定制+预测,科学家开发新型激酶谱虚拟筛选平台
5月16日,中国科学院上海药物研究所研究员郑明月课题组利用结合图神经网络的元学习技术,搭建了支持用户定制的激酶多靶点活性筛选人工智能(AI)平台KinomeMETA,为药物新型激酶靶点发现和药物筛选提供有力工具。相关研究发表于《核酸研究》。 蛋白激酶的异常激活或过表达与多种疾病相关,激酶靶向抑制剂是一类极具价值的治疗药物,有必要对激酶小分子探针的多重药理学效应进行系统评估。因此,需要开发具有更广泛应用场景的AI算法,大规模筛选潜在的激酶靶点和多靶点选择性激酶小分子探针。 研究人员基于前期研究,从超过61万个激酶活性数据中学习不同激酶中活性化合物的作用模式,搭建了KinomeMETA平台。平台包含两大核心模块,其中“定制”模块允许用户使用私有数据,构建全新激酶模型或增强已有激酶模型的预测能力;“预测”模块则可预测化合物对661个野生激酶及临床相关激酶突变体的抑制活性概率。平台还提供了化合物激酶选择性分析、分子性质评估及相似......阅读全文
丙酮酸激酶测定介绍
(1)原理:在二磷酸腺昔(ADP)存在的条件下丙酮酸激酶(PK),催化磷酸烯醇丙酮酸(PEP)转化成丙酮酸,在辅酶Ⅰ还原型(NADH)存在情况下,丙酮酸被LDH转化为乳酸。若标记荧光于NADH上,此时有荧光的NADH变为无荧光的NAD. 参考值:正常荧光在20min内消失。l5.0±1.99I
酪氨酸激酶分析实验
实验材料兔肌肉烯醇化酶试剂、试剂盒1 mmol L DTT 50 mmol L HEPES(pH 7.0 )甘油100 mmol L 乙酸5 × 酪氨酸激酶反应缓冲液[γ-32P] ATP 溶液冰 2 × SDS-PAGE 样品缓冲液仪器、耗材30℃ 水浴和沸水浴实验步骤1. 4℃ 最大速度离心 5
尿激酶的制备要求
本品应从健康人群的尿中提取,生产过程应符合现行版《药品生产质量管理规范》要求。本品在生产过程中应有病毒安全性控制的措施,工艺中需经60℃加热10小时,以使病毒灭活。
肠激酶的分离纯化方法
与大多蛋白的分离纯化方法类似, rEK可通过硫酸铵沉淀、DEAE柱、凝胶层析和透析等方法得到纯品, 另外, 运用组氨酸 (Histidine, His) 在蛋白末端进行标记, Nickel金属螯合柱亲和纯化这种低成本高效率一步分离蛋白的方法, 也正广泛地运用到rEK的分离纯化, 其收率可达50%以上
胸苷激酶的作用机理
转换脱氧胸苷(Thd) 为胸苷酸 (TMP),这种磷酸化方式是唯一的通途引入Thd到DNA代谢。正因如此,TK酶被称为一种嘧啶补救途径的酶。
蛋白激酶C概述(二)
二、PKC的转位与激活 1.PKC的转位 PKC广泛分布于多种组织、器官和细胞,静止细胞中PKC主要存在于胞浆中,当细胞受到刺激后,PKC以Ca2+依赖的形式从胞浆中移位到细胞膜上,此过程称之为转位(translocation)。一般将PKC的转位作为PKC激活的标志。 2.PKC的激活 P
胸苷激酶的发展历史
1951年发现,胸苷(Thd) 与DNA合成的关联;1956年的报告指出,Thd参与DNA合成前,必须磷酸化;1958-60年,TK1被分离和部分的纯化以后,Thd磷酸化由该酶催化的事实也得到证实。;1960s,研究发现,TK以多种同工酶形式存在于各种不同的原核和真核生物中。这两种同工酶原命名为“胚
硫激酶的基本信息
中文名称硫激酶英文名称thiokinase定 义在ATP存在的条件下,催化脂肪酸的羧基与辅酶A的巯基连接而形成脂肪酰辅酶A,从而使脂肪酸活化进入β氧化途径的酶。此酶至少有三种:短链脂肪酸硫激酶(编号:EC 6.2.1.1),激活乙酸、丙酸;中链脂肪酸硫激酶(编号:EC 6.2.1.2),激活4~1
关于胸苷激酶的简介
胸苷激酶(Thymidine kinase)是一种催化胸苷的磷酸化生成胸苷一磷酸的酶。胸苷激酶以醇基为受体催化ATP,也可以α-uridine为受体。催化α-GAT的磷酸基为供体的酶反应。 转换脱氧胸苷(Thd) 为胸苷酸 (TMP),这种磷酸化方式是唯一的通途引入Thd到DNA代谢。正因如此
Cell发布最新激酶研究工具
激酶家族对于细胞的正常功能非常重要,人们开发的许多药物,都是旨在促进或抑制激酶的活性。正确的激酶活性关系着机体的健康,如果它们出现异常就会引起癌症和其他疾病。 斯坦福大学的科学家们开发了一个全新技术,利用生物感应器在单细胞中实现激酶活性的多重分析,这一成果发表在六月十九日的Cell杂志上。
激酶的动力学实验
Km和Vmax的确定 实验材料 蛋白底物 试剂、试剂盒
酪氨酸激酶的简介
酪氨酸激酶(tyrosine kinase,TK),一种酪氨酸特异性蛋白激酶。NTP(往往是ATP)可作用于蛋白的酪氨酸残基并使其磷酸化,引起其构象改变。
肌酸激酶的临床意义
1.增高(1)生理性增高:①运动后可导致肌酸激酶明显增高,且运动越剧烈、时间越长,肌酸激酶升高越明显。②分娩者和新生儿血清肌酸激酶活性高于正常值。③一些治疗和诊断措施,如安装人工心脏起搏器、电休克、放射治疗、心脏按压、心导管检查、泌尿系检查等,可使血清肌酸激酶活性增高。④男性肌肉容量大,血清肌酸激酶
凝胶中激酶直接分析实验
实验方法原理 盐酸胍或脲都能使蛋白质变性,选用哪一种取决于不同的激酶,但一般首选盐酸胍,因为对大多数激酶而言它的变性效果更好。实验材料 10 mmol L 激酶底物有激酶活性的酶样品试剂、试剂盒 2-丙醇Tris•Cl盐酸胍 脲DTTTween 20匹配的激酶反应缓冲液 Mg/ATP 溶液 [γ-3
蛋白激酶A的结构简介
PKA全酶以四聚体形式存在,但PKA被靶向到特定组分时,也会在细胞中形成更高阶的结构。经典的PKA全酶结构由两个调节亚基(R亚基)和两个催化亚基(C亚基)组成。催化亚基包含活性位点、在结合和水解ATP的蛋白激酶中发现的一系列典型残基以及结合调节亚基的结构域。调节亚基具有结合到cAMP的结构域,该
蛋白激酶的研究历史
已发现的蛋白激酶约有400多种,分子内都存在一个同源的由约270氨基酸残基构成的催化结构区。在细胞信号传导、细胞周期调控等系统中,蛋白激酶形成了纵横交错的网络。这类酶催化从ATP转移出磷酸并共价结合到特定蛋白质分子中某些丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸残基的羟基上,从而改变蛋白质、酶的构象和活性。蛋白质磷酸
尿激酶的鉴别方法
取效价测定项下的供试品溶液,用巴比妥-氯化钠缓冲液(pH7.8)稀释制成每1ml中含20单位的溶液,取lml,加牛纤维蛋白原溶液0.3ml,再依次加入牛纤维蛋白溶酶原溶液0.2nl与牛凝血酶溶液0.2ml,迅速摇匀,立即置37℃士0.5℃恒温水浴中保温,立即计时。应在30~45秒内凝结,且凝块在15
胸苷激酶的临床应用
由于TK1(细胞质胸苷激酶)与细胞增殖密切相关,1980s就出现了检测TK1活性的试剂盒,用于肿瘤辅助诊断和肿瘤治疗监控。1990s后期,基于TK1浓度检测的试剂盒问世,在一定程度上解决了活性检测对于实体瘤灵敏度偏低的缺点,同时化学发光法降低了荧光法的污染危害。TK1的应用主要有两个方面:体检应用评
肠激酶的酶学特点
肠激酶在体内激活胰蛋白酶原转化为胰蛋白酶, 由于肠激酶的轻链结构在人、牛和猪中保守, 其识别序列Asp-Asp-Asp-Asp-Lys在脊椎动物中也有很强的保守性, 且几乎所有被定序的胰蛋白酶原都具有4个天冬酰胺相连的特征, 此序列在其他的天然蛋白质上又非常罕见, 而肠激酶的活性中心有1个特殊的阳离
尿激酶的含量测定方法
酶活力牛纤维蛋白原溶液取牛纤维蛋白原,加巴比妥-氯化钠缓冲液(pH7.8)溶解并稀释制成每1ml中含6.67mg可凝结蛋白的溶液牛凝血酶溶液取牛凝血酶,加巴比妥-氯化钠缓冲液(pH7.8)溶解并稀释制成每1ml中含6.0单位的溶液。牛纤维蛋白溶酶原溶液取牛纤维蛋白溶酶原,加三羟甲基氨基甲烷缓冲液(p
酪蛋白激酶分析实验
基本方案 用 β-酪蛋白 备择方案 用多肽底物 实验方法原理 实验材料 β-酪蛋
葡激酶的来源相关介绍
葡激酶是由金黄色葡萄球菌(Staphylocous aureus)分泌的葡萄糖球菌激酶,简称葡激酶(SAK)。但由于葡激酶分泌的量极少,而且直接利用金黄色葡萄球菌发酵,易被金黄色葡萄球菌自身产生的内毒素污染,不仅产量低而且纯化步骤复杂。20世纪80年代初,Sako T等从金黄色葡萄球菌中提取到含
酪氨酸激酶的分类
酪氨酸激酶可分为三类:①受体酪氨酸激酶,为单次跨膜蛋白,在脊椎动物中已发现50余种;②胞质酪氨酸激酶,如Src家族、Tec家族、ZAP70家族、JAK家族等;③核内酪氨酸激酶如Abl和Wee。 根据PTK是否存在于细胞膜受体可将其分成受体型和非受体型。
尿激酶的效价测定
1 酶活力(1)试剂 牛纤维蛋白原溶液取牛纤维蛋白原,加巴比妥一氯化钠缓冲液(pH 7.8)制成每1ml中含6.67mg可凝结蛋白的溶液。牛凝血酶溶液 取牛凝血酶,加巴比妥一氯化钠缓冲液(pH 7.8)制成每1ml中含6.0单位的溶液。牛纤维蛋白溶酶原溶液 取牛纤维蛋白溶酶原,加三羟甲基氨基甲烷缓冲
蚓激酶胶囊的药理毒理
蚓激酶是一种蛋白水解酶。动物试验表明本品具有溶解家兔肺动脉血栓的作用,可明显缩短家兔的优球蛋白溶解时间。
凝胶中激酶直接分析实验
基本方案 直接分析 实验方法原理 盐酸胍或脲都能使蛋白质变性,选用哪一种取决于不同的激酶,但一般首选盐酸胍,因为对大多数激酶而言它的变性效果更好。
尿激酶的基本信息
中文名称:尿激酶中文别名:雅激酶;尿活素;人纤溶酶;人纤维蛋白溶酶;尿激酶6000;天普洛欣;威力尿激酶;雅激酶;尿酸氧化酶英文名称:Urokinase英文别名:Urokinase [USAN:INN:BAN:JAN];Actosolv;Breokinase;E.C. 3.4.21.31;E.C.
概述葡激酶的临床应用
重组葡激酶是一种强效且具有纤维蛋白特异性的新型纤溶酶原激活剂类的溶栓药物。目前,用于治疗心肌梗死和脑栓塞等血栓疾病的溶栓药物主要有:组织纤溶酶原激活剂(tissue type plasminogen activator,tPA)、尿激酶(urokinase)、链激酶(streptokinase)
硫激酶的基-本信息
中文名称硫激酶英文名称thiokinase定 义在ATP存在的条件下,催化脂肪酸的羧基与辅酶A的巯基连接而形成脂肪酰辅酶A,从而使脂肪酸活化进入β氧化途径的酶。此酶至少有三种:短链脂肪酸硫激酶(编号:EC 6.2.1.1),激活乙酸、丙酸;中链脂肪酸硫激酶(编号:EC 6.2.1.2),激活4~1
尿激酶的含量测定方法
酶活力牛纤维蛋白原溶液取牛纤维蛋白原,加巴比妥-氯化钠缓冲液(pH7.8)溶解并稀释制成每1ml中含6.67mg可凝结蛋白的溶液牛凝血酶溶液取牛凝血酶,加巴比妥-氯化钠缓冲液(pH7.8)溶解并稀释制成每1ml中含6.0单位的溶液。牛纤维蛋白溶酶原溶液取牛纤维蛋白溶酶原,加三羟甲基氨基甲烷缓冲液(p