科学家阐明三种经典模式动物的“肠道密码”
噬菌体占肠道病毒的90%以上,作为肠道菌群的关键调控因子,与炎症性肠病、结直肠癌、糖尿病等疾病密切相关。尽管小鼠、猪和食蟹猴被广泛用作肠道研究模型,其噬菌体多样性仍缺乏系统认知,跨物种比较及与人类噬菌体的关联机制研究近乎空白。6月20日,中国科学院深圳先进技术研究院定量合成生物学全国重点实验室、合成生物学研究所合成微生物组学研究中心马迎飞团队在国际学术期刊《微生物组》发表最新研究成果,研究团队首次系统揭示了小鼠、猪、食蟹猴三种模式动物肠道噬菌体的组成特征与分布规律。深圳先进院合成所研究员马迎飞为文章通讯作者,助理研究员于梦浩为文章第一作者。深圳先进院为该研究第一单位。模式动物肠道噬菌体的比较及其与人类肠道微生物的关联。研究人员供图团队利用生物信息学方法,对约1500个小鼠、猪和食蟹猴肠道宏基因组进行高效标准化分析,成功构建了三种模式动物的高质量数据库,其中包括977条小鼠、12896条猪以及1480条食蟹猴种水平、完整度超过90......阅读全文
什么是DNA噬菌体?
中文名称DNA噬菌体英文名称DNA phage定 义能感染细菌并在细菌内复制自身的DNA病毒。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
λ噬菌体DNA提取方法
成功走出第一步:DNA提取 λ噬菌体是最早使用的克隆载体 ,λ噬菌体的基因组是一长度约为50kb的双链DNA分子,它在宿主细胞有两种生活途径,其一是裂解生长,环状DNA分子在细胞内多次复制,合成大量噬菌体基因产物,装配成噬菌体颗粒,裂解宿主菌再进行下一次感染;其二是溶源性生长,即感染细胞
噬菌体的繁殖特点
1.毒性噬菌体指在宿主菌体内复制增殖,产生许多子代噬菌体,并最终裂解细菌。毒性噬菌体的增殖方式是复制,其增殖过程经历吸附穿入、生物合成和成熟释放3个阶段。进入菌细胞内的噬菌体核酸首先经早期转录产生早期蛋白质,并复制子代核酸,再进行晚期转录产生噬菌体的结构蛋白。子代噬菌体达到一定数量时,由于噬菌体合成
噬菌体颗粒的分类
噬菌体颗粒在结构上有很大差别,一般可分成三种类型,即无尾部结构的二十面体,有尾部结构的二十面体和线状体,迄今已知的噬菌体大多数是有尾部结构的二十面体。噬菌体有毒(烈)性噬菌体和温和噬菌体两种类型。侵入宿主细胞后,随即引起宿主细胞裂解的噬菌体称作毒性噬菌体。毒性噬菌体被看作正常表现的噬菌体。温和噬菌体
噬菌体的相关介绍
噬菌体(phage)是侵袭细菌的病毒,也是赋予宿主菌生物学性状的遗传物质。噬菌体必须在活菌内寄生,有严格的宿主特异性,其取决于噬菌体吸附器官和受体菌表面受体的分子结构和互补性。噬菌体是病毒中最为普遍和分布最广的群体。通常在一些充满细菌群落的地方,如:泥土、动物的肠道里,都可以找到噬菌体。 噬菌
噬菌体的临床应用
(1)细菌的鉴定与分型噬菌体的作用具有高度特异性。一种噬菌体只能裂解一种或与该种相近的细菌,故可用于细菌的鉴定和分型。目前已利用噬菌体将金黄色葡萄球菌分为四个群数百个型,这种用噬菌体分型的方法,在流行病学调查上,对追查和分析这些细菌性感染的传染源很有帮助。(2)检测标本中的细菌应用噬菌体效价增长试验
噬菌体侵染细菌实验
原理:噬菌体T2有一个蛋白质的外壳,DNA裹在其中。当噬菌体T2感染大肠杆菌时,它的尾部吸附在菌体上。然后,菌体内形成大量噬菌体,菌体裂解后,释放出几十个乃至几百个与原来感染细菌一样的噬菌体T2。材料:大肠杆菌,LB培养基,恒温箱,T2噬菌体过程:第一阶段(感染阶段 ) 噬菌体侵染寄主细胞的第一步是
M13噬菌体
· M13 Phage (Michael Blaber)Very useful background information about M13: its infection, replication, packing, cloning. If you are new to phag
噬菌体的侵染过程
一个典型的噬菌体的侵染细菌的过程,可以分为三个阶段:感染阶段、增殖阶段和成熟阶段。感染阶段:噬菌体侵染寄主细胞的第一步是“吸附”,即噬菌体的尾部附着在细菌的细胞壁上,然后进行“侵入”。噬菌体先通过溶菌酶的作用在细菌的细胞壁上打开一个缺口,尾鞘像肌动球蛋白的作用一样收缩,露出尾轴,伸入细胞壁内,如同注
λ噬菌体DNA的制备
实验概要本实验介绍了λ噬菌体DNA的制备、操作步骤和注意事项。实验原理λ噬菌体是最早使用的克隆载体,λ噬菌体的基因组是一长度约为50kb的双链DNA分子,它在宿主细胞有两种生活途径:其一是裂解生长,环状DNA 分子在细胞内多次复制,合成大量噬菌体基因产物,装配成噬菌体颗粒,裂解宿主菌再进行下一次
噬菌体侵染细菌实验
这种说法有点偏颇。1、当噬菌体的DNA用32磷标记后,它吸附到大肠杆菌表面,然后把DNA注入到大肠杆菌里面,利用其中的原料复制子代的DNA。离心后,较轻的噬菌体悬浮在上清液中,大肠杆菌及一些较重的颗粒沉淀在底部,由于噬菌体中含有32磷的DNA都注入到大肠杆菌里面,所以上清液放射性很低,底部的沉淀物放
噬菌体都有哪些种类
蛋白质结构 无尾部结构的二十面体:这种噬菌体为一个二十面体,外表由规律排列的蛋白亚单位——衣壳组成,核酸则被包裹在内部。 有尾部结构的二十面体:这种噬菌体除了一个二十面体的头部外,还有由一个中空的针状结构及外鞘组成的尾部,以及尾丝和尾针组成的基部。 线状体:这种噬菌体呈线状,没有明显的头部
温和噬菌体的定义
噬菌体侵入宿主细胞后,噬菌体的DNA只整合在宿主的核染色体上,并可长期随宿主DNA的复制而进行同步复制,一般情况下不进行增殖,不引起宿主细胞裂解的噬菌体,称温和噬菌体或溶源噬菌体。
噬菌体的临床应用
(1)细菌的鉴定与分型噬菌体的作用具有高度特异性。一种噬菌体只能裂解一种或与该种相近的细菌,故可用于细菌的鉴定和分型。目前已利用噬菌体将金黄色葡萄球菌分为四个群数百个型,这种用噬菌体分型的方法,在流行病学调查上,对追查和分析这些细菌性感染的传染源很有帮助。(2)检测标本中的细菌应用噬菌体效价增长试验
M13-噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技
M13 噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术中的应用 实验材料 羧苄青霉素 氯霉素 大肠杆菌 CJ2
一种靶向控制噬菌体来对抗细菌的方法:噬菌体疗法
有人的地方就有江湖?微观世界其实也一样残酷。研究人员发现:假单胞菌会利用自己产生的信号分子,选择性操纵竞争菌株中的噬菌体来击败敌人。这个结果或许提示了一种靶向控制噬菌体来对抗细菌的方法:噬菌体疗法。 噬菌体仍然是人类微生物群中一个相对未知的组成部分。然而,它们可以在细菌的生命周期中发挥强大
用噬菌体ElISA快速鉴定噬菌体展示蛋白的结合亲和性
单价噬菌体展示系统能使一个单独的蛋白质(或多肽)分子呈递在噬菌体颗粒表面,这样的蛋白质与野生型pⅢ衣壳蛋白相连,作为融合蛋白在辅助噬菌体感染的大肠杆菌细胞中,由噬菌粒载体翻译表达出来。这种展示系统能实现单价展示,是由于这种融合蛋白极少替代来自辅助噬菌体基因组的野生型pⅢ蛋白。这种展示可以是高度可变的
噬菌体文库的扩增实验
基本方案 实验材料 噬菌体 试剂、试剂盒
温和噬菌体的治愈现象
溶原状态通常十分稳定,能经历许多代。但在某些条件如紫外线、X线、致癌剂、突变剂等作用下,可中断溶原状态而进入溶菌性周期,这称为前噬菌体的诱导与切离(excision),发生率为10-2-10-5。极少数溶源性细菌中的前噬菌体离开细菌基因组后,不进入溶菌性周期,这个现象被形象地称之为“治愈”。
噬菌体侵染实验的原理
原理:T2噬菌体侵染细菌后,在自身遗传物质的控制下,利用细菌体内的物质合成T2噬菌体自身的组成成分,从而进行大量繁殖。
温和噬菌体的形态介绍
个体微小,结构简单,只含有一种核酸DNA或RNA,只能在活的细胞内以复制方式进行增殖。
噬菌体肽文库的定义
中文名称噬菌体肽文库英文名称phage peptide library定 义将编码多肽的外源基因插入含噬菌体外壳蛋白基因的载体,构建得到能与外壳蛋白融合表达多肽的基因文库。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)
噬菌体克隆的纯化实验
基本方案 实验材料 噬菌体 试剂、试剂盒
血清学筛选噬菌体
1. 准备 NZY agar plates(至少用前 24 小时倒好) ,用前在37℃培养箱中烘烤1-2 小时以去除水滴。2. 将过夜培养的 XL1-blueMRF' 细菌 2000 转/ 分,离心10 分钟,将细菌溶解在10mMMgSO4 中,调整细菌浓度为 OD600=0.5。3. 融化
噬菌体中和试验的特点
中文名称噬菌体中和试验英文名称bacteriophage neutralization test;phage neutralization test定 义一种检测低水平抗噬菌体抗体的敏感试验。即将噬菌体与特异性抗体共温育,以抑制该噬菌体感染宿主,通过观察噬菌斑数量变化,可对中和作用进行定量。应用学
噬菌体展示技术的原理
噬菌体展示技术是将多肽或蛋白质的编码基因或目的基因片段克隆入噬菌体外壳蛋白结构基因的适当位置,在阅读框正确且不影响其他外壳蛋白正常功能的情况下,使外源多肽或蛋白与外壳蛋白融合表达,融合蛋白随子代噬菌体的重新组装而展示在噬菌体表面。被展示的多肽或蛋白可以保持相对独立的空间结构和生物活性,以利于靶分子的
噬菌体展示技术的应用
噬菌体展示可用于蛋白质-蛋白质相互作用的研究。
温和噬菌体的化学组成
头部衣壳内含有噬菌体的遗传物质即DNA或RNA,尾部有能识别宿主菌细胞表面的特殊受体,与噬菌体的吸附功能有关。
简述细菌噬菌体繁殖特点
1.毒性噬菌体 指在宿主菌体内复制增殖,产生许多子代噬菌体,并最终裂解细菌。毒性噬菌体的增殖方式是复制,其增殖过程经历吸附穿入、生物合成和成熟释放3个阶段。 进入菌细胞内的噬菌体核酸首先经早期转录产生早期蛋白质,并复制子代核酸,再进行晚期转录产生噬菌体的结构蛋白。子代噬菌体达到一定数量时,由
gⅥcDNA融合噬菌体ELISA
gⅥ-cDNA融合噬菌体ELISA [器材和试剂] 通用设备及试剂以及以下的设备和试剂: ● 链霉素包被的微量浓度测定板(Pierce) ● T和 2mol/L ● 生物素抗原选择出的(BAS)噬菌体和(或)免疫亲和选择出的(1AS)噬菌体