研究发现不同组蛋白酰化修饰的功能差异

北京时间5月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所罗小舟课题组和北京大学刘涛课题组、刘小云课题组的合作成果发表于国际著名学术期刊《德国应用化学》,研究团队基于基因密码子扩展技术,创造了含共翻译修饰(Co-Translational modification, CTM)核小体的酿酒酵母菌株,进一步揭示了真核生物中不同类型组蛋白酰化修饰的生物学功能差异。 赵英明课题组2011年在Cell杂志上首次报道了巴豆酰化修饰的存在,在之后的数十年里,这一修饰已然成为了真核生物翻译后修饰领域的研究热点。巴豆酰化修饰与乙酰化修饰密切相关,这是因为该修饰作为基因转录激活的标记,与乙酰化修饰类似,都是酶参与调控的修饰过程,且二者在一定程度上存在共同的修饰/去修饰酶。然而,研究表明巴豆酰化修饰可能存在不同于乙酰化修饰且尚未发现的生物学功能。由于缺乏在组蛋白特定位点引入不同酰化修饰的研究工具,研究人员将目光瞄准了基因密码子扩展技术,该技......阅读全文

研究发现不同组蛋白酰化修饰的功能差异

北京时间5月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所罗小舟课题组和北京大学刘涛课题组、刘小云课题组的合作成果发表于国际著名学术期刊《德国应用化学》,研究团队基于基因密码子扩展技术,创造了含共翻译修饰(Co-Translational modification, CTM)核小体的酿酒酵母菌

研究发现全新组蛋白修饰类型——赖氨酸乙酰乙酰化

  细胞代谢为生命过程提供能量。同时,代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知,但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。酮体(包括丙酮、乙酰乙酸和β-羟基丁酸)为脂质代谢产物。在葡萄糖缺乏的状态下,肝脏产生的酮体可用作多种组织的替代能源,且与多种病理生理状态密

表观遗传之组蛋白修饰—组蛋白乙酰化

大家好,我又来啦~~今天给大家放送的是表观遗传之组蛋白修饰相关的内容噢,组蛋白修饰也是一个比较复杂的过程,今天呢,我们就给大家讲讲组蛋白乙酰化及相关的产品。 一 组蛋白修饰 真核生物染色质的基本结构单位是核小体,它由约 146 bp DNA 缠绕组蛋白八聚体组成,其中组蛋白八聚体包含 2 (H2

PTMab直播预告-|-组蛋白新型酰化修饰ChIP介绍

基因组信息以染色质的形式存储在细胞核中,147bp DNA 缠绕组蛋白八聚体形成染色质最小单元核小体。核心组蛋白的柔性 N 末端以及球状核心结构域存在大量共价修饰,如乙酰化、甲基化和磷酸化等。组蛋白赖氨酸乙酰化中和了赖氨酸的正电荷,削弱了组蛋白和DNA的相互作用,从而形成更开放的染色质状态,更高的D

表观遗传修饰家族又添新成员-组蛋白丁酰化新功能诠释

  近年来,芝加哥大学赵英明教授课题组运用高分辨质谱技术发现了多种组蛋白密码,极大丰富了表观遗传修饰调控机制。在刚刚上线的国际知名期刊Molecular Cell上,该课题组又同时报道了三项最新研究成果。其中第一项研究首次发现了一种跟酮体代谢密切相关的表观遗传新修饰——组蛋白三羟基丁酰化[1];第二

研究发现全新DNA单链磷硫酰化修饰系统

DNA单链磷硫酰化修饰-感应修饰限制系统的工作机理  近日,武汉大学药学院教授王连荣课题组在《自然·微生物学》在线发表了细菌DNA磷硫酰化领域的最新研究成果,首次揭示了一套全新的磷硫酰化限制-修饰系统——DNA单链磷硫酰化修饰Ssp系统,并解析了感应基因组修饰抗噬菌体系统的分子机制。  细菌磷硫酰化

研究发现组蛋白去乙酰化酶1的新作用

研究发现组蛋白去乙酰化酶1在特定上皮细胞向间质细胞转化过程中的作用  中科院上海生命科学研究院生化与细胞所宋建国研究组研究发现,组蛋白去乙酰化酶1(Histone deacetylase 1,HDAC1)在转化生长因子-β1 (TGF-β1) 诱导的上皮细胞向间质细胞的转变(Epith

关于组蛋白修饰的方式—乙酰化的基本信息介绍

  组蛋白乙酰化主要发生在H3、H4的N端比较保守的赖氨酸位置上,是由组蛋白乙酰转移酶和组蛋白去乙酰化酶协调进行。组蛋白乙酰化呈多样性,核小体上有多个位点可提供乙酰化位点,但特定基因部位的组蛋白乙酰化和去乙酰化是以一种非随机的、位置特异的方式进行。乙酰化可能通过对组蛋白电荷以及相互作用蛋白的影响,来

组蛋白乙酰化在人胚胎干细胞神经分化中的不同功能

  组蛋白的表观遗传修饰以一种高度动态的变化过程来调节基因表达和生命活动。然而在人类的中枢神经系统发育和神经命运决定过程中,组蛋白(K3K9)乙酰化作为基因开放表达的分子标记,如何参与细胞的神经命运决定目前仍不清楚。  12月17日,国际学术期刊The Journal of Biological C

研究发现组蛋白表观修饰参与调控植物铁离子的吸收

  蛋白精氨酸甲基转移酶在转录调控、RNA加工、DNA修复和信号转导等重要生物学过程中发挥着重要作用。中科院遗传与发育生物学研究所凌宏清和鲍时来研究组最近的合作研究发现,拟南芥蛋白精氨酸甲基转移酶SKB1可根据细胞内铁离子含量的多少,动态结合到控制铁离子吸收的转录调控基因bHLH38、bHLH39、

Cell子刊:组蛋白乙酰化的惊人发现

  在给定细胞中,表观遗传学信号可以决定基因的表达情况。科学家们开发了一种新分析法,对表观遗传学标签进行了系统性研究。  多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,不同类型的细胞只激活功能所需的特定基因。举例来说,肌肉细胞和神经细胞中的基因表达情况就大不相同。哪些基因在何时被激活,很大程度

科研人员创造出含有定点共翻译修饰核小体的酵母菌

  随着蛋白质谱技术的发展,许多组蛋白赖氨酸残基的酰化修饰被鉴定出来,其中巴豆酰化修饰是一类在酵母、哺乳动物等真核生物中保守存在的组蛋白酰化修饰。自2011年被发现以来,巴豆酰化修饰俨然成为了领域内的研究热点。这是因为该修饰是一种重要的表观遗传机制调节基因转录的翻译后修饰。尽管巴豆酰化和乙酰化基团的

GSDMD的棕榈酰化修饰

GSDMD是细胞焦亡过程中的关键蛋白,此前的研究表明GSDMD在细胞焦亡发生时可被Caspase切割,从而释放出N端结构域,释放出的N端结构域进一步形成寡聚体并上膜打孔,最终造成细胞死亡。但此前的研究发现人源GSDMD的C191A突变体会影响其寡聚和造成细胞死亡的能力,因此本文作者尝试探究GSDMD

组蛋白修饰的意义

通过影响组蛋白与DNA双链的亲和性,从而改变染色质的疏松或凝集状态,或通过转录因子与结构基因启动子的亲和性来发挥基因调控作用。这些修饰之间存在协同和级联效应,更为灵活地影响染色质的结构与功能,通过多种修饰方式的组合发挥其调控功能。

发现不同农作物-基因功能差异新机制

  玉米作为一种具有重要经济价值的模式作物,具有丰富的遗传资源,在揭示驯化和植物改良的遗传途径方面具有重要意义。然而,美国加州大学伯克利分校植物和微生物学系的董朝滨(音译)等研究人员,发现驯化玉米和影响其他禾本科作物产量的一些重要途径。在一些情况下,密切相关的禾本科农作物基因之间存在功能差异,似乎不

清华教授发文:首次揭示组蛋白巴豆酰化特异识别机制

  生物通报道:组蛋白翻译后修饰是一类重要的表观遗传调控事件,被认为构成一类“组蛋白密码”,控制着染色质层面的遗传信息解读,在基因表达以及细胞命运决定等生命过程中发挥着关键作用。  来自清华大学医学院李海涛研究团队近期在组蛋白翻译后修饰研究领域取得了重要突破:他们通过对表观调控因子AF9和YEATS

组蛋白甲基化修饰研究再获突破

  日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。  组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是

研究揭示蛋白β羟基丁酰化修饰关键调控因子

  近日,中国科学院上海药物研究所研究员黄河课题组与美国芝加哥大学教授赵英明团队合作,通过全面分析哺乳动物细胞中的Kbhb底物,系统揭示了新型蛋白动态修饰β-羟基丁酰化(Kbhb)的关键调控因子。相关研究成果于2月25日在线发表在Science Advance上。  细胞代谢为生命过程提供能量,同时

国际首次发现植入前胚胎组蛋白修饰建立过程

  由同济大学附属第一妇婴保健院首席科学家高绍荣研究团队的相关科学新发现于2016年9月15日凌晨,在国际著名学术期刊《Nature》在线发表。该研究团队采用最新研究技术,从全基因组水平上揭示了哺乳动物植入前胚胎发育过程中的组蛋白H3K4me3和HK27me3修饰建立过程,并发现宽的(broad)H

表观遗传学修饰

组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因

清华Nature子刊发表表观遗传学新成果

  生物通报道:高等生物的基因组DNA围绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。通过“读取”模块识别组蛋白共价修饰是表观遗传学调控的一个主要机制。  最近人们发现了多种组蛋白赖氨酸酰化,比如巴豆酰化(Kcr)、丁酰化(Kbu

上海药物所合作研究发现一种新组蛋白表观遗传修饰

  美国芝加哥大学Ben May癌症研究所赵英明教授实验室联合中科院上海药物研究所、美国加州大学圣地亚哥分校、法国Joseph Fourier大学等单位研究人员合作完成的关于组蛋白翻译后修饰系统研究的论文于9月18日在《细胞》杂志上在线发表。这也是上海药物所与赵英明教授合作的化学蛋白质组学研究中

揭秘阿尔兹海默病患者如何失去对基因活性的控制?

  阐明大脑中控制基因活性的分子机制或能帮助理解阿尔兹海默病的发病机理,近日,一项刊登在国际杂志Nature Neuroscience上的研究报告中,来自英国埃克塞特大学的科学家们通过研究揭开了基因活性指示器和阿尔兹海默病的发病关联,相关研究或为后期科学家们开发治疗阿尔兹海默病的新型疗法提供新的思路

巴豆酰辅酶A水合酶CDYL调控组蛋白巴豆酰化影响精子发生

  组蛋白修饰是表观遗传学研究的重要方向,其影响了基因的表达调控,和众多生理、病理过程有密切的联系。除了研究较充分的组蛋白乙酰化、甲基化外,景杰生物的科学顾问,芝加哥大学赵英明教授课题组近年来鉴定了八种新型修饰,极大地增加人们对组蛋白修饰的认识,开辟了表观遗传调控的新领域。之后的一系列后续研究表明,

蛋白酰化修饰调控天然产物生物合成研究取得进展

  近期,中国科学院上海药物研究所谭敏佳课题组与华东理工大学叶邦策课题组合作研究,揭示了蛋白赖氨酸酰化修饰在天然产物的生物合成代谢通路中的调控新机制,研究工作发表在8月Cell Chemical Biology(25(8): 984-995. doi: 10.1016/j.chembiol.2018

蛋白酰化修饰调控天然产物生物合成研究取得进展

  近期,中国科学院上海药物研究所谭敏佳课题组与华东理工大学叶邦策课题组合作研究,揭示了蛋白赖氨酸酰化修饰在天然产物的生物合成代谢通路中的调控新机制,研究工作发表在8月Cell Chemical Biology(25(8): 984-995. doi: 10.1016/j.chembiol.2018

最新研究揭示蛋白β羟基丁酰化修饰关键调控因子

  近日,中国科学院上海药物研究所研究员黄河课题组与美国芝加哥大学教授赵英明团队合作,通过全面分析哺乳动物细胞中的Kbhb底物,系统揭示了新型蛋白动态修饰β-羟基丁酰化(Kbhb)的关键调控因子。相关研究成果在线发表在Science Advance上。  细胞代谢为生命过程提供能量,同时代谢物可通过

上海生科院发现组蛋白去乙酰化在小鼠神经诱导中的作用

  4月23日,国际学术期刊Nature Communications在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组的最新研究成果Histone deacetylation promotes mouse neural induction by restricting N

研究揭示核小体乙酰转移酶NuA4的动态机制

组蛋白乙酰化是重要的表观遗传修饰。组蛋白乙酰转移酶在染色质结构、基因转录调控和DNA损伤修复过程中发挥重要作用。通常,表观遗传调控中的大部分组蛋白修饰酶具有位点特异性,即一种修饰酶只对组蛋白尾部的某个特定残基进行修饰。但有研究发现,较多组蛋白乙酰转移酶可以修饰多个位点。例如,核小体乙酰转移酶NuA4

研究揭示核小体乙酰转移酶NuA4的动态机制

  组蛋白乙酰化是重要的表观遗传修饰。组蛋白乙酰转移酶在染色质结构、基因转录调控和DNA损伤修复过程中发挥重要作用。通常,表观遗传调控中的大部分组蛋白修饰酶具有位点特异性,即一种修饰酶只对组蛋白尾部的某个特定残基进行修饰。但有研究发现,较多组蛋白乙酰转移酶可以修饰多个位点。例如,核小体乙酰转移酶Nu