计算机技术还能帮助揭示癌症恶化的分子机制！
近日，费城儿童医院（CHOP）领导的一项研究揭示了蛋白质可变剪切与促癌基因之间的联系。相关结果发表在《PNAS》杂志上。 文章作者，计算与基因组学中心主任Xing博士说：“我们的研究为癌症驱动基因与选择性剪接之间的关系提供了见解，这些发现可用于指导靶向可变剪接的癌症疗法的发展”。 选择性剪接是细胞内必不可少分子过程，它允许基因在将RNA转换成蛋白质之前根据其切割或剪接的位置不同编码不同的蛋白质产物。癌细胞通常利用这一过程来产生促进生长和存活的蛋白质，从而使其不受控制地复制和转移。这在包括前列腺癌在内的许多癌症中都会发生。然而，科学家们并不完全了解导致这种变化的过程。（图片来源：Www.pixabay.com） 为了更好地了解癌症进展过程中可变剪接变化的原因和后果，研究小组研究了将近900种前列腺组织样本中的RNA序列，其中包括健康的前列腺组织以及局部或侵袭性转移性肿瘤组织。为了有效地分析如此大的数据集，该团队创建了一个......阅读全文
环形RNA可变反向剪接和可变剪接表达图谱被系统绘制
6月30日，国际学术期刊Genome Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA研究的最新进展：Diverse alternative back-splicing and alternative spl
关于可变剪接的基本介绍
可变剪接(alternative splicing)是指在同一个mRNA前体内部数个外显子之间产生的差异性连接。这种剪接可以使同一个基因在不同的发育阶段、不同分化状态甚至不同生理状态下,得到多个相似但有差异的mRNA,进而被翻译为氨基酸序列相近似、性质和功能有差异的蛋白质。高度通用性的剪接位点G
调控玉米性状－可变剪接“火”起来
最近，中国农业大学国家玉米改良中心田丰教授团队与杨小红教授团队合作研究，以368份玉米自交系未成熟籽粒为实验材料，定位玉米种全基因组水平QTL(数量性状位点），全面解析了其可变剪接的调控机制，并为研究表型变异提供了重要线索。相关论文近日发表在《植物细胞》杂志上。 可变剪接，这个早在上世纪就
调控玉米性状－可变剪接“火”起来
可变剪接，这个早在上世纪就被提出的概念，在近几年的研究中，又“火”了起来。科学家们发现，可变剪接不仅丰富蛋白质组多样性，还在生物体内起着重要的调控作用。 可变剪接是什么？这项研究有了什么新发现？是怎样得出来的？实验中的难点是什么？对之后的研究有怎样的借鉴意义？科技日报就此采访了该研究团队。
杨力受邀发表MolecularCell综述解析可变剪接
中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组受邀在《分子细胞》（Molecular Cell）发表了题为RNA structure switches RBP binding 的专评文章，对该刊同期发表的一项题为RNA sequence context effects measured in
遗传发育所在大豆可变剪接研究中取得进展
作为一种重要的基因转录后调控机制，可变剪接在真核生物中普遍发生，在基因表达和功能多样性调控中起着重要的作用。不同物种、同一物种的不同组织以及不同基因家族的可变剪接在形式和比例上都存在差异，然而，决定这些差异的因素还尚不为人知。 中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜课题组通过对来自大豆不同
tRAS（转录组可变剪接调控深度分析）
本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程，对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化；根据对照和实验组，系统分析您样品中所蕴藏的可变剪接调控规律，中肯分析所揭示出的重要科学规律；让您快速“发现”所关注的生物学，医学和农业问题的答案。 我们
什么是蛋白质剪接？
蛋白质剪接是特定蛋白质的分子内反应，其中从前体蛋白质中去除内部蛋白质片段（称为内含肽），并在两侧连接C端和N端外部蛋白质（称为内含肽）。前体蛋白的剪接点主要是半胱氨酸或丝氨酸，它们是含有亲核侧链的氨基酸。现在已知的蛋白质剪接反应不需要外源性辅助因子或能源，如三磷酸腺苷(ATP)或三磷酸鸟苷(GTP)
蛋白质剪接的历史
xxx个内含肽是在1988年通过粗糙脉孢菌和胡萝卜液泡ATP酶（不含内含肽）与酵母中的同源基因（含内含肽）之间的序列比较而发现的，该基因最初被描述为推定的钙离子转运蛋白。1990年Hirata等人。证明酵母基因中的额外序列被转录成mRNA并仅在翻译后从宿主蛋白质中去除。从那时起，在生命的所有三个领域
新研究揭示可变剪接调控光形态建成的分子机制
太阳光不仅是植物光合作用的能量来源，也是一种重要的环境信号，调节植物的生长发育进程。其中幼苗光形态建成受光质、光量的精确调控，涉及不同的光受体和一系列信号调控因子。COP1是光形态建成的一个明星蛋白，它作为一种E3泛素连接酶，与目标蛋白互作并促进其降解，COP1在植物和动物中广泛存在。真核生物
tNAS（转录组新可变剪接位点的发现）
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GUT揭示癌症治疗靶点调控RNA可变剪接的分子机制
来自浙江大学基础医学院，中国药科大学等处的研究人员发表了题为“SRSF6-Regulated Alternative Splicing that Promotes Tumor Progression Offers a Therapy Target for Colorectal Cancer”的文
上海生科院揭示RNA可变剪接在细胞周期时序性的调控机制
3月25日，国际学术期刊Elife 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所王泽峰研究组的最新论文“An extensive program of periodic alternative splicing linked to cell cycle progression”。该工作
上海生科院科研人员研发了－premRNA可变剪接分析软件CASH
4 月 6 日，国际著名生物信息学期刊 Briefings in Bioinformatics 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）冯英组和浙江农林大学吴文武博士，上海列冰生物科技有限公司宗杰博士的最新研究进展“CASH： a constructing comprehensiv
蛋白质剪接在生物技术中的应用
内含肽在蛋白质剪接方面非常有效，因此它们在生物技术中发挥了重要作用。迄今已鉴定出200多个内含肽；大小范围为100–800AA。Inteins已被设计用于特定应用，例如蛋白质半合成和蛋白质片段的选择性标记，这对于大蛋白质的NMR研究非常有用。内含肽切除的药物抑制可能是药物开发的有用工具；如果内含肽不
异常剪接
中文名异常剪接定 义指对序列库中异常剪接mRNA的鉴定和分析隶属领域生物领域主要功能处理多顺反子性转录单元，调控转录效率和mRNA的稳定性，同时可以增加产物蛋白的多样性
自剪接
自剪接(self-splicing)出现在稀少的内含子组成核酸酶，核酸酶在只有RNA的情况下代替了剪接体的功能。自剪接的内含子有两种，称为I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接，但不需要任何蛋白质。这种相似性使人相信这些内含子与剪接体在演化过程上有着关连。自剪接亦可能是非常古老，且
RNA－剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子，连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
亿万年前蛋白质或可变身强效抗生素
英国《新科学家》周刊网站9月25日报道题：被复活的古老蛋白质是一种强效抗生素。 如果现代药物无法应对耐多药微生物的话，也许古老的动物可以。生物学家复活了一种哺乳动物抗菌化合物，这种化合物此前最后一次出现在地球上还是5900万年前，那时哺乳动物正从导致了恐龙灭绝的白垩纪-第三纪灭绝事件中恢复
剪接体
剪接体（英文：spliceosome）定义：由核小RNA(snRNA，U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白质因子(约100多种)动态组成、识别RNA前体的剪接位点并催化剪接反应的核糖核蛋白复合体。只与SMT蛋白理解与糖性一致。
剪接位点
中文名称剪接位点英文名称splicing site;splice site定 义剪接体可识别的RNA前体中内含子和外显子连接边界的序列和接头位点。根据位置不同可以分为供体和接纳体剪接位点。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
计算机技术还能帮助揭示癌症恶化的分子机制！
近日，费城儿童医院（CHOP）领导的一项研究揭示了蛋白质可变剪切与促癌基因之间的联系。相关结果发表在《PNAS》杂志上。 文章作者，计算与基因组学中心主任Xing博士说：“我们的研究为癌症驱动基因与选择性剪接之间的关系提供了见解，这些发现可用于指导靶向可变剪接的癌症疗法的发展”。 选择性剪接
简述第Ⅳ类内含子的剪接tRNA的剪接
酵母基因组共有约400个tRNA基因,含有内含子的基因仅占十分之一。内含子的长度从14到46个碱基对不等,它们之间并无保守序列,切除内含子的酶识别仅是共同的二级结构,而不是共同的序列。通常内含子插入到靠近反密码子处,与反密码子碱基配对,未成熟tRNA的反密码子环不存在,而是以插入的内含子所构成的
选择性剪接
中文名选择性剪接外文名alternative splicing别 名可变剪接作 用mRNA前体加工特 点表达水平的不同而导致不同的表型定义选择性剪接（也叫可变剪接）是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点组合）产生不同的mRNA剪接异构体的过程，使得最终的蛋白
浙江大学Nature子刊发表研究新成果
浙江大学生命科学学院的研究团队最近在Nature Communications杂志上发表了可变剪接研究的新成果，可以帮助人们进一步了解剪接异构体的惊人多样性。文章的通讯作者是浙江大学生命科学学院的金勇丰（Yongfeng Jin）教授。 可变剪接能从单个基因组位点产生数量惊人的异构体，果蝇Ds
关于RNA剪接第Ⅱ类内含子的自我剪接介绍
第Ⅱ类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列多为…外显子…↓GUGCG…内含子…嘧啶碱AU↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,在离3’剪接点上游6-12bp有一段比较保守的序列,一致序列为CUCAC,在这一保守序列A的两侧各有一段3~5核苷酸的短序列能与上游方向的核苷酸互补,而A总是不包含在这
致癌新机制：“选择性剪接”
由于正常细胞周期基本机制（如复制、DNA修复和细胞死亡）遭到破坏，在世界范围内，癌症已成为死亡的主要原因之一。 在基因组测序技术的帮助下，如今的生物医学研究人员已经可以鉴定不同肿瘤患者体内的常见遗传突变。 通常情况，人们认为只有DNA突变会导致癌症。9月21日《Cell Reports》杂志
细胞化学词汇可变臂
中文名称：可变臂英文名称：variable arm定 义：转移核糖核酸二级和三级结构中的特定区域，核苷酸残基数长短不一，仅由可变环(单链区)或由可变环与可变茎(双链区)构成。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇可变环
中文名称：可变环英文名称：variable loop定 义：特指转移核糖核酸二级和三级结构中的特定环区，不同转移核糖核酸可变环的核苷酸残基数长短不一。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
光纤可变衰减器
光纤可变衰减器FVA-UV光纤可变衰减器是一种光学机械装置，用于帮助控制两跟光纤之间的光通量，FVA-UV通过SMA 905连接件连接光纤，在UV-VIS至近红外波段一致性衰减所有波长的光。FVA-ADP-UV和FVA-ADP-VIS是用于直接连接到带有准直镜光源的接口上时的适配器。为什么需要信号衰