基于生成式人工智能的新算法MIDAS,实现单细胞多组学数据的马赛克整合
目前,单细胞多组学技术日益成熟,测序数据也在不断增长。然而,不同组学组合、不同测序技术、不同测序样本的“马赛克”式单细胞数据的整合是该领域的巨大挑战。 2024年1月23日,军事医学研究院应晓敏团队和伯晓晨团队在 Nature Biotechnology 期刊发表了题为:Mosaic integration and knowledge transfer of single-cell multimodal data with MIDAS(利用MIDAS进行单细胞多模态数据的马赛克整合和知识迁移)的研究论文。 该研究提出了一种用于单细胞多组学数据马赛克整合及知识迁移的计算工具——MIDAS,首次实现了通用的单细胞多组学马赛克数据的模态对齐、数据补全、批次校正等整合功能,为构建大规模多组学细胞图谱、实现大规模单细胞多组学分析与知识迁移提供了重要的原创技术。 单细胞测序技术是近年来生命科学领域的突破性技术,能够检测单个细胞内的......阅读全文
基于生成式人工智能的新算法MIDAS,实现单细胞多组学数据的马赛克整合
目前,单细胞多组学技术日益成熟,测序数据也在不断增长。然而,不同组学组合、不同测序技术、不同测序样本的“马赛克”式单细胞数据的整合是该领域的巨大挑战。 2024年1月23日,军事医学研究院应晓敏团队和伯晓晨团队在 Nature Biotechnology 期刊发表了题为:Mosaic inte
应晓敏/伯晓晨团队开发基于生成式人工智能的新算法MIDAS,实现单细胞多组学数据的马赛克整合
研究提出了一种用于单细胞多组学数据马赛克整合及知识迁移的计算工具——MIDAS,首次实现了通用的单细胞多组学马赛克数据的模态对齐、数据补全、批次校正等整合功能。 军事医学研究院应晓敏团队和伯晓晨团队在 Nature Biotechnology 期刊发表了题为:Mosaic integratio
德国JUMO压力变送器日常如何维修
德国JUMO GmbH & KG公司成立于1948年,位于德国中部城市Fulda。公司经过六十多年的发展,已经成为欧洲的仪表制造厂商,公司主要致力于生产高质量的传感器、变送器及控制器,可提供工业温度、压力、湿度、液位、流量、pH值、电导率、氧化还原值的测量、控制及记录产品。 该德国JUMO
质谱沙龙第十五期活动报道
2008年12月21日下午,质谱沙龙第十五期活动在第二炮兵总医院远程会诊中心会议室举行。来自发酵研究院、清华大学、二炮总医院、朝阳医院、北大医学院、北医三院、安贞医院、解放军307医院、中科院植物所、AB公司的各位专家、老师、学生20余人。 质谱在植物代谢组学中的应用
著名学者提出新的衰老研究观念
美国加州Buck衰老研究所的Judith Campisi教授主要从事衰老学研究,她的研究揭示了细胞衰老的分子机制及其在人类衰老和癌症中所扮演的角色,有多篇研究成果和综述发表在Cell、Nature, Science、PNAS、EMBO Journal、Aging Cell等一线期刊上。 最近,
科学家开发新的宏基因组分析工具
对环境样品(如海水、医院表面和人类肠道)直接进行微生物测序,已经阐明了我们世界中存在的大量微生物。然而,一个微生物物种可能存在遗传多样性,而在宏基因组分析中往往捕获不到这种多样性。最近在《Genome Research》发表的一项研究中,科学家们开发了一种新的工具,来检测细菌物种内的遗传差异,并
AB-Sciex赞助参加CPSA-2011上海年会
第二届CPSA年会于2011年4月14日在上海淳大万丽酒店顺利召开,AB Sciex 公司赞助并参加了本次年会,4月14日中午AB Sciex的资深应用工程师们在酒店的Danube 宴会厅为大家带来一场精彩的AB Sciex产品应用实例报告会。 AB Sciex 公司展
三重四极杆线性离子阱质谱系列仪器的特点
技术特点: QTRAP系列质谱仪是SCIEX公司独有的三重四极杆-线性离子阱复合型质谱仪,它将业界知名的灵敏度、稳定性和扫描速度等三重四极杆黄金标准技术,与灵敏的、速度同样出色的的线性离子阱质谱技术结合在一起,既保留了串联四极杆质谱仪的很多优势:如母离子扫描(PS)、中性丢失扫描(NL)以及MR
计算机辅助鉴定药物代谢产物
随着分析仪器的发展,单个代谢样品中即可检测到成千甚至上万个化合物,如此庞大的数据亟需无监督的自动化鉴定过程。计算机的引入有效解决了大数据处理难题,同时加速了无标准谱图化合物的解析过程,在一定程度上实现了药物代谢产物的自动化鉴定。计算机辅助鉴定方法多种多样,根据其工作原理,现分为化学结构数据库基础上的
质谱沙龙第三十四期活动报道
基于芯片多通道纳喷质谱的液滴萃取表面分析(LESA) 华质泰科生物技术(北京)有限公司首席技术官刘春胜博士为大家作了题为《基于芯片多通道纳喷质谱的液滴萃取表面分析(LESA)》的报告,主要介绍了芯片多通道纳喷离子源(TriVersa NanoMa
持续复制压力是FA症状的潜在内源性病因
范可尼贫血症(Fanconi anemia, FA)是一种严重的人类遗传疾病,最初由瑞士儿科医生Guido Fanconi在1927年发现记录。其主要表现为骨髓衰竭(bone marrow failure, BMF)、发育畸形及癌症的易发性。迄今为止,已发现至少有22种FA基因(FANCA-W)
《财富》:投资生命科学收益率高于投资信息技术
在风险投资界,科技风投公司好比是电影明星,生命科学风投公司则是跑龙套的。或者说,他们是冠军与参与奖的区别。最近的福布斯最佳创投人排行榜(Forbes Midas List)就说明了这一点,排名最前的生命科学投资人仅在榜单中位列第16名(Venrock风投公司(Venrock)的布莱恩·罗伯茨)。
载有3000余辆汽车货船太平洋起火-部分为纯电动汽车
据悉,本周,一艘载有数百辆电动汽车的货轮在太平洋上发生火灾,火势极为猛烈,船上的灭火系统无法将其扑灭,22 名船员被迫撤离至附近一艘商船上。这艘名为“晨光米达斯号”(Morning Midas)的货轮由伦敦的天蝎座海运公司(Zodiac Maritime)管理,长 600 英尺(IT之家注:约 18
Gilson推出VERITY®1910MS检测器-质量范围达501400-m/z
Gilson近日宣布推出VERITY®1910MS检测器,与其广受欢迎的VERITY 1900检测器相比,提供了更多功能,包括扩展到50-1400 m/z质量范围。这种更广泛的质量范围可满足许多制药和生物技术科学家对肽和小分子蛋白质进行制备色谱纯化的检测需求。增强型VERITY 1910质谱检测
2013财年NIH资助情况简析
编者按:已知美国国立卫生研究院(NIH)2013财年预算为308.60亿美元。本文结合NIH Map Viewer对2013财年NIH的实际资助情况进行简要分析。由本文可知,2013财年NIH资助项目达71 631项,大部分项目获得资助额度在10万~60万美元的区间内,获250万
关于细胞凋亡的讨论
细胞调亡与坏死鉴别的简便方法 midas1、PI和Hoechst33342双标:PI、Hoechst33342均可与细胞核DNA(或RNA)结合。但是PI不能通过正常的细胞膜,Hoechst则为膜通透性的荧光染料,故细胞在处于坏死或晚期调亡时细胞膜被破坏,这时可为PI着红色。正常细胞和中早期调亡细胞
华人学者Nature子刊单细胞基因组测序新突破
在加州大学圣地亚哥分校生物工程师们的领导下,研究人员生成了来自单个大肠杆菌细胞以及人类大脑单个神经元的最完整基因组序列。采用一项新的单细胞基因组测序技术,他们在只有12纳升体积、充满液体的小孔中完成了基因组扩充,从而获得了这一突破性的成果。该项研究发表在11月10日的《自然生物技术》(Natur
SCIEX举办QTRAP®十五周年庆典-风雨同舟-助力中国质谱发展
分析测试百科网讯 2017年6月22日,SCIEX公司QTRAP®用户会暨QTRAP®十五周年庆典在北京举办,来自北京及周边地区各领域的SCIEX用户、SCIEX中国高层领导及工作人员近百人参加了本次活动。分析测试百科网作为支持媒体参加了本次活动。SCIEX十五载QTRAP®历史 QTRAP®
The-Scientist:聚焦CRISPR研究先锋张锋
作为近两年大热的CRISPR技术先锋人物之一,张锋(Feng Zhang)博士成为了科学界冉冉升起的一颗最闪亮的新星。近日,The Scientist以“Feng Zhang: The Midas of Methods”为题,向我们介绍了这位出生于80后,年仅32岁的华人科学家(延伸阅读:CR
QTRAP代表文献回顾
生物分子发表的代表性文献 QTRAP:同时具有三重四极杆和线性离子阱性能的独一无二的LC/MS/MS系统 QTRAP系统最早在ASMS 2002上,作为第一台商用的线性离子阱发布,是世界上唯一的线性离子阱和三重四极杆的复合串联液质联用系统。QTRAP具有独一无二的能力,可以运行蛋白
AB-SCIEX-建立业界首个被验证的过敏原质谱检测法
食物过敏的患病率日益升高,增强了政府部门、食品公司和第三方检测机构对更精确的识别和定量的检测需求。 马萨诸塞州弗雷明汉市—2011年10月26日 生命科学分析技术的全球领导者AB SCIEX公司,今天宣布推出世界上首个经过验证的
大规模单细胞测序构建第一个人脑神经元表达图谱
这项研究开发了首个方法用于人类大脑神经性元不同亚型的鉴定,奠定了"绘制"人脑神经元细胞基因活性方法的基础;同时,可以帮助我们更好的理解人脑正常功能及疾病异常,包括阿尔茨海默氏症、帕金森症、精神分裂症和抑郁症等。通过分离和对单个人类大脑神经元细胞核进行单细胞核转录组测序,研究人员在人脑的六个高级功
关于多聚赖氨酸的配制、保存、使用总结与问题2
八、使用说明操作步骤(可直接在玻片上涂布)1.灭菌的ddH2O 1:10稀释该多聚赖氨酸溶液。2.用之前将稀释的多聚赖氨酸溶液放在室内,使其温度到室温18-26℃3.将玻片浸在稀释的多聚赖氨酸溶液5分钟。注意增加时间不会提高包被效果。4.在60℃烘箱1小时干燥,或室温18-26℃过夜干燥待用。九、注
AB-Sciex视频讲座“AB-Sciex-电喷雾质谱在蛋白质组学中的应用”
4月12日,AB Sciex 公司在分析测试百科网成功举办了题为“AB Sciex 电喷雾质谱在蛋白质组学中的应用”的网络视频讲座。AB Sciex 亚太应用支持中心的靳文海博士首先为大家简单介绍了蛋白质组学和质谱技术发展方向,接下来重
最新DNA甲基化测序技术比较研究
在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具体模式通常与诸如疾病亚型、疾病预后以及药物反应等临床信息具有一一对应的联系。在多种癌症的治疗过程中,DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。 对于拥有成千上万个样本的大量病人来说,全基因组映射与DNA甲基化分析是非常合
从美日医保制度,看药明康德为何“闪崩”?
自1月26日下午2点开始,药明康德股价突然出现大量抛售,直接触及跌停板,显示市场的悲观情绪。同时,大量的卖单堆积,显示出强大的卖出压力。这一下跌趋势迅速影响到了整个生物医药板块,造成了板块整体的动荡。 紧随其后,港股市场中的四家药明系公司也出现了大规模的股价跳水。其中,药明股价跌幅一度超过了3
四十年质谱历程,十五载QTRAP荣耀——SCIEX-QTRAP15周年厦门站
SCIEX QTRAP产品十五周年纪念活动厦门站在翔鹭国际大酒店举办。现场图片 分析测试百科网讯 2017年12月8日,在第三届全国质谱分析学术报告会开幕前夕,SCIEX QTRAP产品十五周年纪念活动登陆厦门,100余专家、学者参与了此次活动,共同探讨QTRAP技术应用与实际案例。 主持人
ANTOP——液质联用类产品获奖盘点
作为分析测试行业前进的见证者,分析测试百科网忠实记录着行业前进的每一个步伐! 自2017年开启ANTOP奖以来,已成功举办3届,科学仪器企业竞相参与,得到了广大网络用户的好评和业界人士的高度关注,下面小编将为您盘点历届获得ANTOP奖的液质联用产品。 免液氦FT-离子回旋共振质谱 奖项主体:
ANTOP质谱类获奖产品盘点
易用型离子淌度高清质谱 奖项主体:Waters Vion IMS QTof 获奖理由:复杂样品得到的分析数据通常也很复杂,可能会存在共流出的色谱峰和背景干扰,这会使得化合物的鉴定变得十分困难,方法开发的成本也会随之增加,且非常耗时。 Waters Vion IMS QTof将离子淌度质谱技
AB-SCIEX-QTRAP-5500系统:突破与超越
AB SCIEX QTRAP ® 5500系统突破与超越—AB SCIEX QTRAP ® 5500系统能解决其它LC/MS/MS系统所不能解决的更多难题 超越与突破 — 超快的扫描速度和高灵敏度,解决其它质谱系统所不能解决的难题 AB SCIEX QTRAP 5500 ® 系统是将