新成药性预测模型可提供更综合且具解释性的评估

华东理工大学药学院教授唐赟团队,通过整合ADMET性质、理化性质以及可合成性,构建了一个全新的成药性预测模型,可为候选药物分子提供更综合、更具解释性的成药性评估。相关研究近日发表于美国化学会的《药物化学杂志》。据统计,平均每10000个化合物中只有1个化合物最终可能成为药物。临床前的类药性研究是关键环节,可帮助研究人员快速、精确地判断化合物作为潜在药物的可行性。传统的类药性评估多以经验法则为基础,虽便于快速筛选,却难以精细区分候选物的优劣。加权函数方法则对毒性等关键安全性维度考虑不足,易导致评价不全面。为此,亟需一种统一、可推广且可解释的类药性评价范式。研究团队建立了一种基于三元组对比学习的变分自编码框架(CLVAE)方法CLaSP。该方法以分子的ADMET性质为核心,融合经典理化性质与可合成性,并通过半监督的三元组对比损失训练构建了结构良好的“类药”潜空间,进而由潜空间坐标导出可解释的成药性评估。测试结果显示,该评分方法在多个......阅读全文

如何使用逻辑斯蒂增长模型进行预测和决策?

以下是使用逻辑斯蒂增长模型进行预测和决策的步骤:一、确定模型参数收集数据:收集与预测对象相关的历史数据。例如,如果要预测某种生物种群的数量变化,需要收集该种群在过去一段时间内不同时间点的数量数据;如果要预测市场需求的增长,需要收集产品在过去的销售量数据等。确保数据的质量和可靠性,尽量避免数据中的错误

机器学习模型有望提前五年预测白血病

 《自然》上发表了一项重磅研究:一个由来自全球多家科研机构的白血病科学家组成的研究小组使用血液检测和机器学习技术,来预测健康个体是否有患急性骨髓性白血病(AML)的风险。这项研究意味着我们可以提早发现AML的高风险人群并进行监测,同时可以进行研发,寻找降低该疾病患病几率的方案。急性骨髓性白血病(AM

新技术构建机器学习模型可预测玉米株高

近日,中国农业科学院生物技术研究所玉米功能基因组团队与作物代谢调控与营养强化团队合作,首次对玉米自交系全生育期进行全自动高通量无损监测,深入解析了玉米株高形成的动态遗传基础和调控网络,并通过机器学习构建了株高的智能预测模型。该研究为玉米表型精准鉴定、重要基因克隆和株型改良提供了有效策略和新的基因资源

能预测碱基编辑效果的新模型开发成功

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时间机器模型问世-穿梭时空或成现实

许多孩子童年的梦想,就是希望能拥有一台动画片《机器猫》中的时光穿梭机,回到过去看一看。正当有人认为这个想法是天方夜谭,嗤之以鼻时,以色列科学家阿莫斯·奥瑞却表示,已经成功制造了一个时光机器的理论模型,他相信穿梭时空回到过去在不久的将来会成为现实。 “甜甜圈”时光环逆流 奥瑞介绍,这个时光机器模型是依

概述成视网膜细胞瘤模型的测试内容

  儿童肿瘤——成视网膜细胞瘤是抗癌基因活动的最富有特征性的模式。在这种以遗传或散发式发生的肿瘤中,成视网膜细胞瘤基因即是隐性癌基因,正常情况下它可阻遏成视网膜细胞的恶性转化。根据knudson所提出的“两次碰撞”假说,具家族性病发危险的成员继承了一个已损伤的非功能性基因。在这样的成员中,第二次“碰

液体活检能够预测前列腺癌症患者的耐药性

  97名患者的相关研究结果近日发表在了《Science Translational Medicine》上,研究人员发现,在开始使用abiraterone之前,没有AR基因改变的患者的生存期和无进展期相比较于具有AR基因突变的患者,或者具有AR基因拷贝数增加的患者,显著增加。此外,他们还鉴定了与药物

调查预测中国成生命科学领袖需20年

  为了分析中国自2008年开始实施的“千人计划”对西方发达国家生命科学界的影响,国际高级管理人才猎头公司J. Robert Scott最近对中国和美国的制药、生物技术、医学设备和保健服务机构的执行官进行了一次非正式民意测验,并将调查结果和基于这些结果提出的观点文章发表在最新出版的《自然—

我国科学家研发天文耀发预测大模型FLARE

  记者5月27日从中国科学院自动化研究所获悉,研究所携手中国科学院国家天文台,基于一站式智能科研平台ScienceOne,联合研发天文耀发预测大模型FLARE,为天文学研究提供全新工具。  中国科学院自动化研究所研究员陈盈盈介绍,恒星耀发是恒星大气中磁场能量的快速释放过程,对于理解恒星结构、演化、

机器学习模型可准确预测农药在植物根系累积量

近日,中国农业科学院植物保护研究所农药应用风险控制创新团队先后在Environmental Science & Technology和Journal of Hazardous Materials上发表研究论文。他们首次利用机器学习模型直接预测植物根部从土壤中吸收累积农药等有机污染物的量,

模型预测埃博拉病毒感染者将持续增多

如果病毒按照目前的速度继续传播,Alessandro Vespignani的模型预测,截至9月24日,埃博拉病毒感染者将接近1万人。  美国波士顿市东北大学物理学家Alessandro Vespignani希望他最近的工作将被证明是错误的。7月,Vespignani开始通过建模了解致命病毒埃博拉是如

李国新团队:基于免疫评分的胃癌预后预测模型

  近日,南方医科大学南方医院普通外科研究成果“ImmunoScore Signature: A Prognostic and Predictive Tool In Gastric Cancer”发表于国际外科学领域最具影响力、被引频次最高的美国外科协会和欧洲外科协会官方期刊Annals of Su

重金属水质基准理论模型与预测取得重要进展

   中国环境科学研究院环境基准与风险评估国家重点实验室在重金属水质基准理论模型与预测研究方面取得重要进展:他们基于金属的物理化学参数,发现并构建了定量离子特征—毒性模型。  环境基准是制定环境标准的基础和科学依据,是国际环境科学研究的前沿领域。水质基准研究始于美国上世纪中叶,近三十年,7次颁布并更

科学家创建近视眼人工智能预测模型

  中山大学中山眼科中心刘奕志团队利用百万医学验光大数据,创建了近视眼人工智能预测模型,可对近视进展趋势进行个体化预测。相关成果日前在线发表于《科学公共图书馆—医学》。  近视眼如果能及早预测其发展规律,并施以增加户外活动等早期干预手段,可减缓其发生发展,对降低高度近视的风险有重要意义。  刘奕志团

生态代谢模型引入pH值-准确预测细菌多样性

土壤生物多样性极其复杂,通常少量土壤中就存在数十亿种生物,包括土壤微生物(细菌、真菌和原生生物)以及土壤动物(线虫)等。明确土壤生物多样性地理分布模式仍是一个巨大的挑战。以前的研究使用定性和图形框架等简单分析方法,仅仅包含少数共存物种或整体系统模型,侧重于突发模式但忽略了其潜在机制。著名生态学家Ja

时空四维模型突破限制-海温预测不再浮于表面

海洋温度体现了海水的热状况,海洋温度变化主要取决于海洋热收支状况及其时间变化。太阳辐射和海洋大气热交换是影响海水温度的两个主要因素。具体来说,纬度、洋流、季节、深度、海洋生物运动等都会影响海水温度变化。周晓锋中国科学院沈阳自动化研究所副研究员从太空视角看,地球像一颗蔚蓝色的“水球”,海洋面积占地球总

Cell-Systems:构建RNA结合蛋白的剪接调控作用预测模型

   基因组研究结果显示,人体内超过90%的基因存在选择性剪接(alternative splicing)。该过程在不同组织以及不同生理阶段受到严格的调控,其失调会导致多种疾病的发生。选择性剪接的体内调控主要由前体mRNA中的顺式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子(trans-a

研究人员开发出稀土矿电驱开采预测模型

近日,中国科学院广州地球化学研究所研究员朱建喜团队,针对离子吸附型稀土矿开发出电驱开采回收预测模型。团队通过设计响应面实验模拟电驱开采过程,从离子传输动力学与电荷量生成机制角度,系统阐明了稀土离子在风化壳中的电动回收过程。相关成果发表于《应用物理快报》(Applied Physics Letters

NASA和IBM联手打造可预测太阳耀斑的AI模型

  近日,美国国家航空航天局(NASA)和IBM欧洲研究院合作,基于NASA卫星图像训练出一个人工智能(AI)模型,可预测未来几小时的太阳外观,甚至可以预测太阳耀斑的出现。  “我更愿意把这个模型看作一架AI望远镜,可以通过它观察、了解太阳活动情况。”IBM欧洲研究院的Juan Bernabe-Mo

MOFormer:无需3D结构、基于Transformer的预测语言模型

金属有机框架(MOF)是具有高比表面积、高孔隙率和结构可设计的结晶性多孔材料,可用于气体吸附、气体储存、气体分离、催化剂等领域。  然而,MOF 的化学空间非常巨大。发现适合特定应用的最佳 MOF 需要对无数潜在候选材料进行高效、准确的搜索。快速且低成本地为特定任务选择性能最佳的 MOF 一直具有挑

如何使用逻辑斯蒂增长模型预测种群数量的变化?

使用逻辑斯蒂增长模型预测种群数量的变化可以按照以下步骤进行: **一、确定模型参数** 1. 收集数据:   - 收集种群在不同时间点的数量数据。这些数据可以通过实地观测、实验研究或者历史记录获得。数据的时间跨度应该足够长,以便能够观察到种群数量的变化趋势。   - 确保数据的准

机器学习模型可准确预测农药在植物根系累积量

近日,中国农业科学院植物保护研究所农药应用风险控制创新团队先后在Environmental Science & Technology和Journal of Hazardous Materials上发表研究论文。他们首次利用机器学习模型直接预测植物根部从土壤中吸收累积农药等有机污染物的量,

如何使用逻辑斯蒂增长模型预测种群数量的变化?

使用逻辑斯蒂增长模型预测种群数量的变化可以按照以下步骤进行: **一、确定模型参数** 1. 收集数据:   - 收集种群在不同时间点的数量数据。这些数据可以通过实地观测、实验研究或者历史记录获得。数据的时间跨度应该足够长,以便能够观察到种群数量的变化趋势。   - 确保数据的准

新模型能有效预测SIVD患者发生认知障碍风险

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495559.shtm

香港测试100款鸡肉-逾6成含耐药性细菌

   据香港电台报道,消委会首次测试市面100款鸡肉产品,发现超过6成含ESBL耐药性细菌。100款鸡肉产品包括全鸡和鸡翼,有鲜宰活鸡、冰鲜样本等,产地来自内地、本地及欧美地区等,结果发现68款对3GC抗生素呈耐药性反应,当中62款含有ESBL耐药肠杆菌科细菌。

利用BRAF基因突变预测息肉发展成肠癌的风险

  在结肠镜检查筛查中,经常性地发现患者存在结肠黏膜息肉。虽然,息肉的某些子群(亚族)被归类为肠癌的前体,然而到现在为止,医学界还不能准确地预测这些息肉发展成肠癌的风险。   近日,由于MedUni Vienna临床病理学研究所Peter Birner和德国海德堡大学科学家的合作,现在可以借助

《机器智能》:秒级预测蛋白质结构的大模型上线

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510009.shtm

科学家开发前列腺癌精准预测与评估模型

  近日,美国丹娜法伯癌症研究院、麻省理工学院和哈佛大学的研究团队利用前列腺癌患者的多组学数据,开发了一款可用于前列腺癌预测与评估的机器学习分析模型P  -NET(Pathway-aware multi-layered hierarchical network)。该研究在《Nature》上发表,题为

预测1型糖尿病主要并发症的新模型

  最近发表在《Diabetologia》(欧洲糖尿病研究协会期刊)的一项最新研究,提出了一种新的模型,可通过容易和常规测量的危险因子,预测哪些1型糖尿病患者将会出现严重的并发症。本研究是由荷兰瓦格宁根大学助理教授Sabita Soedamah-Muthu及其同事完成。  为了制备这个模型,研究人员

磁共振血管壁图像自动分割模型助力脑卒中风险预测

缺血性脑卒中的发生与动脉粥样硬化斑块密切相关,其诊断的关键在于对斑块和血管壁的精准分割和定量评估。然而,传统的手动分割方法效率低下且依赖操作者经验,而现有的计算机自动辅助工具在精度方面仍存在不足,难以满足临床需求。这一技术瓶颈严重制约了缺血性脑卒中的精准诊疗。近日,中国科学院深圳先进技术研究院医学成