科学家测序动物界最大基因组
据最新一期《自然》杂志报道,德国康斯坦茨大学和维尔茨堡大学领导的国际研究团队,对动物界最大基因组的拥有者——肺鱼进行了基因组测序。肺鱼基因组约为人类基因组大小的30倍。测序数据有望揭示当今陆地脊椎动物的鱼类祖先如何成功登陆的奥秘。泥盆纪时期(约4.2亿至3.6亿年前),一种具有强健胸鳍和肺的肉鳍鱼类成功从浅水区域登陆,并能在海岸线上移动和呼吸,这与现今的陆地脊椎动物相似。这一事件标志着脊椎动物首次在陆地上移动,是进化史上的重要里程碑。所有后续的陆地脊椎动物,包括两栖动物、爬行动物、鸟类和哺乳动物(包括人类),都可追溯至这一鱼类祖先。然而,肉鳍鱼类为何如此适应陆地环境仍是未解之谜。为了找到答案,研究人员分析了泥盆纪祖先的现存最近亲属的遗传物质。这些最近亲属中,只有3个谱系的肺鱼至今仍存活,分别在非洲、南美洲和澳大利亚。这些古老的“活化石”看起来仍然非常像它们的祖先。研究人员对这3种谱系的肺鱼基因组进行了完整测序。结果显示,南美洲肺......阅读全文
最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ? Cell官网截图。黄海水产研究所供图 日前,由中国水产科学研究院黄海水产研究所联合青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德?魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学
最大规模肾癌基因组研究
肾癌起源于肾小管上皮细胞,是泌尿系统常见恶性肿瘤之一,发病率占全身恶性肿瘤的3%。肾癌的化疗效果并不理想,肾切除手术被认为是最有效果的治疗途径。近50年来肾癌的发病率和死亡率在持续上升,但人们还不太清楚肾癌的发病原因。 贝勒医学院的副教授Dr. Chad Creighton领导研究团队深入分析
聚焦基因组组装-至今最大组装竞赛寻找最优基因组指标
2013年7月23日,由华大基因和BioMed Cental联合创办的开放式期刊《GigaScience》发表了当前最大、最系统的基因组组装过程及评价结果。在第二届Assemblathon竞赛中,共有21个团队基于由三种不同的测序技术所得的鸟、鱼和蛇的未组装基因组数据,提交了43个组装结果,
Nature:最大规模基因组分析研究
一个国际研究小组完成了对所有生命形式有史以来最大规模的基因组分析研究。以前所未有的细节绘制出了真核基因的进化史,提供了有关最早期生命形式进化机制的一些新见解。 这篇发表在《自然》(Nature)杂志上的研究论文,是建立在著名古生物学家Stephen Jay Gould的研究工作基础之上,Gou
科学家完成迄今最大基因组测序
火炬松的基因组有221.8亿个碱基对——约为人类基因组的7倍多,是目前已完成测序的最大基因组生长在美国佐治亚州奥古斯塔国家高尔夫俱乐部第17号洞附近的火炬松(Pinus taeda)曾挡住了美国前总统德怀特·戴维·艾森豪威尔的很多杆球。1956年,他曾试图砍掉这棵树。如今,火炬松正在
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
日前,复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队,首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划,“DNA元件百科全书计划”(Encyclopedia of DNA Elements)从2003年启动至今整整20周年;本研
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497746.shtm 日前,复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队,首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划,“DN
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
日前,复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队,首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划,“DNA元件百科全书计划”(Encyclopedia of DNA Elements)从2003年启动至今整整20周年;本研
Nature子刊:史上最大真菌的基因组揭秘
蜜环菌(Armillaria fungi)是一群让人又爱又恨的家伙。对于吃货而言,它们味道鲜美。对于农民而言,它们是可恶的杀手。蜜环菌可在朽木上腐生,也可以寄生在树木根部,引起多种植物病害,如猕猴桃根腐病、苹果根朽病等。 蜜环菌会先杀死宿主的根,然后分解根部组织,引起烂根病。它们会在受感染的
Nature公布实体瘤的最大规模全基因组研究
在一项新的研究中,来自荷兰和澳大利亚的多个研究机构的研究人员对转移性实体瘤开展了有史以来最大规模的全基因组研究。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为“Pan-cancer whole-genome analyses of metastatic solid tumours”。他们在
华大基因参与全球最大微生物基因组研究项目
华大基因3月22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目EarthMicrobiomeProject(简称“EMP”),将负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定,并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序,以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。 EMP将对来自全球的20万个样本进
全球最大遗传基因中心落户光谷-共建基因组中心
一只被植入个性化基因用于医学实验的“小白鼠”,售价从数十美元到上千美元不等。这种小鼠需从国外引进的历史即将改变。昨日,全球最大的遗传基因工程研究中心—美国杰克森实验室联合武汉菲沙基因落户武汉光谷生物城,共建基因组医学研究中心。 根据协议,武汉菲沙基因将投资10亿元,把杰克森实验室最先
迄今为止规模最大的灵长类基因组调控元素研究
虽然每个生物体都有一个独特的基因组,一个单一的基因序列,但每个个体都有许多表观基因组。表观基因组由化合物和蛋白质组成,它们可以与DNA结合并调节基因活动,可以激活或失活这些化合物和蛋白质,也可以产生器官或组织特异性蛋白质。由于它是一种高度动态的材料,它可以提供大量的信息来阐明组成身体的各种组织和
Nature公布最大规模肥胖全基因组研究成果
一些时尚杂志总是在说,如果你不能控制好你的体重,那么更加就无法控制住自己的人生,但是肥胖真的是可以完全由人为意志控制的吗,为什么还会有一些人怎么吃也不胖,或者脂肪堆积的地方也不相同呢?近期一组研究人员在迄今为止最大规模的肥胖全基因组研究中追溯了其中的遗传成因,相关成果以两篇论文的形式发表在Nat
世界最大的自闭症基因组数据库公布
自闭症,或称为自闭症谱系障碍,是指包括了社会技能、重复行为、语言和非语言交流、以及与众不同的优势或差异等多表征型障碍。我们现在得知,自闭症分好多亚型,大多数由遗传和环境共同作用造成。据估计,每68名儿童中就有一人患有自闭症。虽然,目前自闭症的干预方法很多。但是大多数缺乏循证医学的证据。尚无最优治
迄今最大规模的中国人基因组测序完成
中国研究人员领导的一个国际研究团队4日说,他们完成了迄今最大规模的中国人基因组测序和分析,有助于揭示基因与生育的联系以及了解中国人口基因结构。 这项发表在新一期美国《细胞》杂志上的研究显示,深圳华大基因研究院用“无创产前基因检测”技术收集了超过14万名中国孕妇的部分基因组样本。“无创产前基因检
多囊卵巢综合征最大规模全基因组研究
Andrea E Dunaif PCOS是育龄妇女最常见的内分泌紊乱之一,是不孕症和II型糖尿病的主要原因。PCOS的起源尚不清楚,诊断往往基于不同临床标准,准确程度备受争议。 研究人员通过对7项涉及10000多名PCOS患者和10万欧洲血统对照者的全基因组关联研究(WGAS)进行荟萃分析,探讨
迄今最大哺乳动物基因组库为进化提供新见解
当21世纪初,小鼠、人类、大鼠和黑猩猩的完整基因组首次发表后,遗传学家通过比较基因序列为了解哺乳动物进化打开了大门。为什么一些哺乳动物嗅觉特别灵敏?为什么有些哺乳动物要冬眠?为什么一些哺乳动物的大脑发更大?20年后的今天,由美国麻省理工学院、哈佛大学等单位的科学家牵头的大型国际研究项目——“Zoon
Nature子刊:最大规模的全基因组肺癌易感性研究
在一项由多国研究人员组成的国际研究组项目中,研究人员利用OncoArray基因分型平台,完成了最大规模的全基因组肺癌易感性研究,从中发现了一些新的癌症易感位点。这一研究成果公布在6月12日的Nature Genetics杂志上。 肺癌是全世界发病率和死亡率最高的癌症之一。每年有超过500万例新
NatureGenetics:最大规模精神分裂症全基因组扫描
――超过41,000位患者的全基因组扫描,揭示了携带精神疾病极大风险的“拷贝数变异”目前发现的许多增加精神分裂症患病风险的遗传变异都是罕见突变,因此很难分析其在疾病中的作用。为了解决这一问题,加州大学圣地亚哥分校的医学院Jonathan Sebat博士研究组完成了目前为止最大的全基因组研究,分析了超
1600亿碱基对,这种蕨类植物拥有已知最大基因组
人类基因组由30亿个碱基对组成。可与太平洋新喀里多尼亚等岛屿上的一种蕨——Tmesipteris oblanceolate相比,就小巫见大巫了。因为这种蕨拥有有史以来发现的最大基因组,包含了1600亿个碱基对。相关研究近日发表于《交叉科学》。这一发现可以帮助科学家了解基因组是如何长得如此之大的,以及
我国科学家参与全球最大微生物基因组研究项目
近日,深圳华大基因研究院宣布,我国科学家将参与全球最大微生物基因组研究项目,对来自全球的20万个样本进行环境DNA测序或宏基因组测序,从而建立一个全球性的基因图谱,并承担核心工作。该项目旨在全方位、系统性研究全球范围内微生物群落功能及进化多样性,以便更好地造福社会及人类。 与以往的微
Nature-子刊:史上规模最大全基因组测序发现了啥?
日前,Human Longevity 公司的研究人员在《Nature Genetics》杂志上发表了史上规模最大的全基因组测序和血液代谢物分析的研究结果。 他们的研究发现了基因组中 101 个新基因位点与 246 种代谢物之间的联系,同时找出 90 种能够导致血液中某些代谢物水平异常的罕见基因
地球生物基因组计划:生命科学史上最大计划即将启动
新浪科技讯 北京时间3月1日消息,“人类基因组计划”与“曼哈顿原子弹计划”、“阿波罗登月计划”并称为自然科学史上的“三大计划”。继人类基因组计划之后,生命科学领域又将迎来一件大事——比人类基因组计划更宏大的地球生物基因组计划(Earth BioGenome Project, EBP)即将启动,目
CG、GP开放共享至今最大实验单体型定相全基因组测序成果
2016年10月11日,美国加州山景城——华大基因子公司Complete Genomics(简称CG)与个人基因组计划项目(简称PGP)共同发布了过百人的实验单体型定相全基因组测序结果。这组数据采用长片段阅读技术(简称LFR)读取,是目前最大的有全面实验确认单体型的高覆盖度全基因组组装。“绝大多
迄今最大全基因组测序数据公布-有望带来新的诊断方法
经过历时5年、超35万小时的基因组测序以及超2亿英镑的投资,英国生物银行30日发布了迄今为止世界上最大的全基因组测序数据,完成了这一有史以来最受瞩目的同类项目。英国生物银行首席研究员罗里·柯林斯表示,对于从事健康研究的科学家来说,这是名副其实的宝库,它能为全球的诊断、治疗和治愈带来变革。 作为
迄今最大规模的基因组测序和分析,揭示基因与生育联系
中国研究人员领导的一个国际研究团队4日说,他们完成了迄今最大规模的中国人基因组测序和分析,有助于揭示基因与生育的联系以及了解中国人口基因结构。 这项发表在新一期美国《细胞》杂志上的研究显示,深圳华大基因研究院用“无创产前基因检测”技术收集了超过14万名中国孕妇的部分基因组样本。“无创产前基因检
贝瑞和康建成全球最大妇科肿瘤基因组数据库
基因组大数据的重大意义开始凸显,贝瑞和康与阿里云合作开展的“神州基因组数据云”项目取得的阶段性成果,便已经收效显著。 9月23日,在第十九届全国临床肿瘤学大会暨CSCO学术年会上,北京贝瑞和康生物技术股份有限公司(以下简称“贝瑞和康”)公布了在生物信息分析领域和大数据建设方面做出的重要成果。
Nature子刊公布世界最大的自闭症基因组数据库
自闭症,或称为自闭症谱系障碍,是指包括了社会技能、重复行为、语言和非语言交流、以及与众不同的优势或差异等多表征型障碍。我们现在得知,自闭症分好多亚型,大多数由遗传和环境共同作用造成。据估计,每68名儿童中就有一人患有自闭症。虽然,目前自闭症的干预方法很多。但是大多数缺乏循证医学的证据。尚无最优治
最大规模的荟萃分析揭示新型冠状病毒的基因组序列特性
迄今为止,对新型冠状病毒(2019-nCoV)基因组进行最大规模的测序分析结果证实,这种病毒起源于蝙蝠,且病毒的异质性较低;近日,一项刊登在国际杂志Journal of Medical Virology上的研究报告中,来自博洛尼亚大学的科学家们通过研究在病毒的蛋白质中鉴别出了一种高度可变的基因组