首个植物功能基因组学智能问答系统PlantGPT问世
近日,中国科学院院士、华南农业大学教授刘耀光和研究员祝钦泷团队联合清华大学,开发了一个以拟南芥为基础的植物功能基因组学专家问答系统PlantGPT,通过融合检索增强生成技术和大语言模型微调方法,实现了对植物功能基因组学专业问题的精准回答与分析。相关成果在线发表于《先进科学》(Advanced Science),并被选为Editor′s Choice与Frontispiece(扉页论文)高亮推荐。 AI驱动的植物功能基因组学研究。研究团队供图 面对全球粮食安全和作物品质提升的挑战,功能基因组学研究在增加作物产量、改善营养品质、提高抗病虫性和逆境适应性等方面发挥了关键作用。然而,现有的计算生物学手段在解析复杂生物系统调控机制及整合多组学数据方面仍存在瓶颈。同时,传统植物数据库如TAIR尽管包含丰富数据资源,但因交互方式局限,常常要求用户掌握精确的性状或基因命名才能有效检索信息。 该研究通过结合检索增强生成技术和大语言模型微......阅读全文
首个植物功能基因组学智能问答系统PlantGPT问世
近日,中国科学院院士、华南农业大学教授刘耀光和研究员祝钦泷团队联合清华大学,开发了一个以拟南芥为基础的植物功能基因组学专家问答系统PlantGPT,通过融合检索增强生成技术和大语言模型微调方法,实现了对植物功能基因组学专业问题的精准回答与分析。相关成果在线发表于《先进科学》(Advanced S
上海市资源植物功能基因组学重点实验室通过验收
2016年12月13日,上海市资源植物功能基因组学重点实验室验收会于上海辰山植物园(中国科学院上海辰山植物科学研究中心)举行。会议由上海市科委基地处周婧主持,上海市科委基地处处长过浩敏处长、7名验收评审专家及重点实验室相关领导和人员出席了本次验收会。 会上,辰山科研中心副主任马金双研究员对科委
“特色植物功能基因组学研究与应用”项目总结交流会召开
近日,“十二五”国家863计划现代农业技术领域“特色植物功能基因组学研究与应用”项目总结交流会在中国农业科学院棉花研究所海南繁育基地召开。科技部农村科技司郭志伟副司长出席会议并讲话,农村科技司农业科技处和农村中心有关同志,项目首席专家、中国工程院院士喻树迅研究员,项目牵头单位中国农业科学院棉花研
昆明植物所山茶属代表植物比较叶绿体基因组学研究获进展
山茶属是山茶科中包含许多举世闻名经济植物的一个重要类群,包括为人类提供天然保健饮料的茶(Camellia sinensis var. assamica 和C. sinensis var. sinensis),健康型高级食用植物油的油茶(C. oleifera)以及观赏花卉云南山茶(C. reti
武汉植物园在裸子植物叶绿体基因组学研究方面获进展
篦子三尖杉(Cephalotaxus oliveri)是我国特有珍稀濒危植物,属裸子植物三尖杉科(Cephalotaxaceae)三尖杉属(Cephalotaxus)。它在三尖杉属中的地位特殊,形态、解剖、胚胎发育、孢粉、核型及分子系统学的研究均支持将其独立成篦子三尖杉组。 松杉类植物
基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破
深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据,首次对苔类目级系统框架进行了重建,得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员,通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员,深圳华大生命科学研究院联合培养研究
海南大学团队定义植物基因组学“终极参考图谱”
近日,记者从海南大学获悉,该校三亚南繁研究院陈飞教授团队首次构建了“分型端粒到端粒超级泛基因组”理论体系,实现了植物基因组从个体单倍型完整到群体遗传多样性全覆盖的技术跨越。相关成果发表在国际期刊《植物科学趋势》。植物基因组研究长期受制于参考基因组的局限——传统组装难以解析着丝粒、端粒等复杂区域,且无
利用植物表型组学挖掘基因组学的成果
到2050年,全球人口将达到97亿,预计作物产量翻一番才能满足全球人口的粮食需求。为了达到这一目标,作物产量需每年增长2.4%,但目前作物产量平均增长率仅为1.3%。作物生产性能的遗传改良仍然是提高作物生产力的关键因素,但当前的改善速度无法满足可持续性和粮食安全的需要。为了确保粮食安全、生态系统的可
高原鱼类进化与功能基因组学科组
青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii),隶属于鲤科裂腹鱼亚科,是国家二级保护动物,仅分布于典型高原咸水湖泊—青海湖中,是维持青海湖“水-鸟-鱼”生态链稳定的核心物种。青海湖裸鲤是鲤科鱼类中唯一一种适应青海湖高盐碱水环境的自然群体,是研究高原鱼类适应进化的良好素材。青海湖裸鲤
版纳植物园叶绿体比较基因组学研究取得进展
樟科油丹属树种木材质优,国际市场上的商品名为“medang”,和楠木树种的亲缘关系较近。以往的分子系统学研究表明油丹属为复系类群,但与润楠属、鳄梨属和楠属等的系统关系尚不明晰。 近日,中国科学院西双版纳热带植物园生物多样性研究组以分布于印度南部的油丹模式种Alseodaphne semecar
昆明植物所在南方菟丝子基因组学研究中取得进展
自然界绝大部分植物都通过叶片的光合作用和根部的水分和营养吸收维持自养生存,而寄生植物则是一类通过寄生在自养植物上获取能量和营养的植物。寄生植物独特的起源、演化和特殊生理生态长期以来吸引着研究者的目光。旋花科茎寄生植物菟丝子寄生行为在实验室中方便控制和观察,近年来已成为许多探索寄生植物生理生态和进
英国成立功能基因组学实验室
近日,英国科研与创新署(UKRI)宣布,医学研究理事会(MRC)、剑桥大学米尔纳治疗研究所(MTI)等联合成立功能基因组学实验室,作为英国卓越研究中心和国家资源中心,汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识,加速新药物和诊断方法的研究发现,巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。 该实验
英国成立功能基因组学实验室
近日,英国科研与创新署(UKRI)宣布,医学研究理事会(MRC)、剑桥大学米尔纳治疗研究所(MTI)等联合成立功能基因组学实验室,作为英国卓越研究中心和国家资源中心,汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识,加速新药物和诊断方法的研究发现,巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。 该实验
全国玉米功能基因组学研究协作平台建立
近日,由中国农业科学院生物技术研究所、安徽农业大学和齐鲁师范学院共同主办的第四届全国玉米功能基因组学术研讨会在海南三亚召开。会议旨在通过创新共享玉米EMS突变体库种质材料,搭建全国玉米功能基因组研究协作平台,协力推动我国玉米功能基因组学研究迈上新台阶。 中国农业科学院生物技术研究所所长李新海致开
武汉植物园葡萄基因组学研究取得新进展
葡萄是世界上第二大果树作物,鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加,如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来,通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合,对植物基因组结构和特点深入解析,将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种
双相情感障碍功能基因组学研究新进展
双相情感障碍(Bipolar disorder,BPD)是常见的重性精神障碍。流行病学发现,BPD具有较高的发病率和死亡率。研究表明,BPD的发生与遗传和环境因素有关。BPD的遗传力为80%左右,表明遗传因素在BPD的发生中起主要作用。全基因组关联研究(GWAS)已报道许多BPD风险基因座(lo
青岛能源所发表嗜热菌功能基因组学综述
日前,中国科学院青岛生物能源与过程研究所功能基因组团队负责人徐健研究员、助理研究员林璐应邀在Biotechnology Advances发表综述文章Dissecting and engineering metabolic and regulatory networks of thermo
多功能植物光合表型测量系统功能特性
创新的多功能植物光合表型平台 可见光成像+多光谱成像+叶绿素荧光(调制和非调制)成像 同一个相机采集所有成像 全自动马达聚焦系统,带全景和微距聚焦程序 出色的高清相机(1.3 M pixel)测量叶绿素荧光 高信噪比叶绿素荧光成像 高质量10 Mp镜头,带光谱可见光和近红外涂层 无
植物水势仪的功能特点
1、大屏幕液晶显示,全中文菜单操作。 2、测量方式:自动测量、手动测量一键式切换。 3、MPa与Bar两种测量单位可供选择。 4、液晶屏显示的压力值就是当前植物的水势值。 5、强大的存储功能,可存储4000条记录。 6、一键式删除所有测量数据。 7、可以通过USB线上传电脑,上位机软
植物呼吸根的功能特点
呼吸根是背地向上生长,露出地面,适应呼吸的根。根中有发达的通气组织,表面又有皮孔,为生活在热带海岸或沼泽地带的一些多年生植物适应土壤中缺乏空气条件的变态根。如红树、海桑、水龙等。
植物固醇的生理功能
植物固醇是植物中的一种活性成分,对人体健康有很多益处。研究发现,植物固醇有降低血液胆固醇、防治前列腺肥大、抑制肿瘤、抑制乳腺增生和调节免疫等作用。国内外研究表明,植物固醇在肠道内可以与胆固醇竞争,减少胆固醇吸收,有效地降低高脂血症患者血液中的“坏”胆固醇(包括总胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇)含量,而不
植物根系分析系统功能特点
1.图片预处理功能 1.1二值化:在目标和背景比较相似时,调整阈值来凸显目标轮廓。 1.2杂质剔除:设定一个像素值后,软件自动剔除图片中小于该像素的独立点,以保证分析不受杂质影响,更为准确。 1.3自由选择目标区:分析根系的某一部分。 2.辅助测量功能 2.1放大缩小:放大缩小
植物光合仪的功能特点
植物光合仪功能特点: 1、外形小巧轻便,便于随身携带,随时随地测量,单人即可操作。 2、点阵液晶显示屏,中文菜单显示多个信息,光标指导操作。 3、可设定修改日期,时间,叶面积、容积、测量间隔时间、用户名等。 4、测量过程和最终结果即时显示,并可储存。也可在仪器上查看
植物水势仪的功能特点
1、大屏幕液晶显示,全中文菜单操作。 2、测量方式:自动测量、手动测量一键式切换。 3、MPa与Bar两种测量单位可供选择。 4、液晶屏显示的压力值就是当前植物的水势值。 5、强大的存储功能,可存储4000条记录。 6、一键式删除所有测量数据。 7、可以通过U
植物硫酸肽的功能特点
中文名称植物硫酸肽英文名称phytosulfokine;PSK定 义一种植物生长因子,其化学组成为硫酸化酪氨酸的五肽。α植物硫酸肽能诱导某些植物叶肉细胞的增殖,其N端截短的类似物和未硫酸化的类似物无生物活性或仅有很低的活性。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),激素与维生素(二级学科)
植物所利用根系解剖结构揭示草原植物根系功能
通过根系性状理解根系功能及其对植物生长、生态系统过程和功能的影响是根系生态学研究的热点和难点问题。根的解剖结构是理解根系功能以及根系结构与功能关联的关键基础。然而,目前关于单子叶和双子叶草本植物的根系解剖结构及其揭示的根系功能的研究较匮乏。 中国科学院植物研究所研究员白文明研究组以内蒙古典
大豆、油菜、花生功能基因组学研究取得阶段性成果
大豆、油菜、花生等作物,不仅是我国人民食用植物油和蛋白质的重要来源,还是发展畜牧养殖业的重要优质蛋白源,在我国国民经济和社会发展中具有十分重要的地位。在国家863计划的资助下,经过两年半努力,“大豆、油菜、花生功能基因组学研究与应用”课题组取得了重要的阶段性成果。2015年6月4日,863计划
生物芯片在功能基因组学研究中的应用进展
生物芯片技术是伴随人类基因组研究发展起来的,它是指通过微电子、微加工技术,在固体基质(如硅芯片、玻片、瓷片等)表面构建的微型生物化学系统,以实现对细胞、蛋白质、核酸及其它生物组分进行快速、敏感、高效地处理。一般来说,应用芯片进行实验主要包括3个步骤:样品制备、生物化学反应、检测和数据分析处
水生植物泽泻科系统发育基因组学研究获新进展
泽泻科(Alismataceae)为古老的单子叶水生植物类群,包含17个属约100个物种。该科植物在世界广泛分布,因其复杂的进化历史、较高的观赏价值和生态价值等,长期以来一直受到植物进化生物学家及生态学家的关注。然而,由于该科植物形态复杂多变以及先前研究所采用的分子标记和样本采集的局限性,该科属间及
澳大利亚CSIRO机构与中科院将在植物基因组学进行合作
据GenomeWeb记者报道,2011年3月10日—澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)今天宣布,将在下周与中科院共同探索在植物基因组研究上的合作计划。 这项研究合作,将重点放在水稻和小麦农作物上。水稻和小麦将同玉米一并成为在世界上种植最广泛的三大农作物;来自两个研