借助人工智能技术，研究团队发现大量全新RNA病毒
记者10日从中山大学获悉，该校医学院施莽教授团队与阿里云李兆融团队将人工智能技术应用于病毒鉴定，发现了传统研究方法未能发现的病毒“暗物质”，探索了病毒学研究的新路径。相关成果近日发表在国际期刊《细胞》上。据介绍，传统的病毒发现方法包括病毒分离和生命组学的生物信息学分析，高度依赖既有知识，对RNA病毒这种高度分化、种类繁多且容易变异的病毒识别效率低。在该研究中，科研团队开发的LucaProt人工智能算法能够对病毒和非病毒基因组序列进行深度学习，并在数据集中自主判断病毒序列。利用这套算法，研究团队在来自全球生物环境样本的10487份RNA测序数据中发现了超过51万条病毒基因组，代表超过16万个潜在病毒种及180个RNA病毒超群，大幅扩展全球RNA病毒的多样性。其中，23个超群无法通过序列同源方法识别，被称为病毒圈的“暗物质”。“人工智能的算法模型能够挖掘出我们之前忽略或根本不知道的病毒，这种能力在疾病防控和新病原的快速识别中尤为重要......阅读全文
2.8.1－流感病毒－RNA－提取
试剂、试剂盒10×RSB 溶液10%SDS蛋白酶 KlOXLiCI 溶液RSB 饱和的酚氯仿异戊醇2mol L 乙酸钠 无水乙醇TSE 溶液LiCl 缓冲液平衡酚TSE 饱和酚4mol LLiCL实验步骤一 材料与设备1. 酚提法1)10×RSB 溶液：O.Olmol/LTris，O.OOlmol/
2.8.2－乙型脑炎病毒－RNA－提取
试剂、试剂盒酚氯仿异戊醇乙醚KAc乙醇DEPC 处理水TBE 缓冲液上样液KCI。仪器、耗材透析袋实验步骤一 材料与设备1) 酚：氯仿：异戊醇 (25:24:1),2) 乙醚3)2.5mol/LKAc4) 乙醇5)DEPC 处理水6)TBE 缓冲液7〕上样液：40% 甘油，0.4% 啡叮溴红的 TB
植物病毒(plant－viruses)RNA提取
大多植物病毒RNA为单链RNA，并且其极性与mRNA极性相同，植物病毒RNA提取较为简单，一般使用酚氯仿即可获得满意结果。 一、材料 提纯TMV病毒液（10mg/ml）。 二、设备 冷冻台式离心机，低温真空干燥仪，电泳仪，电泳槽。 三、试剂 TE
病毒RNA提取实验方法
1，用异硫氰酸胍提取提病毒的详细步骤，可参考（我提过N次做定量PCR都没问题）：1.取 200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管2.加600ul异硫氰酸胍，然后加入对照和样品，再加200ul氯仿，颠倒混匀3.13000rpm离心15min4.在第3步离心快结束时，另取
病毒－RNA复制的几种方式
（ 1）含正链RNA(+)的病毒(例如，噬菌体Q)：(+)RNA充当mRNA，合成蛋白质。以(+)RNA为模板进行复制合成(-)RNA，再以(-)RNA为模板合成(+)RNA组装成病毒颗粒。（ 2）含负链RNA(-)的病毒(例如狂犬病毒)：由(-)RNA合成(+)RNA，再由(+)RNA合成蛋白质、
双链RNA病毒的特点
双链RNA病毒有两个特点：一是它的基因组为10-12条双链RNA分子；二是它有双层衣壳，而没有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中，在该聚合酶的作用下病毒基因组转录正链RNA，它们自髓核逸出。它们既能作为mRNA，又能作为病毒基因组的模板。MRNA翻译结构蛋白，装配内层衣壳后，正链RNA进
病毒RNA复制的主要方式
一病毒含正链RNA，先合成复制酶，复制后合成其他蛋白质进行装配。如噬菌体Qb及灰质炎病毒。 二病毒含负链和复制酶，先合成正链，再合成病毒蛋白和复制病毒RNA。如狂犬病毒。 三病毒含双链RNA和复制酶，如呼肠孤病毒。先复制正链，再翻译成病毒蛋白，最后合成负链，形成双链RNA分子。 四致癌RN
双链RNA病毒的特点
双链RNA病毒有两个特点：一是它的基因组为10-12条双链RNA分子；二是它有双层衣壳，而没有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中，在该聚合酶的作用下病毒基因组转录正链RNA，它们自髓核逸出。它们既能作为mRNA，又能作为病毒基因组的模板。MRNA翻译结构蛋白，装配内层衣壳后，正链RNA进
病毒－RNA复制的方式介绍
（ 1）含正链RNA(+)的病毒(例如，噬菌体Q)：(+)RNA充当mRNA，合成蛋白质。以(+)RNA为模板进行复制合成(-)RNA，再以(-)RNA为模板合成(+)RNA组装成病毒颗粒。（ 2）含负链RNA(-)的病毒(例如狂犬病毒)：由(-)RNA合成(+)RNA，再由(+)RNA合成蛋白质、
病毒－RNA复制的几种方式
（ 1）含正链RNA(+)的病毒(例如，噬菌体Q)：(+)RNA充当mRNA，合成蛋白质。以(+)RNA为模板进行复制合成(-)RNA，再以(-)RNA为模板合成(+)RNA组装成病毒颗粒。（ 2）含负链RNA(-)的病毒(例如狂犬病毒)：由(-)RNA合成(+)RNA，再由(+)RNA合成蛋白质、
RNA病毒的基本概念
RNA病毒是病毒的一种，属于一级。 它们的遗传物质是核糖核酸（RNA ribonucleic acid）。通常其核酸是单链的(ssRNA single-stranded RNA),也有双链的（dsRNA double-stranded RNA）.单链RNA病毒根据他们的翻译意义可分为正译、负译和双译
RNA和DNA病毒的区别
DNA病毒和RNA病毒的区别，主要是病毒核酸的类型不同，DNA病毒的病毒核酸是DNA，RNA病毒的病毒核酸是RNA。RNA病毒的复制过程比较独特，由于遗传信息直接保存在RNA上，因此复制过程通常发生在细胞质内。RNA病毒是用它们自己的RNA复制酶来对基因组进行复制，但是DNA病毒基因组的复制发生在细
禽流感病毒RNA提取protocol
1，用异硫氰酸胍提取1.取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管2.加600ul异硫氰酸胍，然后加入对照和样品，再加200ul氯仿，颠倒混匀3.13000rpm离心15min4.在第3步离心快结束时，另取同样多eppendorf管，加入400ul -20度预冷的异丙
病毒RNA提取实验方法（protocol）
1，用异硫氰酸胍提取提禽流感病毒的详细步骤，可参考（我提过N次做定量PCR都没问题）：1.取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管2.加600ul异硫氰酸胍，然后加入对照和样品，再加200ul氯仿，颠倒混匀3.13000rpm离心15min4.在第3步离心快结束时，
为什么RNA病毒疫苗较难开发
因为RNA不稳定，很容易变异。而且很多RNA病毒的聚合酶没有校正功能，就更容易变异了。
为什么RNA病毒疫苗较难开发
RNA的复制过程中，其错误修复机制的酶的活性很低很低，几乎是没有的，所以其编译很快；而疫苗是要根据病毒的固定基因或蛋白进行开发制作的。所以RNA病毒疫苗较难开发！
双链RNA病毒的复制介绍
双链RNA病毒有两个特点，一是它的基因组为10-12条双链RNA分子；二是它有双层衣壳，而没有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中，在该聚合酶的作用下病毒基因组转录正链RNA，它们自髓核逸出。它们既能作为mRNA，又能作为病毒基因组的模板。MRNA翻译结构蛋白，装配内层衣壳后，正链RN
关于小RNA病毒的基本介绍
重要的有脊髓灰质炎病毒 [1] ，又称小儿麻痹病毒，大多引起隐性感染，只有约1%产生明显的临床症状；甲型肝炎病毒(HAV)，又称72型病毒，病毒由粪便排出，有传染性；猪水疱病病毒(SVDV)，引起猪口腔粘膜、鼻头、乳房、蹄部发生水疱；猪脑脊髓炎病毒(PEV)，主要病变为中枢神经灰质坏死，病死率9
人工智能新模型实现精准RNA靶向和基因调控
据发表在最新一期《自然·生物技术》杂志上的新研究，美国研究人员开发了一种人工智能模型，可预测RNA靶向CRISPR工具的脱靶活性。该模型可精确地设计向导RNA并调节基因表达，这些精确的基因控制可用于开发基于CRISPR的新疗法。 美国纽约大学、哥伦比亚大学工程学院和纽约基因组中心研究人员进行的
怎么看丙肝病毒RNA检查？
丙肝病毒RNA定量检查对丙肝的治疗起着至关重要的作用，丙肝病毒携带者和患者每6个月要做一次该项检查，以便对体内病毒复制情况有所监控了解，但大家在检查后通常对结果并不了解， 其实临床上对于丙肝病毒的检查可以分为：定性和定量检查两个部分，定性检查也是我们常说的阴性还是阳性，而定量检查就是具体的检
RNA测序深入了解疱疹病毒
近日，发表在《Nature Communications》上的一项研究中，研究人员利用单细胞RNA测序深入了解了疱疹病毒，为预防疱疹感染带来了新的见解。 如果你的嘴唇开始刺痛发痒，通常意味着你将患上唇疱疹，这是一种小而令人疼痛的水泡，里面充满了具有高度传染性的单纯疱疹病毒（HSV）。 单纯疱疹
病毒DNA和RNA的简易纯化技术
生物通报道：EZ1病毒迷你试剂盒（EZ1 Virus Mini Kit）是一种能够用于生命科学研究中的病毒DNA和RNA提纯的新型试剂盒。这种试剂盒提供了一种全自动的同步纯化来自血清、血浆和无细胞体液中的病毒DNA和RNA的能力，并且能对下游分析提供高灵敏度的检测。BioRobot® EZ1工作区的
RNA和DNA病毒的共同点
RNA和DNA病毒都能引发肝炎，丙肝由RNA病毒引起，而乙肝由DNA病毒引起。丙肝病毒疫苗的研制“瓶颈”出现在RNA病毒的形态上面。DNA形态通常比较稳定，因此，DNA病毒的复制，都与“原版”DNA高度一致，因此可以研制出许多用于预防乙肝病毒疫苗。与此相反，RNA病毒在复制过程中会发生错误的“拼写检
病毒－RNA复制的几种方式的介绍
（ 1）含正链RNA(+)的病毒(例如,噬菌体Q)：(+)RNA充当mRNA,合成蛋白质。以(+)RNA为模板进行复制合成(-)RNA,再以(-)RNA为模板合成(+)RNA组装成病毒颗粒。 （ 2）含负链RNA(-)的病毒(例如狂犬病毒)：由(-)RNA合成(+)RNA,再由(+)RNA合成
负链RNA病毒复制的主要步骤
有些ssRNA病毒，它们的遗传物质为正链RNA，可以行使mRNA的功能。一旦病毒颗粒中的RNA进入寄主细胞，就直接作为mRNA，翻译出所编码的蛋白质，其中包括衣壳蛋白和病毒的RNA聚合酶。然后在病毒RdRp（RNA指导的RNA聚合酶，即RNA复制酶）的作用下复制病毒RNA。RdRp同时具有解旋酶的功
体液病毒DNA和病毒RNA小量制备试剂盒质检流程
1.抽检方式：从每批次生产的成品中抽取1‰样品进行检验，如该批次生产的产品少于1000盒，抽取一盒作性能检验。2.检验要求：2.1 体液病毒DNA／病毒RNA小量制备试剂盒组成：见产品说明书。2.2组成核酸纯化试剂盒的塑料耗材的要求详见Q／WTJ- J01 00002。2.3使用性能要求：2.3.1
《细胞》：利用RNA干扰抵御艾滋病毒
这种策略可能被开发成对人类的临床应用 美国科学家近日开发出了一种利用抗体将短链RNA(siRNAs)直接送至免疫细胞的方法，并通过RNA干扰极大地帮助抑制HIV病毒对小鼠的感染。相关论文8月7日在线发表于《细胞》(Cell)杂志上。 进行此次研究的是美国哈佛医学院的Priti Kumar和同事。
RNA病毒通过“挟持”肠道菌逃避寄主免疫
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519896.shtm
RNA病毒通过“挟持”肠道菌逃避寄主免疫
该所功能因子利用与生物合成创新团队的研究人员发现，分节段单链正义RNA病毒通过病毒感染，诱导机体产生大量的抗菌肽来抑制有益菌群的丰度与种类，减弱了菌群的抗病毒功能，从而增加了病毒感染程度。该研究从肠道微生物角度为病毒感染治疗提供新思路。相关研究结果3月22日发表在《国际微生物生态学会期刊》（The
病毒RNA的复制的反应特点和缺陷
病毒RNA进入宿主细胞后，可进行复制，即在RNA指导的RNA聚合酶催化进行RNA合成反应。RNA复制酶催化的合成反应是以RNA为模板，由5′向3′方向进行RNA链的合成。RNA复制酶缺乏校对功能的内切酶活性，因此RNA复制的错误率较高，RNA复制酶只是特异地对病毒的RNA起作用，而宿主细胞的RNA一