国家基因库发起国际“千种鱼转录组计划”

2013年11月19日,深圳国家基因库宣布一项具有重要开创性意义的国际“千种鱼转录组计划”(1, 000 Fish Transcriptome,Fish T1K)正式启动。该项目旨在解密鱼类的起源、进化、生殖、发育、性别调控和免疫等问题,助力科研人员开发出新的技术及策略,以更好地应对鱼类育种、疾病防控、海洋食品安全和生物多样性保护等带来的诸多挑战。 相对于其他鱼类转录组研究,千种鱼转录组计划规模之大、学科交叉之广、综合性之强,在全球范围内尚属首例。该项目产出的所有数据将通过国家基因库进行公开,以保证科学家可以实时掌握鱼类研究动态及RNA-seq测序技术的最新应用。 鱼类是所有脊椎动物中种类最多的群体。据估计,全球鱼类约有3万余种。很多鱼类具有极大的经济价值和医学价值,同时在生态保护中起着重要的作用,是自然界生物多样性的一个重要组成部分。测序技术和生物信息分析工具的飞速发展,使大规模鱼类转录组研究成为可能。......阅读全文

国家基因库发起国际“千种鱼转录组计划”

  2013年11月19日,深圳国家基因库宣布一项具有重要开创性意义的国际“千种鱼转录组计划”(1, 000 Fish Transcriptome,Fish T1K)正式启动。该项目旨在解密鱼类的起源、进化、生殖、发育、性别调控和免疫等问题,助力科研人员开发出新的技术及策略,以更好地应对鱼类

国家基因库研发线粒体基因组重要新应用

  继启动万种动物线粒体基因组计划(MT10K, https://www.mt10k.org)之后,深圳国家基因库成功研发出一套应用线粒体基因组监测生物多样性的宏线粒体基因组重测序方法(mitochondrial metagenomics,以下简称“全线粒体混合多样性分析法”)。此方法高效、准确且可

转录组测序和全转录组测序的区别

全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有

国家基因库正式试运行

  据《21世纪经济报道》消息,6月18日,坐落于深圳大鹏新区的国家基因库正式投入试运行。据介绍,国家基因库已初步建成40多个数据库,如中国肿瘤基因组(CCGC)数据库、癌症数据库等。其中,中国肿瘤基因(CCGC)现已收集了超过25种癌症类型数据,近3000例样本数据,近5万条变异信息。

转录组测序原理

而转录组测序即是利用高通量测序技术,将细胞或组织中的全部或部分mRNA, miRNA, lnc RNA 进行测序分析的技术。通过RNA-seq,也就是转录组测序,可以帮助我们了解各种比较条件下所有基因的表达差异包括:正常组织与肿瘤组织;药物治疗前后的表达差异;发育过程中,不同发育阶段,不同组织的表达

国家海洋基因库落户青岛

  青岛市与深圳华大基因研究院日前签署协议,华大基因正式入驻青岛西海岸新区中德生态园,将在这里启动国家海洋基因库建设,发展大健康、现代农业等生命经济产业,打造华大基因北方示范基地。  华大基因是全球基因研究的领跑者,代表中国参与了人类基因组计划、组建了国家基因库、搭建了全球最大的基因组平台。按照约定

中国首个国家基因库开业在即

  国家基因库将于9月22号正式运营,这将是中国首个获批筹建的国家基因库,同时也是目前为止的唯一一个。该基因库由国家发展改革委、财政部、工业和信息化部、原卫生部联合批复,并由华大基因最终负责承建运营。  在开业前夕,新浪科技受邀前往国家基因库所在地,并实地与国家基因库执行主任、华大基因研究院院长徐讯

国家基因库:揭秘中国“诺亚方舟”

在深圳东南部大鹏新区的观音山脚下,矗立着一座依山而建的白色建筑,建筑呈阶梯状向上攀延,从建筑的高处望去,对面是茂密的青山,远处能看见海。在这平静的外表下,建筑内庞大的高通量基因测序房、超级计算房以及冷冻资源房等正在日以继夜地运转着,它们负责存储和管理着我国特有的遗传资源、生物信息和基因数据。这

中国国家基因库正式对外运营

22日,位于广东省深圳市的中国国家基因库正式运营,这是中国首个获批筹建的国家基因库。国家基因库的数据库统一检索系统也将于同日正式开通运行,将公开发布癌症数据集成与整合分析平台等多个数据库,成为为国家生命科学研究和生物产业发展提供基础性服务的公益性平台。存生物资源样本一千万份国家基因库坐落于被称为深圳

国家基因库揭牌仪式在深圳举行

  22日,深圳国家基因库开业仪式在深圳大鹏新区隆重举行。深市市委常委、市政府党组成员田 夫致辞,祝贺基因库主体建筑完工并正式投入使用,对国家基因库筹建5年来取得的成绩表示肯定,并与广东省发改委副主任吴道闻、深圳市市政府副秘书长刘胜、 华大基因董事长汪建,深圳国家基因库主任梅永红,执行主任徐讯等一起

国家基因库拟组建“生物谷歌”

  12月13日至15日,筹备已久的第一届深圳国际生物科技创新论坛暨展览会在深圳会展中心举办。来自美国、英国、德国等18个国家和地区的133家企业和机构参展,其中海外企业共有34家,占展商总数的25.6%。   “如何应对生物信息带来的大数据的挑战?”在这个平台上,国家超级计算天津中心主任刘光明在

国家基因库:揭秘中国“诺亚方舟”

   ■本报记者 张文静 赵广立  在深圳东南部大鹏新区的观音山脚下,矗立着一座依山而建的白色建筑,建筑呈阶梯状向上攀延,从建筑的高处望去,对面是茂密的青山,远处能看见海。在这平静的外表下,建筑内庞大的高通量基因测序房、超级计算房以及冷冻资源房等正在日以继夜地运转着,它们负责存储和管理着我国特有的遗

我国首个国家基因库落户华大基因

  6月17日,我国首个国家基因库及国际科技合作基地两个重大生物科技基础平台落户深圳华大基因研究院。   据国家发改委方面介绍,深圳国家基因库是服务于国家战略需求的国家级公益性科研和产业基础设施。建立国家基因库是为了有效保护、开发和利用我国珍贵的遗传资源,提高我国生命科学研究水平,促进我国生物产业

转录物组的定义

转录组也称“转录物组”。是一个基因组转录的所有RNA。

转录物组的定义

转录组也称“转录物组”。是一个基因组转录的所有RNA。

转录组测序流程步骤

以真核转录组测序为例,实验流程为总RNA提取-mRNA分离-建库试剂-定量-文库回收-桥式扩增-上机测序;项目分析流程为数据产出数据=数据去杂-转录组拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注释-基因表达差异分析-差异基因表达模式聚类-差异基因富集分析。

转录组高通量测序

(第二代高通量测序技术-454)  转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titanium第二代

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

空间转录组和单细胞转录组测序联合应用的典型案例

单细胞转录组测序技术的如火如荼,伴随着空间转录组测序技术的蓬勃发展,可以看到,在现有的高通量检测技术领域,这两种技术已为科学研究的发展提供了前所未有的技术支撑。从2019年单细胞多组学被评为《Nature Methods》年度技术进展,到2020年空间转录组技术也被评为年度技术进展,相信在接

转录组测序与转录表达谱测序的异同

转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特

青岛将建我国首个国家海洋综合基因库

  近日,青岛市与深圳华大基因研究院签署战略合作协议。双方将在青组建青岛华大基因研究院(国家海洋基因库),搭建包括基因资源挖掘、基因组测序在内的技术支撑平台。   据了解,这是我国首个国家海洋综合基因库,将着力构建“1+10”基因组学产业体系:“1”是国家海洋基因库,“10”是依托基因库搭建大海洋基

揭秘搭载生物遗传密码的国家基因库

   9月20日,一名工作人员走过国家基因库的展厅。  在西方神话中,诺亚建造了一艘方舟,带着各种牲畜、鸟类等,躲避了大洪水,安然渡过“世界末日”。  一粒种子、一个细胞、一管血液、一口唾沫、一段脱氧核糖核酸、一条数据……这些不起眼的“现在”可能是构建未来生物科技和产业的砖石。在现实世界中,美国、欧

转录物组学的定义

中文名称转录物组学英文名称transcriptomics定  义研究基因组转录产生的全部转录物的种类、结构和功能的学科。应用学科遗传学(一级学科),总论(二级学科)

转录物组学的定义

中文名称转录物组学英文名称transcriptomics定  义研究基因组转录产生的全部转录物的种类、结构和功能的学科。应用学科遗传学(一级学科),总论(二级学科)

全转录组测序文章

研究背景       长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)普遍被认为是一类不能编码蛋白的长链RNA。由于其序列较长,所以可以有较大的潜力形成多种复杂构象,从而通过不同生物学途径发挥其作用。此外,由于其不具备蛋白编码能力,因此此类RNA也主要由其碱基序列形成的高级

国家基因库参与人类胚胎基因编辑研究

   8月3日,由俄勒冈健康与科学大学、韩国基础科学研究院、美国Salk生物学研究所和深圳国家基因库合成与编辑平台合作完成的人类胚胎基因编辑最新重量级研究成果发表于《自然》杂志。在中国、美国、韩国的国际合作组的通力协作下,科学家第一次成功的利用CRISPR-Cas9系统在人类早期胚胎中对导致肥厚型心

探秘国家基因库:在这里读懂“生命天书”

  早已灭绝的猛犸象还能复活吗?利用在冻土层里发现的猛犸象完整个体,通过基因技术和干细胞技术获得猛犸象胚胎细胞,再为该细胞寻找合适的“代孕妈妈”,或许人们有一天可以见到这种在地球上曾经生活过的庞然大物。  过去,生物的遗传信息好像一本艰深的“生命天书”。现在,人们可以“读懂”乃至“编写”它。2011

全基因组及转录组测序案例分析

案例:应用全基因组测序和 RNA 测序来描绘常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)的基因图谱 背景:常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)是机体免疫应答反应中不能产生抗体的最主要原因。CVIDs 变异度很高,大概 5% 的病人是由基因改变引起的。 目的:利用 Illumina HiSeq25