OxfordNanopore：纳米孔测序仪开放试用
在上个月的美国人类遗传学协会年会上，英国Oxford Nanopore Technologies公司宣布将启动MinION测序仪的试用计划。这次，它果然没有食言。MinION试用计划于11月25日启动，将延续到2014年初，具体截止日期未定。 根据这项试用计划，参与者须支付1,000美元的押金以及运费，而后将收到一台MinION测序仪，包括测序USB装置、流动槽和软件。 除了MinION测序仪，Oxford Nanopore还在开发GridION测序仪。之前，该公司一直没有公布这两款测序仪的具体性能参数，但鉴于许多客户有意了解，它最近在网站上回答了一些常见问题。 GridION和MinION系统的通量如何? 据介绍，GridION系统是可以扩展的。它既可以单独作为一台仪器工作，又可以多台连接，带来更快的结果。至于仪器的通量，它会受到各种因素的影响，包括 DNA的处理速度以及芯片上同时开展的......阅读全文
三代测序的前奏：Illumina再诉牛津纳米孔
Illumina今天正式宣布起诉Oxford Nanopore，诉讼涉及后者在纳米孔测序相关领域涉嫌侵犯Illumina两项ZL。 Illumina同时向美国国际贸易委员会和美国南加州地方法院提出此次诉讼，起诉Oxford Nanopore侵犯其美国ZL局第8673550号和9170230号Z
DNA测序仪原理
abi prism 310型基因分析仪(即dna测序仪)，采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法)，因此通过单引物pcr测序反应，生成的pcr产物则是相差1个碱基的3''''末端为4种不同荧光染料的单
计算/DNA测序仪
测序反应精确度计算公式：100%－差异碱基数(不包括n数)/650×100%差异碱基即测定的dna序列与已知标准dna序列比较不同的碱基，n为仪器不能辨读的碱基。
DNA测序仪定义
DNA序列测定分手工测序和自动测序，手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今 dna序列分析的主流。美国pe abi公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等dna测序仪，其中310型是临床检测实验室中使用最多
AB－SOLiD测序仪
AB SOLiD测序仪可以对由任何方法制成的DNA文库进行测序。AB SOLiD测序仪有一个极大的特点就 是能够将富集模板片段的微珠在芯片上进行高度可控的任意排列。AB SOLiD测序仪也是使用如图5a中所示 的微乳液PCR方法扩增模板片段的，不过，它这里使用的是直径只有1μm的小磁珠。PCR扩增反
基因测序仪定义
基因测序仪又称DNA测序仪，是测定DNA片段的碱基顺序、种类和定量的仪器。主要应用在人类基因组测序、人类遗传病、传染病和癌症的基因诊断、法医的亲子鉴定和个体识别、生物工程药物的筛选、动植物杂交育种等方面。
基因测序仪分类
根据电泳类型分为平板型电泳和毛细管电泳两类： 1. 平板型电泳：平板型电泳的凝胶灌制在两块玻璃板中，聚合后厚度一般小于0.4mm或更薄，因此又称为超薄片层凝胶电泳。是经典的电泳技术，具有样品判读序列长（600-900bp）、一块凝胶板上可同时进行多个样品测序的优点。 2. 毛细管电泳：将凝胶
基因测序仪原理
目前DNA测序仪的工作原理主要基于Sanger发明的双脱氧链末端终止法或Maxam-Gilbert发明的化学降解法。这两种方法在原理上虽然不同，但都是根据在某一固定的位点开始核苷酸链的延伸，随机在某一个特定的碱基处终止，产生以A、T、C、G为末端的四组不同长度的一系列核苷酸链，在变性聚丙烯酰胺凝
DNA测序仪相关
分析或打印出彩色测序图谱 上机操作按仪器操作说明书安装毛细管，进行毛细管位置的校正，人工手动灌胶和建立运行的测序顺序文件。仪器将自动灌胶至毛细管，1.2kv预电泳5min，按编程次序自动进样，再预电泳(1.2kv，20min)，在7.5kv下电泳2h。电泳结束后仪器会自动清洗，灌胶，进下一样品
结果当天可取，基因测序让结核病检测廉价迅捷
日前，英国牛津大学的研究人员利用全基因组测序技术，开发出一种创新结核病 (Tuberculosis， TB) 诊断检测方法。这一检测方法可以在24小时之内检测出患者是否患有结核病，并且确定结核病菌的抗药性，对改善结核病治疗和防止结核病扩散都有非常重大的影响。 结核病是世界范围的流行性传染病。据
未来可分析外星生命？太空测试基因测序装置
据每日邮报报道，最近到达国际空间站的美国宇航员凯特·鲁宾斯(Kate Rubins)将使用Oxford Nanopore Technologies研发的基因测序装置MinION，在太空环境下首次完成基因测序工作。这种口袋大小的测试工具可以帮助深空宇航员生存下来，将来或可被用于解析外星生命。 鲁
纳米孔直接RNA和cDNA长读长测序概述
RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中，转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本，可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时，cDNA测序也极大
纳米孔ZL之争落下帷幕
美国国际贸易委员会近日发布文件称，Illumina公司和英国牛津纳米孔公司的官司已经庭外和解。纳米孔公司同意不再出口或售卖包含氨基酸序列纳米孔的产品，并销毁目前库存的产品。但该文件也明确表示，这些限制不会影响牛津纳米孔对CsgG的使用。CsgG是相关诉讼开始后不就，牛津纳米孔发布的另一种新孔，基于全
纳米孔测序技术有望颠覆DNA测序市场？
Scott Tighe（左）等研究人员利用MinION设备在南极泰勒谷测序微生物DNA。 “我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示。你们相信吗？Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机
纳米孔技术有望颠覆DNA测序市场
Christopher Mason有一个喜欢在会议上展示的技巧。通过从志愿者手机上收集的化验样本获取DNA，他和同事能在1个小时内现场进行谱系分析，甚至详细描述出捐赠者一天的生活细节。“我们能从手机上的残留物预言谁刚吃了一个橘子或者谁吃了猪肉。”美国纽约威尔康奈尔医学院计算生物学家Mason表示
浅谈NGS的这10年（三）
454平台和Ion Torrent平台相比于其他的短读长平台而言，能够提供较长的read读长，分别大约在700bp与400bp，因此在基因组结构较为复杂的研究上应用 较多。然而，由于同样都是基于SNA技术，它们都拥有相同的缺点。虽然，其在非碱基多聚体（non-homopolyme
纳米孔直接RNA和cDNA长读长测序概述
RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中，转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本，可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时，cDNA测序也极大
美国批准“纳米孔测序”新冠检测试剂EUA
纽约 -美国食品药品监督管理局上周授予美国实验室公司紧急使用授权，用于基于纳米孔测序的检测SARS-CoV-2的试剂。 该试剂被称为Clear Dx SARS-CoV-2 WGS v3.0测试，使用牛津纳米孔技术的MinIon测序仪和Clear Labs Clear Dx自动样品制备和分析流
INCSeq：提高纳米孔测序准确性的新方法
新加坡基因组研究院（GIS）的研究人员开发了一种方法，称为INC-Seq，能够提高牛津纳米孔技术公司掌上测序仪MinIon的测序准确性。目前他们正努力改进该方法，将它应用到复杂样本的16S测序、RNA测序以及基因组复杂区域测序等中。 研究人员在近日发表于《Giga Science》的文章中描述
基因测序仪的原理
abi prism 310型基因分析仪采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法)，因此通过单引物pcr测序反应，DNA测序仪生成的pcr产物则是相差1个碱基的3''''末端为4种不同荧光染料的单链dna
基因测序仪的原理
基因测序仪是一种在医学领域使用的仪器。原理：abi prism 310型基因分析仪采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法)，因此通过单引物pcr测序反应，DNA测序仪生成的pcr产物则是相差1个碱基的3'''
操作步骤/DNA测序仪
pcr测序反应(1) 取0.2ml的pcr管，用记号笔编号，将管插在颗粒冰中，按下表加试剂：所加试剂 测定模板管 标准对照管bigdye mix 1μl 1μl待测的质粒dna 1μl －pgem-3zf (+) 双链dna － 1μl待测dna的正向引物 1μl －m13(-21)引物 － 1μl
基因测序仪的原理
基因测序仪是一种在医学领域使用的仪器。原理：abi prism 310型基因分析仪采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法)，因此通过单引物pcr测序反应，DNA测序仪生成的pcr产物则是相差1个碱基的3'''
基因测序仪的原理
abi prism 310型基因分析仪采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法)，因此通过单引物pcr测序反应，DNA测序仪生成的pcr产物则是相差1个碱基的3''''末端为4种不同荧光染料的单链dna
DNA测序仪的计算
测序反应精确度计算公式：100%－差异碱基数(不包括n数)/650×100% 差异碱基即测定的dna序列与已知标准dna序列比较不同的碱基，n为仪器不能辨读的碱基。
DNA测序仪发展历史
70年代末，WalterGilbert发明化学法、FrederickSanger发明双脱氧终止法手动测序，同位素标记 80年代中期，出现自动测序仪（应用双脱氧终止法原理）、荧光代替同位素，计算机图象识别 90年代中期，测序仪重大改进、集束化的毛细管电泳代替凝胶电泳 2001年完成人类基因组
全自动DNA测序仪
全自动DNA测序仪是一种用于生物学、农学领域的分析仪器，于2003年7月22日启用。 技术指标 全自动DNA测序、PCR片段大小分析和定量分析；自动灌胶、进样数据收集分析；还可进行杂合子、PCR序列和片段分析。 主要功能 CEQuence研究模块是一个新的软件模块，它将序列与已知参考序列
基因测序仪相关原理
普通的PCR反应体系中，加入的核苷酸单体为4种2′-脱氧核苷三磷酸(dATP，dCTP，dGTP，dTTP)。测序反应体系中，加入的核苷酸单体为2',3双脱氧核苷三磷酸( ddNTP)。与dNTP相比，ddNTP在脱氧核糖的位置上缺少个羟基，反应过程中虽然可以在DNA聚合酶作用下，通过其
固相测序仪简介
三十年前，由Sanger和G订bert分别建立了DNA双脱氧测序和化学测序技术。现在DNA测序的规模逐渐扩大，从每天能读几千个碱基对序列的小规模测序，发展到如 今每天能够进行成千上万个序列的精确测定，成为数十亿美元的“产业”。世界上几个大的测序中心建立了大规模的基因组测序平台，支持几乎所有大学
基因测序仪临床应用
1. 在感染性疾病诊断上的应用 测序技术可以精确的分析碱基序列，通过序列比对，对各种病原体直接进行鉴定、分型和溯源，明确某一感染性疾病对应病原体的基因序列，可以有针对性地用药和预防，提高用药的有效性和安全性。同时基因测序可以用于发现新型病原体，能更好地做好预防工作。 2. 在遗传性疾病诊断