Nature汇总两个大规模项目提出重要标准

来自加拿大蒙特利尔大学IRCM,美国哈佛大学医学院等处的研究人员根据两个大型研究项目:癌症基因组计划CGP,和癌细胞系百科全书CCLE的研究数据,指出药物筛选研究中标准化的重要性,这对于提高筛选研究的可重复性,寻找更多新型治疗性药物具有重要的意义。 这篇文章发表在Nature杂志上,文章的通讯作者是一位来自IRCM的生物信息学家Benjamin Haibe-Kains。他在这篇文章中强调了标准化药物筛选的重要性,这项研究表明需要进一步发展和标准化药物筛选研究的重现性,因为这对于寻找新的治疗药物及潜在的药物组合非常重要。 癌症基因组计划(CGP)是一项针对主要癌症遗传变异的全面整合分析的计划。最早出现在2005年,目的是绘制一个有关各种癌症基因异常特征的“一览表”,以便通过系统分析找到新方法对抗这一顽疾。 而癌细胞系百科全书(CCLE)整合了来自大约1000个人类癌细胞系的基因表达,染色体拷贝数和大规模平......阅读全文

微生物降解的相关信息介绍

  微生物降解是指微生物把有机物质转化成为简单无机物的现象。自然界中各种生物的排泄物及死体经微生物的分解作用转化为简单无机物。微生物还可降解人工合成有机化合物。如通过脱卤素作用,把DDT转化为DDE和DDD;通过氧化作用,把艾氏剂转化为狄氏剂;通过还原作用,把含硝基的除虫剂还原为胺;芳香基的环裂现象

关于生物发酵工程的基本信息介绍

  生物发酵工程是生物工程的一个重要组成部分,微生物利用碳水化合物发酵生产各种工业溶剂和化工原料。乙醇、丙酮-丁醇、丁醇-异丙醇、丙酮-乙醇、2,3-丁二醇和甘油发酵是微生物进行溶剂发酵的几种形式。  所谓生物工程,一般认为是以生物学(特别是其中的微生物学、遗传学、生物化学和细胞学)的理论和技术为基

化石扫描揭示古生物重要生长信息

《科学进展》杂志最新发表了一项研究,揭示了早期哺乳动物在漫长“生命史”的关键时期是如何生长和发育的。包括英国伦敦玛丽女王大学在内的研究团队此次利用同步加速器X射线断层扫描技术,对化石牙根中的生长环进行成像,从而推测出这些古代生物的寿命、生长速度,甚至性成熟的时间。这是第一次如此详细地重建这些早期哺乳

生物技术与信息技术的融合

   编者按:5月,美国国立卫生研究院(NIH)准备了十年内约200亿美元的“Chief Information Officer-Commodity Solutions Contract”的采购计划,采购信息技术、云服务等领域的服务,以提升其在信息服务方面的能力。本文就这一政策行动,结合近期一些信息

类固醇生物碱的基本信息

中文名称类固醇生物碱英文名称steroid alkaloid定  义存在于植物中的一类含氮类固醇化合物。在藜芦及龙葵内含有几种类固醇生物碱,其中最重要的是异茹碧芥类碱和水解龙葵碱。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),脂质(二级学科)

生物信息学技术的技术原理

生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析,也是蛋白质组研究的重要内容。生物信息学是蛋白质组学研究中不可缺少的一部分。生物信息学的发展,已不仅是单纯的对基因组、蛋白质组数据的分析,而且可以对已知的或新的基因产物进行全面分析。在蛋白质组数据库中储存

关于微生物的基本信息介绍

  微生物包括:细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体,它个体微小,与人类关系密切。涵盖了有益跟有害的众多种类,广泛涉及食品、医药、工农业、环保、体育等诸多领域。在中国大陆地区及台湾的教科书中,均将微生物划分为以下8大类:细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、

英国加大生物信息基础设施建设投资

  认识到海量数据的处理、储存和解释在生物科学研究成果转化中发挥着重要作用,英国加大投资生物信息基础设施建设。日前,英国投资7500万英磅启动建设一个新的生物信息技术中心,资助资金主要由英国生物技术与生物科学研究理事会(BBSRC)、医学研究理事会(MRC)、自然环境研究理事会(NERC)和维康信托

农田生物宏观形态结构信息提取技术

对于农田生物宏观结构信息的数字图像,宜采用计算机图像处理技术提取。所谓数字图像就是图像各点的灰度值的二维数组。根据灰度层次、光谱轴和时间轴上的组合方式的不同,数字图像可分为二值图像、浓淡图像、彩色图像、多光谱图像、立体图像、动态图像等。农田生物色度信息就是用RGB三基色不同数量级的合成来表示。数字图

关于生物糖酵解的基本信息介绍

  生物糖酵解(glycolysis)是指在无氧条件下,葡萄糖在细胞质中被分解成为丙酮酸的过程,期间每分解一分子葡萄糖产生两分子丙酮酸以及两分子ATP,属于糖代谢的一种类型。一共十步反应,包括三种关键酶(限速酶):己糖激酶、6-磷酸果糖激酶、丙酮酸激酶。根据糖代谢是否有氧参与,可以将丙酮酸进行柠檬酸

信息化学物质生物测定的定义

中文名称信息化学物质生物测定英文名称bioassay of semiochemicals定  义测量信息化学物质引起动植物靶标的生物效应的大小与强度。应用学科生态学(一级学科),化学生态学(二级学科)

生物信息学—促动BT与IT双赢

  无论是与结构基因组学对应的“基因时代”,还是与功能基因组学、蛋白质组学相应的“后基因时代”;无论你称呼21世纪是“信息时代”、“后信息时代”,还是“生物时代”,所有这一切,都将BT(生物技术)与IT(信息技术)紧密结合起来。而这其中,无疑“生物信息学”占据了天时地利、出尽了风头,虽然它自身及其相

四氢生物蝶呤的基本信息介绍

  四氢生物蝶呤 [sì qīng shēng wù dié lìng]  [生物化学] tetrahydrobiopterin  分子式:C9H15N5O3  分子量:241.25  CAS号:17528-72-2概述  “BH4缺乏症是当今少数的几种可控制的遗传性疾病之一。  首个治疗四氢生物蝶

关于母体效应基因的基本信息介绍

  又称母体因子,在卵母中呈极性分布,受精后被翻译为在胚胎发育中起重要作用的转录因子和翻译调节蛋白的mRNA分子,他们在胚胎发育的决定中起重要作用。  产生母体影响的基因,属于胞质基因,核外遗传的范畴,编码的基因往往是一些转录因子、受体或翻译调节蛋白,他们在早期胚胎的图式形成中起着关键作用。

关于基因克隆载体的基本信息介绍

  把能够承载外源基因,并将其带入受体细胞得以稳定遗传的DNA分子称为基因克隆载体。  在转基因研究中,单独一个包含启动子、编码区和终止子的基因,或者组成基因的某个原件,一般是不容易进入受体细胞的,即使采用理化方法进入细胞后,也不容易在受体细胞内稳定维持。目的基因能否有效转入受体细胞,并在其中维持和

关于操纵基因的基本信息介绍

  操纵基因是操纵子中的控制基因,在操纵子上一般与启动子相邻,通常处于开放状态,使RNA 聚合酶通过并作用于启动子启动转录。但当它与调节基因所编码阻遏蛋白结合时,就从开放状态逐渐转变为关闭状态,使转录过程不能发生。

关于持家基因的基本信息介绍

  持家基因(house-keeping genes),又称管家基因,是指所有细胞中均要稳定表达的一类基因,其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的。如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。管家基因是一类始终保持着低水平的甲基化并且一直处于活性转录状态的基因。

关于基因扩增技术的基本信息介绍

  基因扩增技术又称无细胞分子克隆系统或特异性DNA序列体外引物定向酶促扩增法,是基因扩增技术的一次重大革新。可将极微量的靶DNA特异地扩增上百万倍,从而大大提高对DNA分子的分析和检测能力,能检测单分子DNA或对每10万个细胞中仅含1个靶DNA分子的样品,因而此方法立即在分子生物学、微生物学、医学

关于单基因病的基本信息介绍

  单基因病(monogenic disease)主要指由一对等位基因突变导致的疾病,分别由显性基因和隐性基因突变所致。所谓显性基因是指等位基因(一对同源染色体同位置上控制性对性状的基因)中只要其中之一发生了突变即可导致疾病的基因,隐性基因是指只有当一对等位基因同时发生了突变即可导致疾病的基因。隐形

关于基因治疗的基本信息介绍

  基因治疗(gene therapy)是指将外源正常基因导入靶细胞,以纠正或补偿缺陷和异常基因引起的疾病,以达到治疗目的。其中也包括转基因等方面的技术应用,也就是将外源基因通过基因转移技术将其插入病人的适当的受体细胞中,使外源基因制造的产物能治疗某种疾病。从广义说,基因治疗还可包括从DNA水平采取

关于基因簇的基本信息介绍

  基因簇少则可以是由重复产生的两个相邻相关基因所组成,多则可以是几百个相同基因串联排列而成。它们属于同一个祖先的基因扩增产物,也有一些基因家族的成员在染色体上排列并不紧密,中间还含有一些无关序列,但总体是分布在染色体上相对集中的区域。   基因簇中也常常包括一些没有生物功能的假基因。   一组

关于抑癌基因的基本信息介绍

  抑癌基因(tumor suppressor genes),也称肿瘤抑制基因,或俗称抗癌基因,是一类存在于正常细胞内可抑制细胞生长并具有潜在抑癌作用的基因。抑癌基因在控制细胞生长、增殖及分化过程中起着十分重要的负调节作用,它与原癌基因相互制约,维持正负调节信号的相对稳定。当这类基因在发生突变、缺失

关于人类假基因的基本信息介绍

  迄今为止,明确鉴定的人类假基因多为已加工假基因,有8000个之多。在Swiss-Prot/TrEMBL收录的编码蛋白质的将近25500个基因序列中,约10%在基因组中有一个或多个近全长已加工假基因。其余的功能基因都没有已加工假基因。核糖体蛋白基因具有最多数量的已加工假基因,约有1700个(占已加

关于基因分离方法的基本信息介绍

  基因分离方法是直接从生物基因组中分离出特定基因的方法。主要使用三种方法。鸟枪法:使用限制性内切酶在特异的序列上将DNA双链切成平均长度为几千个碱基对的混杂片段。这些片段带有粘性末端,与具有相同粘性末端的载体质粒相结合形成重组体。用此重组体群转化受体细胞,再选出带有目的基因的转化细胞。通过增殖,可

关于增变基因的基本信息介绍

  许多增变基因的存在,有力地表明自发突变与其说是依赖于理化因子,莫如说是大大的依赖于遗传控制的生物因子。例如在T4噬菌体中,在同一个DNA多聚酶。  基因座位上曾发现有与增变基因性质相反的反增变基因(antimutator——能使自发突变率降低的基因)的突变型。这是因为在具有增变基因的突变型中DN

关于ras癌基因的基本信息介绍

  ras癌基因参与人类肿瘤的发生发展,它最初是在急性转化性逆转录病毒实验中,从Harvey、Kirsten两株大鼠肉瘤病毒中克隆出的转化基因,自82年Weinberg等人发现其中有活化的H-ras基因后,引起了人们对ras癌基因在人类肿瘤发生、发展中所起作用的极大关注。经十余年研究认为,ras癌基

关于多基因假说的基本信息介绍

  多基因假说是1908年尼尔逊·埃尔用红粒和白粒小麦进行杂交试验提出的假说,对数量性状的遗传进行了解释。  按照他的解释,数量性状是许多彼此独立的基因作用的结果,每个基因对性状表现的效果较微,称为微效基因。但其遗传方式仍然服从孟德尔的遗传规律。而且还假定:  (1)各基因的效应相等。  (2)各个

关于基因间重排的基本信息介绍

  另一种修复的结果更多见,DNA断端的游离单链末端侵入(strand invasion)到对应的染色单体上的等位基因,与另一条染色单体的DNA发生复性,结果形成了两同源染色单体的基因之间转换式移动。这类单链侵入形式导致异源链合成、延伸,会出现三种不同的后果:  (1)从重复序列开始的错配新合成链,

关于基因测序仪的基本信息介绍

  基因测序仪又称DNA测序仪,是测定DNA片段的碱基顺序、种类和定量的仪器。主要应用在人类基因组测序、人类遗传病、传染病和癌症的基因诊断、法医的亲子鉴定和个体识别、生物工程药物的筛选、动植物杂交育种等方面。  根据电泳类型分为平板型电泳和毛细管电泳两类:  1. 平板型电泳:平板型电泳的凝胶灌制在

采用生物信息学和实验方法联合分析转录组信息

The wealth of transcript information that has been made publicly available in recent years requires the development of high-throughput functional geno