OxfordNanopore：纳米孔测序仪开放试用
在上个月的美国人类遗传学协会年会上，英国Oxford Nanopore Technologies公司宣布将启动MinION测序仪的试用计划。这次，它果然没有食言。MinION试用计划于11月25日启动，将延续到2014年初，具体截止日期未定。 根据这项试用计划，参与者须支付1,000美元的押金以及运费，而后将收到一台MinION测序仪，包括测序USB装置、流动槽和软件。 除了MinION测序仪，Oxford Nanopore还在开发GridION测序仪。之前，该公司一直没有公布这两款测序仪的具体性能参数，但鉴于许多客户有意了解，它最近在网站上回答了一些常见问题。 GridION和MinION系统的通量如何? 据介绍，GridION系统是可以扩展的。它既可以单独作为一台仪器工作，又可以多台连接，带来更快的结果。至于仪器的通量，它会受到各种因素的影响，包括 DNA的处理速度以及芯片上同时开展的......阅读全文
新突破！掌上测序仪首次完成人类全基因组测序
最近，英国牛津大学（Oxford University）Wellcome Trust人类遗传学中心（Wellcome Trust Centre for Human Genetics）和在基因组分析领域领先的英国公司Genomics plc宣布，首次使用掌上纳米孔测序仪完成了多个人类全基因组测序和
第三代测序可实现大规模的人类基因测序！
第二代测序是当今应用最为广泛的技术，但读长短是它的软肋，并且它无法解决高度杂合的基因组、高度重复序列、高GC区域、拷贝数变异、大的结构变异等问题。第三代测序技术避免了第二代测序读长短的缺点，近年来渐渐被应用于各大研究中。以前谈到第三代测序，也许你想到的是病毒基因组或细菌基因组测序，而如今随着技术的升
纳米孔测序仪真机现身ASHG
英国Oxford Nanopore Technologies公司在年初的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上发布了一款便携式的基因组测序仪MinION，性能强劲，价格给力，引发市场轰动。然而，大半年过去了，纳米孔测序仪却迟迟不见踪影，连更早发布的GridION也未上市。于是，生物界开始议论
第三代测序重大突破！首次完成人类基因组测序
第二代测序是当今应用最为广泛的技术，但读长短是它的软肋，并且它无法解决高度杂合的基因组、高度重复序列、高GC区域、拷贝数变异、大的结构变异等问题。第三代测序技术避免了第二代测序读长短的缺点，近年来渐渐被应用于各大研究中。以前谈到第三代测序，也许你想到的是病毒基因组或细菌基因组测序，而如今随着技
DNA测序仪：454测序仪
454测序仪的出现极大促进了测序业务的开展，科研人员已经将测序技术作为解决科研工作中许多常见 问题的利器。这是因为454测序仪在以下几个方面取得了质的突破：首先是解决了高通量测序问题；其次它简 化了样品准备步骤，将以往转化大肠杆菌扩增质粒的繁琐过程全部用简单的体外PCR扩增法替代了；最后， 它缩小了
首次在太空利用MinIONDNA测序，与地球结果完美匹配
NASA宇航员凯特·鲁宾斯首次在太空利用MinION测序仪进行DNA测序。 凯特·鲁宾斯，2005年毕业于斯坦福大学医学院生物化学系及微生物学与免疫学系，获得癌症生物学博士学位，2009年进入NASA培训，成为一名合格的宇航员。英国牛津纳米孔公司提供的MinION测序仪，只有手掌大小。 美国国家
iPhone供电的纳米孔测序仪有望上市
Oxford Nanopore的用户组会议于上周四在伦敦召开。媒体并没有被邀请，不过一些用户和博主已经在Twitter上透露了最新消息。Oxford Nanopore正在开发一款智能手机供电的纳米孔测序仪以及一款低成本的文库制备系统。 Oxford Nanopore的用户组会议于上周四在伦敦召
便携式基因测序仪存在未知安全漏洞
美国佛罗里达大学科学家在新一期《自然·通讯》杂志发表论文称，全球广泛使用的便携式基因测序仪存在未知的安全隐患，可能导致私人基因数据在无察觉的情况下泄露或被篡改。研究团队在牛津纳米孔公司生产的MinION便携式测序仪及其配套软件中，识别出3处安全漏洞。其中两处漏洞可使未经授权者擅自访问设备，在用户不知
GEN：纳米孔测序——传染病诊断的新“前锋”
假设你是Doctors Without Borders组织中在西非工作的一名医生，一个发热、头疼、疲劳的小孩被带进你的诊所。根据当地的环境和季节，最可能被诊断出的就是疟疾或埃博拉。然而，这两种疾病都不能给病人一个积极的预后。埃博拉病毒能够快速传播给其他人，需要将患者尽快隔离。 这种情况下，确诊
NASA首次在太空完成RNA直接测序
去年底，美国宇航员在国际空间站首次完成了DNA测序，而不用将样本运送回地球。如今，他们又利用Oxford Nanopore的MinION测序仪，在太空成功完成了RNA直接测序。 这项工作是基于前人的努力。2016年8月，美国宇航员Kate Rubins首次在微重力的环境下完成了DNA测序工作。
最热门基因组遗传学新闻一览
本周包括苹果，IBM等在内的著名企业宣布了各自在生命科学领域研究的最新消息。 苹果推出ResearchKit 首先苹果Apple公司继新的数据共享平台 ResearchKit 首次亮相之后，将开始手机用户的遗传信息。据MIT Technology Review报道，“鼓励iPhone用户将其
高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析－5
图5: 长读长实时测序原理。长reads的合成与真正测序的平台不同的是，合成长读长技术依赖于一个barcode系统来结合不同的片段，通过已有的短读长测序仪来获得长读长reads61。该方法将大的DNA分子分割成若干个小片段到微孔中或者乳液中。每个微孔或者乳液中的模板被切割并且加上了barcodes。
Oxford－Nanopore发布新产品PromethION
Oxford Nanopore似乎与ASHG（美国人类遗传学协会的年会）有着不解之缘。在ASHG 2012上，Oxford Nanopore展示了MinION的真机。在ASHG 2013上，它又宣布启动MinION的早期试用计划。而在今年的ASHG上，Oxford Nanopore揭开了其新产品
基因测序新贵在ZL诉讼期间发布新技术
首创了一种名为纳米孔测序的新DNA分析技术的英国牛津纳米孔技术公司，对其产品的核心部分一直守口如瓶。不过，紧随一项来自测序行业巨头——启迪公司的ZL侵权诉讼，该公司揭示了驱动其最新设备的东西，即一种看上去巧妙避开了启迪公司挑战的细菌孔。 同此前方法相比，纳米孔测序在分析DNA方面更加便捷和廉价
DNA验证个人身份只需几分钟
在科幻电影《戛塔卡》中，只有当访问者的基因谱与样本文件相匹配时，才能确定其身份安全。据美国科学促进会（AAAS）科技新闻共享平台EurekAlert!日前报道，美国哥伦比亚大学和纽约基因中心研究人员开发出了一种廉价的DNA测序仪，将其和定制软件匹配应用，可让实时DNA验证身份成为现实。 研究团
DNA测序仪pcr测序反应
pcr测序反应 (1) 取0.2ml的pcr管，用记号笔编号，将管插在颗粒冰中，按下表加试剂： 所加试剂 测定模板管 标准对照管 bigdye mix 1μl 1μl 待测的质粒dna 1μl － pgem-3zf (+) 双链dna － 1μl 待测dna的正向引物 1μl －
基因测序新贵在ZL诉讼期间发布新技术
面对启迪公司的诉讼，牛津纳米孔技术公司表示，这种名为CsgG的微小孔隙是其新设备的基础。 首创了一种名为纳米孔测序的新DNA分析技术的英国牛津纳米孔技术公司，对其产品的核心部分一直守口如瓶。不过，紧随一项来自测序行业巨头——启迪公司的ZL侵权诉讼，该公司揭示了驱动其最新设备的东
仪器发展新趋势－－体积越来越小，功能越来越强
随着新颖仪器的不断出现，实验室的空间已变得越来越宝贵。仪器开发商也注意到这一点，开始设计体积小巧、功能强大的仪器。在这一期的《BioTechniques》上，Nathan Blow就带我们了解一些新上市的的小仪器。 智能显微镜 两个月前，Nikon公司推出了最新版本的ECLIPSE倒置显微镜
解锁超级细菌耐药的传播机制
细菌耐药性主要是由于耐药基因的广泛传播引起的，而多重耐药质粒融合传播，更使耐药基因的传播如鱼得水。 “多重耐药质粒可以携带多个耐药基因，通过接合转移在不同细菌之间传播，从而造成耐药基因的传播。进一步解析耐药基因及其传播机制的关键是要获得完整的质粒图谱。”扬州大学教授李瑞超与香港城市大学合作，
DNA测序仪
DNA序列测定分手工测序和自动测序，手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今dna序列分析的主流。美国peabi公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等dna测序仪，其中310型是临床检测实验室中使用最多的一种型
基因测序仪
原理编辑abi prism 310型基因分析仪采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法)，因此通过单引物pcr测序反应，DNA测序仪生成的pcr产物则是相差1个碱基的3''''末端为4种不同荧光染料
DNA测序仪
DNA序列测定分手工测序和自动测序，手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今 dna序列分析的主流。美国pe abi公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等dna测序仪，其中310型是临床检测实验室中使用最多的一
Illumina测序仪
Illumina测序仪通常也被称作Solexa测序仪（Illumina测序仪的特点见表5）。它适用于采用各种方 法制备的DNA文库，文库中DNA片段可以长达数百bp，并可通过桥式PCR来扩增模板片段。在 桥式PCR反应中，正向引物和反向引物都被通过一个柔性接头（flexible linker）固定在
从“基因测序仪”观“测序行业”！
基因测序仪：基因测序“皇冠上的明珠” 基因测序仪是测序产业链的起点也是关键环节，它为整个中下游测序服务提供最基本的测序支撑，同时也是壁垒最高的部分，处于基因测序产业价值链顶端。基因测序仪对于基因产业的重要性，如同发动机之于汽车行业，芯片之于电子通信行业，可谓是基因测序“皇冠上的明珠”。 到目前为
高通量测序技术的原理及各平台优势和实践应用的分析－4
表一：NGS平台概述。单分子长读长测序（PacBio和ONT）最近这段时间，最常用的长读长测序法平台就是使用PacBio Biosciences（PacBio）57的单分子实时测序法（single-molecule real-time sequencing, SMRT）（图5a）。该设备使用
两大牛人携手发布新测序技术
经济高效的单分子测序平台能为人们提供很大的帮助，比如破解完整基因组序列、确定单倍型和鉴定mRNA可变剪接。为此，哥伦比亚大学的车靖岳（Jingyue Ju）和哈佛大学的George Church教授合作开发了基于纳米孔的单分子边合成边测序（SBS）系统。 他们给四种核苷酸分别标记上不同的聚合物
纳米孔测序技术
测序长度和准确率的快速提升使得纳米孔测序有望颠覆DNA测序市场。纽约威尔康奈尔医学院的计算生物学家Christopher Mason喜欢在会议上表演一个“绝活”：他和同事先从志愿者手机上收集DNA样本，然后就能在一个小时内现场进行谱系分析，甚至叙述志愿者一天的生活细节。“我们能从留在手机上的DNA信
真核基因组的组装，有纳米孔就够了
生物通报道 农业生物技术公司KeyGene近日只利用纳米孔测序仪MinION生成的序列，组装了立枯丝核菌（Rhizoctonia solani）的基因组。立枯丝核菌是一种农业害虫，感染一些重要的经济作物，包括玉米、水稻和大豆。 在BioRxiv网站的预印本上，KeyGene的Martin de
nanoporetech－使用纳米孔测序技术的微生物学
完整的细菌，真菌和病毒（DNA或RNA）基因组，可进行长时间的纳米孔测序。通过快速的病原体检测方法（无论是在实验室还是在野外），从环境或单一生物样品中鉴定并鉴定微生物。如果需要，还应附有抗菌素耐药性分析。使用直接RNA或cDNA方法对全长转录本进行测序，以进行准确的基因表达和转录本亚型分析。 通过长
牛津纳米孔测序将全面升级，回避IlluminaZL之战
一直以来，牛津纳米孔公司对其核心产品的微通道都持有保密态度，然而自测序巨头Illumina公司对其进行ZL诉讼之后，牛津纳米孔透露了其最新设备的驱动因子——细菌孔隙，似乎有意回避Illumina的ZL之战。 纳米孔测序被誉为是一个比传统测序更便携和实惠的技术，根据单核苷酸通过孔隙产生的电流变化