定向编辑顺式调控元件将可精确调节目标农艺性状
近日,福建农林大学教授朱方捷课题组与中国热带农业科学院研究员吕培涛课题组在《生物技术通报(英文)》(aBIOTECH)发表综述论文。文章总结了高通量鉴定顺式元件组的四类主要方法,介绍了现有顺式元件数据库,探讨了园艺作物中已鉴定的顺式调控元件如何调控重要农艺性状,并展望了顺式调控元件在作物育种中的应用前景。 目前,已有超2000种植物基因组得到解析,如何解读、破译测序获得的基因组密码,是后基因组时代的重要任务。不直接编码蛋白质的基因组“暗物质”区域——非编码区中分布着大量可结合转录因子的功能位点,即顺式调控元件(Cis-regulatory elements, CREs)。 所有顺式元件形成顺式元件组(Cistrome),其与转录因子的互作,调控着基因的定时、定点、定量表达。因此,系统鉴定顺式元件组,不仅有助于注释非编码基因组功能片段、解析转录调控网络,同时也可为作物种质创新提供重要育种靶点。 鉴定顺式元件组的现有高通量......阅读全文
Cell子刊:mRNA编辑的全局调控子
转录成为mRNA的基因组遗传信息,需要先经过加工,然后再翻译成为生物所需的蛋白质。现在,加州大学和印第安纳大学的研究人员,发现了一个能够广泛调控mRNA编辑的重要蛋白。这项研究于二月六日发表在Cell旗下的Cell Reports杂志上。 这一调控机制有助于解释,为何在从海葵到人类的细
我国学者揭示长链非编码RNA顺式调控基因表达的新模式
国际学术期刊Cell Stem Cell(《细胞·干细胞》)于近日在线发表了清华大学医学院沈晓骅研究组的最新研究成果“Divergent lncRNAs regulate gene expression and lineage differentiation in pluripotent cel
Genome-Biology:普通小麦精细表观组图谱绘制成功
7月15日,Genome Biology期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组与南京农业大学张文利研究组等合作完成的研究论文。该工作生成并绘制普通小麦精细的表观组图谱,以此为基础针对性开发整合计算流程对全基因组顺式调控元件进行了系统的挖掘与鉴定,并初步探索
善感地反式作用因子的基本介绍
指和顺式作用元件结合的可扩散性蛋白,包括基础因子,上游因子,诱导因子。 真核生物的转录调控是调控的最重要的途经,大多是通过顺式作用元件和反式作用因子复杂的相互作用而实现的。顺式作用元件(cis-actingelement)存在于基因旁侧序列中能影响基因表达的序列,它们的作用是参与基因表达的调控
顺式作用核酶的定义
中文名称顺式作用核酶英文名称cis-acting ribozyme定 义催化RNA链自我剪接的核酶。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)
科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱
近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合
科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱
近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合
关于基因表达反式作用的介绍
与“顺式作用”相对,反式作用指的是其作用范围可以影响到不同DNA链上的基因(顺式作用的调控仅限于同一条链上的基因),故名。 反式作用的调控原理是借助产生有调控功能的蛋白质而进行的。由于蛋白质合成之后的选择性结合不限于表达它的这条DNA链,所以相比于顺势作用,反式作用的调控范围更广。 例如,某
STEME技术体系助力作物基因组编辑育种技术方法研究
遗传与变异是物种进化的基础。通过物理、化学方法(如辐射诱变、EMS诱变)产生全基因组的随机突变已经成为农作物育种的常规手段,但其中具有新型农艺性状突变体的筛选较为费时、费力。定向进化(Directed Evolution)则通过创制目标基因的突变文库,在施加一定选择压力下能够快速获得目的突变体。
STEME实现植物基因的定向进化和功能筛选
遗传与变异是物种进化的基础。通过物理、化学方法(如辐射诱变、EMS诱变)产生全基因组的随机突变已经成为农作物育种的常规手段,但其中具有新型农艺性状突变体的筛选较为费时、费力。定向进化(Directed Evolution)则通过创制目标基因的突变文库,在施加一定选择压力下能够快速获得目的突变体。
进化分析揭示编码区和非编码区RNA编辑的功能调控效应
2017年3月,国际知名学术期刊PLOS Genetics在线发表了斯坦福大学Jin Billy Li课题组和中山大学生命科学学院张锐课题组共同研究的题为“Evolutionary analysis reveals regulatory and functional landscape of c
顺式显性的基本概念
顺式显性(cis-dominant)指操作子结构中的顺式位点发生突变导致整条链失活,在表型上呈现显性效应的现象。lacOc突变是顺式显性的遗传学证据。F’OclacZ+/O+lacZ- ;lacZ的组成性表达。F’OclacZ-/O+lacZ+ ; lacZ的诱导性表达。
顺式异构体的定义
两个相同原子或基团在双键同一侧的为顺式异构体。
南京大学黄行许:连发CRISPR/Cas9重要研究成果
南京大学模式动物研究所的黄行许(Xingxu Huang)教授,是近年来基因组编辑领域的风云人物之一。其实验室不仅首次在世界上利用CRISPR/Cas9进行了大鼠的条件性基因敲除,还通过原核注射实现了世界上首次猴基因敲除。这些成果在国际上受到广泛的瞩目。 近期黄行许教授课题组接连在CRISPR
美首次对老鼠基因组的调控序列测序
美国科学家在7月1日出版的英国《自然》杂志上撰文表示,他们首次详细标示出了老鼠基因组功能序列中一个重要部分――调控序列的详细情况。老鼠是生物医学研究中最广泛使用的哺乳动物模型,因此,最新研究也将有助于我们进一步解读人类基因组。 加州大学圣地亚哥分校路德维格癌症研究所基因调控实验室主任任兵教
中国医学科学院最新文章解析HOX基因表达模式
“核心刊物”迎来了新期刊:科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英
新的基因编辑领域突破口—表观遗传调控
几十年来,DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质,但是近些年不断的研究表明,生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的,比如科学家们发现,可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰,这种改变不仅影响个体的发育,而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起,且与DNA和组蛋白
新的基因编辑领域突破口—表观遗传调控
几十年来,DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质,但是近些年不断的研究表明,生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的,比如科学家们发现,可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰,这种改变不仅影响个体的发育,而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起,且与DNA和组蛋白
我国学者在微生物调控元件资源应用中取得进展
微生物无处不在,为了适应环境,微生物进化出了感知各种环境因子的遗传元件。其中,別构转录因子(allosteric transcription factor,aTF)集小分子效应物结合结构域与DNA结合结构域于一身,能够通过结合效应物触发别构效应进而精准地调控靶基因的转录,已经在合成生物学遗传电
新项目将挖掘重要农业动植物性状共性调控元件
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519585.shtm
高效双碱基编辑器研发成功并在水稻中实现基因定向进化
近日,中国农业科学院作物科学研究所作物精准育种技术创新团队成功开发了一种高效、编辑范围更广的胞嘧啶和腺嘌呤双碱基编辑融合系统,利用该系统对水稻内源基因编码区进行改造,获得了高抗草甘膦的水稻新型基因资源。相关研究成果在线发表在《植物学报(Journal of Integrative Plant B
新研究揭示猪肌纤维类型分化及转化机制
7月1日,华南农业大学教授吴珍芳团队首次揭示了不同代谢类型猪骨骼肌的染色质空间构象及其介导的调控差异,通过整合表观基因组学与三维基因组学分析并结合分子实验,阐明了超级增强子调控肌纤维类型分化与转化的分子机制。相关成果发表于《自然-通讯》(Nature Communications)。研究对象及高通量
基因的分类
结构基因基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。(1)原核生物结构基因:连续的,RNA合成不需要剪接加工;(2)真核生物结构基因:由外显子(编码序列)和内含子(非编码序列)两部分组成。非结构基因结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列),参与基因表达调控。(1)顺式作用元件:能影响基因表达,但不
基因的分类
结构基因基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。(1)原核生物结构基因:连续的,RNA合成不需要剪接加工;(2)真核生物结构基因:由外显子(编码序列)和内含子(非编码序列)两部分组成。非结构基因结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列),参与基因表达调控。(1)顺式作用元件:能影响基因表达,但不
基因的分类
结构基因基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。(1)原核生物结构基因:连续的,RNA合成不需要剪接加工;(2)真核生物结构基因:由外显子(编码序列)和内含子(非编码序列)两部分组成。非结构基因结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列),参与基因表达调控。(1)顺式作用元件:能影响基因表达,但不
基因的基本分类
结构基因基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。(1)原核生物结构基因:连续的,RNA合成不需要剪接加工;(2)真核生物结构基因:由外显子(编码序列)和内含子(非编码序列)两部分组成。非结构基因结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列),参与基因表达调控。(1)顺式作用元件:能影响基因表达,但不
关于基因的分类介绍
一、结构基因 基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。 (1)原核生物结构基因:连续的,RNA合成不需要剪接加工; (2)真核生物结构基因:由外显子(编码序列)和内含子(非编码序列)两部分组成。 二、非结构基因 结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列),参与基因表达调控。 (1
打破育种瓶颈,实现优异性状“鱼与熊掌”兼得
水稻育种专家常常会碰到一些头疼的问题:穗子大了穗数变少、能抗病的不高产、高产了不优质……优异性状相生相克,“鱼与熊掌”难以兼得。近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋院士团队揭示了水稻产量核心要素穗重和穗数之间相互制约的分子机制,为突破这一育种瓶颈提供了新的遗传资源与研究思路。相关成果4月21
沈阳生态所油藏生物圈采油功能菌定向调控研究取得进展
油藏位于地下深部,具有厌氧、高压、高温和高矿化度等环境特点。油藏环境中栖息的厌氧微生物,形成了独特的微生物类群。作为地下生物圈的组成部分,油藏环境微生物独特的物种多样性与代谢功能多样性,使其不仅在元素的生物地球化学循环过程中发挥重要作用,在生物技术领域也有巨大应用潜力。 微生物采油技术(MEO
大化所发展定向调控分子筛骨架铝落位的新策略
近日,我所低碳催化与工程研究部(DNL12)刘中民院士团队以典型的丝光沸石分子筛作为研究对象,通过设计一种低分压四氯化硅处理(LPST)的策略,实现了铝原子选择性地富集在丝光沸石骨架的T3位点上(位于8元环孔道)。利用该策略改性后的催化剂展现出优异的二甲醚羰基化反应性能。 催化研究一直追求更高效