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生化与细胞所等揭示一种新的蛋白质部分降解机制

国际学术期刊Developmental Cell于6月6日在线发表了中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所赵允研究组、张雷研究组关于Ter94复合物选择K11连接形式泛素化修饰的Ci蛋白被蛋白酶体部分降解的最新研究成果。该工作与加拿大多伦多大学Chi-chung Hui教授合作完成。 蛋白质的泛素化降解作为一个重要的调控机制参与了细胞内的多种生命活动。在这个过程中,蛋白质本身会被加上一种叫做泛素(ubiquitin)的小分子修饰,形成泛素链,从而作为标签被蛋白酶体(proteasome)识别降解。 除了蛋白质的完全降解,人们发现有部分蛋白会通过泛素化-蛋白酶体系统发生部分降解,生成一种具有生物学功能的截短形式的蛋白质片段。其中最典型的例子是Ci/Gli家族的一类蛋白质,它们作为一种直接结合DNA的转录因子发挥作用,调节了与癌症密切相关的Hedgehog信号转导通路的活性。全长的Ci/Gli蛋白能......阅读全文

PNAS-杨弋等-二硫键蛋白质组学研究

我国二硫键蛋白质组学的研究取得新突破。近日出版的《美国科学院院刊》(PNAS),发表了华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室及药学院教授杨弋、哈佛大学医学院教授Joseph Loscalzo合作完成的论文《哺乳动物细胞中线粒体对二硫键蛋白质组的调节》。 这项研究成果,对了解二硫键的形成及

空间蛋白质组学:一种强大的细胞生物学发现工具

真核细胞高度区室化,生物过程被分隔在不同的区室进行。蛋白质功能与亚细胞定位密切相关,不同的区室提供不同的化学环境(例如pH和氧化还原条件)、不同的潜在作用配体或底物。因此,对蛋白质亚细胞定位的严格控制是细胞生理学的重要调控内容。大多数细胞生物学过程涉及蛋白质亚细胞定位的变化,例如转录因子在细胞核-胞

Science推翻长期以来的定论:蛋白质变性全新理论

  生物通报道:敲开一个鸡蛋,滑入热煎锅中,几乎立刻透明和滑溜的蛋清就变白,变硬,在这个过程中我们观察的煎鸡蛋过程,就是生活中十分常见的蛋白质变性这一重要的生化现象。  细胞中蛋白质则是线状分子,缠绕在一起组成蛋白质特异性结构:有些球形,有些是管状的,各不相同。这些结构都会在变性过程中崩解,蛋白质再

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用

     作为后基因组时代出现的新兴研究领域之一, 蛋白质组学(proteomics)正受到越来越多的关注。 蛋白质组学的研究目标是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。 蛋白质组学的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白质分离技术如二维凝胶电泳和高效液相

蛋白质纯化所需的生物提取物制备的实验

实验步骤一、化学法和酶法细胞裂解微量的细胞裂解经常通过化学法或酶法或二者共同采用来完成。例如, 超声和弗式细胞压碎器 (Frenchpress 均质机) 都不便于用在收集小于或等于 5 mL 的培养液的情况,而且应用这些机械的方法经常会遇到过度的产热和样品被氧化等问题。微量细胞裂解的简化方面的重大进

蛋白质纯化所需的生物提取物制备的实验

实验步骤 一、化学法和酶法细胞裂解 微量的细胞裂解经常通过化学法或酶法或二者共同采用来完成。例如, 超声和弗式细胞压碎器 (Frenchpress 均质机) 都不便于用在收集小于或等于 5 mL 的培养液的情况,而且应用这些

酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用

作为后基因组时代出现的新兴研究领域之一, 蛋白质组学(proteomics)正受到越来越多的关注。 蛋白质组学的研究目标是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。 蛋白质组学的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白质分离技术如二维凝胶电泳和高效液相层析, 经典的蛋白质鉴定方法如氨

百人计划人才《细胞》子刊发现细胞因子新功能

来自中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所分子生物学重点实验室(State Key Laboratory of Molecular Biology),美国德州大学西南医药中心的研究人员发现Ufd1是gp78的一个共因子,这揭示了ERAB过程泛素反应中Ufd1的一个未知功能,也说明了U

蛋白质组学概念的起源和发展

  蛋白质组学的诞生和发展,离不开多学科和技术的逐渐交叉融合。这些学科技术包括(但不限于)基因组学、生物化学、分析化学、自动化、基于电磁场的精密质谱仪、信号处理、数理统计和计算机科学。近年来,分子医学、大数据技术和人工智能的发展,进一步加速推动了蛋白质组学的成长,使之在精准医疗领域展示出越来越大的应

Science重要成果:蛋白质组绘图新技术

  为了更清楚地了解细胞内正在发生的事件,科学家们需要知道数以千计蛋白质和其他分子的定位。麻省理工学院的化学家们现在开发了一项新技术,可以标记细胞某一特定区域中所有的蛋白质,从而更准确地绘制这些蛋白质的图像。   领导这一研究的是著名华裔女科学家、化学副教授Alice Ting,她曾

Nature Methods | 朝思暮想:单细胞蛋白质组测序之梦

  近期,Nature Methods 杂志技术编辑Vivien Marx发表文章 A dream of single-cell proteomics,探讨了单细胞蛋白组学的发展,提出了该技术有可能会面对的问题和潜在解决方案。单细胞蛋白质组测序的梦想并不遥远(Credit: S. Larochell

检测细胞凋亡的实验方法比较-2

二、细胞凋亡的细胞化学测定细胞凋亡的细胞化学测定包括细胞表面(细胞膜)的结构和通透性改变的测定和细胞核DNA改变的测定。根据应用的范围,又可分为细胞群休和单个细胞测定两种,以下仅介绍其中几种较为常用的方法。碘化丙啶(propidium iodide,PI)检测早期死亡细胞膜通透性状态的不同是区分细胞

蛋白质和多肽反相HPLC分析和纯化指南(一)

蛋白质组学蛋白质组学是鉴定和定量细胞、组织或生物体蛋白质的科学,目的是了解生物学变化和疾病状态,开发疾病的生物标记和治疗药物的靶点。如果将一个基础蛋白的各个修饰蛋白算作一个蛋白,那么哺乳动物细胞含多达3~4万个蛋白。当计算各个修饰后的蛋白时,蛋白质的数量远远超过了10万。细胞内不同蛋白质的丰度或浓度

一文了解蛋白质组学分析技术

  蛋白质组学(英语:proteomics,又译作蛋白质体学),是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。这个概念最早是在1994年,由Marc Wikins首先提出的新名词。  蛋白质组(Proteome)一词,源于蛋白质(protein)与 基因组(genome

研究发现新物质,或指明疾病在体内的扩散机制

  近日,发表在Journal of Cell Biology上的研究表明,我们细胞中一种前所未知的成分,它能像骑自行车的快递员一样穿梭于繁忙的交通中运送蛋白质。这项发现或许可以解释细胞在疾病(比如癌症)中扩散的机制。  英国华威大学的科学家们发现了这种新的囊泡,这在20年来尚属首次,它是已知最小的

Cell解析蛋白质翻译调控机制

  一个细胞的内部运作涉及到不计其数的单个分子,它们参与到重复循环的相互作用之中来维持生命。蛋白质形成就是这种生命活动的基础。   宾夕法尼亚大学的Joshua B. Plotkin教授说,由于蛋白质是细胞功能的基础构件,科学家们一直以来对于细胞生成蛋白质的机制都极其地感兴趣。   “蛋白质

人体“基因剪刀”抗癌试验首次通过审查

  美国国家卫生研究院一个咨询委员会21日批准了首个利用被誉为“基因剪刀”的CRISPR基因编辑技术来治疗癌症的人体临床试验,让这种目前备受关注的生物医学技术在美国距临床试验仅差美国食品和药物管理局批准一步之遥。   美国国家卫生研究院“重组DNA咨询委员会”批准了这项由美国宾夕法尼亚大学提交的临床

酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用

摘要  蛋白质组学是在后基因组时代出现的一个新兴的研究领域, 它的主要任务是识别鉴定细胞、组织或机体的全部蛋白质, 并分析蛋白质的功能及其模式。 因此, 揭示蛋白质组中蛋白质间的相互作用关系也是蛋白质组学的重要内容之一。 酵母双杂交技术是用来检测蛋白质间是否相互作用的一

大规模蛋白质相互作用研究方法进展(一)

 来源:生命科学 关 薇, 王 建, 贺福初*(军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京 100850)  摘 要:随着2000 年酵母大规模蛋白质相互作用网络图谱的成功描绘,蛋白质相互作用特别是大规模蛋白质相互作用研究成为生命科学领域的又一个研究热点。酵母、果

科学家建立高效运载胞内蛋白质技术

  5月16日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)宋海云研究组与上海应用物理研究所樊春海组合作的研究论文Nanodiamonds Mediate Oral Delivery of Proteins for Stem Cell Activation and Intestinal Remode

科学家建立高效运载胞内蛋白质技术

  5月16日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)宋海云研究组与上海应用物理研究所樊春海组合作的研究论文Nanodiamonds Mediate Oral Delivery of Proteins for Stem Cell Activation and Intestinal Remode

科学家建立高效运载胞内蛋白质技术

  5月16日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)宋海云研究组与上海应用物理研究所樊春海组合作的研究论文Nanodiamonds Mediate Oral Delivery of Proteins for Stem Cell Activation and Intestinal Remode

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  5月16日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)宋海云研究组与上海应用物理研究所樊春海组合作的研究论文Nanodiamonds Mediate Oral Delivery of Proteins for Stem Cell Activation and Intestinal Remode

肿瘤细胞对促凋亡蛋白质敏感性定量研究取得新进展

  近期,医学物理中心戴海明研究员课题组,建立了肿瘤细胞对仅含BH3结构域蛋白质耐受的定量测量研究的新方法,相关成果以Measurements of BH3-only protein tolerance为题发表在细胞死亡的TOP期刊Cell Death and Differentiation(doi

生物医学光学技术

  摘 要:随着生物分子光学标记技术的不断进步,光学技术在揭示生命活动基本规律的研究中正发挥越来越重要的作用,也为医学诊断与治疗提供了更多、更有效的手段。本报告首先简要介绍光学技术在生物医学应用中的发展概况,然后从基因表达及蛋白质—蛋白质相互作用研究方面,讨论生物分子光学技术的特点与优势,阐明基于分

生物医学光学技术

  摘 要:随着生物分子光学标记技术的不断进步,光学技术在揭示生命活动基本规律的研究中正发挥越来越重要的作用,也为医学诊断与治疗提供了更多、更有效的手段。本报告首先简要介绍光学技术在生物医学应用中的发展概况,然后从基因表达及蛋白质—蛋白质相互作用研究方面,讨论生物分子光学技术的特点与优势,阐明基于分

Cell重要成果:绘制凋亡蛋白质组图谱

  斯克里普斯研究所的科学家们同时绘制出了细胞中两种最重要的蛋白质修饰类型的图谱,揭示了在凋亡这一重要细胞过程中它们之间广泛的协同作用。相关论文发表在7月20日的《细胞》(Cell)杂志上。   磷酸化(Phosphorylation)和蛋白质水解(proteolysis)几乎总是被独立开展研究。

Nature方法:巧借“木马”,向细胞传送蛋白

  来自德克萨斯A&M大学的科学家们发现了一种“木马”策略,可以在不损伤细胞的情况下将蛋白质传送至人类活细胞中。研究结果发表在本月的《自然方法》(Nature Methods)杂志上。  该研究小组的首席科学家、德克萨斯A&M大学生物化学副教授Jean-Philippe Pelloi