用“全景地图”破解肿瘤“混乱社区”
肿瘤组织具有高度异质性,细胞类型多样、基因表达杂乱无章,区域界限模糊,传统的空间转录组技术难以全面揭示肿瘤的特性。传统方法通常将采样点视为独立的“房子”,统计每个点的细胞类型和基因表达信息,容易产生误差。 为了解决这一难点问题,西安交通大学叶凯教授团队提出以基因表达的空间分布来构建整体计算框架,相关研究成果以“STMiner:以基因为中心的空间转录组学解析肿瘤组织”为题,于近日发表在《细胞·基因组学》(Cell Genomics)杂志上。 叶凯教授团队长期致力于生物信息学方法研究,并将开发的方法运用于遗传病和肿瘤的早诊和精准治疗。由于肿瘤组织的高异质性和空间转录组数据的高稀疏性,传统侧重局部临近特征的策略往往在肿瘤空间转录组数据分析中出现遗漏和偏差。因此,叶凯教授团队开发了STMiner方法,利用二维高斯混合模型和最优传输理论,将离散的采样点转化为连续的基因分布地图,就像从零散的“房屋信息”中绘制出一张完整的“居民分布图......阅读全文
用“全景地图”破解肿瘤“混乱社区”
肿瘤组织具有高度异质性,细胞类型多样、基因表达杂乱无章,区域界限模糊,传统的空间转录组技术难以全面揭示肿瘤的特性。传统方法通常将采样点视为独立的“房子”,统计每个点的细胞类型和基因表达信息,容易产生误差。 为了解决这一难点问题,西安交通大学叶凯教授团队提出以基因表达的空间分布来构建整体计算框架
银河系全景氢气地图问世首次揭露恒星间结构细节
欧洲《天文与天体物理学》杂志23日公开的一篇论文称,澳大利亚和德国科学家利用超大可操纵射电望远镜,绘制出了前所未有的详细银河系氢气地图,首次揭示了银河系恒星间的结构细节,有助于解释银河系星系形成的最终奥秘。 中性原子氢是宇宙空间中最丰富的元素,并且是恒星和星系间的主要成分。此次,天体物理学
“沉默肿瘤”首张全景分子图谱绘成
7日,记者从复旦大学附属肿瘤医院获悉,该院院长虞先濬教授联合北京大学肿瘤医院、中国科学院上海药物研究所、上海长海医院等单位的研究团队,历时5年成功绘制全球首张无功能性胰腺神经内分泌瘤多组学全景图谱,并根据图谱突破性提出这种“沉默肿瘤”的分子分型框架、预后模型和靶向—免疫治疗新策略,为临床精准诊疗
中外科学家联合实现全球首批生命全景地图绘制
日前,由中国科学家主导,6个国家、32个科研团队共同参与完成了全球首批生命时空图谱。科学家们首次绘制了小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥四种模式生物胚胎发育或器官的时空图谱,并在《细胞》(Cell)期刊及其子刊《发育细胞》(Developmental Cell)上在线发表。研究已通过伦理审查,严格遵循相
全球首批!中外科学家联合实现首批生命全景地图绘制
日前,由中国科学家主导,6个国家、32个科研团队共同参与完成了全球首批生命时空图谱。科学家们首次绘制了小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥四种模式生物胚胎发育或器官的时空图谱,并在《细胞》(Cell)期刊及其子刊《发育细胞》(Developmental Cell)上在线发表。研究已通过伦理审查,严格遵循相
安捷伦推出用于肿瘤全景变异分析的NGS产品
——SureSelect Cancer CGP产品通过快速高效的工作流程,扩展了用于实体瘤分析的生物标志物的数量 2023年4月20日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)近日宣布推出Agilent SureSelect Cancer CGP产品,该产品设计用于泛实体瘤的体细胞变异分析。泛癌种
这张图谱为理解肿瘤血管生成过程提供全景视角
7月10日,重庆大学附属三峡医院联合清华大学、北京协和医院以及中南大学湘雅医院,在《自然》上发表最新研究成果。此项研究首次构建了最大规模的泛癌种脉管系统全息细胞图谱,为充分理解肿瘤血管生成的复杂过程提供了全景视角,同时为临床提升抗血管生成疗效提供科学方案。肿瘤的发生与进展和血管的生成息息相关。血管通
“谷歌地图”展示肿瘤生长所需的结构和功能性血管变化
近日,一份发表在《Nature Scientific Reports》的研究称,约翰·霍普金斯大学医学研究人员开发了一种类似于“谷歌地图”的方法,可以更准确地计算和可视化肿瘤生长所需的结构和功能性血管变化。通过将来自动物模型的肿瘤标本的高质量3D成像数据与复杂的数学公式配对,研究人员表示,他们现
国家测绘局推出在线地图网站“天地图”
今天上午11时,中国区域内数据资源最全的地理信息服务网站“天地图”在京正式开通,此举标志着国家地理信息公共服务平台建设取得重大进展,将从根本上改变我国传统地理信息服务方式。 据介绍,国家地理信息公共服务平台包括公众版、政务版、涉密版三个版本,“天地图”就是公众版成果,是由国家
北京发布“脑卒中救治地图”
2017年世界卒中日暨第七届全国卒中宣传周系列活动启动仪式29日在京举行。北京市卫计委联合北京市脑卒中质控中心发布了北京地区“脑卒中救治地图”,旨在让急性卒中患者快速送达最适合的医疗机构,提升救治效率。 北京市脑卒中救治地图由69家具有脑卒中溶栓能力的医院、1个质控中心和120、999急救网络
环保地图搭建互动平台
图为环保地图平台的中国重点污染源地图 我的目标是建成一款综合环境终端,人们无论走到哪里,都可以查到周边环境的状况,比如大气、污染源、污水处理厂、有毒化学品等,可以对所有的环境信息进行查看。除此之外,还可以在线进行举报、投诉、互动和分享。
《Nature-Methods》大脑地图图解
多年来,出现了多种“大脑地图”,每一种都关注不同的大脑过程,从新陈代谢到认知功能。虽然这些地图很重要,但单独使用它们会限制研究人员从中得出的发现。 现在,来自蒙特利尔神经学研究所的一个团队和其他研究人员在一个地方汇集了40多张现有的大脑地图。这个被称为神经图谱的数据库有望帮助科学家发现不同大脑
“声音地图”帮鸽子导航
如果不能追踪次声,鸽子很容易迷失方向。图片来源:Mill56/Flickr/Creative Commons 鸟类也许没有发达的大脑,然而它们知道如何确定正确的航行路线。就在人类观察和徘徊的时候,它们以令人惊奇的准确路线飞过村镇、穿越大洲。生物学家认为视力、嗅觉和内在的指南针都有助
三项研究描绘肺癌“全景”
与任何其他形式的癌症相比,肺癌能够导致更多的死亡。作为头号癌症杀手,全世界每年有160万人被确诊患上肺癌,且只有不到两成的患者能够活过5年。 如今,发表在上周的3项基因组测序研究结果为更加有效的肺癌个性化治疗奠定了基础,即用最适合其肿瘤遗传特征的治疗来匹配患者。 其中两项最新的研究描
古地图-新地图:从二维空间到多维空间
2018年中非合作论坛峰会刚刚结束,此次会议推进了中非各领域的交流合作。有意思的是,从目前的地图来看,中国是最早在地图上表达非洲大陆的,中国与非洲“联结”在明朝就有了。 地图是地理学的语言。地图是人类对地理空间认知的工具。当下,地图已成为大数据的集中体现,运用于现代人生活,以及经济、军事、环
《走进地图世界》获2020年全国优秀地图作品裴秀奖银奖
10月28日,中国测绘学会正式公布2020年全国优秀地图作品裴秀奖获奖名单。由地图学资深专家陈昱、廖克、施曼丽编著的科普图书《走进地图世界》获得银奖。 《走进地图世界》以揭开地图历史、文化和科学面纱为主旨,梳理了古今中外有关地图趣闻及中外500余幅地图产品,并生动介绍现代地图的学科耦合与地图的
高校青年教师“压力地图”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518038.shtm
《北京工业文化体验地图》发布
9月21日,2024北京文化论坛专业沙龙“数字技术与实体经济融合引领生产生活新潮流”在京举办。沙龙上,北京市经济和信息化局首次对外发布了《北京工业文化体验地图》,并向全社会推介100个工业文化体验项目。北京工业文化体验地图。北京市经济和信息化局供图北京市经济和信息化局党组书记、局长姜广智表示,北京经
武汉发布“湖泊水质地图”
武汉市重点湖泊水质发布系统 武汉市89个重点湖泊,根据水质现状不同,分别用红、黄、橙、蓝、绿等不同色块标识,在武汉市地图上清晰标注。近日,武汉市环保局官方网站“武汉市重点湖泊水质发布系统”正式上线,市民查询全市重点湖泊的水质情况或发现涉湖排污行为投诉,均可直接点击进入。 登录市环保
公益人士绘制癌症村地图
一份由公益人士制作的“中国癌症村地图”正在互联网上被关注,村子数量被认为超过200个。 环保部2月20日发布《化学品环境风险防控“十二五”规划》称个别地方因环境污染出现癌症村。 此前,地下水污染导致癌症高发甚至牛羊绝育的报道,在诸多地区出现。在一些地区,污染
中国环境产业战略地图发布
在日前举行的第八届环境技术产业论坛上,E20环境产业研究院首次发布了《中国环境产业发展展望――面向未来五年的环境产业战略地图》。该研究报告预测,5年后中国环境产业将产生240家上市公司,由20家重资产集团、20家区域环境综合服务集团、100家细分领域系统解决方案领跑者、100家装备和材料生产制
《自然》:人类癌症的致癌全景图
用于新型癌症治疗方法的临床试验设计,一般来说都是集中在肿瘤起源所在的组织,然而近期由纪念斯隆-凯特琳癌症中心的研究人员完成的一项研究则发现了一种新的方法:基于基因组标记进行研究,而不是针对机体器官组织进行研究。 这一研究成果公布在9月26日的Nature Genetics杂志上,同时还
NASA合成40亿像素火星全景照
据英国《每日邮报》网站3月31日报道,美国国家航空航天局(NASA)科学家安德鲁·博德罗夫(Andrew Bodrov)近日利用“好奇”号火星车所拍摄的照片合成了一张火星表面的全景照片,像素超过40亿。借助这一照片,人们可以身临其境地体验一把置身火星的感觉。 “‘好奇’号上面的摄像头只
全球礁石记录项目为珊瑚拍全景
水下世界就在你的指尖之间。近日,卡特林海景调查启动了全球礁石记录项目。该项目受国际保险公司卡特林保险集团资助,是一个含有高分辨率珊瑚礁图像的数据库,它最终将把全世界礁石的图像和数据(比如水温和浑浊度)记录下来。通过使用特制的高分辨率摄像机,调查小组可以分别从左、右、下三个方位同时拍摄图像。
全景碳排放数字地球“碳星球”发布
9月2日,中科星图维天信(北京)科技有限公司(简称“星图维天信”)在2022年中国国际服务贸易交易会上发布全球首个高分辨率近实时全景碳排放数字地球产品——“碳星球beta”。 “碳星球”是全球首个具有日尺度分辨率、近实时更新的全景碳排放数字地球产品。该产品充分利用碳数据模型、纳入卫星遥感监测数
我国实景地图首次大规模向公众开放
国家测绘地理信息局在中国测绘创新基地宣布,天地图携手立得空间信息技术股份有限公司,推出覆盖北京、上海、广州、深圳、香港、澳门等100个城市的 “我秀中国”实景地图网站,地图精度达到10厘米左右,可看清大街上行驶车辆的车牌。这是我国移动测量技术和基于云计算平台的大规模协同生产与数据发布技术上的
“最新中国癌症地图”不靠谱
近日,一则名为“中国肿瘤登记年报首次发布最新版中国癌症地图”的消息在网上热传。但记者向专家求证发现,所谓最新版中国癌症地图纯属误读。 数据不具代表性 所谓的“中国肿瘤登记年报首次发布最新版中国癌症地图”的消息称,该调研在全国25个省份城乡18~60岁人群中抽取了有效样本39966个。文中提
绘制基因组的“谷歌地图”
染色体的功能远不止保持DNA整齐有序。这种基因组DNA和蛋白质组成的复合物有许多不同的结构和构象。这些结构和构象可能会影响周围基因的表达。在某些构象中,线性DNA中相距较远的两个序列可能实际上非常靠近,并影响彼此的活性;而在其他形式中,这两个序列又可能相距甚远。 美国麻省理工学院研究生Erez
新版全球“糖尿病地图”公布
11月14日是联合国糖尿病日。国际糖尿病联盟(IDF)为此公布第六版“IDF糖尿病地图”,反映当前最新的糖尿病全球患病情况和经济负担,并对今后全球糖尿病的发病趋势进行预测。根据IDF的最新数据,中国2013年糖尿病的患病人数为9840万,居全球首位;到2035年,中国的糖尿病患病人数将达到1.4
描摹乡村振兴的“绿色产业”地图
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517376.shtm