《Cell》：lncRNAs开辟增强子生物学新时代
长链非编码RNAs(long noncoding RNAs ，LncRNAs)是在真核生物中发现的一类长度大于200个核苷酸、没有长阅读框架、但往往具有mRNA结构特征的RNA。LncRNAs在基因组中存在普遍的转录现象，但较之编码蛋白质的基因，往往表达水平比较低。LncRNAs自身的表达水平也受到转录及转录后调控机制的严密调节。 由于LncRNAs不编码蛋白质，曾一度被认为是转录本的“噪音”，不具备生物学功能。然而，近几年来科学家们的研究发现，LncRNAs参与调节了多种重要的细胞活动，如基因表达、招募染色质修饰物、调节X染色体失活(XIST)、基因组印记、蛋白质折叠和蛋白质活性等。并且一旦异常表达则可能导致体内生物学功能紊乱，进而引发包括癌症在内的各种疾病。 有新的研究报告称发现一些LncRNAs与增强子区域相关，并且这样的非编码转录与邻近基因活性增高有关联。还有一些实验表明，增强子的功能可以通过一种转录......阅读全文
3.1.2－RNA－大量转录合成
RNA 标准转录体系的一般回收率为 lugRNA/ug 质粒 DNA, 使用下面的方法，可以提高回收率至 5〜l0ug RNA/ug 质粒 DNA。大量制备 RNA 可以用于体外翻译。实验材料模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒TETE 饱和酚氯仿异内醇3mol LNaAc无水乙醇5X 转录缓冲液lOO
简述转录控制的性质
一种基因可以通过多种方式调节，例如，改变转录的RNA的数量，或者控制基因转录时的时间。这种控制允许细胞或有机体对多种内细胞和细胞外的信号作出反应。这其中的一些例子包括:产生信使mRNA、编码产生酶以适应食物来源方式的变化，以及产生参与细胞周期活动的基因产物和产生在高等真核生物中负责细胞分化的基因
合成－5＇加帽转录物
试剂、试剂盒 DEPC处理的水 转录缓冲液 lOOmmol LDTT RNasin rATP rCTP rU
原位PCR的反转录
原位PCR的反转录不同于原位PCR的过程包括两个：即蛋白酶消化后用无RNA酶的DNA酶消化过夜和原位PCR的反转录过程。此处主要介绍这两个过程，其余方法同原位PCR。1．DNA酶消化【试剂与配制】无RNA酶的DNA酶10×缓冲液：35μl 3mol/L NaAc，5μl 1mol/L MgSO4，6
转录终止因子的定义
中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定 义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等)，其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
双向转录的技术特点
E.coli外膜蛋白OmpC和OmpF的合成调控：OmpC和OmpF的合成受到培养基渗透压的控制，当培养基渗透压增加时，由 envZ基因编码的一种外膜受体蛋白能感受渗透压的变化，将信息传递给细胞质内的OmpR蛋白。激活的OmpR是一种正调节蛋白，能促进双向转录，除转录OmpC基因外，还以相反方向在O
共转录的技术特点
中文名称共转录英文名称cotranscription定 义(1)原核生物的基因以多顺反子或操纵子形式存在，被转录为一个共同的信使核糖核酸(mRNA)。(2)通过基因操作使不同的基因同时在细胞或组织中一起转录。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
转录物组的定义
转录组也称“转录物组”。是一个基因组转录的所有RNA。
通用转录因子的定义
通用转录因子（general transcription factors, GTFs） 。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子，这些起始因子称为通用转录因子
合成－5＇加帽转录物
试剂、试剂盒 DEPC处理的水 转录缓冲液 lOOmmol LDTT RNasin rATPrCTPrUTP rGTP0.5 mmol L m7 G(5＇)ppp(5＇)G DNA 模板 RNA 样品缓冲液 RNA 载样缓冲液 MOPS 缓冲液 TE 缓冲液实验步骤 一材料与设备1)DEPC：处理的
转录抑制剂分类
转录抑制剂分为两大类。第一类抑制剂特异性地与DNA链结合,抑制模板的活性,使转录不能进行。这类抑制剂同时抑制DNA复制,例如:放线菌素D、纺锤菌素、远霉素、溴乙锭和黄曲霉素等。第二类抑制剂作用于RNA聚合酶,使RNA聚合酶的活性改变或丧失,从而抑制转录的进行。这类抑制剂只抑制转录,不影响复制,是研究
连缀转录分析实验
实验方法原理 离心机和转头，沸腾的水浴锅， Dounce 匀浆器，晶型塑料或超明亮型吊桶式离心管，聚丙烯管，刀片，预设到 30°C 的振荡水浴，预设到 4°C 和 65°C 的水浴实验材料 非重组质粒载体含感兴趣 cDNA 或基因的重组质粒培养细胞或新鲜组织试剂、试剂盒 氯仿DNA变性溶液乙醇甘油贮
转录的定义和过程
转录(Transcription)是遗传信息从DNA流向RNA的过程。即以双链DNA中的确定的一条链(模板链用于转录,编码链不用于转录)为模板,以A、U、C、G四种核糖核苷酸为原料,在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。作为蛋白质生物合成的第一步,进行转录时,一个基因会被读取并被复制为mRNA,即特
关于转录单位的简介
RNA的合成是由RNA聚合酶（RNA polymerase)催化的。当RNA聚合酶结合到基因起始处时，即为启动子（promoter)的特殊序列上时，转录开始进行。最先转录成RNA的一个碱基对是转录起点（startpoint)，启动子序列围绕在它周围。从起点开始，RNA聚合酶不断沿着模板链不断合成
RNA转录的技术特点
转录时，细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA，通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比，转录有很多相同或相似之处，亦有其自己的特点。转录中，一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说，以特定的DNA片段作为模板，以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂，合成前体
转录模板的操作步骤
1. 提取cDNA质粒；2. 线性化质粒：（利用单一的酶切位点线性化有利于转录）3. 纯化质粒：（尽量避免RNase污染） ① 加等体积的Tris-苯酚：氯仿（1:1）到100μL限制内切酶消化体系，涡旋振荡20s, 13000g离心5min; ②上清转移，加入2倍体积无水乙醇和1/10体积的3M的
转录组高通量测序
（第二代高通量测序技术-454） 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是，转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下，其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titanium第二代
简述转录因子的作用
是通过和顺式因子的互作来实现的。这段序列可以和转录因子的DNA结合域实现共价结合，从而对基因的表达起抑制或增强的作用。 目前，人工转录因子（Artificial Transcription Factor，ATF）的构建已用于转录因子的生物学功能研究中起到重要作用。ATF是指将不同的DNA结合结
基因转录调控的途径
可分为三种主要途径：1）遗传调控（转录因子与靶标基因的直接相互作用）；2）调控转录因子与转录机制相互作用，3）表观遗传调控（影响转录的DNA结构的非序列变化）。
连缀转录分析实验
实验方法原理 离心机和转头，沸腾的水浴锅， Dounce 匀浆器，晶型塑料或超明亮型吊桶式离心管，聚丙烯管，刀片，预设到 30°C 的振荡水浴，预设到 4°C 和 65°C 的水浴 实验材
信使RNA转录的调控
一、遗传信息的表达有时序调控和适应调控，转录水平的调控是关键环节，因为这是表达的第一步。转录调控主要发生在起始和终止阶段。 二、操纵子是细菌基因表达和调控的单位，有正调节和负调节因子。阻遏蛋白的作用属于负调控。环腺苷酸通过其受体蛋白（CRP）促进转录，可促进许多诱导酶的合成。操纵子可构成综合性
转录后水平的调控
真核生物基因转录在细胞核内进行，而翻译则在细胞质中进行。在转录过程中真核基因有插入序列，结构基因被分割成不同的片段，因此转录后的基因调控是真核生物基因表达调控的一个重要方面，首要的是RNA的加工、成熟。各种基因转录产物RNA，无论rRNA、tRNA还是mRNA，必须经过转录后的加工才能成为有活性的分
连缀转录分析实验
核连缀分析用于确定某个克隆的基因是否受转录调控。理论上，核连缀分析应该在检测稳定状态 mRNA 水平变化的杂交实验之后，而在启动子分析之前进行。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）下册，作者：〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实验方法原理离心机和转头，沸腾的水浴锅， Dounce 匀浆器，
概述转录因子的组成
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分： 1、亚基 RNA聚合酶的亚基，它们是转录必须的，但并不对某一启动子有特异性。 2、复合物 某些转录因子能
转录的概念和过程
转录是指由DNA合成RNA的过程。在转录期间，RNA聚合酶根据需要将一个基因的DNA拷贝成mRNA，这个过程在真核生物和原核生物中是相似的。与原核生物明显不同的是，真核RNA聚合酶在转录过程中与mRNA加工酶结合，因此，真核生物的mRNA加工可以在转录开始后快速进行。短寿命的未加工或部分加工的转录产
人类首次“转录”太阳声波
英国科研人员对太阳日冕层产生的声波实施“转录”，首次推出太阳“交响乐”。这项研究不但有助于了解太阳大气层活动，还有助于预测太阳耀斑爆发。首次“转录” 谢菲尔德大学太阳物理和空间等离子体研究中心首次把日冕环状磁场振荡转变为人耳可以听到的声音。 3年前，这一研究中心宣布，观察到太阳日冕
转录组测序流程步骤
以真核转录组测序为例，实验流程为总RNA提取-mRNA分离-建库试剂-定量-文库回收-桥式扩增-上机测序；项目分析流程为数据产出数据=数据去杂-转录组拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注释-基因表达差异分析-差异基因表达模式聚类-差异基因富集分析。
转录组高通量测序
（第二代高通量测序技术-454） 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是，转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下，其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu
转录组高通量测序
（第二代高通量测序技术-454） 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是，转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下，其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu
3.1.1－RNA－标准转录反应
利用 DNA 聚合酶 I 的大片段（Klenow 酶）的 3＇— 5＇外切酶活性将 3＇黏性末端转化成平末端。具体方法是在体外转录体系尚未加入核苷酸和 RNA 聚合酶时，加入 Klenoow 片段 (终浓度为 5U/ug)，于 22℃ 孵育 15mim, 然后再加入核苷酸混合物和RNA 聚合酶实验材