研究开发出原位代谢靶向的功能菌筛选、培养和强化技术
环境修复与生态系统工程高度依赖于原位功能菌的挖掘和应用,但长期以来,业界普遍采用的“先养后筛”范式面临着挑战。由于缺乏有效的菌群原位功能快检方法,因此通常难以快速识别和挖掘具有潜在功能的原位菌株。此外,即使能分离出功能菌,其在纯培养条件下的代谢效能(如除磷效率)往往与其原位环境有巨大差异,经常导致环境修复失败。针对上述挑战,中国科学院青岛生物能源与过程研究所与青岛科技大学、青岛水务集团环境能源有限公司等单位合作,提出了“原位代谢靶向的功能菌筛选、培养和强化”(IMSCA)策略,利用单细胞拉曼分选仪,从环境样品中直接进行单细胞精度的原位代谢功能测量和目标原位功能菌分选。研究发现,单细胞拉曼光谱中的多聚磷酸盐峰强度可作为单细胞水平的定量生物标志物,用于评估菌株从胞外环境中去除可溶解态磷的效率,从而识别聚磷菌(PAO)。在验证IMSCA策略的有效性时,研究团队选择了污水处理这一典型场景进行测试。磷排放是水体富营养化的主要原因,而生物除......阅读全文
CISME水下原位呼吸代谢测量:香港水域珊瑚代谢特性...1
CISME水下原位呼吸代谢测量:香港水域珊瑚代谢特性及耐温耐盐性研究气候变化对珊瑚生态系统的影响被广泛讨论,虽然气候预报预测全球海水温度将稳步上升,但区域水平的温度变化将更加多变。例如,Yuan等人(2019)发现南中国海(SCS)热带和亚热带水域的升温速率(0.038–0.074°C/年)高于预测
CISME水下原位呼吸代谢测量:香港水域珊瑚代谢特性...2
Pg总光合速率也随温度升高至30°C呈线性增加(Δ0.84±0.02 μmol O2 cm−2h−1,p
原位代谢组学分析方法与应用进展
2015年10月17日,第二届全国质谱分析学术报告会在浙江大学紫荆港校区体育馆盛大开幕,在5位院士的精彩报告后,多位学者做了高水平的大会报告。 中国医学科学院/北京协和医学院药物研究所、中央民族大学再帕尔·阿不力孜教授:原位代谢组学分析方法与应用进展 中国医学科学院/北京协和医学院药物研
研究开发出原位代谢靶向的功能菌筛选、培养和强化技术
环境修复与生态系统工程高度依赖于原位功能菌的挖掘和应用,但长期以来,业界普遍采用的“先养后筛”范式面临着挑战。由于缺乏有效的菌群原位功能快检方法,因此通常难以快速识别和挖掘具有潜在功能的原位菌株。此外,即使能分离出功能菌,其在纯培养条件下的代谢效能(如除磷效率)往往与其原位环境有巨大差异,经常导
研究开发出原位代谢靶向的功能菌筛选、培养和强化技术
环境修复与生态系统工程高度依赖于原位功能菌的挖掘和应用,但长期以来,业界普遍采用的“先养后筛”范式面临着挑战。由于缺乏有效的菌群原位功能快检方法,因此通常难以快速识别和挖掘具有潜在功能的原位菌株。此外,即使能分离出功能菌,其在纯培养条件下的代谢效能(如除磷效率)往往与其原位环境有巨大差异,经常导致环
原位PCR和原位RT
(一)、仪器设备 英国Thermo Hybaid原位PCR仪 。(二)、操作流程1、原位PCR 步骤1)预处理:(1)切片常规脱蜡;(2)0.2mol/L HCl处理10min;(3)5μg/ml蛋白酶K消化组织37℃10min;(4)Nase消化组织37℃ 30min;(5)梯度酒精脱水,室温干燥
过程工程所等开发微纳颗粒新剂型实现细胞代谢原位检测
近日,中国科学院过程工程研究所与清华大学、天津大学合作,基于无定形金属有机框架开发出一种新剂型,可实现酶分子的细胞内高效递送和催化,在单细胞水平上实现细胞代谢产物的原位检测。该工作发表于Nature Communications (DOI: https://doi.org/10.1038/s41
间接原位PCR(原位杂交PCR)
与直接原位PCR所不同的是,靶基因在扩增时不进行标记基团的掺入,而是标记一段与扩增片段互补的探针,在扩增结束后,应用此探针进行原位杂交。因此,此处主要介绍原位杂交,其余方法同原位PCR。实验材料组织或细胞样品试剂、试剂盒SSC硫酸葡聚糖甲酰胺脱脂奶粉Denhardt’s 液SDS变性的鲑鱼精DNAR
间接原位PCR(原位杂交PCR)
与直接原位PCR所不同的是,靶基因在扩增时不进行标记基团的掺入,而是标记一段与扩增片段互补的探针,在扩增结束后,应用此探针进行原位杂交。因此,此处主要介绍原位杂交,其余方法同原位PCR。一、预杂交1. 试剂与配制2×SSC50%去离子甲酰胺:用4×SSC配制(v/v)预杂交液:2×SSC,5%硫酸葡
间接原位PCR(原位杂交PCR)
间接原位PCR(原位杂交PCR) 实验材料 组织或细胞样品 试剂、试剂盒
原位PCR
About in situ PCR (Applied Biosystems)Basic information about in situ PCR and its applications.The In Situ PCR: Amplification and Detection in a Cellu
原位PCR
实验概要原位PCR技术自上世纪90年代初建立至今,科学家就一直对原位PCR的技术和应用进行研究,目前该项技术已日臻完善。原位PCR既能分辨带有靶序列的细胞又能标出靶序列在细胞内的位置,在分子和细胞水平上研究疾病的发病机理、临床过程以及病理的转归,其特异性和敏感性均高于一般PCR技术。在病毒学、病理学
微生物代谢的原位拉曼可视化定量分析成功实现
记者21日从中科院海洋研究所获悉,该所研究员张鑫课题组和孙超岷课题组共同合作,基于共聚焦显微拉曼技术,通过三维定量成像实现了长期、近实时、非破坏性的微生物监测,对微生物生长和代谢情况进行可视化及定量分析,为未来分析微生物原位生物过程提供了新思路。研究成果近日发表于《微生物学谱》上。 固体培养基
微生物代谢的原位拉曼可视化定量分析成功实现
记者21日从中科院海洋研究所获悉,该所研究员张鑫课题组和孙超岷课题组共同合作,基于共聚焦显微拉曼技术,通过三维定量成像实现了长期、近实时、非破坏性的微生物监测,对微生物生长和代谢情况进行可视化及定量分析,为未来分析微生物原位生物过程提供了新思路。研究成果近日发表于《微生物学谱》上。记者了解到,张鑫课
间接原位PCR(原位杂交PCR)实验
实验材料 组织或细胞样品试剂、试剂盒 SSC硫酸葡聚糖甲酰胺脱脂奶粉Denhardt’s 液SDS变性的鲑鱼精DNARnaseDTT乙醇仪器、耗材 玻片石蜡膜橡皮泥湿盒实验步骤 一、预杂交 1. 试剂与配制 2×SSC 50%去离子甲酰胺:用4×SSC配制(v/v) 预杂交液:2×SSC,5%硫
原位杂交与荧光原位杂交
一、原位杂交( In Situ Hybridization,ISH) 是用标记的核酸探针,使用非放射检测系统或放射自显影系统,在组织切片、细胞涂片及染色体制片上等对核酸进行定性、定位和相对定量研究的一种分子生物学方法,具有灵敏、特异、直观等优点。已逐渐成为分子生物学和分子病理学的常见技术之一,广泛应
原位杂交与荧光原位杂交
一、原位杂交( In Situ Hybridization,ISH) 是用标记的核酸探针,使用非放射检测系统或放射自显影系统,在组织切片、细胞涂片及染色体制片上等对核酸进行定性、定位和相对定量研究的一种分子生物学方法,具有灵敏、特异、直观等优点。已逐渐成为分子生物学和分子病理学的常见技术之一,广泛
原位杂交与荧光原位杂交
一、原位杂交( In Situ Hybridization,ISH) 是用标记的核酸探针,使用非放射检测系统或放射自显影系统,在组织切片、细胞涂片及染色体制片上等对核酸进行定性、定位和相对定量研究的一种分子生物学方法,具有灵敏、特异、直观等优点。已逐渐成为分子生物学和分子病理学的常见技术之一,广泛
华质泰科引入原位MS新俊SICRIT-剑指呼气及代谢组临床研究
分析测试百科网讯 在 AIMS2019 举办期间,华质泰科生物技术(北京)有限公司宣布与德国 Plasmion 公司签署合作协议。双方将就原位电离新技术—— SICRIT 在大中华区的推广及应用开发展开密切合作。华质泰科生物技术(北京)有限公司总裁兼首席技术官刘春胜博士(左)和 Plasmion
荧光原位杂交的荧光原位杂交
荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)是在20世纪80年代末在放射性原位杂交技术的基础上发展起来的一种非放射性分子细胞遗传技术,以荧光标记取代同位素标记而形成的一种新的原位杂交方法。探针首先与某种介导分子(reporter molecule)结
原位杂交仪原位杂交的意义
原位杂交:在研究DNA分子复制原理的基础上发展起来的一种技术。其基本原理是两条核苷酸单链片段,在适宜的条件下,能过氢键结合,形成DNA-DNA、DNA-RNA或 RNA-RNA 双键分子的特点,应用带有标记的(有放射性同位素,如3H、35S、32P、荧光素生物素、地高辛等非放射性物质)DNA或R
原位杂交仪—原位杂交实验(二)
原位杂交第二天 1. 1)将探针回收,放于-20C保存(通常探针可重复使用十次左右)。 2)加入50%甲酰胺/2XSSCT溶液1毫升,60℃,放置30分钟,重复一次。 3)置换2XSSCT1ml,60℃,放置15分钟。 4)置换0.2XSSCT1ml,60℃,放置30分钟,重复一次。
原位杂交仪—原位杂交实验(三)
原位杂交第三天 1) 用1ml含10%热灭活血清的MABT溶液置换抗体溶液,放置摇床上25分钟,然后用1mlMABT置换,25分钟,再用1mlMABT溶液置换,一小时以上,最后用1mlMABT溶液置换,25分钟。 2) 用1ml 1mM左旋米睉的Staining buffer洗三次,每次放置
原位杂交仪—原位杂交试验(一)
收集斑马鱼的胚胎,在Holfretor水中培养,到达所需要的发育时期时,用蛋白酶去除卵膜,用4%多聚甲醛固定,在4℃保存,二十四小时后用50%甲醇2%多聚甲醛溶液洗,然后换成甲醇,在-20C 保存,待用(两天和两天以上的胚胎需要用双氧水处理,去除色素。或者使用苯锍脲稀溶液培养,可阻断色素的形成)
原位PCR仪
用于从细胞内靶DNA的定位分析的细胞内基因扩增仪,如病源基因在细胞的位置或目的基因在细胞内的作用位置等。是保持细胞或组织的完整性,使PCR反应体系渗透到组织和细胞中,在细胞的靶DNA所在的位置上进行基因扩增,不但可以检测到靶DNA,又能标出靶序列在细胞内的位置,于分子和细胞水平上研究疾病的发病机
直接原位PCR
实验方法原理 原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法
原位PCR配置
主机一台,个人存储卡一张,原位PCR适配器 1.适用于96×0.2ml PCR管或77×0.5ml PCR管或8×12PCR板不需要更换模块; 2.反应槽温控范围:4-99℃; 3.控温精度:±0.2℃; 4.模块均一性:≤±0.5℃; 5.温控速率:升3℃/秒,降2℃/秒,速率可调;
原位PCR定义
原位PCR是Hasse等于1990年建立的技术,就是在组织细胞里进行PCR反应,它结合了具有细胞定位能力的原位杂交和高度特异敏感的PCR技术的优点,是细胞学科研与临床诊断领域里的一项有较大潜力的新技术。原位PCR既能分辨鉴定带有靶序列的细胞,又能标出靶序列在细胞内的位置,于分子和细胞水平上研究疾
直接原位PCR
实验方法原理 原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。实验材料 细胞或组织样品试剂、试剂盒 福尔马林二甲苯PB
原位PCR技术
除了经典的原位杂交外。原位杂交可与其他组织化学技术相结合,或与其他分子生物学技术相结合,使其应用范围扩大,成为更有应用价值的技术。PCR技术是根据生物体内DNA复制的特点而建立的在体外经酶促反应将特定DNA序列进行高效和快速扩增的技术,它可将单一拷贝或低拷贝的待测核酸以指数形式扩增而达到用常规方法可