科学家阐明三种经典模式动物的“肠道密码”
噬菌体占肠道病毒的90%以上,作为肠道菌群的关键调控因子,与炎症性肠病、结直肠癌、糖尿病等疾病密切相关。尽管小鼠、猪和食蟹猴被广泛用作肠道研究模型,其噬菌体多样性仍缺乏系统认知,跨物种比较及与人类噬菌体的关联机制研究近乎空白。6月20日,中国科学院深圳先进技术研究院定量合成生物学全国重点实验室、合成生物学研究所合成微生物组学研究中心马迎飞团队在国际学术期刊《微生物组》发表最新研究成果,研究团队首次系统揭示了小鼠、猪、食蟹猴三种模式动物肠道噬菌体的组成特征与分布规律。深圳先进院合成所研究员马迎飞为文章通讯作者,助理研究员于梦浩为文章第一作者。深圳先进院为该研究第一单位。模式动物肠道噬菌体的比较及其与人类肠道微生物的关联。研究人员供图团队利用生物信息学方法,对约1500个小鼠、猪和食蟹猴肠道宏基因组进行高效标准化分析,成功构建了三种模式动物的高质量数据库,其中包括977条小鼠、12896条猪以及1480条食蟹猴种水平、完整度超过90......阅读全文
用人血清进行噬菌体ElISA
用人血清进行噬菌体ElISA [器材和试剂] ● 包被缓冲液 ● T ● T[,1%TritonX—100,3% A(Sigma)] ● 兔抗人Fc—特异性IgG(Pierce):用包 被缓冲液稀释为5.0ug/ml① ● HRP标记的抗噬
噬菌体文库的扩增实验
基本方案 实验材料 噬菌体 试剂、试剂盒
噬菌体展示技术的定义
噬菌体展示技术是一种将外源肽或蛋白基因与噬菌体特定蛋白基因在其表面进行融合表达的新技术。该技术实现了表型与基因型的统一。随着噬菌体展示技术的进一步发展,其优越性被越来越多的实验室所认识,使得该技术的使用范围不断扩展,也使该技术得以不断的完善和发展。
温和噬菌体的治愈现象
溶原状态通常十分稳定,能经历许多代。但在某些条件如紫外线、X线、致癌剂、突变剂等作用下,可中断溶原状态而进入溶菌性周期,这称为前噬菌体的诱导与切离(excision),发生率为10-2-10-5。极少数溶源性细菌中的前噬菌体离开细菌基因组后,不进入溶菌性周期,这个现象被形象地称之为“治愈”。
噬菌体克隆的纯化实验
噬菌体是感染细菌、真菌、放线菌或螺旋体等微生物的细菌病毒的总称,作为病毒的一种,噬菌体具有病毒特有的一些特性:个体微小;不具有完整细胞结构;只含有单一核酸。噬菌体基因组含有许多个基因,但所有已知的噬菌体都是在细菌细胞中利用细菌的核糖体、蛋白质合成时所需的各种因子、各种氨基酸和能量产生系统来实现其自身
噬菌体侵染实验的原理
原理:T2噬菌体侵染细菌后,在自身遗传物质的控制下,利用细菌体内的物质合成T2噬菌体自身的组成成分,从而进行大量繁殖。
关于细菌噬菌体的简介
噬菌体(bacteriophage, phage)是感染细菌、真菌、藻类 、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称,因部分能引起宿主菌的裂解,故称为噬菌体。二十世纪初在葡萄球菌和志贺菌中首先发现 [3] 。作为病毒的一种,噬菌体具有病毒的一些特性:个体微小;不具有完整细胞结构;只含有单一核酸。可视为
温和噬菌体的形态介绍
个体微小,结构简单,只含有一种核酸DNA或RNA,只能在活的细胞内以复制方式进行增殖。
简述细菌噬菌体的应用
作为分子生物学研究的试验工具 噬菌体是遗传调控、复制、转录与翻译等方面的生物学基础研究和基因工程中的重要材料或工具。遗传学中的转导作用就是以噬菌体作为媒介,在2株细菌间传递遗传物质。 用于细菌的鉴定和分型 噬菌体只能侵染相应的细菌,具有高度的特异性,可用于细菌鉴定。同时,噬菌体具有型的特异
什么是噬菌体肽文库?
中文名称噬菌体肽文库英文名称phage peptide library定 义将编码多肽的外源基因插入含噬菌体外壳蛋白基因的载体,构建得到能与外壳蛋白融合表达多肽的基因文库。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)
温和噬菌体的感染过程
这类噬菌体感染它的宿主细菌后,可把它的DNA整合到细菌染色体中,随着细菌染色体的复制而同时复制。这时不能用任何方法在细菌体内检出噬菌体颗粒的存在,细菌继续生存并进行分裂繁殖。这种携带噬菌体DNA的细菌叫溶原性细菌。在一般外界条件下,溶原性细菌只有极少数发生裂解性反应。但若环境改变,如在紫外线下,激发
噬菌体的分离和鉴定
部分菌株对应的噬菌体分离过程步骤:1、噬菌体分离(1) 以新鲜鸽粪4g 加入100ml 普通液体培养基内,放入37 ℃温箱培养24h。(2) 次日从中取出10ml70 ℃加热30min ,离心2000r/ 10min ,上清液用滤器过滤后保存于4 ℃冰箱备用。(3) 在普通琼脂平板底面分别注明1
细菌噬菌体细菌防御方法
细菌防御噬菌体的主要方法是合成能够降解外来DNA的酶。这些酶被称为限制性内切酶,它们能够剪切噬菌体注入细菌细胞的病毒DNA。细菌还含有另一个防御系统,这一系统利用CRISPR序列来保留其过去曾经遇到过的病毒的基因组片段,从而使得它们能够通过RNA干扰的方式来阻断病毒的复制。这种遗传系统为细菌提供
噬菌体文库的扩增实验
文库一旦包装就应该尽快进行扩增,它可以大大增加文库的拷贝数,但在扩增时由于克隆的生长速率不同,文库的组成可能会出现某种潜在的改变。这种文库克隆组成比率的变化可以通过把文库克隆预吸附到细菌上并使用一种高密度铺平板和短期培养的方法而尽量减少。文库一旦包装就应该尽快进行扩增,它可以大大增加文库的拷贝数,但
噬菌体侵染细菌实验步骤
有四个步骤,分别是:1、培养用p32和s35 标记的大肠杆菌,再用此大肠杆菌培养噬菌体。p32用于标记噬菌体蛋白质,s35 用于标记噬菌体DNA。2、用培养后的p32和s35噬菌体侵染未被标记的的大肠杆菌。3、培养物离心,分离。4 、分别对上清液和沉淀物的放射性进行检测。上清液中有S35,而沉淀中几
噬菌体的形态与结构
噬菌体不能在光学显微镜下观察到,因此,对噬菌体形态、结构的认识,得从电子显微镜开始,这一点与细菌素是相同的。噬菌体个体叫做病毒粒子,它的形状有3种,包括蝌蚪形、微球形和纤丝形。目前已知大部分噬菌体是属于蝌蚪形,它由头和尾两部分组成。噬菌体尾部的结构比较复杂,是感染、吸附、侵入宿主细胞的器官。蛭弧菌、
简述细菌噬菌体繁殖特点
1.毒性噬菌体 指在宿主菌体内复制增殖,产生许多子代噬菌体,并最终裂解细菌。毒性噬菌体的增殖方式是复制,其增殖过程经历吸附穿入、生物合成和成熟释放3个阶段。 进入菌细胞内的噬菌体核酸首先经早期转录产生早期蛋白质,并复制子代核酸,再进行晚期转录产生噬菌体的结构蛋白。子代噬菌体达到一定数量时,由
常见的温和噬菌体介绍
温和噬菌体的种类很多,常见的有大肠杆菌(E.coli)的λ、Mu-I、P1和P2噬菌体等。
l噬菌体载体的类型
插入型 (Insertion vectors )这种载体仅仅有一个可供外源DNA插入的克隆位点。如:λgt10 、 λgt11克隆能力小,不到10kb置换型 (Replacement vectors)这种载体具有两个对应的酶切克隆位点,在两个位点之间的λDNA区段是λ噬菌体的非必需序列,可以被外源插
温和噬菌体的存在状态
温和噬菌体可有三种存在状态:①游离的具感染性的病毒粒子。②原噬菌体:当温和噬菌体侵入其宿主细胞后,前者的核酸附着或整合在细菌染色体上,并与之一道复制,这种处于整合态的噬菌体,称为前噬菌体( Prophage)。 ③营养噬菌体:在宿主细胞内指导特定的病毒核酸和蛋白质合成。
Nature捕捉噬菌体感染特写
科学家们发现了,某种类型的病毒在感染过程中会暂时形成一种管状结构传递它的DNA,而在完成任务后则会将这一管状结构溶解。这项研究工作发表在12月15日的《自然》(Nature)杂志上。 在新文章中,研究人员揭示了phiX174病毒攻击大肠杆菌的机制。由于phiX174病毒能够感染细菌,它实质
噬菌体肽文库的定义
中文名称噬菌体肽文库英文名称phage peptide library定 义将编码多肽的外源基因插入含噬菌体外壳蛋白基因的载体,构建得到能与外壳蛋白融合表达多肽的基因文库。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)
噬菌体侵染细菌实验步骤
有四个步骤,分别是:1、培养用p32和s35 标记的大肠杆菌,再用此大肠杆菌培养噬菌体。p32用于标记噬菌体蛋白质,s35 用于标记噬菌体DNA。2、用培养后的p32和s35噬菌体侵染未被标记的的大肠杆菌。3、培养物离心,分离。4 、分别对上清液和沉淀物的放射性进行检测。上清液中有S35,而沉淀中几
gⅥcDNA融合噬菌体ELISA
gⅥ-cDNA融合噬菌体ELISA [器材和试剂] 通用设备及试剂以及以下的设备和试剂: ● 链霉素包被的微量浓度测定板(Pierce) ● T和 2mol/L ● 生物素抗原选择出的(BAS)噬菌体和(或)免疫亲和选择出的(1AS)噬菌体
噬菌体侵染细菌实验步骤
有四个步骤,分别是:1、培养用p32和s35 标记的大肠杆菌,再用此大肠杆菌培养噬菌体。p32用于标记噬菌体蛋白质,s35 用于标记噬菌体DNA。2、用培养后的p32和s35噬菌体侵染未被标记的的大肠杆菌。3、培养物离心,分离。4 、分别对上清液和沉淀物的放射性进行检测。上清液中有S35,而沉淀中几
检测噬菌体存在的方法
1、将细菌培养液涂平板,如果有噬菌斑说明有噬菌体。如果提取噬菌体的核酸物质,应该大量培养噬菌体,然后离心去除细菌碎片,转移上清后用氯仿-乙醇法即可。2、有的噬菌体可能是溶源性的,已经整合到细菌染色体上了,可以试试不同的条件把它诱导出来,像是UV照射,高温之类的。3、如果噬菌体的背景清楚的话,可以设计
噬菌体侵染细菌实验步骤
大致分为四步。1、培养用p32和s35 标记的大肠杆菌,再用此大肠杆菌培养噬菌体。p32用于标记噬菌体蛋白质,s35 用于标记噬菌体DNA。2、用培养后的p32和s35噬菌体侵染未被标记的的大肠杆菌。3、培养物离心,分离。4 、分别对上清液和沉淀物的放射性进行检测。上清液中有S35,而沉淀中几乎没有
噬菌体侵染细菌的实验
噬菌体是寄生在细菌细胞中的病毒.一个典型的噬菌体的生活周期,可以分为3个阶段感染阶段,增殖阶段和成熟阶段.有关的主要内容在课本上已经介绍过了,这里再稍加详述如下.感染阶段 噬菌体侵染寄主细胞的第一步是"吸附",即噬菌体的尾部附着在细菌的细胞壁上,然后进行"侵入.先通过溶菌酶的作用在细菌的细胞壁上
噬菌体侵染细菌实验步骤
有四个步骤,分别是:1、培养用p32和s35 标记的大肠杆菌,再用此大肠杆菌培养噬菌体。p32用于标记噬菌体蛋白质,s35 用于标记噬菌体DNA。2、用培养后的p32和s35噬菌体侵染未被标记的的大肠杆菌。3、培养物离心,分离。4 、分别对上清液和沉淀物的放射性进行检测。上清液中有S35,而沉淀中几
噬菌体文库的扩增实验
实验材料 噬菌体试剂、试剂盒 MgSO4麦芽糖琼脂糖氯仿DMSOSM仪器、耗材 离心机分光光度计水浴锅实验步骤 1. 制备铺平板菌(1)2.5 ml 新鲜过夜培养的宿主菌液接种于250 ml 含0.2%麦芽糖和10 mmol/l MgSO4的LB培养液中。(2)在37℃恒温摇床剧烈摇荡2~4 h,