生物物理所揭示N端乙酰化修饰促进Sir3的转录沉默功能

8月11日,Nature structural & Molecular Biology 在线发表了中科院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室许瑞明课题组的最新研究成果。该文章题为Nα-acetylated Sir3 stabilizes the conformation of a nucleosome-binding loop in the BAH domain,揭示了N端乙酰化修饰促进Sir3的转录沉默功能以及提高与核小体间相互作用的分子机理。 核小体是真核生物染色质的基本结构单元,是由约146bp的DNA缠绕在核心组蛋白八聚体上形成的直径为11nm的盘状结构。关于核小体的组装、修饰及识别是表观遗传学的重要研究内容。但关于蛋白质与核小体复合体的晶体结构解析仍然是当今研究难点。此项研究选取了酵母中参与基因表达沉默的Sir3蛋白,通过其N-端BAH结构域与核小体复合体的晶体结构解析,定量地分析了N-......阅读全文

抗核小体抗体的检测及应用是什么?

  凋亡细胞是核小体的重要来源,当SLE患者的吞噬细胞对凋亡细胞的清除能力受损或降低,导致核小体在患者体内大量存积,多聚核小体与活化的单核细胞结合后被抗原递呈细胞呈递给CD4+Th2细胞,Th2细胞增殖活化,激活B细胞产生抗核小体抗体(AnuA)。  AnuA特异性高,与SLE病情活动性相关,通常采

去-H1-的寡聚核小体的离心实验

实验材料精核微球菌核酸酶试剂、试剂盒MSBHSBNaClLSBCaCl2EGTA无蔗糖的 HSBSDS透析缓冲液仪器、耗材匀浆器冷冻超速离心机MWCO 透析袋梯度制备装置(用于离心)针头管子实验步骤1. 用 40 ml MSB 重悬约 2 ml 精核。4℃,10 000 g 离心 10 min(用

用梯度盐透析的方法组装核小体串实验

实验方法原理 实验材料 非标记的 G5E4 DNA末端标记的 G5E4 DNA 牛血清白蛋白(BSA)试剂、试剂盒 高盐缓冲液低盐缓冲液实验步骤 1. 准备如下的重组混合液(最后加入组蛋白):约 100 ug/ml 9 份未标记和 1 份末端标记(摩尔数比)的 G5E4 DNA 混合物20 mmol

Nature:研究者揭示FACT蛋白操纵核小体机制

  众所周知,包装DNA的组蛋白(H2A、H2B、H3和H4)需要分子伴侣。FACT(Facilitates Chromatin Transcription)蛋白是一类至关重要的组蛋白伴侣(histone chaperone)。将基因组DNA组装成核小体深刻地影响了真核生物中所有DNA相关过程。FA

HDAC组蛋白去乙酰化酶活性测定及药物筛选方案

组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)是一类蛋白酶,对染色体的结构修饰和基因表达调控发挥着重要的作用。一般情况下,组蛋白的乙酰化有利于DNA与组蛋白八聚体的解离,核小体结构松弛,从而使各种转录因子和协同转录因子能与DNA结合位点特异性结合,激活基因的转录。在细胞核内

生化与细胞所揭示组蛋白H3K4甲基化抑制转录的新机制

  真核生物染色质的组蛋白末端会发生多种的化学修饰(包括乙酰化和甲基化修饰等),这是真核生物细胞随环境变化而改变基因表达谱式的重要调控方式。之前的研究发现,组蛋白H3K4甲基化分布于基因的启动子区,对基因转录主要起正调控作用。然而,有研究表明H3K4甲基化对某些基因表达起到抑制作用,其

科学家重组真核生物tRNA乙酰化修饰活力并实现RNA定点高效乙酰化修饰

4月13日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员周小龙团队,在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上以Activity reconstitution of Kre33 and Tan1 reveals a molecular ruler mechanism in euka

表观遗传之组蛋白修饰—组蛋白乙酰化

大家好,我又来啦~~今天给大家放送的是表观遗传之组蛋白修饰相关的内容噢,组蛋白修饰也是一个比较复杂的过程,今天呢,我们就给大家讲讲组蛋白乙酰化及相关的产品。 一 组蛋白修饰 真核生物染色质的基本结构单位是核小体,它由约 146 bp DNA 缠绕组蛋白八聚体组成,其中组蛋白八聚体包含 2 (H2

组蛋白的成分有哪些?

  通常含有H1,H2A,H2B,H3,H4等5种成分。除H1外,其他4种组蛋白均分别以二聚体(共八聚体)相结合,形成核小体核心。DNA便缠绕在核小体的核心上。而H1则与核小体间的DNA结合。因此,一般认为组蛋白作为结构支持体的作用比其基因调节作用更为重要。鸟类、两栖类等含有细胞核的红细胞中,含有一

同济大学研究揭示胚胎早期核小体重排规律

  在封面设计中,DNA缠绕在灯笼上象征着核小体,斑马鱼胚胎发育过程也以艺术的形式呈现。   2月25日,记者从同济大学获悉,该校生命科学与技术学院张勇课题组与刘小乐课题组,在国际上首次揭示了脊椎动物在胚胎早期发育过程中的核小体重排规律,并对核小体定位的表观遗传预编程作用进行了探讨。相关成果已作为

著名学者庄小威Nature解析核小体重塑

  来自哈佛大学的研究人员在新研究中探究了ISWI染色质重塑因子协调重塑核小体的机制。研究结果发表在6月29日的《自然》(Nature)杂志上。  文章的通讯作者之一是著名的华裔女科学家,哈佛大学庄小威(Xiaowei Zhuang)教授,庄教授早年毕业于中国科技大学少年班,34岁的时候就成为了哈佛

抗核小体抗体检测的原理及临床意义

  原理  将高度纯化的核小体靶抗原固定于微孔板上,患者血清中的抗核小体抗体可与之结合,通过辣根过氧化物酶(HRP)标记的第二抗体(抗人IgG)反应及酶底物/色原显色,即可检测此抗体。  临床意义  1.抗核小体抗体近年来已成为系统性红斑狼疮(SLE)的标志抗体,其敏感性高、特异性强,对SLE诊断有

用逐步盐透析的方法组装核小体模板实验

实验方法原理 实验材料 牛胸腺 DNA放射性标记的 DNA纯化的天然核心组蛋白试剂、试剂盒 NaClTE 缓冲液仪器、耗材 MWCO 透析管实验步骤 1. 准备如下的重组混合液:约 8 ug 未标记的超声破碎的牛胸腺 DNA (作为载体 DNA; 加自 1~2 mg/ml 储液)200 000~40

去-H1-的寡聚核小体的凝胶过滤实验

实验材料精核微球菌核酸酶试剂、试剂盒MSBHSBNaClLSBCaCl2EGTA无蔗糖的 HSBSDS透析缓冲液仪器、耗材匀浆器冷冻超速离心机MWCO 透析袋梯度制备装置(用于离心)针头管子实验步骤1. 用 40 ml MSB 重悬约 2 ml 精核。4℃,10 000 g 离心 10 min(用

用逐步盐透析的方法组装核小体模板实验

实验材料牛胸腺 DNA放射性标记的 DNA纯化的天然核心组蛋白试剂、试剂盒NaClTE 缓冲液仪器、耗材MWCO 透析管实验步骤1. 准备如下的重组混合液:约 8 ug 未标记的超声破碎的牛胸腺 DNA (作为载体 DNA; 加自 1~2 mg/ml 储液)200 000~400 000 cpm 单

清华大学最新Nature发文:NuA4选择性乙酰化组蛋白H4的机理

  生物体遗传信息DNA缠绕组蛋白八聚体1.7圈形成了染色体的基本组成单位——核小体。组蛋白H4的 N端尾巴与临近的核小体相互作用,促进染色体高级结构的形成以及异染色质沉默。核小体组装和异染色质形成阻碍了DNA的复制、转录以及损伤修复等重要生物学过程。生物体进化出了一系列的机制来克服核小体的阻碍。其

HDAC组蛋白去乙酰化酶活性测定及药物筛选方案

选方案组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)是一类蛋白酶,对染色体的结构修饰和基因表达调控发挥着重要的作用。一般情况下,组蛋白的乙酰化有利于DNA与组蛋白八聚体的解离,核小体结构松弛,从而使各种转录因子和协同转录因子能与DNA结合位点特异性结合,激活基因的转录。在细胞核

关于组蛋白的结构组成介绍

  组蛋白是存在于染色体内的与DNA结合的碱性蛋白质,染色体中组蛋白以外的蛋白质成分称非组蛋白。绝大部分非组蛋白呈酸性,因此也称酸性蛋白质或剩余蛋白质。组蛋白于1884年由德国科学家A.科塞尔发现。组蛋白对染色体的结构起重要的作用。染色体是由重复单位──核小体组成。每一核小体包括一个核心8聚体(由4

广州生物院等揭示体细胞重编程染色质动态变化规律

  12月7日,Scientific Reports在线发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院姚红杰课题组与同济大学教授江赐忠课题组相关人员的合作研究成果Dynamically reorganized chromatin is the key for the reprogramming of so

Bdf1通过与RPA促进同源重组修复原理揭晓

  表观遗传调控DNA同源重组机制获揭示   Bdf1偶联H4乙酰化修饰和DNA重组修复过程 武汉大学供图  近日,《尖端科学》在线发表了武汉大学生命科学学院遗传学系、细胞稳态湖北省重点实验室教授陈学峰课题组的最新研究成果。该研究揭示了酵母溴结构域家族蛋白Bdf1及其人类同源蛋白TAF1在促进DNA

科学家绘出表观遗传和转录起始研究“框架图”

10月7日,《科学》在线发表复旦大学教授徐彦辉课题组的研究成果。研究人员解析了包含+1核小体的PIC-Mediator复合物结构,首次展示了转录起始复合物与+1核小体的紧密结合,表明+1核小体对转录起始复合物在染色质上组装的重要调控作用,建立了表观遗传和转录起始的直接关联。作为基因表达调控的核心,转

血液的化学检验项目中性粒细胞核鼓槌小体介绍

中性粒细胞核鼓槌小体介绍:  中性粒细胞核鼓槌小体是细胞上的一种球形或椭圆形突起。其检查方法是采周围血做涂片,甲醇液固定,吉姆萨染色,油镜下观察。一般女性多核白细胞的核鼓槌出现率为2%-3%,而男性几乎没有。中性粒细胞核鼓槌小体正常值:  男性:1.5%中性粒细胞核鼓槌小体临床意义:  鉴别两性畸形

Science:结构上揭示核小体依赖性的cGAS抑制机制

  在一项新的研究中,来自美国北卡罗来纳大学教堂山分校的研究人员首次确定了先天免疫系统中一种名为cGAS的关键DNA感应蛋白与核小体结合在一起时的高分辨率结构,其中核小体是细胞核内最重要的DNA包装单位。相关研究结果于2020年9月10日在线发表在Science期刊上,论文标题为“Structura

临床化学检查方法介绍中性粒细胞核鼓槌小体介绍

中性粒细胞核鼓槌小体介绍:  中性粒细胞核鼓槌小体是细胞上的一种球形或椭圆形突起。其检查方法是采周围血做涂片,甲醇液固定,吉姆萨染色,油镜下观察。一般女性多核白细胞的核鼓槌出现率为2%-3%,而男性几乎没有。中性粒细胞核鼓槌小体正常值:  男性:1.5%中性粒细胞核鼓槌小体临床意义:  鉴别两性畸形

美国NIH将启动3D核小体重大研究计划

        在过去的10年中,科学家已经认识到基因组并非随机存储于细胞核中。但一个核心问题是,基因组和表观基因组的变化是如何影响细胞核的3D结构,以及如何进一步影响到高度受控的转录平衡体系。  为解决这个问题,美国国立卫生研究院(NIH)宣布,将人类染色体的三维结构研究方向视为进一步认知生物学和

去-H1-的寡聚核小体的溶解和纯化实验

实验方法原理 实验材料 精核微球菌核酸酶试剂、试剂盒 MSBHSBNaClLSBCaCl2EGTA无蔗糖的 HSBSDS透析缓冲液仪器、耗材 匀浆器冷冻超速离心机 MWCO 透析袋梯度制备装置(用于离心)针头管子实验步骤 1. 用 40 ml MSB 重悬约 2 ml 精核。4℃,10 000 g

临床化学检查方法介绍嗜中性粒细胞核鼓槌小体

嗜中性粒细胞核鼓槌小体介绍:  鼓槌小体,在成熟中性粒细胞(杆状或分叶)核之一端(或其他部位),可见有一直径2-4μm向外伸出之突起,其头部(顶端)椭圆或更似鼓锤状,故而得名。一个细胞中通常含有一个,有时含有两个,染色与胞核一致。有人以此来鉴别男性与女性。正常成人,中性粒细胞含性染色体者,女性占5%

上海生科院提出改进的核小体精确定位算法iNPS

  9月18日,国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所韩敬东组的最新研究论文Improved Nucleosome Positioning Algorithm iNPS for Accurate Nucleosome Posit

组蛋白乙酰化定量分析

组蛋白乙酰化修饰是基因表观转录调控的重要机制.组蛋白翻译后修饰所引起的染色质结构重塑在真核生物基因表达调控中发挥着重要的作用.组蛋白乙酰化主要发生在H3、H4的N端比较保守的赖氨酸位置上,是由组蛋白乙酰转移酶和组蛋白去乙酰化酶协调进行。组蛋白乙酰化呈多样性,核小体上有多个位点可提供乙酰化位点,但特定

研究发现不同组蛋白酰化修饰的功能差异

北京时间5月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所罗小舟课题组和北京大学刘涛课题组、刘小云课题组的合作成果发表于国际著名学术期刊《德国应用化学》,研究团队基于基因密码子扩展技术,创造了含共翻译修饰(Co-Translational modification, CTM)核小体的酿酒酵母菌