新技术破解临床样本分析难题

8月29日,记者从华大生命科学研究院获悉,该研究院牵头建设的基因组多维解析技术全国重点实验室联合多家机构,共同开发出时空组学技术Stereo-seq V2。该技术攻克了困扰医学界多年的福尔马林固定石蜡包埋样本分析难题,并实现在同一张组织切片上,同时对人体细胞(宿主)和入侵微生物的基因活动进行高分辨率“现场直播”。相关研究成果发表在《细胞》上。 Stereo-seq V2应用于不同保存年限的FFPE乳腺癌样本 据了解,临床中超过90%的样本是福尔马林固定石蜡包埋样本,其便于保存且数量庞大。但在长期保存中,福尔马林固定石蜡包埋样本RNA完整性较差,一直以来被传统空间转录组技术“拒之门外”。 科研团队通过创新解交联技术和随机引物捕获策略,突破这一核心瓶颈,意味着全球医院病理科中积压的福尔马林固定石蜡包埋样本库,可被高效转化为前沿研究的“数据源”,为临床回顾性研究提供可能。 据悉,传统技术在分析“宿主-微生物”时,或只能单独......阅读全文

如何计算样本稀释比例

计算稀释溶液的浓度的公式:V1×M1 = V2×M2V =V2 -V1V1 = 稀释前体积nV2 = 稀释后体积M1 = 前稀释浓度M2 =稀释后浓度V = 合计溶剂稀释例如1公斤溶液,配成原液30倍即1×30,因为已经加2公斤,所以应该减去2公斤,再减去1公斤溶液。需在添加水27公斤,就是原液的3

活体肿瘤样本库与常规肿瘤生物样本库有什么区别?

  一、常规生物样本库  肿瘤在临床上有实体瘤和非实体瘤之分。来源于临床活检或外科手术的固体肿瘤组织,由病理医生决定切割组织的关键部份用于常规病理诊断,且在不影响常规病理诊断的情况下,组织的剩余部份被生物样本库切割收集,将肿瘤蜡块存储到样本库中。但是这种方式保存的样本,不能够保证保存下来的肿瘤块是否

MALDITOF-MS在临床微生物样本直接检测中的应用(三)

四、总结与展望MALDI-TOF MS是一种简单、快速、高通量和高效的微生物鉴定手段, 在临床样本直接检测方面较传统的鉴定方法具有更大的优势, 能显著降低样本检测的周转时间和成本, 但尚存在着一些不足之处, 主要表现在:(1)MALDI-TOF MS在检测和鉴定细菌方面的敏感性还不高,

科学家利用机器学习解开临床癌症样本中的基因组密码

  分析癌症基因组中的突变过程有助于在早期发现和准确诊断癌症,并可以揭示某些癌症患者对治疗产生耐药性的原因。  临床癌症样本是一个巨大的资源,可以为分子诊断技术提供更全面的支持,使特定的癌症患者与适合的癌症疗法相匹配,从而达到最好的治疗效果。然而,由于临床癌症样本中的DNA质量较差(如福尔马林会对D

MALDITOF-MS在临床微生物样本直接检测中的应用(一)

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)是20世纪80年代发展起来的一种新型软电离有机质谱, 作为一种新兴的蛋白质组

不同二代测序平台用于临床肿瘤样本体细胞突变检测的...

使用二代测序技术检测肿瘤组织FFPE样品中的DNA体细胞突变用于临床分子诊断存在的问题是,DNA质量和数量的变异较大,以及检测到的低频突变难以用二代测序以外的其他技术予以验证。以下实验测评了MiSeq和Ion Proton两个平台检测体细胞突变的表现,分别选用了 TruSeq Amplicon

MALDITOF-MS在临床微生物样本直接检测中的应用(二)

三、MALDI-TOF MS在临床样本直接检测中的应用从临床样本直接检测微生物可以节省转种培养的时间。目前已取得显著进展的是从血培养阳性样本中直接检测细菌和酵母样真菌, 而从中段尿和其他无菌体液样本中的直接检测也在快速发展。(一)血流感染病原菌的快速检测血流感染的发病率和死亡率都相当高, 快速准

临床检验分析仪器—形态学分析前样本处理设备的介绍

  1) 形态学分析前样本处理设备— 血细胞分析前样本处理仪器(管理类别:Ⅰ类)  常见仪器有涂片机、细胞离心涂片机、全自动染色机、全自动推片染色机、染色机等。  2) 形态学分析前样本处理设备— 病理分析前样本处理仪器(管理类别:Ⅰ类)  常见仪器有轮转式切片机、平推式切片机、振动式切片机、冷冻切

样本蛋白的结构性质

了解样本蛋白的结构性质有助于选择最合适的抗体,至少两方面因素需要考虑。待测样本蛋白的结构域:抗体是由各种不同免疫原免疫宿主而制备得来,其中的免疫原包括:全长蛋白、蛋白片断、多肽、全有机体(如:细菌)或细胞,抗体说明书一般都有免疫原的描述,如果打算检测的是蛋白片断或一种特殊的同型物或蛋白全长的某一区

ELISA试剂盒检测样本

血清是最常用的ELISA试剂盒标本之一,ELISA检测中血浆一般可视为与血清同等的标本,标本中干扰性物质是引起检测后结果偏高或偏低的主要原因,干扰性物质分为内源性物质和外源性物质两大类;外源性物质常常是由于用于ELISA测定的血标本的采集、贮存等不当所致。如标本溶血、标本被细菌污染、标本贮存过久、标

生物样本库认可依据

  CNAS-R01《认可标识使用和认可状态声明规则》  CNAS-R02《公正性和保密规则》  CNAS-R03《申诉、投诉和争议处理规则》  CNAS-RL01:2019《实验室认可规则》  CNAS-RL02:2018《能力验证规则》  CNAS-RL10:2020《生物样本库认可规则》  C

FDA的样本制备方法举例

   (1)样本的整理在测定生鲜农产品药物残留时,如果没有特别指明,按照规定,应以整个农产品作为试样。除了分析特定食品中特定药物残留外,一般不得洗涤、除尘、削皮。    水果:去掉水果的把、凹处和核。    香蕉:切掉两头。    芒果:去掉皮和核。    甜瓜:去掉皮、茎、籽,只分析食用部分。  

将生物样本存进“银行”

   1月10日,中关村生命银行启新盛典在京举行。作为中关村生命科学园2017年重点开展的创新性建设项目,中关村“生物银行”是由中关村生命科学园孵化器公司和北京起源爱心生物科技有限公司合力打造的生命科学高地。  据悉,生物银行又称生物样本库,主要收集、存储研究用生物样本(包括组织、细胞、血浆、骨髓和

Q12英文样本

西班牙KONIK的气质、液质一体机Q12的英文样本 Q12英文样本

样本中铀的测定方法

废水中铀的测定方法,一般采用铀试剂Ⅲ或5-Br-PADAP分光光度法及固体荧光法。三烷基氧磷萃取-(2-(5-溴-2-吡啶偶氮)-5二乙氨基酚)光度法(简称TRPO萃取-(5-Br-PADAP)光度法)与固体荧光法相比,选择性好、准确、快速。

植物安排样本的前处理

   一、匀浆介质      一般采用0.05 mol/L Tris-HCl, pH 7.4 磷酸盐缓冲液(PBS),客户可根据样本及测定目标的情况自行设定浓度,意图是坚持样本的等渗环境。      二、安排匀浆的制备      1、取安排块(0.2g~0.5g)可到5~10mg在冰冷的PBS中漂洗

生物样本库发展现状

生物样本库是标准化搜集处理、储存和分发健康和疾病生物体的生物大分子、细胞、组织和器官等样本,以及相关的个体生理及病理信息的系统。目前主要是人体样本的搜集储存,包括核酸、蛋白、细胞、血液及其分离成分、尿液、唾液、毛发、精液、卵子、受精卵、卵巢组织、睾丸组织、胎盘、脐带、胸腺、脂肪、皮肤、骨髓、角膜、血

液氮罐生物样本活性保存

  取放物品时要控制在容器颈管内。若必须将提筒提出容器再取放物品,应该等高于提筒侧面孔口的液氮排完后,再将提筒提出,提出时切忌匆匆忙忙的提出,以免液氮从侧面孔逸出冻伤人。  取放完之后,立即将提筒与盖塞轻轻复位。此时要注意尽量缩短液氮罐瓶口的开放时间,更不可把提筒同时全部取出,以免容器吸入空气中的水

石蜡包埋组织样本的制备

实验材料 组织胰蛋白酶试剂、试剂盒 二甲苯乙醇生理盐水仪器、耗材 尼龙网实验步骤 1. 把石蜡包埋组织切成 40~50 μm 厚的组织片 3~5 片,或用乳钵研成 0.5 mm 直径大小颗粒状,放入 10 ml 的试管中。2. 加入二甲苯 5~8 ml 时,在室温下脱蜡 1~2 d,视石蜡脱净与否,

ELISA实验样本处理方法

可用于ELISA实验的样本一般有血清、血浆、尿液、细胞培养上清以及组织匀浆等。不同样本类型的预处理方法也不同。适当的样本预处理是确保ELISA实验正确性和准确性的第一步。这里,我们将介绍几种不同样本类型的处理方法。1. 血清血清是ELISA实验最常用的样本,其预处理也十分简单。使用无热原无内毒素的试

石蜡包埋组织样本的制备

实验材料组织胰蛋白酶试剂、试剂盒二甲苯乙醇生理盐水仪器、耗材尼龙网实验步骤1. 把石蜡包埋组织切成 40~50 μm 厚的组织片 3~5 片,或用乳钵研成 0.5 mm 直径大小颗粒状,放入 10 ml 的试管中。2. 加入二甲苯 5~8 ml 时,在室温下脱蜡 1~2 d,视石蜡脱净与否,更换 1

质谱样本前处理步骤

生物样品基质复杂,且待测目标物多为内源性的化合物,如血清样本含有蛋白质、多肽、氨基酸、脂类、糖类、无机盐、维生素、有机酸、激素等。因此为了降低基质干扰、延长色谱柱使用寿命、防止系统堵塞损坏、提高检测灵敏度和特异性,往往需要对样品进行沉淀、萃取、净化、富集等前处理。 目前常用的样本前处理方法有:蛋白沉

挂号网:移动医疗探路样本

  移动医疗,一个被认为是满眼商机的行业,困扰业内人士的最大问题却是很难找到合适的商业模式。  但在挂号网总经理廖杰远眼里这却不是一个问题。廖杰远对移动医疗模式的理解是,“首先,你给患者提供了什么核心的价值;第二,你获得了多少患者的信任。抓住这两点,一定是能赚钱的。”  “在这种情况下,如果在点点滴

扫描电镜样本的干燥

扫描电镜观察样品要求在高真空中进行。无论是水或脱水溶液,在高真空中都会产生剧烈地汽化,不仅影响真空度、污染样品,还会破坏样品的微细结构。因此,样品在用电镜观察之前必须进行干燥。干燥的方法有以下几种:1) 空气干燥法空气干燥法又称自然干燥法,就是将经过脱水的样品,让其暴露在空气中使脱水剂逐渐挥发干燥。

FFPE样本核酸(DNA/RNA)制备

福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织切片的存档代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料。随着越来越多的研究人员转向 FFPE 样品的分子分析,开发特定的操作步骤,考虑这些样品的独特性质就变得越来越重要。QIAGEN 在 FFPE 样本纯化及下游检测整个流程中都提供完善的解决方案。QIAamp

酒精样本的采集和保存

    乙醇(酒精)是最常见的毒性物质。乙醇测定用于诊断和治疗乙醇中毒(酒精中毒)。长期酗酒可能引起肝脏疾病、高血压、心脏疾病和出生缺陷。急性酒精中毒可以引起昏迷甚至死亡。 一、标本要求 建议使用的标本        血清        血浆: 肝素 (Heparin)               

亲子鉴定及样本采集方法

 亲子鉴定又称“亲生子鉴定”。所谓亲子鉴定,就是根据人类遗传学的理论和实践,从子代和亲代的形态构造或生理机能方面的相似特点,分析遗传特征,对可疑的父与子或母与子之间的亲生关系进行判断,并做出肯定或否定的结论。运用生物学、遗传学以及有关学科的理论和技术,根据子代与亲代之间,在形态结构或生理机能方面具有