小须鲸全基因组图谱获破译

11月25日,韩国海洋科学技术研究所、深圳华大基因研究院等宣布成功破译了小须鲸全基因组图谱,并对鲸类独特生理习性的遗传学机制进行了分析。相关成果在线发表于《自然—遗传学》杂志。 人们一直痴迷于海洋生物是如何演化为陆生生物的。鲸类的进化却反其道而行之,由陆生向水生演化,和陆生偶蹄动物如牛、猪等拥有共同祖先——一种已灭绝的类似鹿的半水生哺乳动物Indohyus。约5400万年前,Indohyus进化为两个分支:一支渐渐习惯水生生活,进化成今天的鲸;另一支坚持陆地生活,成为陆生偶蹄动物。 研究人员对从一只雄性小须鲸肌肉中提取的DNA进行高深度全基因组从头测序,并对三只小须鲸、一只长须鲸、一只宽吻海豚和一只江豚进行了重测序研究。研究发现,小须鲸、宽吻海豚、猪和牛共有9848个直系同源基因家族,其中小须鲸的特异基因家族数为494。与非鲸哺乳动物相比,鲸类中有特异突变位点氨基酸的基因总数为4773,其中695个基因上发现了功能......阅读全文

如何阅读基因载体图谱?(二)

二、选择和准备载体选择载体主要依据构建的目的,同时还要考虑载体中应有合适的限制酶切位点等。如果构建的目的是要表达一个特定的基因,则要选择合适的表达载体。选用哪种载体,还是要结合目的基因及载体特点以实验目的为准绳。 载体选择主要考虑下述3点: 1、构建DNA重组体的目的,克隆扩增/表达表达,选择合适的

分子标记基于图谱克隆基因

  图位克隆(Map—bascd cloning))是近几年随着分子标记遗传图谱的相继建立和基因分子定位而发展起来的一种新的基因克隆技术。利用分子标记辅助的图位克隆无需事先知道基因的序列,也不必了解基因的表达产物,就可以直接克隆基因。图位克隆是最为通用的基因识别途径,至少在理论上适用于一切基因。基因

如何阅读基因载体图谱?(三)

三、改造载体 1、改造启动子:一般在过表达载体中CMV属于广谱型的强启动子,具体可根据实验需求,选用不同启动子,尤其是对于AAV载体构建时选用组织特异性启动子。 启动子名称启动子大小组织特异性ALB2.4kb肝脏特异性CAG944bp广泛表达的强启动子CamKIIa1.2kb大脑皮层和海马神经元特异

如何阅读基因载体图谱?(一)

基因载体是基因工程的核心,也是基因治疗中强有力的生物工具,我们先来认识和阅读载体图谱吧。 一、载体分类及载体组成元件载体分类1、按属性分类:病毒载体和非病毒载体病毒载体是一种常见的分子生物学工具,可将遗传物质带入细胞,原理是利用病毒具有传送其基因组进入目的细胞,进行感染的分子机制。可发生于完整活体或

B类先导专项“脑功能联结图谱与类脑智能研究”结题验收

  8月31日,中国科学院在北京召开B类战略性先导科技专项“脑功能联结图谱与类脑智能研究”结题总体验收会议。总体验收专家组由中科院院士王志珍、贺福初、赵国屏、强伯勤、张钹、郭雷等来自科研机构、高校、医院的科技专家,以及来自科学技术部、财政部、国家卫生和计划生育委员会、工业和信息化部等国家有关部门的管

Nature重要论文:大型基因表达图谱

来自艾伦脑科学研究所的科学家们在最新出版的《自然》(Nature)杂志上报告称证实人类大脑具有一致的遗传蓝图,且拥有巨大的生物化学复杂性。这些研究结果来自于对“艾伦人脑图谱库”(Allen Human Brain Atlas)公开提供的大量数据集的首次深入大规模分析。 这项研究的结果是基于对“艾

斜纹夜蛾精细基因图谱绘出

  28日,记者从西南大学获悉,该校家蚕基因组生物学国家重点实验室联合法国、日本、美国等多国研究机构,在全球首次绘制出斜纹夜蛾精细基因图谱,并于25日发表于国际权威期刊《自然·生态学与进化》上。该研究成果揭示了斜纹夜蛾的高质量基因组精细图谱,以及群体变异图谱和基因表达图谱,可为其防治提供科学依据。 

Nature公布大麦基因组图谱

  大麦是世界上最重要的粮食作物之一,17日Nature公布了目前为止最完善的大麦基因组测序图谱。这项由美国农业部主导的大工程,在德国、日本、芬兰、澳大利亚、英国、美国和中国科学家们的共同努力下,历经六年终于取得了重大进展。大麦基因组图谱将成为人们提高大麦产量、增强大麦抗虫抗病能力、增加大麦营养价值

Nature:大脑基因表达图谱和神经元联系图谱绘制完成

2013年4月2日奥巴马政府公布“脑计划”,现在一年过去,脑计划出了两项突破性成果:科学家绘制出哺乳动物大脑中完整的基因表达图谱和神经元联系图谱        在美国总统巴拉克·奥巴马宣布了“使用先进革新型神经技术的人脑研究”(BRAIN)计划 1 年后,《自然》杂志于4月3日发表了两项研究,介

大脑完整基因表达图谱和神经元联系图谱绘制完成

  继美国总统奥巴马宣布“推进创新神经技术脑研究计划”(简称BRAIN计划或脑计划)一年后,美国科学家成功给“整个大脑”做了图谱。4月3日出版的英国《自然》杂志发表两项相关研究,介绍了哺乳动物大脑中完整的基因表达图谱和神经元联系图谱。此次的图谱对于研究人类大脑发育和神经回路,从而理解人类的行为和认知

新基因图谱揭示基因组交叉地带

  据英国《新科学家》网站近日报道,美国科学家绘制出了目前世界上最先进的人类基因图谱,该图谱能帮助更准确地识别某些影响特定人群的遗传病根源。   这一基因图谱发现,西非人后裔的基因中有着欧洲人后裔所没有的基因重组的高发地带,这有可能是导致特定人种先天性疾病诸如贫血症的遗传学原因。当然

研究发现鲸头骨好比天线

  图片来源:TED CRANFORD, SAN DIEGO STATE UNIVERSITY   鲸能唱歌、发出嗡嗡声,甚至相互间窃窃私语。但对于这些群居的巨人来说,有一件事情始终不详:它们是如何听见声音的。考虑到一些鲸的大小以及它们身处的大海,即便研究这些哺乳动物的基本情况,都极具挑战性。不过

鲸鲨喜爱温暖浅水区

 近日,英国约克大学研究人员在新一期美国开放期刊《同行评议科学杂志》上发表报告说,他们在分析了17处鲸鲨聚集地后发现,这些聚集地有很多共同特征,比如均在温暖的浅水区,同时靠近通往深水区的海床陡坡。

鲸鲨喜爱温暖浅水区

  近日,英国约克大学研究人员在新一期美国开放期刊《同行评议科学杂志》上发表报告说,他们在分析了17处鲸鲨聚集地后发现,这些聚集地有很多共同特征,比如均在温暖的浅水区,同时靠近通往深水区的海床陡坡。图片来源于网络  鲸鲨是一种滤食性鱼类。研究人员认为,这类聚集地为鲸鲨提供了理想的觅食空间。海床陡坡促

解开弓头鲸长寿之谜

  美国科学家在一项研究中发现,弓头鲸异乎寻常的长寿可能是源于其修复DNA的能力增强。这些发现或为衰老和长寿机制带来新见解。相关研究10月30日发表于《自然》。  弓头鲸是已知最大、最长寿的哺乳动物之一,最大寿命可超过200年,体重经常超过80000公斤。它们惊人的体型和长寿本应增加其患癌倾向,因为

巨大鲸鲨- 也会吃素

海洋科学家发现鲸鲨除了吃浮游生物和鱼类外,也会以植物为食,这使该标志性鱼类成为世界上最大的杂食性鱼类。相关研究近日发表于《生态学》(Ecology)。鲸鲨是滤食性动物,人们长期观察到它们在西澳大利亚宁格罗暗礁群捕食磷虾。但当研究人员分析暗礁中鲸鲨的活组织样本时,发现这些动物实际上会吃下很多植物。这一

中国科学家破解海豚基因密码揭鲸目动物进化史

  海豚是人们熟知的水生类哺乳动物,大约于5000万年前从蹄类动物分化而来。记者24日从中科院昆明动物研究所获悉,该所科学家近日对海豚基因组进行了系统分析,进一步揭示了鲸目动物的进化以及它们“入水的秘密”。   鲸目动物是哺乳动物中少有的水生物种,海豚便是其中一种。它们是由陆生哺乳动物中的偶蹄目动

Nat-Commun:新研究揭示脂类代谢的遗传调控图谱

  最近,来自赫尔辛基大学的研究者们已经鉴定出几种新的遗传变异,这些变异与血浆脂质水平和人类心血管疾病的风险有关。该研究表明,针对循环系统中脂质分子的水平进行相关遗传研究可以帮助改善心血管疾病风险的预测和治疗。相关结果最近发表于Nature Communications。心血管疾病是全球死亡率和发病

建立茎尖细胞特异基因表达图谱

  基因差异表达是细胞分化和不同细胞类型形式特异功能的基础。细胞特征的转录图谱对于了解不同类型细胞如何生长发育、响应环境至关重要。但植物细胞由细胞壁固着,不易分离,很难获得细胞类型特异的转录数据。  中国科学院遗传与发育生物学研究所焦雨铃研究组在之前的工作中建立了器官边界区的细胞特异表达图谱 (Ti

小鼠大脑皮层基因活性图谱问世

  一国际研究小组最新发表在《神经细胞》杂志上的论文称,他们使用一种最新测序技术,首次成功描绘出小鼠大脑基因活性的完整图谱。该图谱覆盖了整个基因组的所有基因,十分详细地显示了小鼠大脑皮层各层次的基因活性情况。研究人员指出,该研究成果不仅有助于科学家进一步理解哺乳动物大脑的组织结构情况,

物理图谱进行基因定位的方法介绍

原核生物 DNA分子上缺乏天然的容易识别的标记,可用限制图谱和部分变性图的测定来弥补这一不足。各种限制性核酸内切酶具有各自的识别顺序。这些识别顺序可以作为DNA部位的标记,用不同的限制酶处理同一DNA分子,通过对酶切产生的DNA片段的大小和位置的分析,可以绘制出某一 DNA分子的限制图谱。此外,每一

《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱

  来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了来自一个成人男子91个

分子图谱检测和基因检测的区别

(1)细胞周期是指连续分裂的细胞,从一次分裂完成时开始到下次分裂完成时为止,即甲图中f~l;细胞周期包括分裂间期和分裂期,乙图中各细胞都处于分裂期,还缺少分裂间期的细胞.(2)核仁逐渐解体,核膜逐渐消失发生在前期,即甲图中的bc(hi)段,对应于乙图中的B图.(3)染色体数目加倍发生在后期,即乙图中

基因组图谱的方法和意义

中文名称基因组图谱英文名称genomic map定  义展示一种生物全基因组结构的图谱。按建立图谱的研究目的方法和精细程度,可以有不同的形式,包括以遗传学方法建立的遗传连锁图谱,按距离绘出基因位置分布的物理图谱,经测定核酸序列建立的核苷酸序列图谱,以及标记出可表达序列的转录图谱等。应用学科生物化学与

首次绘制小麦表观基因组图谱

  最近,英国利物浦大学的科学家们,对小麦中调节基因活性的遗传性分子变化,进行了首次全基因组范围的调查,这可能成为提高作物育种技术的一种新工具。相关研究结果发表在最新一期的《Genome Biology》。延伸阅读:权威期刊发布首个小麦单体型图谱。  表观遗传标记是一种化学标签,将自己附着在DNA上

迄今最全斑马鱼基因图谱发布

一个国际科研团队在5日出版的《自然·遗传学》杂志上发布了迄今最全面的斑马鱼基因图谱。斑马鱼是医学和生命科学研究领域使用量第二大的动物模型,这一成果将帮助科学家们更好地研究各种癌症、心脏病和神经退行性疾病,以及在研究中用斑马鱼模型取代哺乳动物模型。 最新研究由DANIO-CODE联盟开展,该联盟由

单倍体基因型的图谱计划介绍

  国际人类单倍型图谱计划(简称单倍型图谱计划)是由6个国家建立的研究联盟正在投入一项大规模的基因组学计划,旨在查明普通疾病背后隐藏的基因。经过国家公共机构与私营公司几个月的共同努力,美国国家卫生研究院(NIH)昨天宣布,已集资1亿美元用于在3年时间里构建一个所谓的单倍型(haplotype)图谱。

首个家鸡基因组图谱绘制完成

西南大学教授徐洛浩课题组以中国特有家鸡品系胡须鸡为材料,在国际上率先绘制出首个家鸡全基因组图谱。2月13日,相关研究成果以《家鸡基因组完成图的演化分析》为题,发表在美国《国家科学院院刊》上。这是继去年人类基因组完成图公布以来,首个发表的脊椎动物基因组完成图,也是基因组完成图谱绘制技术首次在经济动物中

揭秘:帝王蟹的基因组图谱

  科学家成功获得高质量帝王蟹基因组图谱   帝王蟹 唐伯平供图  帝王蟹基因组染色体图谱 唐伯平供图  帝王蟹和其他泛甲壳动物的系统演化关系 唐伯平供图  近日,《分子生态资源》发表了首个歪尾类螃蟹的高质量基因组图谱,即一种重要经济蟹类蓝帝王蟹(Paralithodes platypus)的基因组

鲸和海豚能主动抑制噪音

诸如宽吻海豚等海洋哺乳动物能降低对巨大噪音的听力灵敏度。  想象你在一场摇滚音乐会上无须戴耳机,只是调整一下耳朵里的控制器,便能降低音量并且保护听力。最新研究发现,4种鲸和海豚能很自然地做到这一点。这或许能使上述动物保护自己不受海军声呐或者石油钻探发出的刺耳声音的影响。自1963年起,至少有500起