中科院最新文章:海洋生物cDNA分析

造礁石珊瑚为珊瑚礁生态系统中的框架生物, 研究其重要功能基因对于理解造礁石珊瑚对环境变化的响应有重要指示意义,近期来自中国科学院南海海洋研究所的研究人员提取了澄黄滨珊瑚(Porites lutea)的总RNA, 通过RT-RCR得到 cDNA, 并以 cDNA为模板设计引物进行 test PCR, 获得大小为 254 bp的 ferritin基因cDNA序列,并由此展开了分析研究。 珊瑚礁生态系统具有极高的生物多样性, 且对环境变化的响应极其灵敏, 其主要框架生物造礁石珊瑚属于刺胞动物门。近年来, 随着基因组学和蛋白质组学在造礁石珊瑚研究中的应用, 越来越多的学者开始从基因的角度来研究造礁石珊瑚。 在生物有机体中, 铁是参与细胞代谢所必需的微量元素之一。铁蛋白(ferritin)是广泛存在于动物、植物和微生物体内的一种铁储存和生物矿化蛋白。铁蛋白的表达水平很高, 而且其表达调控在维持机体铁......阅读全文

DNA微阵列检测基因表达水平及识别基因序列

  Schena等1996年用拟南芥光调基因微阵列,以不同器官中的mRNA为探针,检测其基因表达水平,结果表明叶mRNA的表达水平是根的500倍。Shelon等1996年将酿酒酵母基因组DNA克隆制成微阵列,用6条最大染色体和10条最小染色体DNA探针分别标记上红,绿荧光标记进行杂交检测,结果表明9

小常识:原癌基因(oncogene)的表达及其产物的功能介绍

  原癌基因是细胞内与细胞增殖相关的基因,是维持机体正常生命活动所必须的,在进化上高等保守。当原癌基因的结构或调控区发生变异,基因产物增多或活性增强时,使细胞过度增殖,从而形成肿瘤简称为TSG。   原癌基因是细胞的正常基因,其表达产物对细胞的生理功能极其重要,只有当原癌基因发生结构改变或过度表达

小常识:原癌基因(oncogene)的表达及其产物的功能介绍

  原癌基因是细胞内与细胞增殖相关的基因,是维持机体正常生命活动所必须的,在进化上高等保守。当原癌基因的结构或调控区发生变异,基因产物增多或活性增强时,使细胞过度增殖,从而形成肿瘤简称为TSG。   原癌基因是细胞的正常基因,其表达产物对细胞的生理功能极其重要,只有当原癌基因发生结构改变或过度表达

小常识:原癌基因(oncogene)的表达及其产物的功能介绍

  原癌基因是细胞内与细胞增殖相关的基因,是维持机体正常生命活动所必须的,在进化上高等保守。当原癌基因的结构或调控区发生变异,基因产物增多或活性增强时,使细胞过度增殖,从而形成肿瘤简称为TSG。   原癌基因是细胞的正常基因,其表达产物对细胞的生理功能极其重要,只有当原癌基因发生结构改变或过度表达

基因表达系列分析的原理简介

  第一、一个9~10碱基的短核苷酸序列标签包含有足够的信息,能够唯一确认一种转录物。例如,一个9碱基顺序能够分辨262144个不同的转录物(49),而人类基因组估计仅能编码80000种转录物,所以理论上每一个9碱基标签能够代表一种转录物的特征序列。  第二、如果能将9碱基的标签集中于一个克隆中进行

RSV感染的基因表达谱分析

  发表在11月12日的PLOS Medicine杂志上的一项研究,采用全血基因表达谱分析估测了儿童RSV感染的发病机制和疾病严重程度,揭示了在儿童中由RSV感染引起的免疫反应的系统学调节异常,表明分子标记能够用来预测疾病的严重程度。   呼吸道合胞体病毒(RSV,Respiratory sy

Science开发创新基因表达研究方法

  来自卡罗林斯卡学院和瑞典皇家理工学院(KTH)的科学家们,开发出了一种高分辨率的新方法来研究组织中活化的基因。这种方法可用于所有的组织类型,对于临床前研究和癌症诊断均具有价值。他们的研究结果发布在7月1日的《科学》(Science)杂志上。  疾病会改变组织中一些RNA分子和蛋白质的表达。在实验

药物使沉默基因恢复表达

密歇根大学综合性癌症中心研究人员报道,利用药物将一个与癌细胞发育有关基因打开,为治疗癌症带来新的希望。研究结果刊登于在线版《Oncogene》杂志。 Herceptin和Gleevec等流行新药的靶标是引发癌症的遗传突变,但因为控制生长的基因被关闭了,癌症还会复发。即便研究人员可以利用这些关闭的基

陈鹏博士PNAS基因的表达调控

  魔法师的学徒开启了一个输水系统,但是却不能够停止它,很快水浸没到了他的脖子,他陷入到困境中。不同于这个无能的学徒,活细胞具有更好的设计:当它们激活一种基因时,它们就会将一种系统留作备用来关闭基因。细胞不想浪费能源来生成它们不再需要的蛋白。康奈尔大学的研究人员在新研究中确定了细胞利用的两种机制,并

单个脑细胞的基因表达谱

  科研人员报告了一种根据基因表达谱为人类大脑的单个细胞分类的方法。人类大脑含有许多种类的细胞,它们的基因表达模式有差别。此前为这些细胞类型分类的方法一直限于使用几个基因或蛋白质标记物以及分析整个细胞群。Stephen Quake及其同事使用单细胞RNA测序分析了来自人类大脑组织的466个个体细胞的

可怕,汞能引起基因表达改变

  即使水中的汞浓度极低也可以随着食物链富集,从藻类到浮游动物到小鱼,再到大鱼,最后被人类食用,食用汞富集的鱼后会引起严重的不可逆的神经失调。虽然目前我们已经知道了重金属对人类的危害,但是对于处于食物链底端的生物有什么危害吗?比如说像藻类这样的初始生产者。日内瓦大学的研究者们使用分子生物学工具第一次

Nature揭示多变的基因表达模式

   脊椎动物早期胚胎发育受到一些基因以及它们的“语法”控制。解译这一语法或许有助于了解畸形或癌症的形成,并开发出一些新的治疗药物。第一次,一项研究发现在斑马鱼的不同发育阶段基因表达过程中存在各种将DNA转录为RNA的机制。研究人员将这项研究发表在《自然》(Nature)杂志上。  在对几个基因组进

SeqScope剖析所有基因表达

  研究潜在疾病基因的研究人员一直受到限制,因为传统的成像技术一次只能研究少数几个基因。    图片来自于论文  组成人类基因组的大约30,000 个基因中包含了对生命至关重要的指令。然而,我们的每个细胞在其日常功能中仅表达这些基因的一部分。例如,心脏细胞和肝细胞之间的差异取决于表达哪些基因——基因

优化基因表达的关键因素

在基因表达研究中,研究者比较注意选择合适的表达载体和宿主系统,而往往忽视基因本身是否与载体和宿主系统为最佳匹配这样一个实质性问题。基因的最佳化表达可以通过对基因的重新设计和合成来实现,如消除稀有密码子而利用最佳化密码子,二级结构最小化,调整GC含量等。以下就密码子最佳化、翻译终止效率和真核细胞

基因表达RNA加工的机制介绍

  原核蛋白编码基因的转录产生的是可以翻译成蛋白质的信使RNA(mRNA),但真核基因的转录会产生RNA的初级转录本(pre-mRNA),必须经过一系列加工才能成为成熟RNA(mRNA)。RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。RNA加工可能是真核生物细胞核带来的进化优势。在原核生物中

关于LacZ基因的时空表达介绍

  转基因小鼠实验系统已被广泛用于单一基因功能的研究,如组织特异表达和发育程序的调控。产生转基因小鼠最普遍的方法是将DNA通过显微注射注入受精卵的原核中。在研究小鼠胚胎发育过程中外源基因的时空表达方面,将融合基因注射进入小鼠受精卵原核中更是一条行之有效的途径。  通过上述方法,将SV40早期启动子和

Nature重要论文:大型基因表达图谱

来自艾伦脑科学研究所的科学家们在最新出版的《自然》(Nature)杂志上报告称证实人类大脑具有一致的遗传蓝图,且拥有巨大的生物化学复杂性。这些研究结果来自于对“艾伦人脑图谱库”(Allen Human Brain Atlas)公开提供的大量数据集的首次深入大规模分析。 这项研究的结果是基于对“艾

关于基因表达调控的技术简介

  基因调控是现代分子生物学研究的中心课题之一。因为要了解动植物生长发育规律。形态结构特征及生物学功能,就必须搞清楚基因表达调控的时间和空间概念,掌握了基因调控机制,就等于掌握了一把揭示生物学奥秘的钥匙。基因表达调控主要表现在以下几个方面:   ①转录水平上的调控;   ②mRNA加工、成熟水平

通过qPCR开展基因表达谱分析

  一提起基因表达谱分析,大家马上会想到芯片。然而,并不是每个实验室都具备这个条件。现在,利用每个实验室都有的定量PCR仪,也能开展可靠的基因表达谱分析啦。   QIAGEN推出的RT2 Profiler PCR Array是一种高度可靠且灵敏的基因表达谱分析技术,它利用实时定量PC

转基因动物表达系统组成

转基因动物表达系统,包括外源基因、表达载体和受体细胞等,基因组的转移则是细胞核移植和动物克隆技术,人工合成与设计基因、全基因乃至基因组的转基因技术是合成生物学。

PNAS描述新型基因表达调控系统

  报道:科学家们开发了一个调控基因表达的新系统,该系统只需将特定DNA序列简单插入到基因的任意一侧,就可以实现剂量依赖性的基因表达抑制。这项成果发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志上,文章认为这一系统有望替代Tet基因表达调控系统。   这是首次采用适体酶核糖开关有条件地knockdown病毒基

基因表达的翻译调控的介绍

  翻译调控的效果不如转录调控或调控mRNA的稳定性,但也偶尔得到使用。抑制蛋白质翻译是毒素和抗生素的主要作用目标,因此它们可以通过超越其正常的基因表达控制来杀死细胞。蛋白质合成抑制剂包括抗生素新霉素和毒素蓖麻毒素。

基因表达量变化差值是什么

差值是△CT,即是相对于某个内参基因的相对表达量,而不是绝对表达量;在此基础上再进行比值,即△△CT,是(某两个处理之间的)差异表达倍数。

基因表达调控的方式有哪些

基因表达调控分为很多水平:1.DNA和染色体水平:基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化.2.转录水平调控(主要调控方式):转录起始、延伸、终止均有影响.原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作...

关于基因表达顺式作用的介绍

  顺式作用是生物体进行基因表达调节的方式之一,与“反式作用”相对。顺式作用指的是,调节因子是与被调节基因同处于一条DNA链上的另一端DNA片段而进行的调节。   以二倍体生物为例,对于某一位置的基因,两条同源染色体上会有一对等位基因和一对相应的顺式调节因子。如果其中一个顺式调节因子发生突变而产生

基因表达调控的基本规律

过表达,即表达过度,当基因表达(转录)的严格控制被打乱时,基因可能不恰当被“关闭”,或以高速度进行转录。高速转录导致大量mRNA产生,大量蛋白质(protein)产物出现。在RNA聚合酶的催化下,以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录。在双链DNA中,作为转录模板的链称为模板链或反义链;而不作为转

测定线粒体基因表达怎么做

亲缘鉴定是否可以用线粒体?首先你要知道什么是线粒体,其次你要了解线粒体是怎么遗传的,应该初中就会讲。那么结论是线粒体用于母系。。。就是外孙女-妈妈-外婆-外婆的妈妈。只要来自同一个母亲就可以用。但是线粒体的检测目前没有一个标准,就是所选取的检测区域存在者争议,所以可以做为一个参考。

基因表达转录调控的主要途径

基因表达转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。

基因表达的转录调控的介绍

  可分为三种主要途径:  1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);  2)调控转录因子与转录机制相互作用;  3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。  通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合

TaqMan探针基因表达分析全面升级

TaqMan探针对于大家来说不是什么新名词了,然而你知道吗,对于部分降解的RNA,如福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)样品中的RNA,TaqMan引物探针的设计有更多的讲究,你知道这是为什么吗?FFPE样本在固定时导致核酸相互交联且片段化,RNA片段的大小在50-300 nt,大部分片段在100 n