版纳植物园叶绿体比较基因组学研究取得进展

樟科油丹属树种木材质优,国际市场上的商品名为“medang”,和楠木树种的亲缘关系较近。以往的分子系统学研究表明油丹属为复系类群,但与润楠属、鳄梨属和楠属等的系统关系尚不明晰。 近日,中国科学院西双版纳热带植物园生物多样性研究组以分布于印度南部的油丹模式种Alseodaphne semecarpifolia Nees和分布于我国云南的极危种细梗油丹(A. gracilisKosterm)、黄连山油丹(A.huanglianshanensis H. W. Li & Y. M. Shui)为实验材料,通过二代测序技术完成了叶绿体基因组全覆盖测序。 通过比对发现,樟科油丹属植物的叶绿体基因组大小约为153kb,比近缘属润楠属、鳄梨属及楠属植物的叶绿体基因组大,比土楠属植物的叶绿体基因组小。差异主要源自连接单拷贝区和反向重复区的两个基因ycf1和ycf2。两基因的长度变化造就了反向重复区的缩减和扩张,直接影响叶绿体基因组......阅读全文

版纳植物园叶绿体比较基因组学研究取得进展

  樟科油丹属树种木材质优,国际市场上的商品名为“medang”,和楠木树种的亲缘关系较近。以往的分子系统学研究表明油丹属为复系类群,但与润楠属、鳄梨属和楠属等的系统关系尚不明晰。  近日,中国科学院西双版纳热带植物园生物多样性研究组以分布于印度南部的油丹模式种Alseodaphne semecar

昆明植物所山茶属代表植物比较叶绿体基因组学研究获进展

  山茶属是山茶科中包含许多举世闻名经济植物的一个重要类群,包括为人类提供天然保健饮料的茶(Camellia sinensis var. assamica 和C. sinensis var. sinensis),健康型高级食用植物油的油茶(C. oleifera)以及观赏花卉云南山茶(C. reti

蓝藻和叶绿体基因组的比较研究

原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。蓝藻基因组的作图和测

蓝藻和叶绿体基因组的比较研究

  原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。  蓝藻基因组的

蓝藻和叶绿体基因组的比较研究

  原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。  蓝藻基因组的

蓝藻和叶绿体基因组的比较研究

蓝藻和叶绿体基因组的比较研究原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模

蓝藻和叶绿体基因组的比较研究

原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。蓝藻基因组的作图和测

榕属叶绿体基因组比较研究获进展

  近年来,叶绿体基因组因基因组小、突变率和重组率低的特点,被广泛用于植物系统发育、分子进化、谱系地理学的研究。榕属(Ficus)作为桑科的最大属,且是热带雨林的关键物种,而其系统发育关系仍需进一步研究。榕属物种具有多样的生态型,体现了对不同生境的高度适应性。尽管近年来关于榕属叶绿体基因组的研究有所

Nature发布比较基因组学研究重要发现

   来自杜克大学医学院、Brigham妇女医院和哈佛医学院的研究人员,发现了一个机制可以解释:一些遗传突变在一种基因组中会致病,而在另一种基因组中则为良性的原因。  在发表于6月29日《自然》(Nature)杂志上的研究论文中,研究人员比较了成千上万的人类致病突变与大约100个动物物种的相似序列。

关于蓝藻和叶绿体基因组的比较研究介绍

  原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。  蓝藻基因组的

细胞化学基础蓝藻和叶绿体基因组的比较研究

原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。蓝藻基因组的作图和测

武汉植物园在裸子植物叶绿体基因组学研究方面获进展

  篦子三尖杉(Cephalotaxus oliveri)是我国特有珍稀濒危植物,属裸子植物三尖杉科(Cephalotaxaceae)三尖杉属(Cephalotaxus)。它在三尖杉属中的地位特殊,形态、解剖、胚胎发育、孢粉、核型及分子系统学的研究均支持将其独立成篦子三尖杉组。   松杉类植物

叶绿体亚分级实验——叶绿体亚分级

实验材料叶绿体试剂、试剂盒裂解缓冲液仪器、耗材微量离心管小型离心机实验步骤1. 将含 1 mg 叶绿素的叶绿体悬液吸至一微量离心管中。2. 在小型离心机中 14000 r/min 离心 30 秒钟,弃去上清。3. 加 1 ml 裂解缓冲液,振荡,冰浴 5 分钟。裂解缓冲液:10 mmol/L HEP

昆明植物所建立叶绿体基因组遗传信息获取技术体系

  在分子生物学和基因组时代,叶绿体基因组为植物分类、系统发育和物种鉴定等提供了不可或缺的遗传信息。随着新一代测序技术的快速发展,叶绿体基因组学已经成为植物系统基因组学和超级条形码研究的热点,也是中国科学院昆明植物研究所三个重大突破目标——iFlora 研究的重要内容。  昆明植物所种质资源库多年来

叶绿体基因组遗传信息获取技术体系建立

  记者日前从中科院昆明植物所获悉,该所种质资源库多年来致力于叶绿体基因组学研究,并建立了较为完善的叶绿体基因组遗传信息获取技术体系。该技术体系解决了叶绿体基因组获取方法需要大量新鲜材料以及一些物种因个体微小须通过二代测序方法获取叶绿体基因组的难题。  2012年以来,科研人员利用二代测序技术研究了

从豌豆组织分离叶绿体实验_叶绿体分离

实验材料叶子组织试剂、试剂盒PBF-Percoll 溶液山梨醇BSAHEPES-KOHEDTA仪器、耗材聚碳酸酯离心管实验步骤1. 制备 Percoll 梯度(1) 两个 50 ml 的聚碳酸酯离心管中分别加入 25 ml 50% 的 PBF-Percoll 溶液。50% PBF-Percoll0.

比较分子生理基因组学-—cDNA阵列的异种杂交实验

近几年来, DNA 微阵列已经被公认是分子生物学研究的一种标准方法。特别是在生物医学研究方面,常用物种的微阵列一面世就得到广泛应用。但是对于非模式生物来说 ,微阵列的应用尚未得到充分开展,而这些物种往往表现出一些很有趣的生理表型。对大多数比较生物学的研究者来说,制备一个新物种的 D N A 阵列或微

比较分子生理基因组学-—cDNA阵列的异种杂交实验

实验步骤 一、材料 这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级,或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品,包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌,在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clo

二代测序技术助龙胆族叶绿体基因组进化和系统学获进展

  随着二代测序技术的发展,植物叶绿体基因组序列已普遍应用于重建植物“生命之树”研究中。大多数植物叶绿体基因组呈环状四分体结构,包含约80个蛋白编码基因。叶绿体基因组由于缺乏重组,而常被认为是连锁的单一基因座;然而,越来越多的研究表明,叶绿体基因组中不同区域以及不同编码基因具有不同的核酸替代速率,经

科学家开发比较基因组学进化分析新方法

  比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据,解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一,如PAML等方法,都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展,众多物种的基因组

比较分子生理基因组学-—cDNA阵列的异种杂交实验(一)

实验步骤 一、材料这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级,或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品,包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌,在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clontech购得。人 19K cDNA 阵列从Ontario 癌症研究所购得

科学家开发比较基因组学进化分析新方法

  比较基因组学是从进化角度分析不同物种的基因组数据,解析基因功能和疾病、表型的遗传学机制。通过同源基因编码区序列的进化比较是其中最常见的分析方法之一,如PAML等方法,都在物种序列比较分析中被广泛应用。但这些方法仅分析多个物种的单一序列和分歧位点信息。随着二代、三代测序技术的发展,众多物种的基因组

比较分子生理基因组学-—cDNA阵列的异种杂交实验(二)

二、方法在开始任何微阵列实验之前,必须要选定合适的对照和时间点,这样获得的数据才有生物学意义。关于如何选择合适的对照,参见注释 1 和 2。1 总 R N A 的提取2 R N A 变性凝胶电泳(1)制备一块 1 % 的琼脂糖甲醛变性胶,浸没在 IXM OPS 缓冲液中,胶上的孔应被溶液完全没过。将

叶绿体是什么

叶绿体是质体的一种, 是高等植物和一些藻类所特有的能量转换器。叶绿体是含有绿色色素(主要为叶绿素 a 、b)的质体,为绿色植物进行光合作用的场所,存在于高等植物叶肉、幼茎的一些细胞内,藻类细胞中也含有。叶绿体的形状、数目和大小随不同植物和不同细胞而异。

叶绿体DNA分离

设备:Hitachi CS-150GXL或CS-120GXL微量超速离心机,S100AT6 转头,5PA 密封管(如果用4PC管,可接比例减少各层液量)溶液配制:A液:0.35Msorbitol(山梨醇),50mM Tris—Hcl (PH8.0) 25mM EDTA—Na2B液:5%(w/w)So

叶绿体(chloroplast)分离

设备:Hitachi CF—7D2离心机,T5SS或T4SS或T7A转头50ml PP 离心管CP—MX ,CP—WX超速离心机,R28S转头,40ml PA管。(或其他品牌离心机,同类转头)溶液配置:A液:0.35M Sorbitol,(山梨醇),50mM Tris—HCL (PH8.0) 5mM

什么是叶绿体

叶绿体叶绿体(chloroplast)植物绿色细胞中存在的有色质体。其内含有叶绿素及类胡萝卜素,是进行光合作用的场所。在高等植物中一般呈椭圆形,长轴4~10微米,短轴2~4微米。它被双层膜(称为外被)包围着,内部为层膜系统和基质(或称间质)所组成。在电镜下观察,每一层膜是由双层膜组成扁平的囊,中间是

利用大规模比较基因组学绘制A群链球菌候选疫苗图谱

  近日,澳大利亚昆士兰大学等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“Atlas of group Astreptococcalvaccine candidates compiled using large-scale comparative genomics”的文章,利用大规模比较

叶绿体亚分级实验

叶绿体亚分级 实验材料 叶绿体                                                           试剂、试剂盒 裂解缓冲液                                              

叶绿体亚分级实验

            实验材料 叶绿体 试剂、试剂盒 裂解缓冲液