全球最大数字微生物数据库建成
来自爱尔兰、法国和意大利的科学家携手，成功构建了全球最大的数字微生物库——“阿波罗”（APOLLO）。“阿波罗”囊括了247092个计算模型，其中包含迄今为止最全面的人体微生物组计算模型，有望增进科学家对人体微生物组及其对健康影响的理解。相关论文发表于最新一期《细胞系统》杂志。 研究团队重点关注了细菌微生物组，即那些栖息于人体内外的细菌群落。他们基于真实样本，创建了14451个微生物群落的计算模型，每个模型都展示了这些群落内不同微生物代谢如何随身体部位、年龄和健康状况的变化而变化。这些计算模型依据的样本分布身体不同部位，跨越不同年龄，是迄今最全面的人类微生物组计算模型的集合。“阿波罗”还预测了与克罗恩病、帕金森病和儿童营养不良有关的关键代谢物，为开发诊断和治疗新策略提供了宝贵线索。 研究团队表示，这一数据库将成为科学家探索微生物在人体内功能、微生物与健康和疾病相互作用的新利器，降低对繁琐的活体生物实验的依赖。 这一成果......阅读全文
全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日，《自然》在线发表中外科学家的合作成果，该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库，从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者，助理研究员刘琨为文章共同第一作者。该成果在《自然》报道 山东大学供图微生物已在生物制造、
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日，《自然》在线发表中外科学家的合作成果，该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库，从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者，助理研究员刘琨为文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物医药、生物农业、环境治理等
全球最大数字微生物数据库建成
来自爱尔兰、法国和意大利的科学家携手，成功构建了全球最大的数字微生物库——“阿波罗”（APOLLO）。“阿波罗”囊括了247092个计算模型，其中包含迄今为止最全面的人体微生物组计算模型，有望增进科学家对人体微生物组及其对健康影响的理解。相关论文发表于最新一期《细胞系统》杂志。 研究团队重点关
中国科学家建立全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的全球首个青藏高原冰川微生物
中国科学家建立全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的
解码“基因宝藏”：最全海洋微生物基因数据库出炉
9月4日晚，华大生命科学研究院（简称“华大”）联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构，在《自然》上发表研究成果。他们通过对目前已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘，构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库，并从中发现了大量具有应用潜力的基因资源
微生物领域数据库及其分析系统建设研究取得进展
中国科学院计算机网络信息中心大数据技术与应用发展部与中科院微生物研究所等，在微生物领域数据库及其分析系统建设方面取得新进展，提出了一种利用语义网技术构建知识图谱的方法，可将冠状病毒相关的毒株、基因组、蛋白序列、蛋白结构、抗体、文献和ZL等多源异构数据映射至资源描述框架（RDF），并构建了基于语义网框
最大的海洋微生物基因数据库有助于药物发现
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516176.shtm迄今对包括细菌、病毒和真菌在内的海洋微生物基因进行的最全面分析，可为研究人员发现抗生素、追踪气候变化影响和保护濒危物种奠定基础。1月16日，相关成果发表于《科学前沿》。据《自然》报道，
最大的海洋微生物基因数据库有助于药物发现
迄今对包括细菌、病毒和真菌在内的海洋微生物基因进行的最全面分析，可为研究人员发现抗生素、追踪气候变化影响和保护濒危物种奠定基础。1月16日，相关成果发表于《科学前沿》。据《自然》报道，2021年，研究人员构建了一个目录，其中包含约3亿组陆地微生物和海洋微生物的基因。现在，沙特阿拉伯阿卜杜拉国王科技大
“百万微生态”计划将构建全球最大人体微生物组数据库
2019年10月26日，“百万微生态”国际合作计划（MMHP）在深圳第14届国际基因组学大会（ICG-14）上正式启动，来自中国、瑞典、丹麦、法国、拉托维亚等多国科学家将合作开展微生物宏基因组研究，致力于在未来三至五年内对100万份来自肠道、口腔、皮肤、生殖道等器官的微生物组样品进行测序分析，绘
融智生物发布全球首个商用化生物组学微生物质谱数据库
近日，融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。 传统上，基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异，对核糖体蛋白组的质谱测试，可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TO
期刊数据库更新
图片来源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评，认为其扭曲了学术出版。近日，美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告（JCR）数据库的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数，除以其两年间发表的文章数量，
期刊数据库更新
图片来源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评，认为其扭曲了学术出版。近日，美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告（JCR）数据库的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数，除以其两年间发表
研究构建绵羊和山羊肠道高质量微生物基因组数据库
近日，西北农林科技大学羊遗传改良与生物育种团队携手国内外多家科研机构，在绵羊和山羊肠道微生物基因组数据库构建及肠道粘蛋白和多糖代谢功能菌种挖掘方面取得进展，研究成果发表在Microbiome上。研究团队在全国范围内的32个羊场收集了来自21个绵羊和山羊品种共计320个肠道样本，分别构建了包含1.6亿
超4000种－融智生物发布商用化生物组学微生物质谱数据库
近日，融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。 传统上，基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异，对核糖体蛋白组的质谱测试，可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TO
中外科学家合作建立全球最大海洋微生物组数据库
9月4日，国际顶级期刊《自然》（Nature）在线发表中外科学家的合作成果“ Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting ”。该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库，从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗
中外科学家合作建立全球最大海洋微生物组数据库
9月4日，国际顶级期刊《自然》（Nature）在线发表中外科学家的合作成果“ Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting ”。该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库，从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具
核酸数据库的概念
中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定 义DNA、RNA序列的资料库，主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性，如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级
GenBank数据库概述（四）
NCBI站点地图---其他基因组数据介绍：1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 ：把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起，包括序列，图谱，和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序：小鼠基因组计划的测序进展，HTG序列contigs（可以用大小和染色体号来浏览）由
GenBank数据库概述（三）
结构： 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB：分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook
GenBank数据库概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述，下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1，国际标准组织（ISO）数据表示格式，下载
GenBank数据库概述（一）
1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库，一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合（UniGene），人类基因组基因图
QP2010农药数据库
Shimadzu气质联用的多种农药库 QP2010农药数据库
汉语语言产生数据库发表
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517976.shtm
生命科学常用数据库
The NationalCenter for Biotechnology Information. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/National Center for GenomeResources.http://www.ncgr.org/ncgr/ncgr.html T
全球危险病毒数据库上线
一个供研究人员共享危险病毒基因组的新数据库，有望解决许多阻碍现有方法的问题。但前提是，必须说服研究人员使用它。据《自然》报道，这一名为Pathoplexus的数据库于上个月启动，数据库背后的科学家团队希望有更多研究人员分享已知和新出现的对公共卫生具有重要意义的基因序列。澳大利亚悉尼大学病毒学家Edw
美国更新食品掺假数据库
9月5日食品安全新闻网消息，美国药典委员会（USP）更新了食品掺假数据库（FFD2.0）。食品掺假数据库主要为行业、监管部门以及消费者预防和应对食品掺假事件发生提供技术支持。最新的FFD2.0涵盖了科研文献、媒体信息、食品监管记录、司法裁决记录中涉及食品掺假事件的各种信息。新版食品掺假数据库将于
拉曼光谱免费数据库
拉曼数据库在物质鉴定和化学分析方面具有重要的作用。关于拉曼数据，我们一般会关注两个峰的位置，分别是D峰和G峰。D峰和G-峰均是C原子晶体的 Raman特征峰，分别在1350cm-1和 1580 cm-1附近，D峰反应的是晶格的碳缺陷，G峰反应的是材料的碳化程度。I(D) / I(G) 是 D峰和G峰
盐湖资源环境信息数据库建成
日前，中国科学院青海盐湖研究所在科技部基础专项、中科院“百人计划”等项目的支持下，立足柴达木盆地盐湖资源优势，历时6年建成的盐湖资源与环境科学基础数据共享数据库正式通过科技部验收。这标志着目前我国数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统正式建成，并对基于科学数据的盐湖资源合理利用、长远决策