研究在单细胞水平解析猕猴桃抗寒分子机制

近日,中国农业科学院郑州果树研究所猕猴桃资源与育种团队在《园艺学前沿》(Horticulture Advances)上发表研究论文,首次在单细胞水平解析猕猴桃抗寒分子机制。 该研究通过scRNA-seq技术构建首个猕猴桃叶片单细胞转录图谱,基于UMAP聚类、同源标记基因与通路富集分析,成功鉴定8种细胞类型。进一步分析发现,保卫细胞和叶肉细胞在不同抗寒基因型(HT和HY)间存在显著差异。分析发现保卫细胞和叶肉细胞具有不同的发育轨迹,是导致抗寒差异的原因。此外,研究还鉴定到一个抗寒性负调控基因AaTIFY,为基因编辑育种提供了新靶点。 该研究首次将单细胞RNA测序技术应用于猕猴桃,在单细胞分辨率下揭示了不同抗寒基因型猕猴桃叶片细胞分化发育的异质性,并挖掘出关键的抗寒负调控基因,为深入理解猕猴桃抗寒分子机制和分子育种提供了重要理论基础和新基因资源。 猕猴桃资源与育种创新团队副研究员林苗苗和硕士研究生张珍珍为论文共同第一作者,......阅读全文

研究在单细胞水平解析猕猴桃抗寒分子机制

  近日,中国农业科学院郑州果树研究所猕猴桃资源与育种团队在《园艺学前沿》(Horticulture Advances)上发表研究论文,首次在单细胞水平解析猕猴桃抗寒分子机制。  该研究通过scRNA-seq技术构建首个猕猴桃叶片单细胞转录图谱,基于UMAP聚类、同源标记基因与通路富集分析,成功鉴定

猕猴桃抗寒性调控分子机制获揭示

  近日,中国农业科学院郑州果树研究所猕猴桃资源与育种团队揭示了猕猴桃AaBAM3.1基因与AaCBF4互作调控猕猴桃抗寒性的分子机制。该研究为猕猴桃抗寒研究提供了新线索。相关研究成果发表于《园艺研究》。  据研究员方金豹介绍,近年来频繁出现的极端低温天气严重影响了猕猴桃的生长发育和产量。猕猴桃枝条

科学家揭示猕猴桃维生素C抗寒的分子机制

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/494982.shtm冷胁迫限制植物的生长、发育和分布,是影响农业生产持续稳定发展的重要因素之一。维生素C是一种抗氧化剂,能够参与非生物应激耐受和活性氧代谢。探究低温胁迫如何诱导维生素C生物合成以减少对植物

猕猴桃维生素C生物合成和冷胁迫调控新机制

  冷胁迫限制植物的生长、发育和分布,是影响农业生产持续稳定发展的重要因素之一。维生素C(L-抗坏血酸,AsA)是一种抗氧化剂,参与非生物应激耐受和活性氧(ROS)代谢。探究低温胁迫如何诱导维生素C生物合成以减少对植物的氧化损伤,这对增强植物抗寒性、提高作物维生素C含量具有重要意义。  近日,中国科

尼古丁会在单细胞水平上影响胎儿发育

  怀孕的准妈妈们需要注意了,又有新证据表明吸烟会对腹中胎儿造成极大伤害。美国一项新研究显示,尼古丁会在单细胞水平上对人类胚胎发育产生广泛不利影响,新生儿暴露在尼古丁环境下3周后,就可能导致多种出生缺陷。  尼古丁是烟草的主要化学成分。已有大量动物模型研究表明,怀孕期间暴露在尼古丁环境下会增加妊娠并

单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就

  今天,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺

单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就

  今天,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺

单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就

  今天,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺

植物抗寒性鉴定

我国植物种类繁多,分布区域广,在晚秋和早春时期发生的冻害和冷害两种低温危害,常常给越冬作物和果木造成严重伤害。冻害由0℃以下低温造成,冷害由0℃以上低温引起,冷害对植物的伤害程度,除取决于低温外,还取决于低温维持时间的长短。植物抗寒性的强弱决定其生长季节,因此蔬菜作物利用抗寒品种,可以将露地栽培提前

研究揭示TAO眼眶组织单细胞水平免疫微环境

  甲状腺相关性眼病(TAO)是甲状腺疾病最常见的甲状腺外表现之一。目前,由于发病机制不明,TAO的治疗仍面临挑战。中山大学中山眼科中心教授苏文如团队联合中南大学湘雅医院教授王祥珪团队,研究揭示TAO眼眶组织单细胞水平免疫微环境。相关研究结果以研究论文的形式发表于Cell Reports Medic

性别与衰老对外周血免疫单细胞水平的影响

  近期,我国科学家团队在单细胞层面揭示了性别与衰老对外周血免疫细胞的影响,研究成果发表在《美国科学院院刊》(PNAS),标题为“Effects of sex and aging on the immune cell landscape as assessed by single-cell tran

质谱流式技术——蛋白水平的单细胞技术

摘要:在蛋白质水平,流式一直是最为常用的单细胞分析手段。但是由于串色等问题的困扰,流式通常只能进行6~10种蛋白的同时检测。质谱流式技术的出现给研究者带来了惊喜。利用分辨力超强的质谱技术以及独特的金属标记抗体,CyTOF2质谱流式细胞仪在检测通道数量和信号质量两方面都有了质的提升。单细胞技术在近年来

Science:在单细胞水平观察表观遗传动态调节

  我们是否能够对活细胞进行重编程以便让它们做我们想要它们在体内做的事情呢?执行这样的控制---合成生物学的一个主要目标---可能允许开发基于细胞的疗法以便可能有朝一日替换用于治疗疾病(如癌症)的传统药物。然而,为了实现这个长期目标,科学家们必须首先学着对细胞做的很多关键事情(如细胞彼此之间通信)进

植物抗寒性的定义

植物抗寒性包括抗冷性和抗冻性。植物对冰点以上低温的适应叫抗冷性。植物对冰点以下低温的适应叫抗冻性。

研究揭示马铃薯抗寒新机理

  在广东省重点研发计划、广东省自然科学基金等项目的资助下,华南农业大学园艺学院马铃薯课题组陈琳、副研究员赵竑博等和华中农业大学园林院教授宋波涛合作,研究揭示了马铃薯抗寒育种机理。相关研究发表于Plant, Cell & Environment。  马铃薯普通栽培种Solanum tuberosum

首次揭示单细胞水平大豆根瘤基因表达的动态特征

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500742.shtm近日,中国农业科学院作物科学研究所大豆优异基因资源发掘与创新利用创新团队与国内高校合作,首次在单细胞水平解析了大豆根瘤成熟过程中基因表达的动态变化,并在未成熟的根瘤侵染细胞中成功鉴定到

油料所破译油菜抗寒基因密码

  近日,中国农业科学院油料作物研究所(以下简称油料所)油料作物逆境生物学与抗性改良团队联合扬州大学团队,首次发现能显著提升油菜抗寒能力的关键基因模块,成功揭示了油菜耐寒分子机制。该研究成果日前发表于国际期刊《植物生物技术杂志》。  据悉,长江中下游“油稻轮作”模式是充分利用冬闲田的重要举措,但晚稻

茶树抗寒功能基因模块被发现

近日,中国农业科学院茶叶研究所茶树遗传育种创新团队研究鉴定出茶树低温胁迫功能基因模块,阐明了茶树抗寒机制,相关研究成果发表在《植物细胞与环境(Plant, Cell & Environment)》。低温是限制茶树生长最重要的环境因子之一。钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶(CIPK)广泛参与植物的生长

单细胞水平揭示造血干细胞扩增的动态图谱

  造血干细胞具有自我更新和分化的生物学特征,既可以维持其自身在造血组织中的恒定数量,又能向红系、粒系、巨核系和淋巴系等多种血细胞分化。造血干细胞移植广泛应用于白血病、再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征等临床血液系统恶性肿瘤的治疗,然而,造血干细胞来源不足,限制其广泛应用。因此,如何模拟体内造血干细

神经与精神疾病单细胞水平研究结果重磅发布

破译自闭症等神经发育疾病和双相情感障碍等常见精神疾病的遗传原因,一直是重大挑战,这是因为人脑太过复杂。在《科学》《科学转化医学》和《科学进展》杂志上,来自PsychENCODE联盟的科学家们发表了十几篇论文,首次在单细胞水平上展示了人类大脑的观察发现。图片来源:《科学》网站《科学》杂志发表的研究介绍

怎样用拉曼光谱检测单细胞水平的固态氮

  氮是维持生命活动最重要的营养元素之一。氮气是氮元素的丰富来源,但由于性质惰性,不能为生物直接利用。氮的生物地球化学循环是将氮转化成生物可利用形式的关键过程。固氮微生物,包括固氮细菌和固氮古菌,可将惰性的氮气转化成生物可利用的氨态氮或硝态氮。据估计,生物可利用氮的半数由生物固氮过程提供。然而,由于

在单细胞水平预测DNA甲基化的新方法

   如今,DNA甲基化的检测已经达到了单细胞的分辨率。不过,目前的方法还不能完整覆盖CpG,总是留下一些缺口。英国的一个团队最近开发出一种计算方法,可准确填补这些缺口。这项结果发表在《Genome Biology》杂志上。  研究人员使用所谓的深度神经网络策略来开发他们的方法,并命名为DeepCp

Science十大科学突破之单细胞水平细胞谱系追踪

  理解任何多细胞生命系统的前提是理解“细胞”,今天,单细胞研究已经不再只是纸上谈兵了,全球已经有许多实验室展开了单细胞研究。  生物通报道:12月21日Science杂志公布了2018年度十大科学突破。今年的Science十大科学突破之首是单细胞水平细胞谱系追踪技术,除此之外,今年的十大科学突破中

质谱流式细胞仪:蛋白水平的单细胞技术

  【摘要】在蛋白质水平,流式一直是最为常用的单细胞分析手段。但是由于串色等问题的困扰,流式通常只能进行6~10种蛋白的同时检测。质谱流式技术的出现给研 究者带来了惊喜。利用分辨力超强的质谱技术以及独特的金属标记抗体,CyTOF2质谱流式细胞仪在检测通道数量和信号质量两方面都有了质的提升。

科学家在单细胞水平解析拟南芥根发育全景图

  正如没有相同的指纹、完全一样的叶片,构成生命体基本单元的细胞同样存在高度的异质性。近年来随着单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)的发明与应用,使得研究人员能够在单细胞水平研究单细胞属性、细胞间异质性和细胞类型,深入解析生命活动的内在基本机理。  4月18日,国际学术期刊Molecular

Cell:首次在单细胞水平描绘肝癌微环境中的免疫图谱

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院BIOPIC中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大-清华生命科学联合中心张泽民研究组,首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组,以及美国AMGEN公司的欧阳文军研究组在Cell杂志发表了题为“Landscape o

我国学者在单细胞水平解析拟南芥根发育全景图

  正如没有相同的指纹、完全一样的叶片,构成生命体基本单元的细胞同样存在高度的异质性。近年来随着单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)的发明与应用,使得研究人员能够在单细胞水平研究单细胞属性、细胞间异质性和细胞类型,深入解析生命活动的内在基本机理。  4月18日,国际学术期刊Molecular

如何从单细胞水平探寻金属元素的药理学意义?

细胞是生命结构和生命活动的基本单位,基于单细胞的研究是生命研究的基础。单细胞分析可获得细胞在微环境中准确的个体信息,大量细胞个体呈现的差异性信息对于研究细胞的信号传导、生理病理和重大疾病的早期诊断具有十分重要的意义。 传统的细胞内金属含量的分析方法通常是:将细胞进行消解,然后通过原子吸收光谱(AAS

Cell:-中国学者首次发布大规模肿瘤单细胞水平免疫图谱

  2017 年 6 月 15 日,北京大学生命科学学院 BIOPIC 中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大  -清华生命科学联合中心张泽民研究组,首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组,及美国 AMGEN 公司的欧阳文君研究组在《Cell》杂志发表了题为

cell-张泽民团队首次发布大规模肿瘤单细胞水平免疫图谱

  2017年6月15日,北京大学生命科学学院 BIOPIC 中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大  -清华生命科学联合中心张泽民研究组,首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组,及美国 AMGEN 公司的欧阳文君研究组在《Cell》杂志发表了题为“Land