生物物理所揭示N端乙酰化修饰促进Sir3的转录沉默功能
8月11日,Nature structural & Molecular Biology 在线发表了中科院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室许瑞明课题组的最新研究成果。该文章题为Nα-acetylated Sir3 stabilizes the conformation of a nucleosome-binding loop in the BAH domain,揭示了N端乙酰化修饰促进Sir3的转录沉默功能以及提高与核小体间相互作用的分子机理。 核小体是真核生物染色质的基本结构单元,是由约146bp的DNA缠绕在核心组蛋白八聚体上形成的直径为11nm的盘状结构。关于核小体的组装、修饰及识别是表观遗传学的重要研究内容。但关于蛋白质与核小体复合体的晶体结构解析仍然是当今研究难点。此项研究选取了酵母中参与基因表达沉默的Sir3蛋白,通过其N-端BAH结构域与核小体复合体的晶体结构解析,定量地分析了N-......阅读全文
清华大学、德克萨斯大学Cell联合发布表观遗传重要发现
谈到配送,就连联邦快递(Federal Express®)和UPS快递(UPS®)也无法与人体相比。在癌症生物学中存在着一个令人惊叹的包装和传送系统,其影响了人体是否将会形成癌症。 组蛋白,这一染色质的主要组成元件是一个让人感兴趣的领域。人们认为染色质畸变可导致与癌症相关的DNA损伤。来自清华
施晓冰博士Cell发布表观遗传重要发现
谈到配送,就连联邦快递(Federal Express®)和UPS快递(UPS®)也无法与人体相比。在癌症生物学中存在着一个令人惊叹的包装和传送系统,其影响了人体是否将会形成癌症。 组蛋白,这一染色质的主要组成元件是一个让人感兴趣的领域。人们认为染色质畸变可导致与癌症相关的DNA损伤。来自德克
PTMab直播预告-|-组蛋白新型酰化修饰ChIP介绍
基因组信息以染色质的形式存储在细胞核中,147bp DNA 缠绕组蛋白八聚体形成染色质最小单元核小体。核心组蛋白的柔性 N 末端以及球状核心结构域存在大量共价修饰,如乙酰化、甲基化和磷酸化等。组蛋白赖氨酸乙酰化中和了赖氨酸的正电荷,削弱了组蛋白和DNA的相互作用,从而形成更开放的染色质状态,更高的D
关于组蛋白修饰的基本信息介绍
组蛋白修饰(histone modification)是指组蛋白在相关酶作用下发生甲基化、乙酰化、磷酸化、腺苷酸化、泛素化、ADP核糖基化等修饰的过程。 H3·H4 的乙酰化可打开一个开放的染色质结构,增加基因的表达。转录共同激活物如CBPö;P300、PCA F 实质上是体内的组蛋白
组蛋白的合成修饰的相关介绍
这是形成组蛋白各组分微不均一性的主要原因。修饰的方式有: ①乙酰化。有两种: 一种是H1、H2A、H4组蛋白的氨基末端乙酰化,形成α-乙酰丝氨酸,组蛋白在细胞质内合成后输入细胞核之前发生这一修饰。 另一种是在H2A、H2B、H3、H4的氨基末端区域的某些专一位置形成N6-乙酰赖氨酸。 ②
染色质的组装过程
①最开始是H3·H4四聚体的结合,由CAF-1介导与新合成的裸露的DNA结合。②然后是两个H2A·H2B二聚体由NAP-1和NAP-2介导加入。为了形成一个核心颗粒,新合成的组蛋白被特异地修饰。组蛋白H4的Lys5和Lys12两个位点典型地被乙酰化。③核小体最后的成熟需要ATP来创建一个规则的间距以
物理所SM1组基于单分子力谱技术解析泛素修饰对基因调控
人类基因组包含大约31.6亿个DNA碱基对,线性DNA分子作为庞大遗传信息的载体一般都比较长(人类一条染色体的DNA长度约为2米),生命通过组蛋白将DNA分子有序组织压缩形成微米级别的染色质存储到细胞核中。核小体是染色质的结构和功能的最基本单元,其中DNA缠绕在组蛋白巴聚体周围约两圈,完成对DN
单分子力谱定量解析泛素修饰对基因调控研究的新进展
人类基因组包含大约31.6亿个DNA碱基对,线性DNA分子作为庞大遗传信息的载体一般都比较长(人类一条染色体的DNA长度约为2米),生命通过组蛋白将DNA分子有序组织压缩形成微米级别的染色质存储到细胞核中。核小体是染色质的结构和功能的最基本单元,其中DNA缠绕在组蛋白巴聚体周围约两圈,完成对DN
关于组蛋白修饰—基因调控的基本介绍
基因表达是一个受多因素调控的复杂过程.组蛋白是染色体基本结构-核小体中的重要组成部分,其N-末端氨基酸残基可发生乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、多聚ADP糖基化等多种共价修饰作用.组蛋白的修饰可通过影响组蛋白与DNA双链的亲和性,从而改变染色质的疏松或凝集状态,或通过影响其它转录因子与结构基因启
核基因的定义
核基因(Gene,Mendelian factor)是指携带有遗传信息的DNA(即基因是具有遗传效应的DNA),也称为遗传因子,是控制性状的基本遗传单位。
关于染色质免疫沉淀法的基本介绍
染色质免疫沉淀法(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。 核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰,如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛
研究发现DNA守护者及表观遗传载体更新机制
人类的遗传信息储存于DNA。虽然人体所有体细胞DNA都一样,其编码基因的表达在不同细胞中却不尽相同。那么,基因在不同类型的细胞中怎样选择性表达呢?人类DNA长达1.8米,通常缠绕在组蛋白上形成核小体,核小体经进一步折叠将DNA包装在小小的细胞核中。组蛋白起着DNA守护者的作用,决定着DNA上哪些
单分子力谱定量解析泛素修饰对基因调控研究获进展
人类基因组包含大约31.6亿个DNA碱基对,线性DNA分子作为庞大遗传信息的载体一般都比较长(人类一条染色体的DNA长度约为2米),生命通过组蛋白将DNA分子有序组织压缩形成微米级别的染色质存储到细胞核中。核小体是染色质的结构和功能的最基本单元,其中DNA缠绕在组蛋白巴聚体周围约两圈,完成对DN
核小体识别和泛素化机制,有助开发更好的癌症治疗方法
在一项新的研究中,来自美国梅奥诊所的研究人员利用先进的成像技术,对BRCA1-BARD1蛋白复合物有了前所未有的了解,该复合物在乳腺癌或卵巢癌患者中经常发生突变。这项研究确定了BRCA1-BARD1功能的多个方面,为未来的转化研究、癌症预防工作和药物开发提供了支持。相关研究结果于2021年7月2
Nature:新研究揭示核小体结合导致cGAS失活的分子基础
在所有哺乳动物中,环状GMP-AMP合酶(cGAS)感知病原DNA的入侵,并刺激炎症信号转导、自噬和凋亡。cGAS都是通过检测处于错误位置的DNA来发挥作用的。在正常条件下,DNA被紧密地包装在细胞核中并受到保护。DNA没有理由会在细胞周围自由移动。当DNA片段确实最终逃离细胞核并进入细胞质中时
血液的化学检验项目嗜中性粒细胞核鼓槌小体介绍
嗜中性粒细胞核鼓槌小体介绍: 鼓槌小体,在成熟中性粒细胞(杆状或分叶)核之一端(或其他部位),可见有一直径2-4μm向外伸出之突起,其头部(顶端)椭圆或更似鼓锤状,故而得名。一个细胞中通常含有一个,有时含有两个,染色与胞核一致。有人以此来鉴别男性与女性。正常成人,中性粒细胞含性染色体者,女性占5%
对核小体进行高分辨率模拟,揭开其复杂堆积
日本京都大学(Kyoto University)细胞材料综合科学研究所(iCeMS)的科学家开发了一种技术,可以对人类基因组的一个基本单元——核小体——进行高分辨率模拟。他们的研究结果发表在Nature Protocols杂志上,应该有助于加深对核小体折叠变化如何影响基因内部工作的理解。
免疫系统和表观遗传学调控:一个新的前沿领域
表观遗传学(epigenetics)研究转录前基因在染色质水平的结构修饰对基因功能的影响,这种修饰可通过细胞分裂和增值周期进行传递。表观遗传学已成为生命科学中普遍关注的前沿,在功能基因组时代尤其如此。免疫系统被认为是一个解析表观遗传学调控机制的良好模型,而且免疫细胞伯分化及功能表达和表观遗
Notch信号通路的相关基因介绍SPEN基因
这个基因编码一种激素诱导的转录抑制因子。这种基因产物的转录抑制可以通过与其他抑制因子的相互作用、参与组蛋白脱乙酰化的蛋白质的募集或通过转录激活因子的分离来实现。这个基因的产物含有一个羧基末端结构域,可以与其他共加压蛋白结合。该结构域还允许与nurd复合物的成员相互作用,nurd复合物是一种核小体重塑
SPEN基因的结构特点和生理作用
这个基因编码一种激素诱导的转录抑制因子。这种基因产物的转录抑制可以通过与其他抑制因子的相互作用、参与组蛋白脱乙酰化的蛋白质的募集或通过转录激活因子的分离来实现。这个基因的产物含有一个羧基末端结构域,可以与其他共加压蛋白结合。该结构域还允许与nurd复合物的成员相互作用,nurd复合物是一种核小体重塑
厦门大学陈瑞川教授JBC发表表观遗传学新成果
真核生物的基因转录是一个复杂而精密的过程。近年来人们发现的正性转录延伸因子P-TEFb,是调控转录延伸的一种基本蛋白,参与了参与绝大多数基因的转录表达。该蛋白的作用机制一直是相关领域的一个主要研究热点。 可诱导的基因表达在许多细胞过程中起到了至关重要的作用,而转录延伸被认为是这种基因表达的关键
什么是乙酰化?常见的乙酰化剂
乙酰化就是将有机化合物分子中的氮、氧、碳原子上引入乙酰基CH3CO-的反应,最常见的是组蛋白乙酰化。常用氯乙酰和醋酸酐等作为乙酰化剂。
研究证明乙酰化过程与基因转录有重要关联
最近,一个来自格拉德斯通研究所的科学团队对一个最基本的生物学过程——基因转录有了重要发现。 2013年,Gladstone的高级研究员Melanie Ott博士发现,在哺乳动物等复杂生物体的基因转录过程中,聚合酶的调控尾部也会发生另一种称为乙酰化的修饰。然而,到目前为止,没有人知道乙酰化是做什
中国科大在染色质重塑SWI/SNF与INO80复合体结构研究获进展
中国科学技术大学教授蔡刚课题组利用冷冻电镜技术,解析了染色质重塑SWI/SNF与INO80复合体及其不同核小体结合状态复合物的三维结构,揭示了SWI/SNF与INO80复合体共有的肌动蛋白(Actin)和核肌动蛋白相关蛋白(Arps)组成的Actin/Arp模块作为构象调控的分子开关,调控核小体结合
华南植物园在植物叶片发育表观遗传调控研究中获进展
组蛋白去乙酰化酶(HDAC)在染色体的结构修饰和基因表达调控中发挥着重要的作用。HDAC通过去乙酰化作用移除核心组蛋白N-末端的乙酰基,增加 DNA与组蛋白之间的引力,使松弛的核小体变得十分紧密,从而抑制基因转录的起始与表达。研究表明,HDAC在植物生长发育过程中发挥重要调控作用。 AS
组蛋白研究进展速览!
本文中,小编盘点了多篇研究报告,共同解析科学家们在组蛋白研究上取得的新成就,与大家一起学习!图片来源:Daniel N. Weinberg et al,doi:10.1038/s41586-019-1534-3 【1】Nature:揭示组蛋白标记H3K36me2招募DNMT3A并影响基因间DN
北京大学Cell子刊发布表观遗传新成果
来自北京大学的研究人员在新研究中揭示出了,组蛋白分子伴侣FACT促进DNA复制耦联的核小体组装的机制。这一研究成果发布在1月21日的《Cell Reports》杂志上。 领导这一研究的是北京大学生命科学学院与北京大学-清华大学生命科学联合中心的李晴(Qing Li)研究员,其主要从事染色质组装
乙酰化的概念及常见的乙酰化剂
乙酰化就是将有机化合物分子中的氮、氧、碳原子上引入乙酰基CH3CO-的反应,最常见的是组蛋白乙酰化。常用氯乙酰和醋酸酐等作为乙酰化剂。
关于组蛋白修饰的形式介绍
在哺乳动物基因组中,组蛋白则可以有很多修饰形式.。一个核小体由两个H2A,两个H2B,两个H3,两个H4组成的八聚体和147bp缠绕在外面的DNA组成. 组成核小体的组蛋白的核心部分状态大致是均一的,游离在外的N-端则可以受到各种各样的修饰,包括组蛋白末端的乙酰化,甲基化,磷酸化,泛素化,ADP
细胞化学词汇核基因
中文名称:核基因英文名称:nuclear gene定 义:真核生物中位于细胞核内染色体上的基因。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)