科学家首次实现对斑马鱼全脑十万级神经元实时监控
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519158.shtm记者15日从中国科学院自动化研究所获悉，来自该所和中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心的科研人员，开发了一套实感智能计算-控制平台。基于该平台，他们在国际上首次实现对斑马鱼全脑十万级神经元的实时监控。相关研究成果在线发表于《自然·神经科学》杂志。全脑范围单神经元活动成像技术，是解析大脑并行分布式计算原理的有力工具。然而，受限于数据实时处理能力，该技术很难实时分析以及在大尺度上闭环调控和研究脑功能。受天文学领域快速射电暴检测技术的启发，科研人员建立了光学神经信号预处理系统，即实感智能计算-控制平台，成功对高达500MB/s的大数据流神经功能数据进行实时配准、信号提取和分析。利用该平台，研究团队首先实时监控了斑马鱼的全脑神经元，进而快速提取和分析了斑马鱼的全脑神经元活动，同时对任意选择的神经元集群活动进......阅读全文
斑马鱼嗅觉作用主要是左鼻子
斑马鱼嗅觉作用主要是左鼻子 如同人有“左撇子”一样，鱼也有类似“左撇子”的鼻子。 日前，日本名古屋市立大学与国立遗传学研究所的一项新研究发现，斑马鱼发挥嗅觉作用的主要是左鼻子。相关研究论文在线刊登在了近期出版的《自然—神经科学》(Nature Neuroscience)杂志上。
敲降斑马鱼基因的方法学比较
一、基因敲降的前期准备工作相同 1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。 1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎（通常为48 hpf前的胚胎），提取总RNA，然后进行体外转录（RT）。 1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物，以1.2获得的cDNA为模板，
斑马鱼的胚胎原位杂交试验实录
收集斑马鱼的胚胎，在Holfretor水中培养，到达所需要的发育时期时，用蛋白酶去除卵膜，用4%多聚甲醛固定，在4℃保存，二十四小时后用50%甲醇2%多聚甲醛溶液洗，然后换成甲醇，在-20C 保存，待用（两天和两天以上的胚胎需要用双氧水处理，去除色素。或者使用苯锍脲稀溶液培养，可阻断色素的形成）原位
Dev－Cell：转基因斑马鱼的彩色皮肤
美国杜克大学的研究人员，利用基因工程改造的方法，造成单个的皮肤细胞可以产生70种不同颜色的荧光。该研究发表在最近的《Developmental Cell》上。 该团队并非是为了好玩才做成这样五彩斑斓的斑马鱼，实际上，他们希望通过颜色标记来研究斑马鱼皮肤的愈合。利用颜色来标记细胞，可以让斑马鱼皮
斑马鱼胚胎细胞的培养——细胞系
实验材料链酶蛋白酶E用D-PBSA配制1%胰蛋白酶和1mmol L EDTAZEM-2细胞（或等同物）试剂、试剂盒LDF基础培养液LDF原代培养液LDF维持培养液D培养液Holtfreter缓冲液实验步骤鳟鱼胚胎提取物：(a)收集胚胎（受精后 28 天的 Shasta Rainbow 或其他鳟鱼种系
除了小鼠，斑马鱼也被盯上了－|－PNAS
植有人类肿瘤细胞（红色）的斑马鱼胚胎，这一模型有望帮助医生快速筛选癌症患者最佳的治疗方案（图片来源：Rita Fior团队） 最新一期《PNAS》在线发表了一篇题为“Single-cell functional and chemosensitive profiling of combinato
寄生虫感染或破坏斑马鱼实验
研究人员表示，一种感染实验室斑马鱼的常见寄生虫可能令多年的行为实验结果产生混淆。不过，批评者认为，这个案例仍有待证实。 和小鼠一样，斑马鱼被用在全球的实验室中，以研究从药物疗效到诸如精神分裂症和自闭症等遗传性疾病和障碍的所有事情。由于斑马鱼和人类都具有高度社会性，因此研究人员认为，和啮齿类动物
斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4
斑马鱼基因敲除是怎么做的？
一、基因敲除的设计方案1.1 基因的基本信息确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR，分析其效率及脱靶的情况一般使用C
－Nat－Commun：斑马鱼可用于癫痫药物筛选
化学药物Clemizole在“Dravet综合症”的一个斑马鱼模型中能有效防止癫痫类发作。在Nature Communications上发表的这一发现确认了一个新方法，后者有可能被用来识别癫痫病的另类疗法。 “Dravet综合症”是一种从婴儿时期开始的严重癫痫，以严重的、自发的和复发的
敲降斑马鱼基因的方法学比较
一、基因敲降的前期准备工作相同1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎（通常为48 hpf前的胚胎），提取总RNA，然后进行体外转录（RT）。1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物，以1.2获得的cDNA为模板，进行PCR扩增，确认目标基因
斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4
Nature：系统解析斑马鱼参考基因组
斑马鱼(Zebrafish)是研究发育生物学的新兴模式动物。斑马鱼由于具有饲育容易、胚胎透明、体外受精、突变种多、遗传学工具成熟等诸多优点，近年来已成为研究脊椎动物发育与人类遗传疾病的新兴模式动物。 近日，英国桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)
斑马鱼胚胎细胞的培养——原代培养
实验方法原理收集胚胎，除去绒毛膜，用胰蛋白酶分散胚胎细胞，然后在胚胎成纤维细胞饲养层上培养从斑马鱼囊胚和原肠期胚获得的原代细胞。实验材料链酶蛋白酶E用D-PBSA配制1%胰蛋白酶和1mmol L EDTA胚胎成纤维细胞饲养层人重组白血病抑制因子试剂、试剂盒LDF基础培养液LDF原代培养液LDF维持培
Nature－Methods发布突破性成像技术
苏黎世联邦理工学院的研究人员开发了一种新显微成像技术，首次实现了在活体三维组织中选择性成像单个细胞。这一成果发表在五月十八日的Nature Methods杂志上。 研究人员用这一技术在斑马鱼幼鱼的神经系统中获得了惊人的微观图像。他们不仅展示了脊髓中的运动神经元，还以另一种颜色突出了其中一个神经
《自然》：发现斑马鱼造血干细胞生成机理
为医学界研究白血病疗法提供了新思路 法国科学家日前通过对斑马鱼胚胎进行即时监控，发现了其造血干细胞的生成机理。这一成果为医学界研究白血病疗法提供了新思路。 该研究由法国国家科研中心和巴斯德研究所共同完成。研究人员在最新一期英国《自然》杂志上报告说，他们采用即时成像技术对斑马鱼的胚胎进行了观察
斑马鱼：一条游上“试药路”的小鱼
蓝色的世界、嗡嗡作响的机器、不时出现的人影……湖蓝色的塑料鱼缸里，七八条小鱼在水中自由游弋，不时停下来盯着外面的世界。看见人影走近，有的小鱼开始在鱼缸里打转，有的则依旧悠然地游来游去。 这些体长不过５厘米、带有墨蓝色斑纹的斑马鱼并不知道，它们从一出生就已同那些野外的同类们分道扬镳，成为人类医药
国际首例－他们用光指挥斑马鱼的白细胞
未来，如果你生病了，除了吃药外，还有更多简单高效的治疗方式可选择，比如用光照一照身体就能远程遥控白细胞，从而主动调动身体的免疫能力。这并非科幻。我国科学家已实现了在活体上用光将白细胞变成“医学微机器人”，可自主控制白细胞的激活和运动，这在国际上是第一例。7月13日，暨南大学李宝军教授和郑先创教授研究
孕酮信号可独立维护斑马鱼精巢正常发育
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/3/474828.shtm 近日，中国科学院水生生物研究所一项研究发现，揭示了孕酮/ NPGR信号对斑马鱼精巢发育的调控作用。研究发现，动物体内增强的孕酮/NPGR信号，可以发挥不依赖于雄激素信号通路，促进
“太空养鱼”后续来了！4条斑马鱼状态良好
今年4月26日，载有4条斑马鱼和金鱼藻的小型受控生命生态实验组件由神舟十八号载人飞船送往中国空间站问天舱的生命生态科学实验系统的小型受控生命生态实验模块中，开展在轨实验，目前已经过去了二十余天，科研人员介绍，4条斑马鱼的状态良好。航天员成功开展了两次水样样品采集和一次鱼食盒更换操作，发现斑马鱼在微重
淋巴管帮助斑马鱼“培育”早期脑细胞
在大脑发育的胚胎阶段，一些神经元和突触可以正常形成并连接，但另一些不能，导致一些部分和部分被丢弃。这会留下死亡或垂死的细胞，这就需要中枢神经系统雇佣一种清理人员。小胶质细胞接受了这个挑战，“摄取”废物，因此对大脑发育至关重要。然而，科学家们对它们是如何在大脑中繁殖的还缺乏充分的了解。美国圣母大学生物
国际首例－他们用光指挥斑马鱼的白细胞
未来，如果你生病了，除了吃药外，还有更多简单高效的治疗方式可选择，比如用光照一照身体就能远程遥控白细胞，从而主动调动身体的免疫能力。这并非科幻。我国科学家已实现了在活体上用光将白细胞变成“医学微机器人”，可自主控制白细胞的激活和运动，这在国际上是第一例。7月13日，暨南大学李宝军教授和郑先创教授
《干细胞》：斑马鱼细胞可修复人视网膜
在最新一期的《干细胞》（Stem Cells）杂志上，来自英国的研究人员发现，斑马鱼眼睛中的一类叫做Muller胶质细胞的特殊细胞对对视网膜的再生至关重要，该细胞还有助于视力的恢复。研究人员预言，这种Muller胶质细胞可能用于恢复人类受损视网膜。 已经知道，视网膜损伤是造成失明的主要原因，引起视
从斑马鱼身上竟然获得治疗帕金森的方法
与哺乳动物相比，成年斑马鱼会使大脑中的神经元再生，但这种能力的程度和变异性尚不清楚。来自Edinburgh大学脑神经科学研究中心的Thomas Becker及其研究团队探寻了各种多巴胺能神经元群体的丧失是否足以触发神经元的功能性再生。 他们的研究结果为未来治疗具有运动异常、震颤等症状的神经系统
诺奖得主Science解开斑马鱼条纹的秘密
斑马鱼，一种小的淡水鱼，得名于一种醒目的蓝黄色相间条纹图案。在幼鱼皮肤生长过程中，有三种主要的色素细胞类型——黑色细胞、反光银色细胞和黄色细胞出现，它们多层镶嵌，构成特征性的颜色图案。 众所周知，所有这三种细胞类型必须相互作用才能形成适当的条纹，但是，形成成鱼条纹的色素细胞的胚胎起源，直到现在
神经元活动如何产生行为？答案在极个别的神经元中
我们大脑中的神经元活动如何引发行为上改变？从细胞层面到行为学层面存在巨大的鸿沟。这长久以来都是神经科学的难题。近日，来自马克斯普朗克神经生物学研究所的科学家们开发了一种方法，可以让他们识别出那些参与特定运动指令的神经细胞。科学家首次通过人为地激活少数神经元来诱发鱼的行为。了解神经环路的核心成分是
科学家揭示斑马鱼大脑空间信息表达机制
中国科学院上海微系统与信息技术研究所研究员李孟与德国马克斯普朗克学会生物控制论研究所合作，证实了在斑马鱼幼鱼端脑中存在编码空间的神经元，表明斑马鱼可作为研究空间信息在全脑尺度表达及处理的全新模式动物，为开发类脑空间计算及类脑导航提供了理论基础和生物机理支持。相关研究发表于《自然》。当来到一座陌生的城
上海生科院实现清醒小动物大脑多巴胺调质释放的实时检测
11月18日的《神经科学杂志》报道了中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所的最新科研成果。该成果揭示在小巧透明的幼年斑马鱼上，奖赏性嗅觉刺激诱发脑中多巴胺的释放，所释放的多巴胺可以用电化学方法实时记录并能追溯其上游的神经环路。这是首次在清醒的小动物脑中记录到感觉刺激引起的多巴胺释放。对其上游
斑马鱼为何作为高内涵筛选HCS的模式动物？
有两种有效的筛选方法，广泛用于早期药物发现中的化合物分选。这些方法包括高通量筛选 （HTS） 和高内涵筛选 （HCS）。虽然前者从大量新药候选药物中快速有效地分选有用的化合物，但HCS使用基于成像的多参数分析来鉴定可能影响这些药物疗效的化合物。 在本文中，您将了解什么是HCS，使用的不同方法以及常见
斑马鱼模型有助研发关节炎新疗法
你相信么，鱼也会患上关节炎！美国南加州大学研究人员领导的一项研究发现，地球上早期出现的硬骨鱼很容易患上关节炎。研究人员表示，对鱼类关节炎患病机制的研究，或许会加速人类关节炎预防和治疗手段的研究进程。 长有四肢的骨脊椎动物，如人类，都是从肉鳍类鱼进化而来。在生物进化过程中，为更适应生存环境，陆