用“全景地图”破解肿瘤“混乱社区”

肿瘤组织具有高度异质性,细胞类型多样、基因表达杂乱无章,区域界限模糊,传统的空间转录组技术难以全面揭示肿瘤的特性。传统方法通常将采样点视为独立的“房子”,统计每个点的细胞类型和基因表达信息,容易产生误差。 为了解决这一难点问题,西安交通大学叶凯教授团队提出以基因表达的空间分布来构建整体计算框架,相关研究成果以“STMiner:以基因为中心的空间转录组学解析肿瘤组织”为题,于近日发表在《细胞·基因组学》(Cell Genomics)杂志上。 叶凯教授团队长期致力于生物信息学方法研究,并将开发的方法运用于遗传病和肿瘤的早诊和精准治疗。由于肿瘤组织的高异质性和空间转录组数据的高稀疏性,传统侧重局部临近特征的策略往往在肿瘤空间转录组数据分析中出现遗漏和偏差。因此,叶凯教授团队开发了STMiner方法,利用二维高斯混合模型和最优传输理论,将离散的采样点转化为连续的基因分布地图,就像从零散的“房屋信息”中绘制出一张完整的“居民分布图......阅读全文

绘制基因组的“谷歌地图”

  染色体的功能远不止保持DNA整齐有序。这种基因组DNA和蛋白质组成的复合物有许多不同的结构和构象。这些结构和构象可能会影响周围基因的表达。在某些构象中,线性DNA中相距较远的两个序列可能实际上非常靠近,并影响彼此的活性;而在其他形式中,这两个序列又可能相距甚远。  美国麻省理工学院研究生Erez

“深挖”卫星数据,精准绘制人口地图

  尼日利亚卫生部门今后将不必只依靠不完整的人口普查数据发放麻疹疫苗了。《自然》官网10日报道称,由比尔·梅琳达·盖茨基金会日前交付尼日利亚政府的、基于卫星图像建筑物的分析详图中,对当地人口分布做出了明确标示。  盖茨基金会与美国橡树岭国家实验室、英国南安普顿大学研究人员一起,制作了尼日利亚北部各州

官方发布|北京发布首份产业地图

  2月20日,北京市发改委上线了本市首份产业地图,为企业在京发展提供清晰的产业指示指引,进一步擦亮“北京服务”品牌。  这份产业地图覆盖一、二、三产,融合高精尖产业、现代服务业、两业融合、现代基础设施产业、现代农业等31个重点行业,聚焦16个区和经开区的重点产业区域,全面展示各区、相关园区产业基础

世界疟疾地图可以指导控制政策

非洲首当其冲,98%的高风险地区在该大陆   科学家绘制了据称是40多年来首幅关于全球疟疾感染率的地图,这是为了在防控这种疾病的过程中为政策提供信息并监测进展。   今天(3月24日)出版的《公共科学图书馆•医学》杂志发表了恶性疟原虫范围地图,恶性疟原虫是最致命的一种疟疾寄生虫。该地图是由2

韩国首尔推出“太阳能地图”

  据LG Solar透露,目前韩国政府在推动光伏产业发展方面不遗余力,并已推出可再生能源组合标准项目。该项目自去年生效,并已取代原先的上网电价补贴政策。据该项目显示,2015年韩国光伏装机容量目标为1.2GW。韩国首尔市政府正摩拳擦掌积极推行新规划,以期成为领先的太阳能城市。据报道,首尔市“太

最新银河系多维地图发布

天文学家关于银河系的主要参考指南刚刚得到重大更新。正在追踪近20亿颗恒星的“盖亚任务”发布了一幅大幅改进的银河系多维地图,其中包括数千万颗恒星和许多颗小行星的三维运动,探测到的恒星“地震”和可能的太阳系外行星。 6月13日,盖亚团队在一场新闻发布会上公布了这一地图,以及大约50篇科学论文,

-美一机构推出研究经费地图

  想知道你的州从美国国立卫生研究院(NIH)获得多少经费吗?这意味着多少工作岗位?将鼠标固定在医学研究联盟(生物医学研究游说组织)发布的一张在线地图上,你就能知道答案。例如,2013年,加利福尼亚州从NIH获得33亿美元,直接支持了超过5.9万个工作岗位,几乎是产业岗位的4倍。相比之下,爱达荷州仅

发现新物种?参考这幅地图吧

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454931.shtm 2020年,贡扎加叶蛙在巴西东北部被发现,那里可能有更多未被描述的脊椎动物。图片来源:DIEGO J. SANTANA 参与绘制地球上所有生命的地图的生态学家现在已经迈

黑洞全景来了:中国学者领衔,全球联手

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499510.shtm   ?人类历史上拍摄的首张黑洞照片。EHT合作组织供图上面这个“甜甜圈”很多人都熟悉。它是人类历史上拍到的第一个黑洞。该黑洞位于距离地球5500万光年外的M87星系中心,是目

“好奇”号火星车-采样间歇发回“全景自拍”

  美国国家航空航天局(NASA)日前在官网上发布了一张360度全景图,这是“好奇”号探测器在火星上寻找新岩石样本的间歇,在其所在的“薇拉—鲁宾”山脊上,与周围环境进行的一次“自拍”。  虽然火星上持续数月的沙尘暴正在消退,但照片中,天空仍旧一片灰黄,“好奇”号火星车的甲板上铺满沙尘。照片前景是火星

首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布

中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位,共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱,为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源,也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。植物的所有组织、器官中都富含蛋白质,它是构成细胞和生

首个水稻全景定量蛋白质组图谱发布

  中国农业科学院生物技术研究所近日联合国内多家单位,共同绘制了水稻全景定量蛋白质组图谱,为水稻的基因功能研究提供了重要的蛋白质表达量资源,也为基因组学、蛋白质组学等多组学数据支撑作物智能设计育种提供了新思路。相关研究成果发表在国际期刊《自然植物》上。  植物的所有组织、器官中都富含蛋白质,它是构成

2016世界艾滋病日-|-全景科普

2016年12月1日迎来了全球第29个“世界艾滋病日”。今年的活动主题依旧为:行动起来,向‘零’迈进(英文主题为Getting to Zero)。 艾滋病自1981年被发现至今30余年,肆虐全球,夺去了3500多万人的生命,发展成为一个严重的全球范围的公共卫生和社会问题。艾滋病到底是一种什么样的病?

夏光:“污染防治攻坚战”全景图

  党的十九大将坚决打好污染防治攻坚战作为决胜全面建成小康社会的三大攻坚战之一。这是一项非同寻常的部署,说明污染防治在当前国家经济社会发展全局中具有非常重要的影响,同时又面临较大的难度,必须赋予其特殊地位,做出特殊安排。  打好污染防治攻坚战,就是要在特定的时间内,集中强大的力量,努力攻克一批生态环

2016世界艾滋病日-|-全景科普

  2016年12月1日迎来了全球第29个“世界艾滋病日”。今年的活动主题依旧为:行动起来,向‘零’迈进(英文主题为Getting to Zero)。  艾滋病自1981年被发现至今30余年,肆虐全球,夺去了3500多万人的生命,发展成为一个严重的全球范围的公共卫生和社会问题。艾滋病到底是一种什么样

天津大学启用全景教学空间开展授课

LED全彩环幕、裸眼3D、全景智能板书、全景VR、AI助教……新学期伊始,天津大学启用全景教学空间开展授课,升级140余间智慧教室,以AI技术为师生学习生活赋能充电。在北洋园校区33教学楼,天津大学全景教学空间正式启用,该空间占地341平方米,能同时容纳200人开展活动,是集网络教学、实境教学、三维

“普朗克”卫星绘出首幅宇宙辐射全景图

  在7月5日于意大利都灵市举行的一场新闻发布会上,欧洲空间局(ESA)公布了由去年发射的普朗克探测卫星拍摄的首幅宇宙微波辐射的全景图。它将有助于科学家了解宇宙大爆炸后各种天体的形成过程。天文学家根据它提供的数据,可以更好地了解宇宙的起源及其现在的运行方式。  欧航局当天发表公报说,

全景巡天望远镜发现首个风险小行星

  据物理学家组织网9月28日(北京时间)报道,世界第一台全景式巡天望远镜和快速反应系统(Pan-STARRS)中的PS1望远镜发现了一个小行星,今年10月中旬该小行星将到达距地球650万千米之内。小行星9月16日出现在望远镜搜寻景区内,直径约46米,当时距地球约3200万千米。这是P

中国天眼成果频出-附中国天眼全景图

12月19日拍摄的“中国天眼”全景(维护保养期间摄,无人机照片)。新华社记者 欧东衢 摄  20日上午,2021年度FAST运行和发展中心年终总结会在贵州省平塘县中国天眼(FAST)观测基地举行。  据了解,目前利用FAST望远镜观测产生的科学成果不断涌现。FAST已发现509颗脉冲星,是世界上所有

黑洞全景来了:中国学者领衔,全球联手

  上面这个“甜甜圈”很多人都熟悉。它是人类历史上拍到的第一个黑洞。该黑洞位于距离地球5500万光年外的M87星系中心,是目前宇宙中所知质量最大的黑洞之一,大约65亿倍太阳质量。2017年,事件视界望远镜(EHT)的射电望远镜,拍摄到了它的“特写”。  最近,由中国学者、中国科学院上海天文台研究员路

成都给13个科研机构授牌“重大产业技术平台”

  7月23日上午,成都市首批重大产业技术平台授牌暨高科技成都全景图开通启动仪式在成都高新区举行。承担重大产业的13家单位的科研机构被成都市科技局授牌为第一批“成都市重大产业技术平台”。  据了解,首批重大产业技术平台将享受平台专项资金等相应的激励政策扶持。其中,承担国家集成电路设计成都产

我国研发高分辨“脑地图”可视仪

  人脑中错综复杂的神经元网络,就如同地球上密布的道路网,如今人们借助遥感卫星分辨地球上的路网容易多了,但要绘制“脑地图”,似乎远比发射几颗遥感卫星困难许多。近日,华中科技大学的专家,正着手解决这一问题,他们开始研发高分辨全脑神经元网络的可视化仪器。   该校骆清铭教授领导的团队经过8年的攻关,在

广东绘就国内首部海洋经济地图

  5月4日,由广东省海洋局与渔业局牵头,会同广东省科学院广州地理研究所等编制完成的我国首部海洋经济地图——《广东海洋经济地图》(下称《地图》)在广州正式发布。     《地图》分海情篇、战略篇、发展篇和畅想篇四大篇章,以图说的方式解读了国务院去年批复的《广东海洋经济综合试验区发展规划》。    据

假毛虫揭示最危险地图

  与生活在更冷环境中相比,生活在热带或低海拔地区更危险。这是一个不走寻常路的新研究得出的结论。  生物学家已经知道,植物和动物的种类会随着与赤道距离的增加而减少。而且,他们怀疑,物种间的相互作用也有类似影响,但没有人在不同地区系统地进行过相关研究。  于是,研究人员制作了2900只假毛毛虫,40个

全球首张货船污染地图绘制完成

美国科学家近日发表于《科学进展》的一项研究,通过分析2003年到2020年的卫星数据,确定了燃料法规对货船污染的影响。 研究小组的数据显示,在国际海事组织的《船用燃料油》和《燃料法规》分别于2015年和2020年生效后,硫污染发生了重大变化。 此外,该研究丰富的数据还有助于回答污染物和

科普新著《走进地图世界》出版面市

日前,陈昱、廖克、施曼丽编著的地图科普新著《走进地图世界》,由陕西新华出版传媒集团陕西人民出版社正式出版发行。该著作以科普新视野角度,浏览既古典又现代的地图世界。

今日入伏!全国头伏中暑指数地图出炉

  6月以来,我国多地遭遇极端高温天气,不少人直呼“热度爆表堪比三伏”。这样的热度还在持续,今天(7月11日)我国正式入伏,这意味着一年中最热的时候到了。  今年三伏有多长?会比前期更热吗?哪里将开启“伏”汤蹈火模式?中国天气网特别推出全国头伏中暑指数地图,看哪里中暑最高发。同时帮你认清三伏天五大养

全球首张昆虫大脑“地图”绘制完成

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515799.shtm (图片来源:Eye of ScienceScience Photo Library)来自英国剑桥大学、美国约翰斯·霍普金斯大学等多家顶尖机构的研究人员,首次完整地对“果蝇幼虫

细绘氢地图-探秘银河系

   科学家们利用分别位于南北半球的两架大型全可动射电望远镜,耗时超过10年,绘制了更为详细的银河系中性氢地图,首次揭示了银河系恒星际气体的结构细节,有助于解释银河系形成的奥秘。  在地球以外,人们更熟识的是太阳系中的日、月、行星,也许你还能认出一些星座。但是,它们并非宇宙的“主体”。就宇宙的元素组

“盖亚”绘成详细银河系地图

  据英国《自然》杂志近日发表的一篇新闻特写,欧洲空间局(ESA)的“盖亚”(Gaia)探测器任务已绘制成超详细银河系地图,并发现银河系历史上一段此前不为人知的“动荡岁月”。  自2018年4月“盖亚”数据集公布以来,数百篇论文相继发表,它们所描绘的银河系远比科学家此前所设想的更复杂更富于变化。其中