AJHG:龙尔平团队等运用高通量功能组学技术解析肺癌多基因易感机制

人类的基因组被视作是一本书写生命的“天书”:凭借A、T、C、G四种碱基,排列组合出无数种可能性,蕴含着人类演化与生老病死的奥秘。 自人类基因组计划起,科学家们前赴后继地开启了对人类基因组的探索,其中最核心的使命之一,是理解个体罹患疾病风险的差异,即回答:为什么有的人容易得病,而有的人不容易? 研究发现,大多数人类常见病是由多个基因和环境因素共同参与的复杂性疾病。全基因组关联分析(GWAS)是目前研究复杂性疾病的主流策略,其主要原理是通过对比大量患者与健康人群基因组,来确定与疾病易感性存在显著统计学关联的大致基因组区域——基因座。自GWAS研究开展18年来,已发现了近20万个基因座与疾病的遗传易感性显著相关。然而,由于连锁不平衡的存在,基因座内通常有成百上千个可能致病的变异位点,这是传统的单位点分子功能实验无法承受的量级。如何高通量测定变异位点的功能性,有效筛选致病的功能位点,是解析GWAS基因座需要攻克的关键难题。 近......阅读全文

自动化所肺癌影像组学研究获进展

  近期,中国科学院自动化研究所分子影像院重点实验室与上海肺科医院放射科、广东省人民医院放射科、华西医院呼吸内科、中国医学科学院肿瘤医院PET-CT中心合作,将影像组学应用于四期EGFR突变型非小细胞肺癌的靶向治疗疗效评估中,取得了阶段性的临床科研成果。相关研究成果发表在临床肿瘤领域期刊Clinic

AJHG:龙尔平团队等运用高通量功能组学技术解析肺癌多基因易感机制

  人类的基因组被视作是一本书写生命的“天书”:凭借A、T、C、G四种碱基,排列组合出无数种可能性,蕴含着人类演化与生老病死的奥秘。  自人类基因组计划起,科学家们前赴后继地开启了对人类基因组的探索,其中最核心的使命之一,是理解个体罹患疾病风险的差异,即回答:为什么有的人容易得病,而有的人不容易? 

【NEJM】综述:肺癌基因组学发现的临床意义

  Charles Swanton与Ramaswamy Govindan两位教授合作在最近的新英格兰医学杂志发文,全面综述肺腺癌、鳞癌和小细胞肺癌这三种常见的病理类型的大规模基因组学研究发现,及其在肺癌的发生发展和临床诊疗中的意义。  基因组变异  基因组概览  肺癌与吸烟高度相关,是突变负荷最强的

科学家绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱

肺癌是全球癌症致死的首位原因,而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%,是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型,5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比,小细胞肺癌的治疗手段单一,患者总生存率低。分子表征与组学研究不足,限制了小细胞肺癌的基础研究和临床进展,迄今为止,仅有少量针对小细胞肺癌临床样

科学家绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱

  肺癌是全球癌症致死的首位原因,而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%,是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型,5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比,小细胞肺癌的治疗手段单一,患者总生存率低。分子表征与组学研究不足,限制了小细胞肺癌的基础研究和临床进展,迄今为止,仅有少量针对小细胞肺癌临

蛋白质组学技术的功能介绍

  “读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。    自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大

蛋白质组学技术的功能介绍

“读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大多数疾病并不是

我国科研人员绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱

  肺癌是全球癌症致死的首位原因,而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%,是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型,5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比,小细胞肺癌的治疗手段单一,患者总生存率低。分子表征与组学研究不足,限制了小细胞肺癌的基础研究和临床进展,迄今为止,仅有少量针对小细胞肺癌临

蛋白质组学的主要功能

蛋白质组学集中于动态描述基因调节,对基因表达的蛋白质水平进行定量的测定,鉴定疾病、药物对生命过程的影响,以及解释基因表达调控的机制.作为一门科学,蛋白质组研究并非从零开始,它是已有20多年历史的蛋白质(多肽)谱和基因产物图谱技术的一种延伸.多肽图谱依靠双向电泳(Two-dimensionalgele

与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有何优点

那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点:①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易;②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于基因和蛋白的数目.③ 由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的,所以研究

功能代谢组学用于胶质瘤研究获进展

  近日,中国科学院大连化学物理研究所与美国NIH、哈尔滨医科大学附属第一医院合作将功能代谢组学用于胶质瘤研究取得新进展:利用毛细管电泳-质谱技术,发现瘤组织中的亚牛磺酸含量显著高于癌旁对照组织中的亚牛磺酸,并且与胶质瘤分级即恶性程度呈正相关。经过分子对接计算机模拟,科研人员发现亚牛磺酸能够与α-酮

“临床用单细胞组学技术开发与肺癌应用研究”项目获批

   近日,由博奥生物集团有限公司暨生物芯片北京国家工程研究中心牵头申报的“临床用单细胞组学技术开发与肺癌应用研究”项目获得国家重点研发计划“精准医学研究”2016年度项目立项。  该项目将围绕单细胞组学技术临床转化应用的难点和热点问题,整合微电子、自动化、生物芯片、新一代测序、大数据、医学等多学科

科研人员首次大规模揭示小细胞肺癌蛋白组学图谱

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516499.shtm小细胞肺癌约占肺癌总数的15%,恶性程度高,难以通过基因突变信息获得有效靶点和分子分型,导致其治疗手段单一,患者总生存率一直止步不前。1月5日记者获悉,我国科研人员首次在国际上大规模表

中央型肺癌的影像学检查

  1.X线表现:  ①癌瘤局限于粘膜,未构成支气管的狭窄及阻塞者,X线上可无阳性表现。  ②癌瘤致支气管狭窄,可出现一侧或叶的肺气肿。深呼气位照片易于显示。  ③癌瘤致支气管狭窄,造成分泌物引流不畅,则出现阻塞性肺炎。  ④癌瘤致支气管阻塞则出现阻塞性肺不张。另外,癌瘤向支气管外蔓延,形成肺门区肿

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?       代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

基因组学:将数字信息转化为生物学功能

优势 ·      同时检测克隆和定量荧光标记---使用表现型筛选克隆   ·      从加样、涂布到挑取完全自动化工作流程   ·      从样品涂布到挑取、复制和重排记录并追踪样品数据   ·      每天准确挑取超过30000个筛选到的克隆,效率>98%   美国能源部联合基因组研究所(

全国玉米功能基因组学研究协作平台建立

近日,由中国农业科学院生物技术研究所、安徽农业大学和齐鲁师范学院共同主办的第四届全国玉米功能基因组学术研讨会在海南三亚召开。会议旨在通过创新共享玉米EMS突变体库种质材料,搭建全国玉米功能基因组研究协作平台,协力推动我国玉米功能基因组学研究迈上新台阶。 中国农业科学院生物技术研究所所长李新海致开

英国成立功能基因组学实验室

  近日,英国科研与创新署(UKRI)宣布,医学研究理事会(MRC)、剑桥大学米尔纳治疗研究所(MTI)等联合成立功能基因组学实验室,作为英国卓越研究中心和国家资源中心,汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识,加速新药物和诊断方法的研究发现,巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。  该实验

新蛋白质组学方法引领蛋白功能研究革命

人类细胞是通过成千上万个蛋白质的协同作用来控制它们生长和分化的。但是,到目前为止,大多数人类蛋白质的特定功能还不清楚。 疾病的发生常常是由于冠军细胞蛋白质功能的失常。目前,世界各地已经启动了大量大规模的研究计划以了解所有人类蛋白质的功能。 现在,来自IRCM(Instiut de recherc

英国成立功能基因组学实验室

  近日,英国科研与创新署(UKRI)宣布,医学研究理事会(MRC)、剑桥大学米尔纳治疗研究所(MTI)等联合成立功能基因组学实验室,作为英国卓越研究中心和国家资源中心,汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识,加速新药物和诊断方法的研究发现,巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。  该实验

组学大数据“秒懂”功能基因的朋友圈

 玉米实验田。受访者供图 经典的遗传学手段克隆并解析了一批重要的功能基因。然而,在功能基因组提出二十几年之后的今天,水稻和玉米中克隆的功能基因仍不足其所有基因的10%,已克隆基因的新功能还不断被发现。 如何快速克隆功能基因、解析重要性状变异的分子机制,并全局解码重要作物的遗传变异的奥秘

发现组学力量,共推组学发展

  分析测试百科网讯 2020年11月27日,由赛默飞世尔科技主办、分析测试百科网协办的组学技术前沿创新高峰论坛在成都隆重举行。本次会议旨在“发现质谱力量”,邀请国内组学领域大咖共讨质谱在组学研究中的“力量”,期望共同推动中国组学研究发展。赛默飞中国区色谱与质谱业务应用支持总监薄涛博士主持大会开幕赛

利用植物表型组学挖掘基因组学的成果

到2050年,全球人口将达到97亿,预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标,作物产量需每年增长2.4%,但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素,但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可

同济大学重要成果再登Cell,表征小细胞肺癌的蛋白组学图谱

  小细胞肺癌约占肺癌总数的15%,恶性程度高,难以通过基因突变信息获得有效靶点和分子分型,导致其治疗手段单一,患者总生存率一直止步不前。  北京时间今天(1月5日)零点,国际顶级学术期刊《细胞》(Cell)在线发表了同济大学医学院/附属上海市肺科医院张鹏教授团队、中国科学院上海药物研究所周虎研究员

双相情感障碍功能基因组学研究新进展

  双相情感障碍(Bipolar disorder,BPD)是常见的重性精神障碍。流行病学发现,BPD具有较高的发病率和死亡率。研究表明,BPD的发生与遗传和环境因素有关。BPD的遗传力为80%左右,表明遗传因素在BPD的发生中起主要作用。全基因组关联研究(GWAS)已报道许多BPD风险基因座(lo

首个植物功能基因组学智能问答系统PlantGPT问世

  近日,中国科学院院士、华南农业大学教授刘耀光和研究员祝钦泷团队联合清华大学,开发了一个以拟南芥为基础的植物功能基因组学专家问答系统PlantGPT,通过融合检索增强生成技术和大语言模型微调方法,实现了对植物功能基因组学专业问题的精准回答与分析。相关成果在线发表于《先进科学》(Advanced S