全球最大规模结直肠癌多组学研究成果发布
肠癌多组学研究成果发布 结直肠癌被称为“沉默杀手”,全球每年结直肠癌新增病例约190万例,发病率居所有癌症第三位。更可怕的是,约20%的患者在确诊时已发生转移,其死亡率更是高居各类癌症第二位。面对这一严重威胁人类生命健康的重大疾病,科学界近期传来好消息——8月7日,中国科学院杭州医学研究所组学与智慧医疗中心联合瑞典乌普萨拉大学、华大生命科学研究院、华大基因智惠医学研究院,共同在《自然》杂志上发表研究论文,公布了全球首个大规模结直肠癌多组学的研究结果,并结合临床信息系统总结了与临床结果和疾病进展密切相关的分子特征。“这是目前全球最大的结直肠癌多组学研究。”论文通讯作者、中国科学院杭州医学研究所—华大生命组学中心研究员吴逵表示,该研究对1063例结直肠癌样本进行了全基因组及转录组测序分析,发现了一系列与癌症不同阶段相关的基因,并识别了结直肠癌关键预后因子,为结直肠癌的预防、治疗及预后都提供了数据基础。结直肠癌驱动基因的全景......阅读全文
PNAS:研究重塑结直肠癌发生模型
这一发现导致的治疗策略可能同样有助于治疗II型糖尿病 图片说明:美国德州大学西南医学中心的Lawrence Lum博士(右)和Wei Tang博士。 (图片来源:UT Southwestern Medical Center) 美国科学家近日研究发现,一个之前被认为会促进结直肠癌的蛋白实际
【结直肠癌】病因与临床表现
结、直肠癌是我国常见的恶性肿瘤。占我国恶性肿瘤的第四位,并有上升的趋势。中国人结、直肠癌与西方人比较有3个流行病学特点:①直肠癌比结肠癌发病率高,约1.5∶1;②低位直肠癌在直肠癌中所占比例高,约占75%,大多数直肠癌可在直肠指检时触及;③青年人(
便隐血试验(FOBT)与结直肠癌
最近科华生物获得便隐血(FOB)检测试剂盒(胶体金法)的注册证,该检测项目丰富了科华生物的POCT产品线,其应用具有重要的临床意义和公共卫生意义。目前,FOBT已被世界各国广泛应用于结直肠癌的大规模人群筛查。随着中国老龄化进程的加快和结直肠癌发病率的逐年上升,科华生物在此刻推出的检测性能优越、质量可
结直肠癌诊治还须“早”发力
一例早期结直肠癌,只需采用内镜黏膜下剥离术(ESD)即可治疗,人均住院天数为5天,相关医疗费用在1.05万元。但如果是一例IV期结直肠癌,通常需要采取手术+放化疗+靶向用药等手段治疗,人均住院天数为140天,相关医疗费用至少在30万元。 前不久,在第三届国家癌症中心结直肠癌国际高峰论坛上,山
Biomarker时代的结直肠癌精准治疗
日前,2016届CSCO学术年会在厦门圆满完成,本届年会以“精细管理、精准医疗”为主题,其中精准检测作为实施精准医学的第一步,成为本届CSCO学术年会的热点话题。 在艾德生物与默克联合举办的结直肠癌专场卫星会中,来自临床的刘云鹏教授、李进教授、王新教授和来自病理的丁彦青教授、阎晓初教授、邰艳红
维甲酸抑制结直肠癌的发展
最近,斯坦福大学医学院的研究人员报道称,维甲酸——来自于维生素A的一种化合物,对于抑制小鼠和人类结直肠癌,起着重要的作用。研究人员发现,癌症小鼠肠道内的代谢产物水平低于正常水平。此外,如果一些结直肠癌患者的肠道组织中高水平地表达一种蛋白质(可降解维甲酸),那么这些患者往往比其他患者的表现更差。相
与结直肠癌相关的基因突变类型HLAC基因
HLA-C属于HLA I类重链相似度。这一类分子是由重链和轻链(β-2微球蛋白)组成的异二聚体。重链锚定在膜上。I类分子通过呈现内质网腔中的肽在免疫系统中起着中心作用。几乎在所有细胞中都有表达。重链约45kDa,其基因包含8个外显子。外显子1编码先导肽,外显子2和3编码α1和α2结构域,两者结合肽,
与结直肠癌相关的基因突变类型-EPAS1基因
该基因编码一个转录因子,参与氧调节基因的诱导,随着氧水平的下降而诱导。编码蛋白包含一个基本的螺旋-环-螺旋结构域蛋白二聚结构域以及一个在信号转导途径中发现的对氧水平有反应的结构域。该基因突变与红细胞增多症家族性4型有关。
与结直肠癌相关的基因突变类型HIF1A基因
该基因编码转录因子缺氧诱导因子-1(hif-1)的α亚单位,是由α亚单位和β亚单位组成的异二聚体。HIF-1通过激活许多基因的转录,包括那些参与能量代谢、血管生成、细胞凋亡和其他蛋白质产物增加氧气输送或促进对缺氧的代谢适应的基因,作为细胞和全身对缺氧的稳态反应的主要调节器。因此,HIF-1在胚胎血管
与结直肠癌相关的基因突变类型EPHB4基因
肾上腺素受体及其配体,肾上腺素,介导许多发育过程,特别是在神经系统。根据其结构和序列关系,肾素被分为通过糖基磷脂酰肌醇连接锚定在膜上的肾素-A(efna)类和作为跨膜蛋白的肾素-B(efnb)类。EPH受体家族根据其胞外结构域序列的相似性及其与肾素A和肾素B配体结合的亲缘关系分为2组。肾上腺素受体构
与结直肠癌相关的基因突变类型FLT3基因
FLT3(FMS样酪氨酸激酶3)基因所编码蛋白一种调节造血的III类受体酪氨酸激酶,激活的受体激酶磷酸化激活多个信号通路,包括细胞凋亡、增殖及骨髓造血细胞的分化。FLT3的突变或者高表达可能会造成该蛋白的持续激活,从而导致急性髓细胞白血病和急性淋巴细胞白血病。
与结直肠癌相关的基因突变类型EZH2基因
EZH2基因编码的是一种组蛋白赖氨酸N-甲基转移酶,参与DNA甲基化从而抑制其他基因转录,EZH2也可甲基化组蛋白H3第27位赖氨酸。EZH2的甲基化活性促进异染色质的形成从而使基因沉默,是PRC2复合物的组分之一。EZH2的突变或者过表达与多种类型癌症相关,如乳腺癌、前列腺癌、黑色素瘤和膀胱癌等。
与结直肠癌相关的基因突变类型FGFR1基因
FGFR1基因所编码的蛋白质是属于成纤维细胞生长因子受体(FGFR)家族成员之一,目前已确定了四种由FGFRs, 即FGFR1、FGFR2、FGFR3和FGFR4。FGFR1是一种跨膜蛋白质,属于受体酪氨酸激酶,当FGF与FGFR1胞外段结合后,受体细胞内段酪氨酸激酶活性区首先发生自身磷酸化,然后使
与结直肠癌相关的基因突变类型SMAD4基因
SMAD4基因编码的蛋白属于SMAD家族,可以被跨膜丝氨酸/苏氨酸受体激酶激活,如转化生长因子TGF-β受体,因此作为TGF-β信号的重要胞浆内信号级联分子,SMAD4可以自身形成同源复合物或与激活型其他的SMAD家族成员形成异源复合物,转移位到细胞核内,与其他转录因子协同作用,调节TGF-β应答基
与结直肠癌相关的基因突变类型THBS2基因
该基因编码的蛋白质属于凝血酶敏感蛋白家族。是一种二硫键联的同源三聚体糖蛋白,介导细胞间和细胞间和基质间的相互作用。这种蛋白已被证明是一种有效的肿瘤生长和血管生成抑制剂。对小鼠的研究表明,这种蛋白可能调节间充质细胞的细胞表面特性,并参与细胞粘附和迁移。
与结直肠癌相关的基因突变类型IRS2基因
该基因编码胰岛素受体底物2,这是一种胞质信号分子,通过充当不同受体酪氨酸激酶和下游效应器之间的分子接头来调节胰岛素、胰岛素样生长因子1和其他细胞因子的作用。这种基因的产物在受体刺激时被胰岛素受体酪氨酸激酶磷酸化,在IL4治疗后被白细胞介素4受体相关激酶磷酸化。
与结直肠癌相关的基因突变类型-GSTP1基因
谷胱甘肽S-转移酶(GSTS)是一个酶家族,通过催化许多疏水性和亲电性化合物与还原性谷胱甘肽的结合,在解毒过程中发挥重要作用。根据其生化、免疫和结构特性,可溶性GST可分为4大类:α、μ、π和θ。GST家族成员是一个多态基因,编码活性的、功能不同的GSTP1变异蛋白,被认为在异种代谢中起作用,并在癌
与结直肠癌相关的基因突变类型DKK1基因
这个基因编码一种属于Dickkopf家族的蛋白质。是一种具有两个富含半胱氨酸区域的分泌蛋白,通过抑制Wnt信号通路参与胚胎发育。骨髓血浆和外周血中dkk1水平升高与多发性骨髓瘤患者存在溶骨性骨病变有关。
与结直肠癌相关的基因突变类型HSPA5基因
该基因编码的蛋白是热休克蛋白70(hsp70)家族的成员。局限于内质网(ER)内腔,参与ER中蛋白质的折叠和组装。由于这种蛋白质与许多ER蛋白质相互作用,它可能在监测蛋白质通过细胞的转运中起到关键作用。
与结直肠癌相关的基因突变类型BARD1基因
这个基因编码一种与BRCA1的N端区域相互作用的蛋白质。除了在体内和体外结合BRCA1的能力外,它还与BRCA1最保守的2个区域具有同源性:N端环基序和C端BRCT域。环基序是一个富含半胱氨酸的序列,存在于多种调节细胞生长的蛋白质中,包括肿瘤抑制基因和显性原癌基因的产物。该蛋白还含有3个串联锚蛋白重
与结直肠癌相关的基因突变类型NOTCH1基因
NOTCH1基因所编码的蛋白是一种高度保守的细胞表面受体,Notch家族包括4种受体,分别为NOTCH1,NOTCH2,NOTCH3和NOTCH4,他们的配体包括JAG1,JAG2,DLL1,DLL3和DLL4。Notch信号的紊乱不仅直接而且还可通过其他多条信号通路间接的诱导肿瘤发生,已发现Not
与结直肠癌相关的基因突变类型TP53基因
TP53基因编码的是分子量约为53kDa的蛋白,P35根据其分子量大小命名的,首次是在1979年发现致瘤病毒SV40可以与该蛋白形成复合物,并且将克隆得到p53转入到细胞可引起细胞癌变,所以最初的10年普遍认为p53是抑癌基因。后来发现之前肿瘤细胞来源的p53基因突变体能够促使细胞发生转化,而野生型
与结直肠癌相关的基因突变类型-CDKN1A基因
这个基因编码一种有效的细胞周期蛋白依赖激酶抑制剂。编码蛋白结合并抑制细胞周期蛋白依赖性激酶2或-细胞周期蛋白依赖性激酶4复合物的活性,因此在G1期起调节细胞周期进展的作用。该基因的表达受到肿瘤抑制蛋白p53的严格控制,通过该蛋白介导p53依赖细胞周期G1期停滞,以响应各种应激刺激。该蛋白可与DNA聚
与结直肠癌相关的基因突变类型PSMD4基因
26S蛋白酶体是一种多催化蛋白酶复合物,由2个复合物、一个20S核和一个19S调节器组成,具有高度有序的结构。20S核由4个28个不相同亚单位的环组成,2个环由7个α亚单位组成,2个环由7个β亚单位组成。19S调节器由一个碱基(包含6个ATPase亚单位和2个非ATPase亚单位)和一个LID(包含
与结直肠癌相关的基因突变类型ERBB3基因
该基因编码受体酪氨酸激酶的表皮生长因子受体(egfr)家族的一个成员。这种膜结合蛋白具有神经调节蛋白结合域,但不具有活性激酶域。因此,它可以结合这个配体,但不能通过蛋白磷酸化将信号传递到细胞中。然而,它确实与其他具有激酶活性的表皮生长因子受体家族成员形成异二聚体。异二聚化导致激活导致细胞增殖或分化的
与结直肠癌相关的基因突变类型CDX2基因
该基因是尾相关同源盒转录因子基因家族的成员。编码蛋白是参与细胞生长和分化的肠道特异性基因的主要调节因子。这种蛋白也在肠道的早期胚胎发育中起作用。这种基因的异常表达与肠道炎症和肿瘤发生有关。
与结直肠癌相关的基因突变类型CTNNB1基因
CTNNB1基因编码的蛋白β-catenin是一种粘着连接蛋白,与钙粘蛋白、α-catenin共同组成粘附连接(adherens junctions,AJs)复合体的,通过调控细胞生长以及细胞间的粘附,对上皮细胞层的构建与维持起着重要作用。β-catenin可与APC蛋白结合,发生突变后可导致结直肠
与结直肠癌相关的基因突变类型ERBB2基因
ERBB2编码的蛋白属于表皮生长因子受体家族,该家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(erbB3)及HER4(erbB4),也属于受体酪氨酸激酶家族。ERBB2没有与配体结合的结构域,但可以与家族成员形成异源二聚体来结合配体如表皮生长因子(EGF),从而
与结直肠癌相关的基因突变类型TOP1基因
这个基因编码一种DNA拓扑异构酶,这种酶在转录过程中控制和改变DNA的拓扑状态。这种酶催化单链DNA的瞬间断裂和重新结合,使单链DNA彼此穿过,从而改变DNA的拓扑结构。该基因定位于20号染色体,并具有位于1号和22号染色体上的假基因。
与结直肠癌相关的基因突变类型NRG1基因
该基因编码的蛋白质是一种膜糖蛋白,可调节细胞信号传导,并在多器官系统的生长和发育中起到关键作用。通过选择性启动子的使用和剪接,该基因产生了一种不同亚型的特殊变体。这些亚型以组织特异性的方式表达,在结构上有显著差异,分为I型、II型、III型、IV型、V型和VI型。这种基因的失调与癌症、精神分裂症和双