我国学者与海外合作者在利用人工智能识别潜在RNA病毒研究方面取得进展

图 使用人工智能对全球病毒圈的深度挖掘 在国家自然科学基金项目(批准号:82341118、32270160)等资助下,中山大学医学院施莽教授团队、阿里云李兆融团队,联合悉尼大学Edward Holmes教授团队,在人工智能(artificial intelligence,AI)算法识别潜在的RNA病毒种(species)及RNA病毒超群(supergroups)研究方面取得进展。相关成果以“利用人工智能揭示隐藏的RNA病毒圈(Using Artificial Intelligence to Document the Hidden RNA Virosphere)”为题,于2024年10月9日在《细胞》(Cell)杂志在线发表。论文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01085-7。 病毒是地球生态系统的重要组成部分,与人类健康关系密切。目前人类对病毒多样性的认......阅读全文

抗戊肝病毒抗体检测非特异性结果多:RNA-分析补充

    戊型肝炎病毒(HEV)可通过粪-口途径传播,同时在全球范围内,也是急性肝炎的常见原因。 直接或间接接触活体动物或 HEV 污染的食品可能是最常见的感染途径,但血液途径感染也是可以发生的。    戊型肝炎病毒感染通常是轻微或无症状的,并且无后遗症,同时小于 5% 的感染个体发展为肝炎。然而,暴

浙大揭示新冠病毒RNA非编码区域与宿主蛋白质互作网络

  近日,浙江大学生命科学研究院冯新华、蒋超、任艾明、杨兵实验室在美国微生物协会(American Society for Microbiology)旗下的期刊mSystems杂志上合作发表了题为“High-sensitivity profiling of SARS-CoV-2 noncoding

纯化RNA实验——从组织中纯化总RNA

实验材料组织试剂、试剂盒RNA 抽提缓冲液氯仿实验步骤1. 从动物取下组织,直接进行第 2 步或在液氮中快速冷冻新鲜解剖的组织。冷冻后的组织可以贮存在 -70℃。2. 组织(0.05~0.3 g)在 2.0 ml RNA 抽提缓冲液中匀浆。3. 每管加 200 μl 氯仿,混合均匀,冰浴 15 分钟

RNA干扰(RNA-interference,RNAi)基础知识(2)

1RNA i的发现RNA i是在研究秀丽新小杆线虫(C. elegans)反义RNA (antisenseRNA )的过程中发现的,由dsRNA 介导的同源RNA 降解过程。1995年,Guo等发现注射正义RNA (senseRNA )和反义RNA 均能有效并特异性地抑制秀丽新小杆线虫par

什么是RNA?RNA的作用是什么?

核糖核酸(缩写为RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A(腺嘌呤)、G(鸟嘌呤)、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶),其中,U(尿

RNA干扰(RNA-interference,RNAi)基础知识(3)

SiRNASmall interfering RNA (siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。ShRNAshRNA 短发夹RNAshRNA

RNA干扰(RNA-interference,RNAi)基础知识(1)

Rnai最近由于RNA 干扰(RNA interference,RNA i)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在 RNA i领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA 干扰是

Science聚焦:球形RNA让RNA疗法重获新生

  几十年来,RNA疗法在治疗遗传疾病的道路上走得并不顺遂。不过,随着新型RNA(球形核酸SNA)在人体试验中取得成功,这一领域似乎焕发出新的活力。Science网站特别撰文介绍了这项重要突破。  RNA疗法一般是用反义RNA破坏疾病相关蛋白的生产。在美国化学学会(ACS)上周的一次会议上,研究人员

什么叫做外源性RNA和内源性RNA

核糖核酸(缩写为RNA,即RibonucleicAcid),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A腺嘌呤、G鸟嘌呤、C胞嘧啶、U尿嘧啶,其中,U(尿嘧啶)取代了DNA

RNA-gel-electrophoresis

实验概要RNA gel electrophoresis主要试剂DEPC H2ODEPC 0.1% (v/v)q.s. de-ioinized H2O37ºC x1 hr, or r.t. overnightAutoclave.(NaOAc, EDTA and ethidium bromide sol

RNA-反转录

 实验材料 poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin实验步骤 一材料与设备1)p

RNA提取原理

RNA抽取一般使用Trizol法抽提:Trizol是一种总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速裂解细胞,抑制细胞释放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法进行提取组织或细胞中的RNA。Trizol作用原理:在匀质化或溶解样品中,Trizol试剂可保持RNA的完整性,同时能破坏细胞及溶解细胞成

RNA-反转录

            实验材料 poly(A)+RNA 反转录酶 鼠源反转酶  或禽源反转录酶 试剂、试剂盒 oligo

Poly(A)+RNA-Isolation

Eukaryotic messenger RNA (mRNA) can be separated from the other RNA species in a total RNA preparation by affinity chromatography by virtue of the

RNA的提取

一、准备试剂:氯仿,异丙醇,75℅乙醇,无RNase的水或0.5℅SDS(溶液均需用DEPC处理过的水配制)。二、操作步骤:1. 匀浆处理:a. 组织 将组织在液氮中磨碎,每50-100mg组织加入1ml TRIzol,用匀浆仪进行匀浆处理。样品体积不应超过TRIzol体积10℅。b. 单层培养细胞

RNA干涉实验

实验方法原理 当确定了靶基因上的 siRNA 分子作用位点以后,根据靶位点的序列可以很方便地推导得到相应的 siRNA 分子的正义与反义 RNA 链序列。它们包含 19 bp 的互补双链区和两侧的不配对区(每侧为 2 个 U 成 2 个 T ),在合成时用 T 替代 U 可以降低成本并可以提

RNA点杂交

1) 纯化的RNA的点杂交和狭线杂交安装印迹装置1.切一张合适大小的带正电荷尼龙膜。用铅笔标上表示方向的记号。用水把膜简单弄湿,在20×SSC中室温泡1 h。2.在膜浸泡期间,先用0.1 mol/L NaOH小心清洗印迹装置,再用无菌水洗干净。3.把两片厚滤纸用20×SSC浸湿,再放到真空器顶部。4

RNA干涉实验

RNA 干涉(RNA1) 是指在真核细胞中引入双链 RNA ( doubt-stranded RNA,dsRNA ) 分子从而导致具有序列同源性的基因产生特异件基内沉默(gene silencing ) 的现象。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理当确定了靶基因上的 siRN

Reverse-Transcription-of-RNA

实验概要The purpose of Reverse transcription of RNA is acquiring cDNA for follow research.实验原理Reverse  Transcription (RT reaction) is a process in which s

小分子RNA

RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具,

RNA-Isolation-Protocol

Stabilize RNAStart with 15 ml E. coli Culture containing 7.5* 109 cells (OD600= 0.2 Dilute cells or scale up)Pipet 30 ml of RNAProtect Bacteria Reagen

RNA加工修饰

中文名RNA加工修饰所属领域生物学定义RNA加工修饰,主要加工方式是切断和碱基修饰,真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。

RNA-isolation-for-Microarray

Description RNA extraction using TRI REAGENT. This method gives ample amout of RNA.Procedure It is 3 days procedure.Day 1:1. Harvest the cells and cen

RNA点杂交

RNA点杂交1)  纯化的RNA的点杂交和狭线杂交安装印迹装置1.切一张合适大小的带正电荷尼龙膜。用铅笔标上表示方向的记号。用水把膜简单弄湿,在20×SSC中室温泡1 h。2.在膜浸泡期间,先用0.1 mol/L NaOH小心清洗印迹装置,再用无菌水洗干净。3.把两片厚滤纸用20×SSC浸湿,再放到

DNA-and-RNA-EXTRACTIONS

A protocol / method / schedule /procedure for extraction / isolation of both DNA and RNA from the same material typically plant leaf / leaves(See also

RNA-Isolation-Protocol

RNA Isolation Protocol(Revised 5-15-2003)Stabilize RNAStart with 15 ml E. coli Culture containing 7.5* 109 cells (OD600= 0.2 Dilute cells or scale up)

RNA干涉实验

化学合成siRNA分子实验 体外转录合成siRNA分子实验 采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子 采用RNaseⅢ制备siRNA分子实验             实验方法

RNA微注射

·         RNA Injection (Hoshi Lab)The oocyte is a useful model for the investigation of the function of usr/localious genes and is a widely used syst

RNA的制备

来源于任何细胞的RNA都可以通过反转录酶的作用拷贝成双链DNA并克隆化,获得相应的于特定细胞来源的cDNA文库。因此,RNA制备的意义有两个方面 * 获得特定细胞来源的cDNA文库,克隆目的基因 * 分析基因的表达,阐明基因调控的特性,了解从基因转录产生RNA的结构,数量,水平及合成的速率抑制RNA

RNA-gel-electrophoresis

MaterialsDEPC H2ODEPC 0.1% (v/v)q.s. de-ioinized H2O37ºC x1 hr, or r.t. overnightAutoclave.(NaOAc, EDTA and ethidium bromide solutions should also be