借助人工智能技术,研究团队发现大量全新RNA病毒

记者10日从中山大学获悉,该校医学院施莽教授团队与阿里云李兆融团队将人工智能技术应用于病毒鉴定,发现了传统研究方法未能发现的病毒“暗物质”,探索了病毒学研究的新路径。相关成果近日发表在国际期刊《细胞》上。据介绍,传统的病毒发现方法包括病毒分离和生命组学的生物信息学分析,高度依赖既有知识,对RNA病毒这种高度分化、种类繁多且容易变异的病毒识别效率低。在该研究中,科研团队开发的LucaProt人工智能算法能够对病毒和非病毒基因组序列进行深度学习,并在数据集中自主判断病毒序列。利用这套算法,研究团队在来自全球生物环境样本的10487份RNA测序数据中发现了超过51万条病毒基因组,代表超过16万个潜在病毒种及180个RNA病毒超群,大幅扩展全球RNA病毒的多样性。其中,23个超群无法通过序列同源方法识别,被称为病毒圈的“暗物质”。“人工智能的算法模型能够挖掘出我们之前忽略或根本不知道的病毒,这种能力在疾病防控和新病原的快速识别中尤为重要......阅读全文

PLOS:先天免疫系统如何区分病毒RNA和内源性RNA

  目前,慕尼黑大学的研究人员已经确定了可使活细胞内先天免疫系统区别病毒RNA和内源性RNA的结构特点。   当病毒感染细胞的时候,它们控制细胞代谢和劫持用于产生病毒蛋白的细胞资源。这个过程依赖于病毒RNA分子,在宿主细胞内它们被直接传送给新合成的RNA病毒,并通过细胞的翻译设备提供病毒蛋白的制造

研究发现RNA病毒逃逸机体天然免疫机理

  中国工程院院士曹雪涛研究团队在最新研究中,获得了RNA病毒如何通过其独特方式逃逸天然免疫细胞监控清除作用的研究结果,并发现了天然免疫识别与调控的新型分子机制。相关研究论文近日发表在Cell(《细胞》)杂志上。   巨噬细胞、树突状细胞等天然免疫细胞,是机体感知与识别外源病原体入

癌细胞能教唆正常细胞释放“类”病毒RNA

  乳腺癌为什么比其他肿瘤更具侵袭性?7月13日《Cell》报道了一项研究发现,癌细胞能迫使正常细胞像病毒一样生长,从而使肿瘤长大、抵抗治疗和扩散。科学家在患者(尤其是三阴性乳腺癌侵袭性病例)血液中发现了一种病毒类似物。宾夕法尼亚医学院的研究人员说,破解癌细胞的这一工作原理,将有望开辟针对性治疗方法

新冠病毒改变感染细胞RNA首次获证

据物理学家组织网9日报道,通过分析研究病毒、人类和动物细胞RNA获得的13个数据集,巴西圣保罗联邦大学(UNIFESP)的科学家首次证明,新冠病毒会改变宿主细胞RNA的功能。相关论文发表于最新一期《细胞与感染微生物学前沿》杂志。 在本研究中,来自UNIFESP的科研团队通过直接RNA测序,

Thogoto病毒的RNA转录和复制机制获揭示

近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员熊晓犁团队与广州国家实验室研究员陈新文团队合作,在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下,研究揭示了正黏病毒科Thogoto病毒的RNA转录和复制机制。相关成果发表于《自然-通讯》。THOV 聚合酶在RNA合成过程中呈现不同的构象。研究团队供图

Thogoto病毒的RNA转录和复制机制获揭示

  近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员熊晓犁团队与广州国家实验室研究员陈新文团队合作,在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下,研究揭示了正黏病毒科Thogoto病毒的RNA转录和复制机制。相关成果发表于《自然-通讯》。  RNA的转录和复制是RNA病毒生命周期中至关重要的步骤

BIOG病毒RNA提取试剂盒说明书

  BIOG病毒RNA提取试剂盒说明书(中量)   运输条件:常温运输   货 号:51027-M:10次反应    51028-M:20次反应   储存条件:室温(15-25℃),消化液、RNA Carrier请于-20℃存放   产品特点   试剂盒组成   组分

柱式病毒RNA提取试剂盒操作步骤

1.如果有N个样品,标记N+2个1.5~2mL螺旋盖塑料离心管,多出的一个为阳性对照,一个为阴性对照。为避免污染,建议不要使用压盖式塑料离心管。在每个管上做个标记,以在后续操作时区别向心面和离心面。然后各加入0.2mL液体样品(血清、血浆、尿液、脑脊液、唾液、眼泪等等)。不同样品处理方法如下:① 如

BIOG病毒RNA提取试剂盒使用说明

BIOG病毒RNA提取试剂盒说明书(中量) 运输条件:常温运输  货    号:51027-M:10次反应       51028-M:20次反应  储存条件:室温(15-25℃),消化液、RNA Carrier请于-20℃存放试剂盒组成 组分 10次 20次

RNA干扰用于病毒性疾病的治疗

加州大学洛杉矶分校和加州理工学院的研究人员开发出使用RNAi技术来阻止艾滋病病毒进入人体细胞。这个研究小组设计合成的lenti病毒载体引入siRNA,激发RNAi使其抑制了HⅣ-1的coreceptor-CCR5进入人体外周T淋巴细胞,而不影响另一种HⅣ-1主要的coreceptor-CCR4,从而

RNA干扰对病毒性疾病的治疗

  加州大学洛杉矶分校和加州理工学院的研究人员开发出使用RNAi技术来阻止艾滋病病毒进入人体细胞。这个研究小组设计合成的lenti病毒载体引入siRNA,激发RNAi使其抑制了HⅣ-1的coreceptor-CCR5进入人体外周T淋巴细胞,而不影响另一种HⅣ-1主要的coreceptor-CCR4,

BIOG病毒RNA提取试剂盒说明书

  BIOG病毒RNA提取试剂盒说明书(中量)   运输条件:常温运输   货 号:51027-M:10次反应    51028-M:20次反应   储存条件:室温(15-25℃),消化液、RNA Carrier请于-20℃存放   产品特点   试剂盒组成   组分

探索庞大未知的“病毒圈”-脊椎动物RNA病毒研究获重要突破

  由中国疾病预防控制中心传染病所研究员、复旦大学附属上海市公共卫生临床中心兼职教授张永振带领的研究团队,在脊椎动物RNA病毒的发现、遗传与进化领域取得重要突破,这项成果4月5日在《自然》杂志上以研究论文形式发表。  目前,人们对脊椎动物RNA病毒多样性及其进化史的认识,很大程度上还局限在哺乳类和鸟

病毒所从头合成型病毒RdRP引发RNA合成的诱导契合机制

  RNA病毒转录及基因组复制过程均不涉及DNA形式,需要由病毒自身编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRP)来主导完成。RdRP在特定位点精准而高效地引发聚合反应对维持病毒基因组的完整性及合成正确的转录产物至关重要。根据引发方式的不同,Rd

英国使用人工智能来识别新冠病毒新变体

3月13日,英国曼彻斯特大学、牛津大学科研团队在学术期刊《美国科学院院刊》发表成果,他们开发出一种人工智能框架,能够从大量数据中快速识别出未来可能存在风险的病毒基因组,可识别和追踪新冠肺炎病毒新型变体,有助于应对病毒传播。自新冠肺炎爆发以来,全球已出现了多波新变种,传播性、免疫反应逃逸程度不断增强,

Cell:科学家揭示埃博拉病毒和其它RNA病毒的关键结构蛋白

  埃博拉病毒和狂犬病毒都是两种人类的致死性病原体,其同属于RNA病毒类别,而且其在宿主体内常常会共享一套常用的策略来进行病毒基因组的复制,而其它同类型的病毒包括马尔堡病毒、麻疹病毒、腮腺炎病毒以及水疱性口炎病毒等;研究者发现水疱性口炎病毒(VSV)可以引发牲畜患急性病,但其并不会引发人类患病,但其

揭示哺乳动物干细胞利用抗病毒Dicer抵御多种RNA病毒入侵

  在一项新的研究中,来自英国弗朗西斯-克里克研究所的研究人员发现了一种以前认为随着哺乳动物的进化而消失的重要机制有助于保护哺乳动物的干细胞免受SARS-CoV-2和寨卡病毒等RNA病毒的侵害。他们认为,这一发现有朝一日可能在开发新的抗病毒治疗方法中得到利用。相关研究结果发表在2021年7月9日的S

研究发现小RNA病毒致柞蚕患吐白水病

  近日,大连理工大学(Dalian University of Technology)李文利课题组与瑞典农业科技大学(Swedish University of Agricultural Sciences)OlleTerenius课题组合作,在患病柞蚕幼虫体内发现了一株新的小RNA病毒,即

RNASeq,区分细菌和病毒感染新工具

  在临床治疗中,准确鉴定细菌感染和病毒感染至关重要,这关系到治疗干预方案选择和抗生素耐药隐患预防。  例如下呼吸道感染(lower respiratory tract infections,LRTIs),不同病原体引起的不同疾病有着相似的临床症状,让医生很难做出正确诊断。  如今,罗切斯特大学医学

改造型Cas9:RNA病毒的新杀器?

  Cas9是一种特殊的核酸内切酶,已经迅速成为了基因组编辑时代的革命性的新工具。通过小的RNA作为引导序列,Cas9能够特异性结合到DNA上我们感兴趣的区域,然后切割DNA双链。  《美国科学院院刊》近期发表了一篇关于改造Cas9系统的文章。来自一种革兰氏阴性细菌(Francisella novi

禽流感病毒RNA的三种提取方法

实验概要本实验介绍了禽流感病毒RNA的三种提取方法:异硫氰酸胍提取,TRIzol LS提取及Trizol法。实验步骤1. 用异硫氰酸胍提取   1) 取200ul样品数 阴性对照 阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管。   2) 加600ul异硫氰酸胍,然后加入对照和样品,再加200ul氯仿

Cas9/guideRNA遏制“病媒”蚊子传播病毒

  每当夏日将至,人们就开始陷入到被蚊子支配的恐惧之中,小小的蚊子不仅让很多人饱受皮肉之苦,还会传播疟疾、登革热、丝虫病等危害性较强的传染病。因此,别看人类处在食物链的顶层,可几十年过去了,除了杀虫剂策略,我们仍然没有什么一劳永逸的办法对付蚊子。随着CRISPR 基因编辑革命的爆发,人们开始将目光聚

PARP9:RNA病毒的非经典感受器

  RNA病毒感染在人群能引起严重的疾病,对人类健康造成严重的威胁。最近正在流行的2019冠状病毒病(COVID-19)就是由RNA病毒严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染引起的, 这也让抗病毒免疫研究再次成为媒体关注的焦点。天然免疫细胞是人体对抗病毒感染的第一道最重要的防线。它

m6A“RNA甲基化”研究汇总—病毒篇

RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星,也是国自然申请的大热点;究其原因,是因为最近一两年,RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展,病毒感染,神经发育,干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天,我们承接上一期的癌症篇,为您带来病毒领域的RNA甲基化研究

RNA干扰治疗病毒性疾病的方法

加州大学洛杉矶分校和加州理工学院的研究人员开发出使用RNAi技术来阻止艾滋病病毒进入人体细胞。这个研究小组设计合成的lenti病毒载体引入siRNA,激发RNAi使其抑制了HⅣ-1的coreceptor-CCR5进入人体外周T淋巴细胞,而不影响另一种HⅣ-1主要的coreceptor-CCR4,从而

植保所RNA病毒复制酶从核转运至质并启病毒复制的机制

  近日,作物有害生物功能基因组研究创新团队在国际知名期刊《新植物学家(New Phytologist)》在线发表研究论文“Nuclear exportin 1 facilitates turnip mosaic virus infection by exporting the sumoylated

诺如病毒感染:血清病毒-RNA-较少见-仅限于婴幼儿

诺如病毒(Noroviruses ,NoVs),又称诺瓦克病毒,是人类杯状病毒科中诺如病毒属的原型代表株。NoVs 感染性腹泻在全世界范围内均有流行,全年均可发生感染,寒冷季节呈现高发,感染对象主要是老人和学龄儿童。据估计,每年全球约有 71,000 例儿童死于 NoVs 胃肠炎(gas

免疫系统清理“RNA病毒”-有望找到慢性病毒感染药物靶点

  科技日报讯 RNA病毒?没听过。但丙肝病毒、艾滋病病毒、SARS病毒、埃博拉病毒、禽流感病毒、流感病毒……一定如雷贯耳。它们,都归属RNA病毒。先天免疫反应是人体抵抗病毒的第一道防线。不过,免疫系统到底如何“清除”病毒,在学界依然是个谜。湖南大学生物学院病原生物学与免疫学研究所朱海珍团队一项最新

以丙肝病毒血清样本为例介绍如何提高RNA病毒核酸检测...

以丙肝病毒血清样本为例介绍如何提高RNA病毒核酸检测灵敏度这段时间普通民众都是谈新冠病毒色变,无非印证了一句话「人们对不了解的事物才会感到恐惧」。为了减少我们的恐惧感,让我们来深入了解新闻发布会上不断提及的「新冠病毒核酸检测」吧。首先分享中国疾控中心发布的检测新冠病毒的引物、探针序列:推荐选用针对新

MagaBio-plus病毒DNA/RNA纯化试剂盒III在新冠病毒疫情防控...

MagaBio plus病毒DNA/RNA纯化试剂盒III在新冠病毒疫情防控的应用新冠病毒疫情防控一直是一项重要的任务,在疫情的检测中,通过核酸检测试剂盒进行检测是最重要的确诊手段之一。而检测试剂盒不可或缺的部分是核酸分离纯化试剂盒,需要先分离后才能检测。杭州博日科技作为中国PCR行业的领军者,拥有