国越来越受欢迎的食品当中。目前,这类食品的人均年消费量为16KG。此外,全球气候的持续变暖,也使得这些致病菌向德国的沿

什么是血型鉴定?

  ABO血型系统主要是根据人类红细胞表面所含凝集原(即血型抗原,有A、B、H三种)的不同而命名的。ABO血型鉴定,即指ABH血型抗原的检测。红细胞含A抗原的叫A型,含B抗原的叫B型,含A和B抗原的叫AB型;不含A、B抗原,而含H抗原的称O型。A型人血清中只含抗B抗体;B型血清中只含抗A抗体;AB型

亲子鉴定的方法

  鉴定的方法主要有以下几种:  (1)血型鉴定。血型鉴定,就是根据血型的遗传规律对亲生关系的判定。ABO式的血型遗传是受A、B和O三个等位基因控制的。每个人都有其中任何两个基因,这两个基因可以是相同的。在两个染色体配对时,可组合有6种基因,即AA、AO、BB、BO、AB、OO,这6种基因就是决定生

STR细胞鉴定意义

  导读:   新买到的细胞,实验室传了几代的细胞,又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞,被污染了么? 鉴定正确么?用它做研究会影响实验结果么? 没有经过相应的细胞鉴定,使用了被污染的细胞,经过大量的实验,写出一篇论文,但是结论被推翻,论文被召回,大量的时间、物力和人力被浪费,一切都要从头再来。

金沸草的鉴定介绍

  性状鉴别  旋覆花。茎呈圆柱形,长30-60cm,直径2-5mm,表面绿褐色或暗棕色,有多数细纵纹;质脆,断  面黄白以,纤维状,髓部中空。叶互生,叶片披针形或长圆形,多破碎,绿黑色或绿灰色,基部渐狭,无柄,全缘或有疏齿;叶脉在背面隆起,中脉1条,侧脉8-13对。有时可见茎端生有扁于形的干燥头状

益智的化学鉴定

  薄层层析:取该品适量,粉碎后加水蒸馏,提取的挥发油加无水硫酸钠脱水后点样于硅胶G薄层板上,以樟脑、1,8-桉油精为对照品,石油醚-醋酸乙酯(85:15)展开,10%磷钼酸乙醇液显色,样品液色谱在与对照品色谱的相应位置上有相同斑点。该品以个大、饱满、气味浓者为佳。

肠道杆菌的鉴定

肠道杆菌是一群寄居于人或动物的肠道内的细菌,多数为非致病菌或条件致病菌,少数为致病菌。其生物学性状相似,但生化反应、抗原  构造有差异,据此可将它们分类、鉴定。 实验目的:熟悉肠道杆菌未知标本分离和鉴定方法;2.掌握肥达式反应的原理及结果分析,熟悉其操作过程; 3.了解大肠杆菌  、痢疾杆菌及伤

细菌鉴定系统用途

①细菌鉴定功能:可以将绝大部分细菌及真菌鉴定到“种”及“亚种”水平,这些细菌包括:肠杆菌科中的20个菌属、非发酵菌中的8个菌属、弧菌科中的3个菌属、奈瑟菌科中的2个菌属、微球菌科的3个菌属以及酵母样真菌中的6个菌属,合计近200种细菌(或真菌)。②抗生素敏感度分析功能:可以根据被检细菌在不同浓度的各

ABO血型的鉴定

实验概要1. 观察红细胞凝集现象。  2. 学习ABO血型鉴定方法,掌握血型鉴定原理。实验原理ABO血型是根据红细胞表面存在的凝集原决定的。存在A凝集原的称为A血型,存在B凝集原的称为B血型。而血清中还存在凝集素。当A凝集原与抗A凝集素相遇或B凝集原与抗B凝集素相遇时,会发生红细胞凝集反应。一般A型

如何鉴定天平砝码

 如何鉴定天平砝码 一、天平砝码以其操作简单、称量准确可靠等优点,迅速在工业生产、科研、贸易等方面得到广泛应用。但因电子天平的计量性能经过一段时间的使用后可能发生变化,国家规定对其性能应进行定期检定。目前检定电子天平的依据文件是《JJG98-90 非自动天平检定规程》(以下称JJG98 - 90)

STR细胞鉴定意义

导读:新买到的细胞,实验室传了几代的细胞,又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞,被污染了么? 鉴定正确么?用它做研究会影响实验结果么? 没有经过相应的细胞鉴定,使用了被污染的细胞,经过大量的实验,写出一篇论文,但是结论被推翻,论文被召回,大量的时间、物力和人力被浪费,一切都要从头再来。背景介绍应

肠道杆菌的鉴定

肠道杆菌是一群寄居于人或动物的肠道内的细菌,多数为非致病菌或条件致病菌,少数为致病菌。其生物学性状相似,但生化反应、抗原  构造有差异,据此可将它们分类、鉴定。 实验目的: 1.熟悉肠道杆菌未知标本分离和鉴定方法; 2.掌握肥达式反应的原理及结果分析,熟悉其操作过程; 3.了解大肠杆菌  、

什么是痕迹鉴定

痕迹鉴定属于刑事技术鉴定,只能有具有专门技术的侦查人员来完成。痕迹鉴定是刑事侦查中常用的鉴定。 刑事诉讼中的痕迹是指犯罪行为所引起的一切物质环境的改变。 广义的痕迹,包括与犯罪行为有关的可以证明犯罪事实的所有物质。如留在犯罪现场的犯罪工具、衣物、毛发、血迹以及其他物质;与犯罪有联系的有机生命体,如受

质粒DNA电泳鉴定

1.目的学会常用的DNA琼脂糖凝胶电泳。2.原理DNA双螺旋分子骨架两侧带有含负电荷的磷酸根,在电场中会向正极方向移动。不同长度的DNA由于受到凝胶介质的阻力不同,表现为不同的迁移率而被分开。3.器材电泳仪,水平凝胶电泳槽和梳子及其制胶模块,250ml三角瓶,微波炉,台式离心机,旋涡混合器,凝胶成像

白薇的显微鉴定

  1.根横切面:表皮为类多角形细胞,外壁稍增厚。皮层约为20余列类圆形薄壁细胞,含细小淀粉粒和草酸钙簇晶;内皮层细胞扁长,凯氏点明显。表皮为径向延长的细胞。中柱鞘为1-2列切向延长的薄壁细胞;韧皮部窄;形成层成环;木质部导管、管胞、木纤维及木薄细胞壁均木化;导管直径8-56μm。  2.根茎横切面

红粉中药化学鉴定

  取该品0.5g,加水10ml,搅匀,缓缓滴加适量的盐酸溶解后,溶液照下述方法试验:  (1)取溶液1ml,加氢氧化钠试液(呈碱性时),即生成黄色沉淀。(检查汞盐)  (2)取溶液1ml,调至中性,加碘化钾试液,即生成猩红色沉淀,能在过量的碘化钾试液中溶解;再以氢氧化钠试液碱化,加铵盐即生成红棕色

亲子鉴定知多少?

  什么是亲子鉴定?    学术点讲,亲子鉴定就是利用医学、生物学和遗传学的理论和技术,从子代和亲代的形态构造或生理机能方面的相似特点,分析遗传特征,判断父母与子女之间是否是亲生关系。    提起亲子鉴定,很多人会想到古代小说上常常提到的滴血认亲。古代"滴血认亲"的方法,分为两种。一种叫滴骨

种子植物鉴定实验

实验方法原理 植物分类主要是根据桢物各部分形态特征来进行的,在鉴定一种植物时,首先要对该种植物进行全面细致的分析观察,并作好描述记录,以利鉴定工作进行。实验材料 植物材料仪器、耗材 放大镜实验步骤 (一)一般被子植物分析观察的内容1 生活型:是乔木、灌木、草本(一年生、二钉生或多年生),还是藤本(木