基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破
深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据，首次对苔类目级系统框架进行了重建，得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员，通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员，深圳华大生命科学研究院联合培养研究生余进博士，美国康涅狄克大学Bernard Goffinet教授共同完成该项工作。苔类（liverworts）是植物界的一个门，属于苔藓植物三个主要分支（苔、藓、角苔）之一，其起源历史可追溯至4亿年前。作为一个古老的植物类群，苔类植物多样性却非常丰富，目前全世界有苔类7300余种，隶属15目，87科，300余属，其深层次系统演化关系尚有很大争议。近年来，随着高通量测序技术的发展，植物系统发育基因组学获得了快速的发展，转录组（transcriptome）数据被广泛应用于植物系统发育基因组学中。转录组是某一特定状态下基因组的所有转录本，数......阅读全文
基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破
深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据，首次对苔类目级系统框架进行了重建，得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员，通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员，深圳华大生命科学研究院联合培养研究
多个秋海棠属植物基因组被破译
秋海棠属植物叶型与叶斑的多样性 仙湖植物园供图近日，由深圳市仙湖植物园与深圳华大生命科学研究院牵头完成的秋海棠属植物基因组研究成果在植物学领域国际权威刊物《新植物学家》（New Phytologist）正式发表。最新发布的研究成果中，研究团队完成了桑寄生状秋海棠、铁十字秋海棠、黑武士秋海棠、和
仙湖植物园第七届学术交流活动举行
参会领导嘉宾合影。主办方 供图 近日，深圳市南亚热带植物多样性重点实验室暨深圳市中科院仙湖植物园第七届(2021年)学术交流活动在深圳举行。该活动就生态文明建设和可持续发展背景下植物园的功能和建设，特有物种保护和特色植物的基因组研究等方向进行了深入交流。 开幕式上，仙湖植物园主任杨义标、
现存最原始种子植物苏铁基因组发布
近日，科学家完成苏铁基因组解析工作，发布苏铁完整基因组图谱，这意味着种子植物基因组演化研究中的最后一块拼图已顺利完成。4月18日，《自然-植物》（Nature Plants）以封面文章发表该研究成果。据悉，该研究成果数据公开共享，全球科学家可免费下载使用。苏铁是地球上现存最古老的种子植物，是著名的“
中国植物园联盟举办植物园园林园艺论坛
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454943.shtm 深圳市中国科学院仙湖植物园主任杨义标致辞 论坛现场 参会领导嘉宾合影。主办方供图 3月23日，由中国植物园联盟主办，中国科学院核心植物园和深圳市中国
海峡两岸植保机构在深圳共建植物保种基地
深圳市中科院仙湖植物园(简称“仙湖植物园”)与台湾辜严倬云植物保种中心联合保种基地，7月26日在仙湖植物园揭牌。该基地专为热带、亚热带植物保育所用，将作为双方后续植物保育行动的基础平台。 辜严倬云植物保种中心是世界上最大的热带、亚热带植物保种中心，当前以超过31000种的收藏规模冠绝全球，被誉
买麻藤类植物全基因组破译
近日，由深圳市中国科学院仙湖植物园，中科院中-非联合研究中心、武汉植物园、植物研究所，英国皇家植物园邱园等10余家国内外知名院所联合开展的“裸子植物——买麻藤全基因组计划”取得重要进展。 裸子植物和被子植物的起源、分歧及演化，是现代植物学科的基础热点领域。现存35万余种种子植物被分成苏铁类、松
百年盛会落鹏城－仙湖借势展宏图
7月29日，被誉为植物科学界“奥林匹克”的第19届国际植物学大会在深圳闭幕。百年大会首次来到中国就“花落深圳”，并非偶然。除了看重深圳的城市建设、会展设施、植被资源、物种保护与利用等因素外，深圳市中科院仙湖植物园的发展也功不可没。从2008年倡议申办大会到2011年获得举办权，至今，仙湖植物园始
我国学者攻破高质量角苔参考基因组
苔藓类包括苔、藓和角苔三大分支，是现存最早的陆生植物，代表了植物演化过程中从水生到陆生的过渡类群。长久以来关于早期陆地植物的起源与植物登陆一直存在诸多争论和未解之谜。近年来，人们利用组学数据将早期陆地植物的系统位置争论聚焦到了角苔类上。角苔类以其难解的系统位置、衍生与原始兼具的形态特征、与细菌和
2023年中国植物园学术年会在深圳召开
近日，由中国植物学会、中国野生植物保护协会等单位共同主办的2023年中国植物园学术年会在深圳市中国科学院仙湖植物园举行。会议期间还举办了“多肉植物科普展”和“‘蕨’处逢生——蕨类植物展”科普展览。 本次年会以“保护中国的植物多样性”为主题，旨在进一步促进中国植物园的高质量发展，加强植物园的管理
植物界“大熊猫”为何悄然“消失”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519848.shtm前不久，香港嘉道理农场暨植物园植物保育部高级生态学主任张金龙博士在查看最新版《广东省高等植物多样性编目和分布数据集》时，惊讶地发现有植物界“大熊猫”之称的仙湖苏铁（Cycas fair
研究发现栽培5年的牛大力药效和经济价值最高
近日，中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所南药与健康研究中心团队联合深圳市仙湖植物园在牛大力不同栽培年限次生代谢产物动态变化规律与品质评价方面取得重要进展，为牛大力的真伪鉴别、品质评价、标准制定、创新产品研发奠定了科学基础，为牛大力产业的发展提供了技术支撑。牛大力为著名的药食同源植物，具有地方传
第五届亚洲蕨类植物学大会在深圳召开
11月15日至17日在深圳召开了第五届亚洲蕨类植物学大会。这次会议由中国花卉协会蕨类植物分会、系统与进化植物学国家重点实验室(中科院植物研究所)和深圳仙湖植物园共同组织。来自亚洲、欧洲、北美和非洲15个国家的150余位专家参加了此次会议。 15日上午，中国花卉协会蕨类植物分会会
张力荣获里克勒夫·葛洛勒苔藓多样性研究卓越奖
7月9日，在加拿大举行的2021国际苔藓学会大会上，国际苔藓学会主席、美国康涅狄格大学教授伯纳德·葛菲尼宣布：深圳市城市管理和综合执法局仙湖植物园研究员张力获颁“里克勒夫·葛洛勒苔藓多样性研究卓越奖”。据悉，到目前为止，全世界仅有7位获奖者，张力是第二位获此殊荣的中国苔藓学家。张力研究员在野外考
苔藓物种多样性研究的最新进展是什么？
以下是苔藓物种多样性研究的一些最新进展：新物种的发现与记录：在上海，去年启动首次全面的生物多样性本底调查，近期在桃浦中央绿地内发现真藓科真藓属的红蒴真藓，为上海首次记录。华东师范大学科研团队今年 5 月在普陀区的 4 个位点开展苔藓植物调查和标本采集，共发现苔藓植物 15 科、22 属、29 种 3
大数据解码“植物王国”
植物对环境变化非常敏感，植物大数据研究与运用具有重要意义。我国的植物大数据研究成果已经应用于三峡水淹区多样性调查、濒危物种评估、保护区的有效性评估、入侵种预测、国家重点野生植物分布、中医药植物分析等多个领域，支撑着包括国家自然科学基金、国家科技基础条件平台项目、国家环保公益性行业科研专项等多个项
类转录化学药物诱导型基因组编辑和转录激活系统
生物学变化多受到高度动态的分子事件调控，为了更精确的理解并研究这些过程，应用条件性可诱导的技术手段是十分必要的。此前，得到广泛应用的药物诱导技术之一是通过配体结合激发雌激素受体蛋白（ER）从细胞质到细胞核的转运。在没有激素配体的情况下，ER与热激蛋白（hsp90）结合定位于细胞质中；一旦与配体结
百岁兰基因组和适应性进化机制研究新进展
百岁兰（Welwitschia mirabilis）又名千岁兰，是买麻藤类单种科百岁兰科孑遗植物，系裸子植物中唯一的草状木本，是罕见的植物。化石记录百岁兰曾广泛分布在巴西、葡萄牙等地。随着大陆板块分裂，气候骤变，自然居群幸存于如今的安哥拉与纳米比亚沙漠。百岁兰是《濒危野生动植物种国际贸易公约》（
植物园在淫羊藿类黄酮合成途径的转录调控研究
淫羊藿，作为我国传统中草药之一，已有两千多年的历史，始载于《神农本草经》，具有补肾壮阳、强筋健骨、祛风除湿的功效。研究表明淫羊藿药用植物中的主要活性成分是类黄酮化合物，特别是C8-异戊烯黄酮醇苷类化合物，例如淫羊藿苷、淫羊藿素、朝藿定C等。另外，淫羊藿属植物因其具有奇特的花型、丰富多彩的花色及叶
武汉植物园在莲NAC转录因子研究中获进展
NAC转录因子是植物特有的一类转录因子，广泛存在于植物界，并参与调节植物的各种生物学过程，例如器官发生、组织发育以及胁迫应答响应等。然而，莲中NAC转录因子家族尚未报道。 近日，Frontiers in genetics发表了中国科学院武汉植物园莲种质资源与遗传育种学科组撰写的题为Genome
全基因组及转录组测序案例分析
案例：应用全基因组测序和 RNA 测序来描绘常见的变异型免疫缺陷综合症（CVIDs）的基因图谱 背景：常见的变异型免疫缺陷综合症（CVIDs）是机体免疫应答反应中不能产生抗体的最主要原因。CVIDs 变异度很高，大概 5% 的病人是由基因改变引起的。 目的：利用 Illumina HiSeq25
《肯尼亚植物志》国内首发
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503075.shtm6月15日，由长江出版传媒和中国科学院武汉植物园主办的《肯尼亚植物志》新书国内首发暨中肯合作出版研讨会在北京召开。来自中国科学院国际合作局、武汉植物园、国家植物园、昆明植物研究所和深圳
铁树“开花”：苏铁喜获完整基因组图谱
苏铁基因组图谱研究由来自22个科研机构的65位科学家联合完成。 苏铁目系统发育树支持现存苏铁是在经历大量灭绝以后，几次辐射演化的后代。如今苏铁有2科10属。（刘阳供图） 也许你不熟悉苏铁类植物，但你一定听说过“铁树开花”这个成语，比喻事情很难实现。相传因受苏东坡青睐，铁树得名“苏铁”。作为现存最
RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止？
近日，南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化（polyadenylation）的转录本在
Nature－Genetics：基因组其实是这样转录的
在人类基因组中大约储存着两万个基因和数千个调控元件。基因编码蛋白质合成的信息，其他基因组元件负责调节基因活性和执行其他功能。所有这些DNA编码信息都需要被复杂的分子机器读取，并转换为细胞能使用的信息。 人们一般认为，读取基因就和读一个语句差不多。读取机器被多种序列引导到基因的起始位置，然后从左
武汉植物园等长链非编码RNA调控基因转录研究获进展
长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)一般指长度大于200个核苷酸的非编码RNA，目前已在多种生物中发现了大量lncRNA，然而只有少数lncRNA的精细作用机理被阐明。 中国科学院武汉植物园汪志伟博士在植物种群遗传学科组王艇研究员支持和中国科学院留学
版纳植物园转录调控因子Alfinlike基因家族研究获进展
通过比较基因组学，在基因组层次上研究特定基因家族的进化，进而揭示其变化的原因和机制，已成为目前进化生物学关注的热点问题。中科院西双版纳热带植物园生态进化生物学研究组研究人员利用模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)及其近缘物种琴叶拟南芥(A. lyrata)和小盐芥(Th
华南植物园关于植物转录起始调控机制的研究获进展
转录复合体将DNA转录为RNA，是遗传信息由细胞核向细胞质转递的基础。由于核小体与基因组的紧密结合，转录复合体需克服核小体障碍进而确保功能基因的表达。染色质重塑复合体（Chromatin Remodeler）被认为在转录过程中发挥了重要作用。这类蛋白复合体能通过水解ATP来调控核小体的组成和分布
版纳植物园拟南芥WRKY57转录因子研究获进展
植物叶片衰老受到多种发育因子和环境因子所调控。外源植物激素茉莉酸(JA)处理可以诱导叶片细胞迅速进入衰老程序，而生长素(Auxin)却可以有效地抑制该过程发生。众所周知，植物激素JA和auixn介导的信号途径之间存在着交叉调控通路，并在植物发育和抵抗病原菌侵染等生理过程中发挥着重要调控功能。但是
植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器，对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队，历时五年，通过对三种高等植物（水稻、玉米和拟南芥